MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Natronomonas pharaonis DSM 2160

Total Repeats: 838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007426	AAGG	2	8	1132	1139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007426	GTCG	2	8	1238	1245	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_007426	CCGG	2	8	10035	10042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007426	ACGG	2	8	14959	14966	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007426	GAAC	2	8	22558	22565	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_007426	GTTC	2	8	23210	23217	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_007426	AACA	2	8	28882	28889	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_007426	AGGG	2	8	28958	28965	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007426	GCCA	2	8	36101	36108	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007426	TCGG	2	8	40079	40086	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_007426	ACGG	2	8	40135	40142	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_007426	CTGG	2	8	41552	41559	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_007426	GCCG	3	12	46182	46193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007426	GTCG	2	8	63742	63749	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_007426	TCGG	2	8	72876	72883	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_007426	CGGG	2	8	96255	96262	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007426	CCCG	2	8	109138	109145	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_007426	GTTC	2	8	114489	114496	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_007426	CCGG	2	8	133908	133915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007426	ACGG	2	8	133993	134000	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_007426	TTGA	2	8	135657	135664	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007426	GCGG	2	8	139062	139069	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_007426	GCGG	2	8	139116	139123	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_007426	GTTG	2	8	142764	142771	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007426	TACC	2	8	144110	144117	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_007426	CGGC	2	8	147701	147708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_007426	GCGG	2	8	150585	150592	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_007426	TCCC	2	8	153006	153013	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_007426	GAGT	2	8	153216	153223	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007426	CTGT	2	8	153800	153807	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_007426	ACCG	2	8	153951	153958	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007426	CTTC	2	8	157413	157420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007426	TCGG	2	8	158966	158973	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_007426	ACAG	2	8	159566	159573	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_007426	CGGA	2	8	159645	159652	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_007426	ACTC	2	8	159712	159719	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_007426	GACA	2	8	159885	159892	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_007426	GCGG	2	8	165470	165477	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
39	NC_007426	GACT	2	8	165855	165862	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007426	GGCT	2	8	166096	166103	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_007426	GCCG	2	8	178529	178536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_007426	ACCG	2	8	181690	181697	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007426	CGGC	2	8	188349	188356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_007426	TGAG	2	8	188447	188454	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007426	ACCG	2	8	188952	188959	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_007426	CATT	2	8	193709	193716	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007426	GGCC	2	8	195058	195065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007426	TTGA	2	8	206004	206011	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007426	ACGT	2	8	210366	210373	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_007426	ACGT	2	8	210578	210585	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_007426	GGGC	2	8	210706	210713	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_007426	CCCA	2	8	210904	210911	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
53	NC_007426	GAAT	2	8	210938	210945	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007426	AGGT	2	8	211293	211300	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007426	GCAC	2	8	211912	211919	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_007426	CCTA	2	8	211933	211940	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007426	AGGC	2	8	212307	212314	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_007426	CTCG	2	8	212618	212625	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_007426	TCGG	2	8	213181	213188	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_007426	CAAA	2	8	213433	213440	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_007426	AGTC	2	8	213808	213815	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_007426	TCGG	2	8	214394	214401	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_007426	TTCC	2	8	214803	214810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007426	GACC	2	8	216024	216031	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_007426	AATG	2	8	216716	216723	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007426	GGAG	2	8	217339	217346	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007426	CGAC	2	8	217735	217742	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_007426	CGAC	2	8	217744	217751	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_007426	CGGG	2	8	225407	225414	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_007426	CGTT	2	8	227001	227008	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_007426	CAGT	2	8	228042	228049	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_007426	CAGC	2	8	232936	232943	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_007426	CACC	2	8	235092	235099	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
74	NC_007426	CACC	2	8	235672	235679	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
