MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli O157:H7 EDL933 plasmid pO157

Total Repeats: 263

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007414	TGCC	2	8	420	427	0 %	25 %	25 %	50 %	75994448
2	NC_007414	CCTC	2	8	568	575	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_007414	TGGA	2	8	787	794	25 %	25 %	50 %	0 %	75994449
4	NC_007414	GACT	2	8	837	844	25 %	25 %	25 %	25 %	75994449
5	NC_007414	GACA	2	8	1339	1346	50 %	0 %	25 %	25 %	75994450
6	NC_007414	GAAT	2	8	1443	1450	50 %	25 %	25 %	0 %	75994450
7	NC_007414	TAAA	2	8	1606	1613	75 %	25 %	0 %	0 %	75994450
8	NC_007414	TCAT	2	8	1629	1636	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_007414	TAAT	2	8	1878	1885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007414	AGGC	2	8	2127	2134	25 %	0 %	50 %	25 %	75994452
11	NC_007414	CAGA	2	8	2489	2496	50 %	0 %	25 %	25 %	75994453
12	NC_007414	TGGC	2	8	2805	2812	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_007414	GCTC	2	8	3004	3011	0 %	25 %	25 %	50 %	75994454
14	NC_007414	TACC	2	8	3429	3436	25 %	25 %	0 %	50 %	75994455
15	NC_007414	CCGA	2	8	3472	3479	25 %	0 %	25 %	50 %	75994455
16	NC_007414	CAGA	2	8	3664	3671	50 %	0 %	25 %	25 %	75994455
17	NC_007414	CATT	2	8	4207	4214	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_007414	GACA	2	8	4248	4255	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_007414	CCCT	2	8	4370	4377	0 %	25 %	0 %	75 %	75994456
20	NC_007414	ATCA	2	8	4654	4661	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_007414	CTGC	2	8	5727	5734	0 %	25 %	25 %	50 %	75994459
22	NC_007414	CTTC	2	8	5945	5952	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007414	CCAG	2	8	6954	6961	25 %	0 %	25 %	50 %	75994461
24	NC_007414	TCCG	2	8	7029	7036	0 %	25 %	25 %	50 %	75994461
25	NC_007414	CTTT	2	8	7656	7663	0 %	75 %	0 %	25 %	75994463
26	NC_007414	TTAT	2	8	8034	8041	25 %	75 %	0 %	0 %	75994463
27	NC_007414	AAAT	2	8	8260	8267	75 %	25 %	0 %	0 %	75994463
28	NC_007414	TGAT	2	8	8700	8707	25 %	50 %	25 %	0 %	75994463
29	NC_007414	GAAA	2	8	8955	8962	75 %	0 %	25 %	0 %	75994463
30	NC_007414	TACA	2	8	9379	9386	50 %	25 %	0 %	25 %	75994463
31	NC_007414	CCTC	2	8	9605	9612	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_007414	GTTG	2	8	10021	10028	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007414	ATAC	2	8	10044	10051	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_007414	TTAC	2	8	10580	10587	25 %	50 %	0 %	25 %	75994465
35	NC_007414	GTAT	2	8	10767	10774	25 %	50 %	25 %	0 %	75994465
36	NC_007414	GTGG	2	8	10947	10954	0 %	25 %	75 %	0 %	75994465
37	NC_007414	AACA	2	8	11124	11131	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_007414	CAAA	2	8	11567	11574	75 %	0 %	0 %	25 %	75994466
39	NC_007414	ACAA	2	8	11675	11682	75 %	0 %	0 %	25 %	75994466
40	NC_007414	ACTG	2	8	11683	11690	25 %	25 %	25 %	25 %	75994466
41	NC_007414	TATC	2	8	12798	12805	25 %	50 %	0 %	25 %	75994466
42	NC_007414	ACTG	2	8	13599	13606	25 %	25 %	25 %	25 %	75994466
43	NC_007414	CATC	2	8	13676	13683	25 %	25 %	0 %	50 %	75994466
44	NC_007414	AAAC	2	8	14140	14147	75 %	0 %	0 %	25 %	75994466
45	NC_007414	GGAC	2	8	14460	14467	25 %	0 %	50 %	25 %	75994466
46	NC_007414	TGCC	2	8	15186	15193	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_007414	AATA	2	8	16015	16022	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007414	AAAT	2	8	16440	16447	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007414	AATA	2	8	16507	16514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007414	CTGC	2	8	16610	16617	0 %	25 %	25 %	50 %	75994470
51	NC_007414	ACGT	2	8	17627	17634	25 %	25 %	25 %	25 %	75994472
