MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 EDL933 plasmid pO157

Total Repeats: 166

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007414	GA	3	6	50	55	50 %	0 %	50 %	0 %	75994448
2	NC_007414	TG	3	6	401	406	0 %	50 %	50 %	0 %	75994448
3	NC_007414	AT	3	6	1159	1164	50 %	50 %	0 %	0 %	75994450
4	NC_007414	TG	3	6	1200	1205	0 %	50 %	50 %	0 %	75994450
5	NC_007414	TG	4	8	2729	2736	0 %	50 %	50 %	0 %	75994453
6	NC_007414	GC	3	6	3541	3546	0 %	0 %	50 %	50 %	75994455
7	NC_007414	CA	3	6	4312	4317	50 %	0 %	0 %	50 %	75994456
8	NC_007414	CA	3	6	5349	5354	50 %	0 %	0 %	50 %	75994458
9	NC_007414	TG	3	6	6480	6485	0 %	50 %	50 %	0 %	75994460
10	NC_007414	TG	3	6	6863	6868	0 %	50 %	50 %	0 %	75994461
11	NC_007414	TA	3	6	8364	8369	50 %	50 %	0 %	0 %	75994463
12	NC_007414	AT	3	6	9162	9167	50 %	50 %	0 %	0 %	75994463
13	NC_007414	TA	3	6	9876	9881	50 %	50 %	0 %	0 %	75994464
14	NC_007414	AG	4	8	10325	10332	50 %	0 %	50 %	0 %	75994465
15	NC_007414	GC	3	6	10432	10437	0 %	0 %	50 %	50 %	75994465
16	NC_007414	CT	3	6	11256	11261	0 %	50 %	0 %	50 %	75994466
17	NC_007414	CA	4	8	11616	11623	50 %	0 %	0 %	50 %	75994466
18	NC_007414	TG	3	6	13013	13018	0 %	50 %	50 %	0 %	75994466
19	NC_007414	AT	3	6	13257	13262	50 %	50 %	0 %	0 %	75994466
20	NC_007414	AT	3	6	13573	13578	50 %	50 %	0 %	0 %	75994466
21	NC_007414	GC	3	6	14099	14104	0 %	0 %	50 %	50 %	75994466
22	NC_007414	CA	4	8	14493	14500	50 %	0 %	0 %	50 %	75994466
23	NC_007414	TG	3	6	18523	18528	0 %	50 %	50 %	0 %	75994473
24	NC_007414	GC	3	6	19383	19388	0 %	0 %	50 %	50 %	75994474
25	NC_007414	TC	3	6	19626	19631	0 %	50 %	0 %	50 %	75994474
26	NC_007414	AG	3	6	19667	19672	50 %	0 %	50 %	0 %	75994474
27	NC_007414	TA	3	6	19728	19733	50 %	50 %	0 %	0 %	75994474
28	NC_007414	TA	3	6	19773	19778	50 %	50 %	0 %	0 %	75994474
29	NC_007414	GA	3	6	20039	20044	50 %	0 %	50 %	0 %	75994474
30	NC_007414	TG	3	6	21291	21296	0 %	50 %	50 %	0 %	75994475
31	NC_007414	GA	3	6	21320	21325	50 %	0 %	50 %	0 %	75994475
32	NC_007414	CT	3	6	22571	22576	0 %	50 %	0 %	50 %	75994476
33	NC_007414	GA	3	6	23034	23039	50 %	0 %	50 %	0 %	75994477
34	NC_007414	AC	3	6	24734	24739	50 %	0 %	0 %	50 %	75994477
35	NC_007414	CA	3	6	25316	25321	50 %	0 %	0 %	50 %	75994477
36	NC_007414	TA	3	6	25702	25707	50 %	50 %	0 %	0 %	75994477
37	NC_007414	GC	3	6	25983	25988	0 %	0 %	50 %	50 %	75994478
38	NC_007414	GC	3	6	29583	29588	0 %	0 %	50 %	50 %	75994480
39	NC_007414	GC	3	6	29720	29725	0 %	0 %	50 %	50 %	75994480
40	NC_007414	CG	3	6	30330	30335	0 %	0 %	50 %	50 %	75994481
41	NC_007414	CG	3	6	30948	30953	0 %	0 %	50 %	50 %	75994481
42	NC_007414	CA	3	6	31243	31248	50 %	0 %	0 %	50 %	75994481
43	NC_007414	AG	3	6	32904	32909	50 %	0 %	50 %	0 %	75994485
44	NC_007414	GC	3	6	33233	33238	0 %	0 %	50 %	50 %	75994485
45	NC_007414	TG	3	6	36085	36090	0 %	50 %	50 %	0 %	75994489
