MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 EDL933 plasmid pO157

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007414	CCTC	2	8	568	575	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_007414	TCAT	2	8	1629	1636	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_007414	TAAT	2	8	1878	1885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007414	TGGC	2	8	2805	2812	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007414	CATT	2	8	4207	4214	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_007414	GACA	2	8	4248	4255	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_007414	ATCA	2	8	4654	4661	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_007414	CTTC	2	8	5945	5952	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_007414	CCTC	2	8	9605	9612	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_007414	GTTG	2	8	10021	10028	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007414	ATAC	2	8	10044	10051	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_007414	AACA	2	8	11124	11131	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_007414	TGCC	2	8	15186	15193	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007414	AATA	2	8	16015	16022	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007414	AAAT	2	8	16440	16447	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007414	AATA	2	8	16507	16514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007414	TCAG	2	8	22198	22205	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_007414	ACCA	2	8	22233	22240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007414	TGCT	2	8	22813	22820	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_007414	GCTT	2	8	22838	22845	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_007414	GTAA	2	8	38796	38803	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007414	ATCA	2	8	39091	39098	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_007414	TTAT	2	8	39288	39295	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007414	CAAA	2	8	47417	47424	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_007414	AGTG	2	8	47672	47679	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007414	TGGA	2	8	47791	47798	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007414	GTGC	2	8	47832	47839	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_007414	CGCC	2	8	47850	47857	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_007414	CACT	2	8	48482	48489	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007414	ACTG	2	8	49633	49640	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_007414	ACTT	2	8	49706	49713	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_007414	TCAT	2	8	49857	49864	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_007414	TACA	2	8	51447	51454	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_007414	TCGC	2	8	55203	55210	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_007414	CGGG	2	8	61566	61573	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_007414	CCGG	2	8	61680	61687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_007414	GCGG	2	8	63306	63313	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_007414	GCGG	2	8	64255	64262	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
39	NC_007414	ACGG	2	8	64960	64967	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007414	ACTG	2	8	66162	66169	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_007414	ATTT	2	8	66394	66401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007414	GTCA	2	8	66433	66440	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_007414	GACT	2	8	70160	70167	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_007414	GGCG	2	8	74118	74125	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_007414	TAAG	2	8	77117	77124	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.