MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 EDL933 plasmid pO157

Total Repeats: 218

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007414	TGCC	2	8	420	427	0 %	25 %	25 %	50 %	75994448
2	NC_007414	TGGA	2	8	787	794	25 %	25 %	50 %	0 %	75994449
3	NC_007414	GACT	2	8	837	844	25 %	25 %	25 %	25 %	75994449
4	NC_007414	GACA	2	8	1339	1346	50 %	0 %	25 %	25 %	75994450
5	NC_007414	GAAT	2	8	1443	1450	50 %	25 %	25 %	0 %	75994450
6	NC_007414	TAAA	2	8	1606	1613	75 %	25 %	0 %	0 %	75994450
7	NC_007414	AGGC	2	8	2127	2134	25 %	0 %	50 %	25 %	75994452
8	NC_007414	CAGA	2	8	2489	2496	50 %	0 %	25 %	25 %	75994453
9	NC_007414	GCTC	2	8	3004	3011	0 %	25 %	25 %	50 %	75994454
10	NC_007414	TACC	2	8	3429	3436	25 %	25 %	0 %	50 %	75994455
11	NC_007414	CCGA	2	8	3472	3479	25 %	0 %	25 %	50 %	75994455
12	NC_007414	CAGA	2	8	3664	3671	50 %	0 %	25 %	25 %	75994455
13	NC_007414	CCCT	2	8	4370	4377	0 %	25 %	0 %	75 %	75994456
14	NC_007414	CTGC	2	8	5727	5734	0 %	25 %	25 %	50 %	75994459
15	NC_007414	CCAG	2	8	6954	6961	25 %	0 %	25 %	50 %	75994461
16	NC_007414	TCCG	2	8	7029	7036	0 %	25 %	25 %	50 %	75994461
17	NC_007414	CTTT	2	8	7656	7663	0 %	75 %	0 %	25 %	75994463
18	NC_007414	TTAT	2	8	8034	8041	25 %	75 %	0 %	0 %	75994463
19	NC_007414	AAAT	2	8	8260	8267	75 %	25 %	0 %	0 %	75994463
20	NC_007414	TGAT	2	8	8700	8707	25 %	50 %	25 %	0 %	75994463
21	NC_007414	GAAA	2	8	8955	8962	75 %	0 %	25 %	0 %	75994463
22	NC_007414	TACA	2	8	9379	9386	50 %	25 %	0 %	25 %	75994463
23	NC_007414	TTAC	2	8	10580	10587	25 %	50 %	0 %	25 %	75994465
24	NC_007414	GTAT	2	8	10767	10774	25 %	50 %	25 %	0 %	75994465
25	NC_007414	GTGG	2	8	10947	10954	0 %	25 %	75 %	0 %	75994465
26	NC_007414	CAAA	2	8	11567	11574	75 %	0 %	0 %	25 %	75994466
27	NC_007414	ACAA	2	8	11675	11682	75 %	0 %	0 %	25 %	75994466
28	NC_007414	ACTG	2	8	11683	11690	25 %	25 %	25 %	25 %	75994466
29	NC_007414	TATC	2	8	12798	12805	25 %	50 %	0 %	25 %	75994466
30	NC_007414	ACTG	2	8	13599	13606	25 %	25 %	25 %	25 %	75994466
31	NC_007414	CATC	2	8	13676	13683	25 %	25 %	0 %	50 %	75994466
32	NC_007414	AAAC	2	8	14140	14147	75 %	0 %	0 %	25 %	75994466
33	NC_007414	GGAC	2	8	14460	14467	25 %	0 %	50 %	25 %	75994466
34	NC_007414	CTGC	2	8	16610	16617	0 %	25 %	25 %	50 %	75994470
35	NC_007414	ACGT	2	8	17627	17634	25 %	25 %	25 %	25 %	75994472
36	NC_007414	GCAG	2	8	17636	17643	25 %	0 %	50 %	25 %	75994472