46	NC_007414	AG	3	6	36608	36613	50 %	0 %	50 %	0 %	75994489
47	NC_007414	TA	3	6	37340	37345	50 %	50 %	0 %	0 %	75994490
48	NC_007414	TC	3	6	38367	38372	0 %	50 %	0 %	50 %	75994492
49	NC_007414	CT	3	6	39435	39440	0 %	50 %	0 %	50 %	75994493
50	NC_007414	AT	3	6	39508	39513	50 %	50 %	0 %	0 %	75994493
51	NC_007414	TA	3	6	39609	39614	50 %	50 %	0 %	0 %	75994493
52	NC_007414	TC	3	6	40214	40219	0 %	50 %	0 %	50 %	75994494
53	NC_007414	AT	3	6	40646	40651	50 %	50 %	0 %	0 %	75994494
54	NC_007414	CT	3	6	41144	41149	0 %	50 %	0 %	50 %	75994494
55	NC_007414	AT	3	6	41285	41290	50 %	50 %	0 %	0 %	75994494
56	NC_007414	AT	3	6	41477	41482	50 %	50 %	0 %	0 %	75994494
57	NC_007414	TA	3	6	41766	41771	50 %	50 %	0 %	0 %	75994494
58	NC_007414	AT	3	6	41986	41991	50 %	50 %	0 %	0 %	75994494
59	NC_007414	TA	3	6	42069	42074	50 %	50 %	0 %	0 %	75994494
60	NC_007414	AG	3	6	42418	42423	50 %	0 %	50 %	0 %	75994494
61	NC_007414	GA	3	6	42580	42585	50 %	0 %	50 %	0 %	75994494
62	NC_007414	TA	3	6	42630	42635	50 %	50 %	0 %	0 %	75994494
63	NC_007414	TA	3	6	42757	42762	50 %	50 %	0 %	0 %	75994494
64	NC_007414	CA	3	6	42785	42790	50 %	0 %	0 %	50 %	75994494
65	NC_007414	CA	4	8	42976	42983	50 %	0 %	0 %	50 %	75994495
66	NC_007414	TA	3	6	43117	43122	50 %	50 %	0 %	0 %	75994495
67	NC_007414	TC	3	6	43514	43519	0 %	50 %	0 %	50 %	75994495
68	NC_007414	GA	3	6	43613	43618	50 %	0 %	50 %	0 %	75994495
69	NC_007414	GA	3	6	44075	44080	50 %	0 %	50 %	0 %	75994495
70	NC_007414	TA	3	6	44422	44427	50 %	50 %	0 %	0 %	75994495
71	NC_007414	CA	3	6	44849	44854	50 %	0 %	0 %	50 %	75994495
72	NC_007414	CA	3	6	44922	44927	50 %	0 %	0 %	50 %	75994495
73	NC_007414	CA	3	6	45070	45075	50 %	0 %	0 %	50 %	75994496
74	NC_007414	GA	3	6	45090	45095	50 %	0 %	50 %	0 %	75994496
75	NC_007414	AT	3	6	46673	46678	50 %	50 %	0 %	0 %	75994497
76	NC_007414	AT	3	6	46805	46810	50 %	50 %	0 %	0 %	75994498
77	NC_007414	AT	3	6	46938	46943	50 %	50 %	0 %	0 %	75994498
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81	NC_007414	CG	3	6	50921	50926	0 %	0 %	50 %	50 %	75994506
82	NC_007414	CG	3	6	51070	51075	0 %	0 %	50 %	50 %	75994506
83	NC_007414	CG	3	6	51200	51205	0 %	0 %	50 %	50 %	75994506
84	NC_007414	AG	4	8	52139	52146	50 %	0 %	50 %	0 %	75994509
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88	NC_007414	GC	3	6	56680	56685	0 %	0 %	50 %	50 %	75994515
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90	NC_007414	TA	3	6	59188	59193	50 %	50 %	0 %	0 %	75994518
91	NC_007414	AT	3	6	59432	59437	50 %	50 %	0 %	0 %	75994518
92	NC_007414	CA	3	6	59802	59807	50 %	0 %	0 %	50 %	75994518
93	NC_007414	CA	3	6	60502	60507	50 %	0 %	0 %	50 %	75994518
94	NC_007414	AC	3	6	60881	60886	50 %	0 %	0 %	50 %	75994519
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96	NC_007414	TG	3	6	61086	61091	0 %	50 %	50 %	0 %	75994519
