MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 EDL933 plasmid pO157

Total Repeats: 1106

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007414	CAT	2	6	78	83	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75994448
2	NC_007414	CAC	2	6	90	95	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75994448
3	NC_007414	CCA	2	6	97	102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75994448
4	NC_007414	AGC	2	6	138	143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994448
5	NC_007414	GGC	2	6	159	164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75994448
6	NC_007414	TGG	2	6	247	252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75994448
7	NC_007414	ATT	2	6	258	263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75994448
8	NC_007414	AGG	3	9	467	475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75994448
9	NC_007414	CCG	2	6	507	512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75994448
10	NC_007414	TGA	2	6	549	554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994448
11	NC_007414	GCA	2	6	846	851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994449
12	NC_007414	AAT	2	6	949	954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75994449
13	NC_007414	TAT	2	6	1173	1178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75994450
14	NC_007414	GTT	2	6	1223	1228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75994450
15	NC_007414	GGT	2	6	1332	1337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75994450
16	NC_007414	TGA	2	6	1347	1352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994450
17	NC_007414	GCC	2	6	1478	1483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75994450
18	NC_007414	ACA	2	6	1500	1505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75994450
19	NC_007414	TGC	2	6	1515	1520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994450
20	NC_007414	ACA	2	6	1543	1548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75994450
21	NC_007414	TCA	2	6	1703	1708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75994451
22	NC_007414	CAG	3	9	1782	1790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994451
23	NC_007414	ACC	2	6	1791	1796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75994451
24	NC_007414	ATT	2	6	1914	1919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75994452
25	NC_007414	ATT	2	6	1938	1943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75994452
26	NC_007414	CGG	2	6	2054	2059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75994452
27	NC_007414	ATG	2	6	2065	2070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994452
28	NC_007414	TTC	2	6	2107	2112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75994452
29	NC_007414	CTG	2	6	2172	2177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994452
30	NC_007414	ACA	2	6	2202	2207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75994452
31	NC_007414	GCT	2	6	2211	2216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994452
32	NC_007414	CAG	2	6	2217	2222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994452
33	NC_007414	ATG	2	6	2737	2742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994453
34	NC_007414	CTT	2	6	2993	2998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75994454
35	NC_007414	CAA	2	6	3052	3057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75994455
36	NC_007414	GCT	2	6	3261	3266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994455
37	NC_007414	CAC	2	6	3321	3326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75994455
38	NC_007414	CTG	2	6	3359	3364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994455
39	NC_007414	TGC	2	6	3504	3509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994455
40	NC_007414	CGT	2	6	3706	3711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994455
41	NC_007414	CGT	2	6	3826	3831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994455
42	NC_007414	GCG	2	6	4277	4282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75994456
43	NC_007414	ACA	2	6	4308	4313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75994456
44	NC_007414	AAC	2	6	4320	4325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75994456
45	NC_007414	TGT	2	6	4442	4447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75994456
46	NC_007414	CAA	2	6	4838	4843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75994457
47	NC_007414	GCC	2	6	4897	4902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75994457
48	NC_007414	AGG	3	9	4961	4969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75994457
49	NC_007414	CTG	2	6	5170	5175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994458
50	NC_007414	AAT	2	6	5443	5448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75994459
51	NC_007414	GCA	2	6	5569	5574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994459
52	NC_007414	AGC	2	6	6032	6037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994460
53	NC_007414	TGA	2	6	6042	6047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994460
54	NC_007414	GAC	2	6	6094	6099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994460
55	NC_007414	TTA	2	6	6159	6164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75994460
56	NC_007414	GTG	2	6	6326	6331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75994460
57	NC_007414	TGC	2	6	6524	6529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994460
58	NC_007414	CAG	2	6	6548	6553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994460
59	NC_007414	GGC	2	6	6606	6611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75994460
60	NC_007414	GCA	2	6	6632	6637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994460
61	NC_007414	ACC	2	6	6660	6665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75994460
62	NC_007414	TGC	2	6	6716	6721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994460
63	NC_007414	CAG	2	6	6745	6750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994460
64	NC_007414	CAC	2	6	6857	6862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75994461
65	NC_007414	GTT	2	6	6945	6950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75994461
66	NC_007414	CTG	2	6	6979	6984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994461
67	NC_007414	GCC	2	6	7071	7076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75994462