52	NC_007414	GCAG	2	8	17636	17643	25 %	0 %	50 %	25 %	75994472
53	NC_007414	TTAT	2	8	17961	17968	25 %	75 %	0 %	0 %	75994472
54	NC_007414	GGCT	2	8	18052	18059	0 %	25 %	50 %	25 %	75994472
55	NC_007414	TAAT	2	8	18138	18145	50 %	50 %	0 %	0 %	75994472
56	NC_007414	CCTT	2	8	18338	18345	0 %	50 %	0 %	50 %	75994473
57	NC_007414	CGGG	2	8	19021	19028	0 %	0 %	75 %	25 %	75994473
58	NC_007414	CAGC	2	8	19147	19154	25 %	0 %	25 %	50 %	75994473
59	NC_007414	TGAA	2	8	19986	19993	50 %	25 %	25 %	0 %	75994474
60	NC_007414	GCAG	2	8	20293	20300	25 %	0 %	50 %	25 %	75994474
61	NC_007414	ACCA	2	8	20321	20328	50 %	0 %	0 %	50 %	75994474
62	NC_007414	GCAG	2	8	21178	21185	25 %	0 %	50 %	25 %	75994475
63	NC_007414	GCAC	2	8	21743	21750	25 %	0 %	25 %	50 %	75994475
64	NC_007414	TCGT	2	8	22051	22058	0 %	50 %	25 %	25 %	75994475
65	NC_007414	TCAG	2	8	22198	22205	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_007414	ACCA	2	8	22233	22240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_007414	TGCT	2	8	22813	22820	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_007414	GCTT	2	8	22838	22845	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_007414	ATGA	2	8	23028	23035	50 %	25 %	25 %	0 %	75994477
70	NC_007414	ATTT	2	8	23139	23146	25 %	75 %	0 %	0 %	75994477
71	NC_007414	GTCC	2	8	23289	23296	0 %	25 %	25 %	50 %	75994477
72	NC_007414	AAAC	2	8	23492	23499	75 %	0 %	0 %	25 %	75994477
73	NC_007414	CTGC	2	8	23805	23812	0 %	25 %	25 %	50 %	75994477
74	NC_007414	CAAA	2	8	24492	24499	75 %	0 %	0 %	25 %	75994477
75	NC_007414	GGCA	2	8	25405	25412	25 %	0 %	50 %	25 %	75994477
76	NC_007414	TTAT	2	8	25835	25842	25 %	75 %	0 %	0 %	75994478
77	NC_007414	ACAG	2	8	26196	26203	50 %	0 %	25 %	25 %	75994478
78	NC_007414	TTCT	2	8	26912	26919	0 %	75 %	0 %	25 %	75994479
79	NC_007414	GTAA	2	8	27074	27081	50 %	25 %	25 %	0 %	75994479
80	NC_007414	ACAG	2	8	28396	28403	50 %	0 %	25 %	25 %	75994479
81	NC_007414	TCAG	2	8	29531	29538	25 %	25 %	25 %	25 %	75994480
82	NC_007414	CACT	2	8	30299	30306	25 %	25 %	0 %	50 %	75994481
83	NC_007414	GAGG	2	8	32098	32105	25 %	0 %	75 %	0 %	75994483
84	NC_007414	CAGG	2	8	32301	32308	25 %	0 %	50 %	25 %	75994483
85	NC_007414	CGGA	2	8	32495	32502	25 %	0 %	50 %	25 %	75994484
86	NC_007414	GGGC	2	8	32636	32643	0 %	0 %	75 %	25 %	75994484
87	NC_007414	GCTG	2	8	33039	33046	0 %	25 %	50 %	25 %	75994485
88	NC_007414	TGAA	2	8	33340	33347	50 %	25 %	25 %	0 %	75994485
89	NC_007414	GCAG	2	8	33536	33543	25 %	0 %	50 %	25 %	75994486
90	NC_007414	ATTA	2	8	33667	33674	50 %	50 %	0 %	0 %	75994486
91	NC_007414	GATC	2	8	33792	33799	25 %	25 %	25 %	25 %	75994486
92	NC_007414	TCTG	2	8	33978	33985	0 %	50 %	25 %	25 %	75994486
93	NC_007414	TCAG	2	8	34232	34239	25 %	25 %	25 %	25 %	75994486
94	NC_007414	GGAG	2	8	34256	34263	25 %	0 %	75 %	0 %	75994486
95	NC_007414	GAGG	2	8	34305	34312	25 %	0 %	75 %	0 %	75994486
96	NC_007414	AACA	2	8	34329	34336	75 %	0 %	0 %	25 %	75994487
97	NC_007414	GACA	2	8	34601	34608	50 %	0 %	25 %	25 %	75994487
98	NC_007414	ACCC	2	8	35951	35958	25 %	0 %	0 %	75 %	75994488
99	NC_007414	GGCC	2	8	36269	36276	0 %	0 %	50 %	50 %	75994489
100	NC_007414	ATTC	2	8	36444	36451	25 %	50 %	0 %	25 %	75994489
101	NC_007414	TCTG	2	8	36662	36669	0 %	50 %	25 %	25 %	75994489
102	NC_007414	GGGA	2	8	36703	36710	25 %	0 %	75 %	0 %	75994489
103	NC_007414	AGCT	2	8	36734	36741	25 %	25 %	25 %	25 %	75994489
104	NC_007414	ATGG	2	8	36756	36763	25 %	25 %	50 %	0 %	75994489
105	NC_007414	GGCA	2	8	36767	36774	25 %	0 %	50 %	25 %	75994489
106	NC_007414	TCAG	2	8	36799	36806	25 %	25 %	25 %	25 %	75994489
107	NC_007414	CCCG	2	8	36857	36864	0 %	0 %	25 %	75 %	75994489
108	NC_007414	TCCA	2	8	37097	37104	25 %	25 %	0 %	50 %	75994490