75	NC_007426	CCGG	2	8	238111	238118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_007426	AAGC	2	8	238682	238689	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_007426	CCGA	2	8	242798	242805	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_007426	GAAA	2	8	243103	243110	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007426	TCGC	2	8	256881	256888	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_007426	CCGG	2	8	260361	260368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_007426	CGAC	2	8	260889	260896	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007426	TTTC	2	8	261037	261044	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_007426	CGTC	2	8	262642	262649	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_007426	CGAG	2	8	262889	262896	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_007426	TCAG	2	8	266526	266533	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_007426	GCCG	3	12	271977	271988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_007426	ATTA	2	8	276369	276376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007426	GCGG	2	8	280075	280082	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
89	NC_007426	ACGC	2	8	280084	280091	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_007426	TACG	2	8	284732	284739	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_007426	GGCT	2	8	284817	284824	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_007426	GGTT	2	8	288407	288414	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007426	AATA	2	8	302362	302369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007426	CCCG	2	8	302973	302980	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
95	NC_007426	TCGG	2	8	302991	302998	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_007426	GTTA	2	8	307262	307269	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007426	CGGC	2	8	314871	314878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_007426	GACC	2	8	319615	319622	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_007426	CAGC	2	8	328662	328669	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_007426	TCGT	2	8	331760	331767	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_007426	TGGT	2	8	333741	333748	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007426	GGCG	2	8	336289	336296	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103	NC_007426	GAAC	2	8	342632	342639	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_007426	GTAC	2	8	355186	355193	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_007426	GTTT	2	8	355357	355364	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007426	CGCT	2	8	355446	355453	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_007426	TCGC	2	8	357097	357104	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_007426	CCCG	2	8	357141	357148	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
109	NC_007426	TCTT	2	8	361497	361504	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_007426	GTGC	2	8	361551	361558	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_007426	GCGT	2	8	361670	361677	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_007426	TTTG	2	8	372903	372910	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007426	ACGG	2	8	378578	378585	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_007426	CGGC	2	8	378602	378609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_007426	GACC	2	8	380423	380430	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_007426	GTTC	2	8	391697	391704	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_007426	CGAC	2	8	397285	397292	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_007426	TCGG	2	8	398738	398745	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_007426	TCCC	2	8	398773	398780	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
120	NC_007426	TTCA	2	8	400444	400451	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_007426	CTGA	2	8	400623	400630	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_007426	CTTT	2	8	405672	405679	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_007426	GCCG	2	8	405680	405687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_007426	AGCC	2	8	407140	407147	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_007426	GTTT	2	8	407224	407231	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007426	TCGT	2	8	410789	410796	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_007426	CGAC	2	8	411409	411416	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_007426	GGCC	2	8	420937	420944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_007426	GTCG	2	8	421039	421046	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_007426	GCCG	3	12	422650	422661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_007426	CGAC	2	8	432820	432827	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_007426	CCGC	2	8	434843	434850	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
133	NC_007426	GTCC	2	8	434886	434893	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_007426	CGCC	2	8	436045	436052	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
135	NC_007426	CTGC	2	8	437996	438003	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_007426	CTGA	2	8	439951	439958	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_007426	GGCT	2	8	440012	440019	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_007426	GCCG	2	8	442119	442126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_007426	TGAC	2	8	447618	447625	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_007426	GACG	2	8	450485	450492	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_007426	ACCA	2	8	458853	458860	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_007426	GCCA	2	8	464484	464491	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_007426	TCGG	2	8	469383	469390	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_007426	CACC	2	8	472974	472981	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
145	NC_007426	CGGA	2	8	474269	474276	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_007426	ACCC	2	8	478614	478621	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
147	NC_007426	AGGG	2	8	478805	478812	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007426	CGAA	2	8	478903	478910	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_007426	AGCG	2	8	479192	479199	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_007426	GCGG	2	8	484348	484355	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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498	NC_007426	CGCT	2	8	1616282	1616289	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
499	NC_007426	CGTT	2	8	1617392	1617399	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
500	NC_007426	AGTC	2	8	1620510	1620517	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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