37	NC_007414	TTAT	2	8	17961	17968	25 %	75 %	0 %	0 %	75994472
38	NC_007414	GGCT	2	8	18052	18059	0 %	25 %	50 %	25 %	75994472
39	NC_007414	TAAT	2	8	18138	18145	50 %	50 %	0 %	0 %	75994472
40	NC_007414	CCTT	2	8	18338	18345	0 %	50 %	0 %	50 %	75994473
41	NC_007414	CGGG	2	8	19021	19028	0 %	0 %	75 %	25 %	75994473
42	NC_007414	CAGC	2	8	19147	19154	25 %	0 %	25 %	50 %	75994473
43	NC_007414	TGAA	2	8	19986	19993	50 %	25 %	25 %	0 %	75994474
44	NC_007414	GCAG	2	8	20293	20300	25 %	0 %	50 %	25 %	75994474
45	NC_007414	ACCA	2	8	20321	20328	50 %	0 %	0 %	50 %	75994474
46	NC_007414	GCAG	2	8	21178	21185	25 %	0 %	50 %	25 %	75994475
47	NC_007414	GCAC	2	8	21743	21750	25 %	0 %	25 %	50 %	75994475
48	NC_007414	TCGT	2	8	22051	22058	0 %	50 %	25 %	25 %	75994475
49	NC_007414	ATGA	2	8	23028	23035	50 %	25 %	25 %	0 %	75994477
50	NC_007414	ATTT	2	8	23139	23146	25 %	75 %	0 %	0 %	75994477
51	NC_007414	GTCC	2	8	23289	23296	0 %	25 %	25 %	50 %	75994477
52	NC_007414	AAAC	2	8	23492	23499	75 %	0 %	0 %	25 %	75994477
53	NC_007414	CTGC	2	8	23805	23812	0 %	25 %	25 %	50 %	75994477
54	NC_007414	CAAA	2	8	24492	24499	75 %	0 %	0 %	25 %	75994477
55	NC_007414	GGCA	2	8	25405	25412	25 %	0 %	50 %	25 %	75994477
56	NC_007414	TTAT	2	8	25835	25842	25 %	75 %	0 %	0 %	75994478
57	NC_007414	ACAG	2	8	26196	26203	50 %	0 %	25 %	25 %	75994478
58	NC_007414	TTCT	2	8	26912	26919	0 %	75 %	0 %	25 %	75994479
59	NC_007414	GTAA	2	8	27074	27081	50 %	25 %	25 %	0 %	75994479
60	NC_007414	ACAG	2	8	28396	28403	50 %	0 %	25 %	25 %	75994479
61	NC_007414	TCAG	2	8	29531	29538	25 %	25 %	25 %	25 %	75994480
62	NC_007414	CACT	2	8	30299	30306	25 %	25 %	0 %	50 %	75994481
63	NC_007414	GAGG	2	8	32098	32105	25 %	0 %	75 %	0 %	75994483
64	NC_007414	CAGG	2	8	32301	32308	25 %	0 %	50 %	25 %	75994483
65	NC_007414	CGGA	2	8	32495	32502	25 %	0 %	50 %	25 %	75994484
66	NC_007414	GGGC	2	8	32636	32643	0 %	0 %	75 %	25 %	75994484
67	NC_007414	GCTG	2	8	33039	33046	0 %	25 %	50 %	25 %	75994485
68	NC_007414	TGAA	2	8	33340	33347	50 %	25 %	25 %	0 %	75994485
69	NC_007414	GCAG	2	8	33536	33543	25 %	0 %	50 %	25 %	75994486
70	NC_007414	ATTA	2	8	33667	33674	50 %	50 %	0 %	0 %	75994486
71	NC_007414	GATC	2	8	33792	33799	25 %	25 %	25 %	25 %	75994486
72	NC_007414	TCTG	2	8	33978	33985	0 %	50 %	25 %	25 %	75994486
73	NC_007414	TCAG	2	8	34232	34239	25 %	25 %	25 %	25 %	75994486
