MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 EDL933 plasmid pO157

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007414	CCGGG	2	10	1468	1477	0 %	0 %	60 %	40 %	75994450
2	NC_007414	GCCCC	2	10	4393	4402	0 %	0 %	20 %	80 %	75994456
3	NC_007414	GGGTT	2	10	4920	4929	0 %	40 %	60 %	0 %	75994457
4	NC_007414	GAAGA	2	10	7914	7923	60 %	0 %	40 %	0 %	75994463
5	NC_007414	GTCTT	2	10	12341	12350	0 %	60 %	20 %	20 %	75994466
6	NC_007414	AAAAC	2	10	13065	13074	80 %	0 %	0 %	20 %	75994466
7	NC_007414	ATGCG	2	10	13964	13973	20 %	20 %	40 %	20 %	75994466
8	NC_007414	TGGTA	2	10	18965	18974	20 %	40 %	40 %	0 %	75994473
9	NC_007414	GTTCC	2	10	20804	20813	0 %	40 %	20 %	40 %	75994474
10	NC_007414	GATGG	2	10	24445	24454	20 %	20 %	60 %	0 %	75994477
11	NC_007414	GCTGA	2	10	24798	24807	20 %	20 %	40 %	20 %	75994477
12	NC_007414	GTTTT	2	10	26025	26034	0 %	80 %	20 %	0 %	75994478
13	NC_007414	GTCAG	2	10	29837	29846	20 %	20 %	40 %	20 %	75994480
14	NC_007414	CCCTT	2	10	30768	30777	0 %	40 %	0 %	60 %	75994481
15	NC_007414	GAGGT	2	10	32270	32279	20 %	20 %	60 %	0 %	75994483
16	NC_007414	GAGGT	2	10	34725	34734	20 %	20 %	60 %	0 %	75994487
17	NC_007414	AGTGG	2	10	35685	35694	20 %	20 %	60 %	0 %	75994488
18	NC_007414	CGCTT	2	10	36012	36021	0 %	40 %	20 %	40 %	75994488
19	NC_007414	TTTCG	2	10	36688	36697	0 %	60 %	20 %	20 %	75994489
20	NC_007414	GGTTA	2	10	36713	36722	20 %	40 %	40 %	0 %	75994489
21	NC_007414	TGTTA	2	10	43774	43783	20 %	60 %	20 %	0 %	75994495
22	NC_007414	CAGGT	2	10	44117	44126	20 %	20 %	40 %	20 %	75994495
23	NC_007414	AGAAC	2	10	44825	44834	60 %	0 %	20 %	20 %	75994495
24	NC_007414	TCTCT	2	10	45202	45211	0 %	60 %	0 %	40 %	75994496
25	NC_007414	CAGAA	2	10	45589	45598	60 %	0 %	20 %	20 %	75994496
26	NC_007414	AATGG	2	10	46546	46555	40 %	20 %	40 %	0 %	75994497
27	NC_007414	CACAC	2	10	48047	48056	40 %	0 %	0 %	60 %	75994500
28	NC_007414	CAGCA	2	10	51534	51543	40 %	0 %	20 %	40 %	75994507
29	NC_007414	GGCGT	2	10	60834	60843	0 %	20 %	60 %	20 %	75994519
30	NC_007414	GCTGG	2	10	62336	62345	0 %	20 %	60 %	20 %	75994520
31	NC_007414	CCGCC	2	10	64009	64018	0 %	0 %	20 %	80 %	75994522
32	NC_007414	ACCGT	2	10	64769	64778	20 %	20 %	20 %	40 %	75994523
33	NC_007414	TGTAC	2	10	65004	65013	20 %	40 %	20 %	20 %	75994524
34	NC_007414	GGAAG	2	10	65680	65689	40 %	0 %	60 %	0 %	75994525
35	NC_007414	GGCGG	2	10	65870	65879	0 %	0 %	80 %	20 %	75994525
36	NC_007414	CCGGG	2	10	67092	67101	0 %	0 %	60 %	40 %	75994527
37	NC_007414	GGCGG	2	10	69163	69172	0 %	0 %	80 %	20 %	75994529
38	NC_007414	AAGTG	2	10	71220	71229	40 %	20 %	40 %	0 %	161367665
39	NC_007414	ACTGA	2	10	72532	72541	40 %	20 %	20 %	20 %	75994533
40	NC_007414	TTACG	2	10	75448	75457	20 %	40 %	20 %	20 %	75994537
41	NC_007414	TCTAC	2	10	78926	78935	20 %	40 %	0 %	40 %	75994541
42	NC_007414	GACTT	2	10	79782	79791	20 %	40 %	20 %	20 %	75994541
43	NC_007414	ATCAG	2	10	80014	80023	40 %	20 %	20 %	20 %	75994541
44	NC_007414	AAACG	2	10	81758	81767	60 %	0 %	20 %	20 %	75994541
45	NC_007414	TGCAT	2	10	82684	82693	20 %	40 %	20 %	20 %	75994541
46	NC_007414	GAAAG	2	10	82840	82849	60 %	0 %	40 %	0 %	75994541
47	NC_007414	AAAAT	2	10	83532	83541	80 %	20 %	0 %	0 %	75994541
48	NC_007414	CATTC	2	10	83720	83729	20 %	40 %	0 %	40 %	75994541
49	NC_007414	AATTA	2	10	84280	84289	60 %	40 %	0 %	0 %	75994541
50	NC_007414	ATATT	2	10	85599	85608	40 %	60 %	0 %	0 %	75994541
51	NC_007414	GATGT	2	10	85692	85701	20 %	40 %	40 %	0 %	75994541
52	NC_007414	TTTAT	2	10	85924	85933	20 %	80 %	0 %	0 %	75994541
53	NC_007414	TAAAT	2	10	86365	86374	60 %	40 %	0 %	0 %	75994541
54	NC_007414	AGAAA	2	10	86377	86386	80 %	0 %	20 %	0 %	75994541
55	NC_007414	ATTGT	2	10	87251	87260	20 %	60 %	20 %	0 %	75994541
56	NC_007414	TGATT	2	10	87601	87610	20 %	60 %	20 %	0 %	75994541
57	NC_007414	CGCCC	2	10	89169	89178	0 %	0 %	20 %	80 %	75994544
58	NC_007414	ACCGG	2	10	89438	89447	20 %	0 %	40 %	40 %	75994544
59	NC_007414	ACCTG	2	10	90047	90056	20 %	20 %	20 %	40 %	75994544
60	NC_007414	CTGGT	2	10	90385	90394	0 %	40 %	40 %	20 %	75994545
61	NC_007414	GAACG	2	10	90836	90845	40 %	0 %	40 %	20 %	75994545

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.