109	NC_007414	GCAG	2	8	38475	38482	25 %	0 %	50 %	25 %	75994492
110	NC_007414	GTAA	2	8	38796	38803	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007414	ATCA	2	8	39091	39098	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_007414	TTAT	2	8	39288	39295	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007414	GAAA	2	8	39557	39564	75 %	0 %	25 %	0 %	75994493
114	NC_007414	GAAA	2	8	39808	39815	75 %	0 %	25 %	0 %	75994493
115	NC_007414	TAAA	2	8	39829	39836	75 %	25 %	0 %	0 %	75994494
116	NC_007414	TTCT	2	8	40522	40529	0 %	75 %	0 %	25 %	75994494
117	NC_007414	CTTT	2	8	40740	40747	0 %	75 %	0 %	25 %	75994494
118	NC_007414	GAGC	2	8	40770	40777	25 %	0 %	50 %	25 %	75994494
119	NC_007414	AATG	2	8	41067	41074	50 %	25 %	25 %	0 %	75994494
120	NC_007414	TGCT	2	8	41155	41162	0 %	50 %	25 %	25 %	75994494
121	NC_007414	AGAA	2	8	41450	41457	75 %	0 %	25 %	0 %	75994494
122	NC_007414	AACA	2	8	41589	41596	75 %	0 %	0 %	25 %	75994494
123	NC_007414	TATG	2	8	41783	41790	25 %	50 %	25 %	0 %	75994494
124	NC_007414	TTGC	2	8	42913	42920	0 %	50 %	25 %	25 %	75994495
125	NC_007414	TTGC	2	8	43570	43577	0 %	50 %	25 %	25 %	75994495
126	NC_007414	AATA	2	8	43884	43891	75 %	25 %	0 %	0 %	75994495
127	NC_007414	ATGG	2	8	44046	44053	25 %	25 %	50 %	0 %	75994495
128	NC_007414	TTCT	2	8	45455	45462	0 %	75 %	0 %	25 %	75994496
129	NC_007414	TAAA	2	8	45620	45627	75 %	25 %	0 %	0 %	75994496
130	NC_007414	AGGA	2	8	45689	45696	50 %	0 %	50 %	0 %	75994496
131	NC_007414	ATAC	2	8	46021	46028	50 %	25 %	0 %	25 %	75994496
132	NC_007414	GAAA	2	8	46300	46307	75 %	0 %	25 %	0 %	75994496
133	NC_007414	AAAC	2	8	46507	46514	75 %	0 %	0 %	25 %	75994497
134	NC_007414	CATC	2	8	47256	47263	25 %	25 %	0 %	50 %	75994499
135	NC_007414	CAAA	2	8	47417	47424	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_007414	AGTG	2	8	47672	47679	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007414	TGGA	2	8	47791	47798	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007414	GTGC	2	8	47832	47839	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_007414	CGCC	2	8	47850	47857	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
140	NC_007414	CGGG	2	8	48218	48225	0 %	0 %	75 %	25 %	75994500
141	NC_007414	CACT	2	8	48482	48489	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_007414	GACT	2	8	48634	48641	25 %	25 %	25 %	25 %	161367664
143	NC_007414	GAAT	2	8	49260	49267	50 %	25 %	25 %	0 %	161367664
144	NC_007414	CCCA	2	8	49272	49279	25 %	0 %	0 %	75 %	161367664
145	NC_007414	ACTG	2	8	49633	49640	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_007414	ACTT	2	8	49706	49713	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_007414	TCAT	2	8	49857	49864	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_007414	CAGA	2	8	50189	50196	50 %	0 %	25 %	25 %	75994505
149	NC_007414	CTTC	2	8	50824	50831	0 %	50 %	0 %	50 %	75994506
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152	NC_007414	CATA	2	8	51427	51434	50 %	25 %	0 %	25 %	75994506
153	NC_007414	TACA	2	8	51447	51454	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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191	NC_007414	ACTG	2	8	66162	66169	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
192	NC_007414	ATTT	2	8	66394	66401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_007414	GTCA	2	8	66433	66440	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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261	NC_007414	TGAA	2	8	91542	91549	50 %	25 %	25 %	0 %	75994546
262	NC_007414	CAGC	2	8	91764	91771	25 %	0 %	25 %	50 %	75994546
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.