74	NC_007414	GGAG	2	8	34256	34263	25 %	0 %	75 %	0 %	75994486
75	NC_007414	GAGG	2	8	34305	34312	25 %	0 %	75 %	0 %	75994486
76	NC_007414	AACA	2	8	34329	34336	75 %	0 %	0 %	25 %	75994487
77	NC_007414	GACA	2	8	34601	34608	50 %	0 %	25 %	25 %	75994487
78	NC_007414	ACCC	2	8	35951	35958	25 %	0 %	0 %	75 %	75994488
79	NC_007414	GGCC	2	8	36269	36276	0 %	0 %	50 %	50 %	75994489
80	NC_007414	ATTC	2	8	36444	36451	25 %	50 %	0 %	25 %	75994489
81	NC_007414	TCTG	2	8	36662	36669	0 %	50 %	25 %	25 %	75994489
82	NC_007414	GGGA	2	8	36703	36710	25 %	0 %	75 %	0 %	75994489
83	NC_007414	AGCT	2	8	36734	36741	25 %	25 %	25 %	25 %	75994489
84	NC_007414	ATGG	2	8	36756	36763	25 %	25 %	50 %	0 %	75994489
85	NC_007414	GGCA	2	8	36767	36774	25 %	0 %	50 %	25 %	75994489
86	NC_007414	TCAG	2	8	36799	36806	25 %	25 %	25 %	25 %	75994489
87	NC_007414	CCCG	2	8	36857	36864	0 %	0 %	25 %	75 %	75994489
88	NC_007414	TCCA	2	8	37097	37104	25 %	25 %	0 %	50 %	75994490
89	NC_007414	GCAG	2	8	38475	38482	25 %	0 %	50 %	25 %	75994492
90	NC_007414	GAAA	2	8	39557	39564	75 %	0 %	25 %	0 %	75994493
91	NC_007414	GAAA	2	8	39808	39815	75 %	0 %	25 %	0 %	75994493
92	NC_007414	TAAA	2	8	39829	39836	75 %	25 %	0 %	0 %	75994494
93	NC_007414	TTCT	2	8	40522	40529	0 %	75 %	0 %	25 %	75994494
94	NC_007414	CTTT	2	8	40740	40747	0 %	75 %	0 %	25 %	75994494
95	NC_007414	GAGC	2	8	40770	40777	25 %	0 %	50 %	25 %	75994494
96	NC_007414	AATG	2	8	41067	41074	50 %	25 %	25 %	0 %	75994494
97	NC_007414	TGCT	2	8	41155	41162	0 %	50 %	25 %	25 %	75994494
98	NC_007414	AGAA	2	8	41450	41457	75 %	0 %	25 %	0 %	75994494
99	NC_007414	AACA	2	8	41589	41596	75 %	0 %	0 %	25 %	75994494
100	NC_007414	TATG	2	8	41783	41790	25 %	50 %	25 %	0 %	75994494
101	NC_007414	TTGC	2	8	42913	42920	0 %	50 %	25 %	25 %	75994495
102	NC_007414	TTGC	2	8	43570	43577	0 %	50 %	25 %	25 %	75994495
103	NC_007414	AATA	2	8	43884	43891	75 %	25 %	0 %	0 %	75994495
104	NC_007414	ATGG	2	8	44046	44053	25 %	25 %	50 %	0 %	75994495
105	NC_007414	TTCT	2	8	45455	45462	0 %	75 %	0 %	25 %	75994496
106	NC_007414	TAAA	2	8	45620	45627	75 %	25 %	0 %	0 %	75994496
107	NC_007414	AGGA	2	8	45689	45696	50 %	0 %	50 %	0 %	75994496
108	NC_007414	ATAC	2	8	46021	46028	50 %	25 %	0 %	25 %	75994496
109	NC_007414	GAAA	2	8	46300	46307	75 %	0 %	25 %	0 %	75994496
110	NC_007414	AAAC	2	8	46507	46514	75 %	0 %	0 %	25 %	75994497
