MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 EDL933 plasmid pO157

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007414	ATT	2	6	648	653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007414	ATA	2	6	661	666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007414	TTA	2	6	1080	1085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007414	GTA	2	6	2435	2440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007414	GAG	2	6	2472	2477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007414	AGA	2	6	2764	2769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007414	CAA	2	6	2941	2946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007414	CCT	2	6	3904	3909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_007414	AAT	2	6	3913	3918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007414	CCG	2	6	3954	3959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_007414	CAC	2	6	3976	3981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_007414	TCA	2	6	3997	4002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007414	GCC	2	6	4137	4142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_007414	ACT	2	6	4195	4200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007414	CAT	3	9	4455	4463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007414	TCT	2	6	4473	4478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007414	TCG	2	6	4561	4566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007414	CGG	2	6	4683	4688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007414	ATT	2	6	4745	4750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007414	ATT	2	6	5420	5425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007414	CCG	2	6	5749	5754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_007414	CGG	2	6	5815	5820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007414	CCG	2	6	5899	5904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_007414	TGC	2	6	5953	5958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007414	ACA	2	6	7336	7341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007414	TGA	2	6	9590	9595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007414	GAT	2	6	11159	11164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007414	AGC	2	6	15434	15439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007414	TCA	2	6	15449	15454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007414	CCA	2	6	15485	15490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_007414	TCA	2	6	15557	15562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007414	TAT	2	6	15902	15907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007414	TCT	2	6	16322	16327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007414	ATT	2	6	16330	16335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007414	TAT	3	9	16349	16357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007414	ATT	2	6	16363	16368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007414	AAT	2	6	16422	16427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007414	AGC	2	6	16478	16483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007414	ACA	2	6	16529	16534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007414	AGG	2	6	16754	16759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007414	TCG	2	6	16770	16775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007414	AGA	2	6	16803	16808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007414	TGT	2	6	16860	16865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007414	TGT	2	6	17197	17202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007414	AAT	2	6	17234	17239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007414	TGT	2	6	17271	17276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007414	ATT	2	6	17312	17317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007414	CGG	2	6	19251	19256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007414	AGG	2	6	21094	21099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007414	TGT	2	6	22722	22727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007414	ATA	3	9	22858	22866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007414	CTT	2	6	31376	31381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007414	AGG	2	6	36078	36083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007414	TAA	2	6	36942	36947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007414	TGT	2	6	36972	36977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007414	GTG	2	6	37498	37503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007414	ATG	2	6	37513	37518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007414	TAT	2	6	38909	38914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007414	TAA	2	6	39036	39041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007414	TAT	3	9	39154	39162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007414	TGT	2	6	39169	39174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007414	CTT	2	6	39222	39227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007414	AGG	2	6	42828	42833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007414	AGG	2	6	42847	42852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007414	AAT	2	6	46476	46481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007414	TAT	2	6	47094	47099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007414	GAA	2	6	47620	47625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007414	CTG	2	6	47658	47663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007414	CTT	2	6	47682	47687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007414	CAG	2	6	48299	48304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007414	GCA	2	6	48440	48445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007414	ATA	2	6	48497	48502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007414	ATA	2	6	51802	51807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007414	GTG	2	6	53265	53270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007414	GGT	2	6	54853	54858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007414	TCA	2	6	55046	55051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007414	TGA	2	6	55053	55058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007414	TTA	2	6	55076	55081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007414	TCT	2	6	55141	55146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007414	TTC	2	6	55180	55185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_007414	GCG	2	6	55230	55235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007414	ATA	2	6	55246	55251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007414	CTT	2	6	55271	55276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007414	AAC	2	6	55307	55312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007414	TGT	2	6	55342	55347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007414	TAA	2	6	55372	55377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007414	TCG	2	6	57661	57666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007414	TCG	2	6	57704	57709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007414	ATT	2	6	57715	57720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007414	GTC	2	6	57900	57905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007414	GAG	2	6	58207	58212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007414	AAT	2	6	58261	58266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007414	TGT	2	6	58614	58619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007414	AAG	2	6	58703	58708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007414	CTC	2	6	61613	61618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_007414	TGA	2	6	61759	61764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007414	GAC	2	6	61809	61814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_007414	CGC	2	6	63298	63303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_007414	CGC	2	6	64178	64183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_007414	CGT	2	6	64247	64252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007414	CGC	2	6	64312	64317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_007414	CCT	2	6	64333	64338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_007414	AAC	2	6	64512	64517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007414	GGA	2	6	64518	64523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007414	GGC	2	6	64968	64973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_007414	GCC	2	6	64977	64982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_007414	CGT	2	6	65485	65490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007414	CAC	2	6	65511	65516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_007414	TTG	2	6	65525	65530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007414	CAG	2	6	65557	65562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007414	GCG	2	6	66275	66280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007414	CAG	3	9	66320	66328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007414	AGG	2	6	66475	66480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007414	GGA	2	6	68879	68884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007414	GCG	2	6	69569	69574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007414	ATT	2	6	70485	70490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007414	GCA	2	6	72506	72511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007414	ATG	2	6	73771	73776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007414	GGT	2	6	73814	73819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007414	GCT	2	6	74186	74191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007414	GAG	2	6	76268	76273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007414	AGA	2	6	76789	76794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007414	AAT	2	6	77173	77178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007414	TGG	2	6	77271	77276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007414	ACA	2	6	77294	77299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007414	TGT	2	6	77822	77827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007414	TAA	2	6	78312	78317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007414	CTA	2	6	78429	78434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_007414	CAC	2	6	78443	78448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_007414	ACA	2	6	78469	78474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007414	ATT	2	6	78508	78513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007414	CAG	2	6	88099	88104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007414	CAG	2	6	88919	88924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_007414	TTA	2	6	91084	91089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007414	ACA	2	6	91094	91099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.