68	NC_007414	TCA	2	6	7147	7152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75994462
69	NC_007414	AGA	2	6	7166	7171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75994462
70	NC_007414	AAG	2	6	7198	7203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75994462
71	NC_007414	GCA	2	6	7221	7226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994462
72	NC_007414	GTA	2	6	7277	7282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994462
73	NC_007414	TTC	2	6	7401	7406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75994463
74	NC_007414	CTA	2	6	7468	7473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75994463
75	NC_007414	CTC	2	6	7494	7499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	75994463
76	NC_007414	CCA	2	6	7551	7556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75994463
77	NC_007414	TGG	2	6	7625	7630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75994463
78	NC_007414	ATG	2	6	7704	7709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994463
79	NC_007414	GTG	2	6	7725	7730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75994463
80	NC_007414	ACA	2	6	7959	7964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75994463
81	NC_007414	GCC	2	6	8015	8020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75994463
82	NC_007414	GAT	2	6	8126	8131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994463
83	NC_007414	GAG	2	6	8132	8137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75994463
84	NC_007414	GGA	2	6	8236	8241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75994463
85	NC_007414	GAA	2	6	8356	8361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75994463
86	NC_007414	TGA	2	6	8478	8483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994463
87	NC_007414	ACG	2	6	8489	8494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994463
88	NC_007414	ACC	2	6	8534	8539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75994463
89	NC_007414	GCG	2	6	8684	8689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75994463
90	NC_007414	AAT	2	6	8828	8833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75994463
91	NC_007414	GAA	2	6	8893	8898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75994463
92	NC_007414	TGC	2	6	8998	9003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994463
93	NC_007414	GAA	2	6	9060	9065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75994463
94	NC_007414	CAG	2	6	9120	9125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994463
95	NC_007414	ATT	2	6	9138	9143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75994463
96	NC_007414	GGT	2	6	9239	9244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75994463
97	NC_007414	TTC	2	6	9274	9279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75994463
98	NC_007414	CTG	2	6	9335	9340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994463
99	NC_007414	AGA	2	6	9373	9378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75994463
100	NC_007414	GAT	2	6	9494	9499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994463
101	NC_007414	AGA	2	6	9701	9706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75994464
102	NC_007414	TGA	2	6	9710	9715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994464
103	NC_007414	TCA	2	6	9756	9761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75994464
104	NC_007414	CTT	2	6	9777	9782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75994464
105	NC_007414	GAT	2	6	9801	9806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994464
106	NC_007414	TGA	2	6	9854	9859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994464
107	NC_007414	GAA	2	6	9866	9871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75994464
108	NC_007414	CTG	2	6	10180	10185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994465
109	NC_007414	CAT	2	6	10276	10281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75994465
110	NC_007414	ATC	2	6	10355	10360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75994465
111	NC_007414	GTT	2	6	10392	10397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75994465
112	NC_007414	TAC	2	6	10488	10493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75994465
113	NC_007414	TCA	2	6	10622	10627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75994465
114	NC_007414	AAG	2	6	10799	10804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75994465
115	NC_007414	CTG	2	6	10810	10815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994465
116	NC_007414	CGA	2	6	10969	10974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994465
117	NC_007414	TTA	2	6	11022	11027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75994465
118	NC_007414	GAT	2	6	11044	11049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994465
119	NC_007414	AGG	2	6	11280	11285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75994466
120	NC_007414	ATC	2	6	11319	11324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75994466
121	NC_007414	TTA	2	6	11380	11385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75994466
122	NC_007414	CAA	2	6	11486	11491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75994466
123	NC_007414	GAA	2	6	11505	11510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75994466
124	NC_007414	TGG	2	6	11592	11597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75994466
125	NC_007414	ACC	2	6	11633	11638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75994466
126	NC_007414	TGT	2	6	11736	11741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75994466
127	NC_007414	CAG	2	6	11788	11793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994466
128	NC_007414	TGA	2	6	11952	11957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994466
129	NC_007414	CAA	2	6	11982	11987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75994466
130	NC_007414	TGA	2	6	11994	11999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994466
131	NC_007414	TAA	2	6	12003	12008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75994466
132	NC_007414	GCA	2	6	12127	12132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994466
133	NC_007414	GAA	2	6	12168	12173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75994466
134	NC_007414	ACC	2	6	12256	12261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75994466