111	NC_007414	CATC	2	8	47256	47263	25 %	25 %	0 %	50 %	75994499
112	NC_007414	CGGG	2	8	48218	48225	0 %	0 %	75 %	25 %	75994500
113	NC_007414	GACT	2	8	48634	48641	25 %	25 %	25 %	25 %	161367664
114	NC_007414	GAAT	2	8	49260	49267	50 %	25 %	25 %	0 %	161367664
115	NC_007414	CCCA	2	8	49272	49279	25 %	0 %	0 %	75 %	161367664
116	NC_007414	CAGA	2	8	50189	50196	50 %	0 %	25 %	25 %	75994505
117	NC_007414	CTTC	2	8	50824	50831	0 %	50 %	0 %	50 %	75994506
118	NC_007414	GGCG	2	8	51187	51194	0 %	0 %	75 %	25 %	75994506
119	NC_007414	ATAC	2	8	51410	51417	50 %	25 %	0 %	25 %	75994506
120	NC_007414	CATA	2	8	51427	51434	50 %	25 %	0 %	25 %	75994506
121	NC_007414	CTCC	2	8	51507	51514	0 %	25 %	0 %	75 %	75994507
122	NC_007414	AGTG	2	8	52585	52592	25 %	25 %	50 %	0 %	75994510
123	NC_007414	CAGC	2	8	52837	52844	25 %	0 %	25 %	50 %	75994510
124	NC_007414	AGGA	2	8	52900	52907	50 %	0 %	50 %	0 %	75994510
125	NC_007414	CCAC	2	8	53418	53425	25 %	0 %	0 %	75 %	75994511
126	NC_007414	GATG	2	8	53625	53632	25 %	25 %	50 %	0 %	75994511
127	NC_007414	GACG	2	8	53639	53646	25 %	0 %	50 %	25 %	75994511
128	NC_007414	GTAA	2	8	53785	53792	50 %	25 %	25 %	0 %	75994511
129	NC_007414	CCAC	2	8	53799	53806	25 %	0 %	0 %	75 %	75994511
130	NC_007414	TTCC	2	8	53964	53971	0 %	50 %	0 %	50 %	75994511
131	NC_007414	TTCC	2	8	54788	54795	0 %	50 %	0 %	50 %	75994513
132	NC_007414	TGGA	2	8	56351	56358	25 %	25 %	50 %	0 %	75994514
133	NC_007414	ACTG	2	8	56868	56875	25 %	25 %	25 %	25 %	75994515
134	NC_007414	GAAT	2	8	57093	57100	50 %	25 %	25 %	0 %	75994515
135	NC_007414	GCTG	2	8	57120	57127	0 %	25 %	50 %	25 %	75994515
136	NC_007414	TGGT	2	8	58539	58546	0 %	50 %	50 %	0 %	75994517
137	NC_007414	CTTA	2	8	58884	58891	25 %	50 %	0 %	25 %	75994518
138	NC_007414	ACTC	2	8	59020	59027	25 %	25 %	0 %	50 %	75994518
139	NC_007414	ACAG	2	8	59467	59474	50 %	0 %	25 %	25 %	75994518
140	NC_007414	TGGA	2	8	59591	59598	25 %	25 %	50 %	0 %	75994518
141	NC_007414	AGGA	2	8	59813	59820	50 %	0 %	50 %	0 %	75994518
142	NC_007414	CTGG	2	8	60051	60058	0 %	25 %	50 %	25 %	75994518
143	NC_007414	GGAG	2	8	60454	60461	25 %	0 %	75 %	0 %	75994518
144	NC_007414	GTAT	2	8	60648	60655	25 %	50 %	25 %	0 %	75994519
145	NC_007414	GCTG	2	8	60873	60880	0 %	25 %	50 %	25 %	75994519
146	NC_007414	TTCA	2	8	61286	61293	25 %	50 %	0 %	25 %	75994519