135	NC_007414	TCC	2	6	12305	12310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	75994466
136	NC_007414	GAT	2	6	12382	12387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994466
137	NC_007414	GCA	2	6	12425	12430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994466
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139	NC_007414	AAT	2	6	12571	12576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75994466
140	NC_007414	GTG	2	6	12590	12595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75994466
141	NC_007414	TGC	2	6	12717	12722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994466
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143	NC_007414	AAT	2	6	12781	12786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75994466
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148	NC_007414	CAA	2	6	13092	13097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75994466
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152	NC_007414	CTG	2	6	13432	13437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994466
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155	NC_007414	TGG	2	6	13646	13651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75994466
156	NC_007414	ATG	2	6	13694	13699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994466
157	NC_007414	AAC	2	6	13819	13824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75994466
158	NC_007414	TGG	2	6	13828	13833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75994466
159	NC_007414	AAC	2	6	14075	14080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75994466
160	NC_007414	GCC	3	9	14260	14268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75994466
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162	NC_007414	CAT	2	6	14373	14378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75994466
163	NC_007414	GTG	2	6	14399	14404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75994466
164	NC_007414	CAG	2	6	14505	14510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994466
165	NC_007414	CCG	2	6	14516	14521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75994466
166	NC_007414	CTG	2	6	14938	14943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994466
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168	NC_007414	TTC	2	6	15612	15617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75994468
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170	NC_007414	TAT	2	6	16219	16224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75994469
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213	NC_007414	CAG	2	6	20402	20407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994474
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234	NC_007414	AAG	2	6	22108	22113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75994475
235	NC_007414	CAA	2	6	22507	22512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75994476
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239	NC_007414	CTG	2	6	23280	23285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994477
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249	NC_007414	AAT	2	6	23763	23768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75994477
250	NC_007414	TGT	2	6	23905	23910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75994477
251	NC_007414	TAA	2	6	24026	24031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75994477
252	NC_007414	TGG	2	6	24104	24109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75994477
253	NC_007414	ATA	2	6	24250	24255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75994477
254	NC_007414	TGG	2	6	24290	24295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75994477
255	NC_007414	AAC	2	6	24429	24434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75994477
256	NC_007414	AAT	2	6	24516	24521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75994477
257	NC_007414	CTG	2	6	24589	24594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994477
258	NC_007414	ATC	2	6	24633	24638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75994477
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260	NC_007414	GTC	2	6	24822	24827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994477
261	NC_007414	ATA	2	6	24889	24894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75994477
262	NC_007414	GAC	2	6	25079	25084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994477
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265	NC_007414	AAG	2	6	25222	25227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75994477
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279	NC_007414	TTA	2	6	26277	26282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75994478
280	NC_007414	ATA	2	6	26322	26327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75994478
281	NC_007414	AAT	3	9	26351	26359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75994478
282	NC_007414	TAA	2	6	26443	26448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75994478
283	NC_007414	GCA	2	6	26572	26577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994478
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286	NC_007414	AGT	2	6	26977	26982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994479
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289	NC_007414	GTT	2	6	27053	27058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75994479
290	NC_007414	GGT	2	6	27064	27069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75994479
291	NC_007414	TGC	2	6	27108	27113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75994479
292	NC_007414	GTG	2	6	27146	27151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75994479
293	NC_007414	TGA	2	6	27177	27182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75994479
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371	NC_007414	GAG	2	6	32314	32319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75994483
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499	NC_007414	GGA	2	6	42078	42083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75994494
500	NC_007414	GAC	2	6	42090	42095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75994494

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