147	NC_007414	TGGC	2	8	61408	61415	0 %	25 %	50 %	25 %	75994519
148	NC_007414	TGCG	2	8	61962	61969	0 %	25 %	50 %	25 %	75994520
149	NC_007414	GCAG	2	8	62451	62458	25 %	0 %	50 %	25 %	75994520
150	NC_007414	CAGT	2	8	63594	63601	25 %	25 %	25 %	25 %	75994522
151	NC_007414	GGCA	2	8	65293	65300	25 %	0 %	50 %	25 %	75994524
152	NC_007414	CGCT	2	8	67150	67157	0 %	25 %	25 %	50 %	75994527
153	NC_007414	CCCG	2	8	67262	67269	0 %	0 %	25 %	75 %	75994527
154	NC_007414	GCCA	2	8	68022	68029	25 %	0 %	25 %	50 %	75994527
155	NC_007414	CAGT	2	8	68304	68311	25 %	25 %	25 %	25 %	75994528
156	NC_007414	GTCT	2	8	68737	68744	0 %	50 %	25 %	25 %	75994528
157	NC_007414	CTGT	2	8	69114	69121	0 %	50 %	25 %	25 %	75994529
158	NC_007414	TGCC	2	8	69375	69382	0 %	25 %	25 %	50 %	75994529
159	NC_007414	CAGA	2	8	69858	69865	50 %	0 %	25 %	25 %	75994530
160	NC_007414	ACTA	2	8	70506	70513	50 %	25 %	0 %	25 %	161367665
161	NC_007414	GAAC	2	8	71523	71530	50 %	0 %	25 %	25 %	161367665
162	NC_007414	TCTG	2	8	71891	71898	0 %	50 %	25 %	25 %	161367665
163	NC_007414	GAAG	2	8	71988	71995	50 %	0 %	50 %	0 %	161367665
164	NC_007414	GGAT	2	8	72051	72058	25 %	25 %	50 %	0 %	161367665
165	NC_007414	TCAG	2	8	72089	72096	25 %	25 %	25 %	25 %	161367665
166	NC_007414	CTGG	2	8	72398	72405	0 %	25 %	50 %	25 %	161367665
167	NC_007414	GAGG	2	8	73355	73362	25 %	0 %	75 %	0 %	75994534
168	NC_007414	GTTC	2	8	74441	74448	0 %	50 %	25 %	25 %	75994537
169	NC_007414	TCAG	2	8	74519	74526	25 %	25 %	25 %	25 %	75994537
170	NC_007414	CCGG	2	8	74574	74581	0 %	0 %	50 %	50 %	75994537
171	NC_007414	ATGG	2	8	74715	74722	25 %	25 %	50 %	0 %	75994537
172	NC_007414	TTGA	2	8	75043	75050	25 %	50 %	25 %	0 %	75994537
173	NC_007414	CGGG	2	8	75062	75069	0 %	0 %	75 %	25 %	75994537
174	NC_007414	GCAG	2	8	75231	75238	25 %	0 %	50 %	25 %	75994537
175	NC_007414	GAAG	2	8	75606	75613	50 %	0 %	50 %	0 %	75994537
176	NC_007414	GTGG	2	8	75666	75673	0 %	25 %	75 %	0 %	75994537
177	NC_007414	TATC	2	8	77335	77342	25 %	50 %	0 %	25 %	75994539
178	NC_007414	CGTA	2	8	77466	77473	25 %	25 %	25 %	25 %	75994539
179	NC_007414	GGCT	2	8	77551	77558	0 %	25 %	50 %	25 %	75994539
180	NC_007414	CATC	2	8	77675	77682	25 %	25 %	0 %	50 %	75994539
181	NC_007414	GAAC	2	8	77953	77960	50 %	0 %	25 %	25 %	75994540
182	NC_007414	GTAA	2	8	78803	78810	50 %	25 %	25 %	0 %	75994541
183	NC_007414	TAAT	2	8	79083	79090	50 %	50 %	0 %	0 %	75994541
184	NC_007414	TACC	2	8	79432	79439	25 %	25 %	0 %	50 %	75994541
185	NC_007414	ATGA	2	8	79559	79566	50 %	25 %	25 %	0 %	75994541
186	NC_007414	TAAC	2	8	79794	79801	50 %	25 %	0 %	25 %	75994541
187	NC_007414	GTTT	2	8	80592	80599	0 %	75 %	25 %	0 %	75994541
188	NC_007414	AGTG	2	8	80815	80822	25 %	25 %	50 %	0 %	75994541
189	NC_007414	ATAA	2	8	80882	80889	75 %	25 %	0 %	0 %	75994541
190	NC_007414	CTAC	2	8	80930	80937	25 %	25 %	0 %	50 %	75994541
191	NC_007414	AATT	2	8	81214	81221	50 %	50 %	0 %	0 %	75994541
192	NC_007414	TTAT	2	8	81222	81229	25 %	75 %	0 %	0 %	75994541
193	NC_007414	CAAA	2	8	82946	82953	75 %	0 %	0 %	25 %	75994541
194	NC_007414	TTTA	2	8	83471	83478	25 %	75 %	0 %	0 %	75994541
195	NC_007414	AAAT	2	8	83553	83560	75 %	25 %	0 %	0 %	75994541
196	NC_007414	AGAA	2	8	83739	83746	75 %	0 %	25 %	0 %	75994541
197	NC_007414	ATGA	2	8	84053	84060	50 %	25 %	25 %	0 %	75994541
198	NC_007414	ATTT	2	8	84647	84654	25 %	75 %	0 %	0 %	75994541
199	NC_007414	TGAC	2	8	84735	84742	25 %	25 %	25 %	25 %	75994541
200	NC_007414	TGCA	2	8	84775	84782	25 %	25 %	25 %	25 %	75994541
201	NC_007414	AGGG	2	8	85206	85213	25 %	0 %	75 %	0 %	75994541
202	NC_007414	TGGT	2	8	85224	85231	0 %	50 %	50 %	0 %	75994541
203	NC_007414	CTAT	2	8	85628	85635	25 %	50 %	0 %	25 %	75994541
204	NC_007414	ACAG	2	8	85759	85766	50 %	0 %	25 %	25 %	75994541
205	NC_007414	CTGT	2	8	85808	85815	0 %	50 %	25 %	25 %	75994541
206	NC_007414	TAGT	2	8	87219	87226	25 %	50 %	25 %	0 %	75994541
207	NC_007414	AATA	2	8	87445	87452	75 %	25 %	0 %	0 %	75994541
208	NC_007414	CAGT	2	8	87483	87490	25 %	25 %	25 %	25 %	75994541
209	NC_007414	AAAG	2	8	87758	87765	75 %	0 %	25 %	0 %	75994541
210	NC_007414	CTCA	2	8	87929	87936	25 %	25 %	0 %	50 %	75994541
211	NC_007414	GATG	2	8	88142	88149	25 %	25 %	50 %	0 %	75994542
212	NC_007414	GTCT	2	8	88398	88405	0 %	50 %	25 %	25 %	75994542
213	NC_007414	TTTG	2	8	88528	88535	0 %	75 %	25 %	0 %	75994543
214	NC_007414	GTGG	2	8	90710	90717	0 %	25 %	75 %	0 %	75994545
215	NC_007414	CAGC	2	8	91495	91502	25 %	0 %	25 %	50 %	75994546
216	NC_007414	TGAA	2	8	91542	91549	50 %	25 %	25 %	0 %	75994546
217	NC_007414	CAGC	2	8	91764	91771	25 %	0 %	25 %	50 %	75994546
218	NC_007414	ATGC	2	8	91890	91897	25 %	25 %	25 %	25 %	75994546

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.