97	NC_007414	CA	3	6	62417	62422	50 %	0 %	0 %	50 %	75994520
98	NC_007414	TG	3	6	62469	62474	0 %	50 %	50 %	0 %	75994520
99	NC_007414	GC	3	6	63013	63018	0 %	0 %	50 %	50 %	75994521
100	NC_007414	CA	3	6	63273	63278	50 %	0 %	0 %	50 %	75994521
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102	NC_007414	CG	3	6	65647	65652	0 %	0 %	50 %	50 %	75994525
103	NC_007414	CA	3	6	66107	66112	50 %	0 %	0 %	50 %	75994525
104	NC_007414	CG	3	6	66951	66956	0 %	0 %	50 %	50 %	75994527
105	NC_007414	GA	3	6	67126	67131	50 %	0 %	50 %	0 %	75994527
106	NC_007414	GC	3	6	68334	68339	0 %	0 %	50 %	50 %	75994528
107	NC_007414	TG	3	6	68525	68530	0 %	50 %	50 %	0 %	75994528
108	NC_007414	GC	3	6	69928	69933	0 %	0 %	50 %	50 %	75994530
109	NC_007414	GA	3	6	70203	70208	50 %	0 %	50 %	0 %	75994531
110	NC_007414	AG	3	6	70447	70452	50 %	0 %	50 %	0 %	75994531
111	NC_007414	CG	3	6	71130	71135	0 %	0 %	50 %	50 %	161367665
112	NC_007414	GT	4	8	71686	71693	0 %	50 %	50 %	0 %	161367665
113	NC_007414	TG	3	6	72407	72412	0 %	50 %	50 %	0 %	161367665
114	NC_007414	AC	3	6	72622	72627	50 %	0 %	0 %	50 %	75994533
115	NC_007414	CT	3	6	73967	73972	0 %	50 %	0 %	50 %	75994535
116	NC_007414	GT	4	8	73979	73986	0 %	50 %	50 %	0 %	75994535
117	NC_007414	GT	3	6	73992	73997	0 %	50 %	50 %	0 %	75994535
118	NC_007414	GT	3	6	74792	74797	0 %	50 %	50 %	0 %	75994537
119	NC_007414	AT	3	6	75263	75268	50 %	50 %	0 %	0 %	75994537
120	NC_007414	GC	4	8	75402	75409	0 %	0 %	50 %	50 %	75994537
121	NC_007414	TG	3	6	75898	75903	0 %	50 %	50 %	0 %	75994537
122	NC_007414	AT	3	6	76167	76172	50 %	50 %	0 %	0 %	75994537
123	NC_007414	AT	3	6	76363	76368	50 %	50 %	0 %	0 %	75994538
124	NC_007414	AG	3	6	77872	77877	50 %	0 %	50 %	0 %	75994540
125	NC_007414	GA	3	6	78258	78263	50 %	0 %	50 %	0 %	75994540
126	NC_007414	AG	3	6	78631	78636	50 %	0 %	50 %	0 %	75994541
127	NC_007414	AT	3	6	79396	79401	50 %	50 %	0 %	0 %	75994541
128	NC_007414	GA	3	6	79921	79926	50 %	0 %	50 %	0 %	75994541
129	NC_007414	AT	3	6	80034	80039	50 %	50 %	0 %	0 %	75994541
130	NC_007414	AT	3	6	80649	80654	50 %	50 %	0 %	0 %	75994541
131	NC_007414	TA	3	6	81395	81400	50 %	50 %	0 %	0 %	75994541
132	NC_007414	AT	3	6	81529	81534	50 %	50 %	0 %	0 %	75994541
133	NC_007414	AG	3	6	81538	81543	50 %	0 %	50 %	0 %	75994541
134	NC_007414	TA	3	6	81562	81567	50 %	50 %	0 %	0 %	75994541
135	NC_007414	AT	3	6	81736	81741	50 %	50 %	0 %	0 %	75994541
136	NC_007414	AT	3	6	81819	81824	50 %	50 %	0 %	0 %	75994541
137	NC_007414	AT	3	6	82053	82058	50 %	50 %	0 %	0 %	75994541
138	NC_007414	TA	4	8	82360	82367	50 %	50 %	0 %	0 %	75994541
139	NC_007414	GA	3	6	82409	82414	50 %	0 %	50 %	0 %	75994541
140	NC_007414	AT	3	6	83393	83398	50 %	50 %	0 %	0 %	75994541
141	NC_007414	TA	3	6	83579	83584	50 %	50 %	0 %	0 %	75994541
142	NC_007414	TA	3	6	84159	84164	50 %	50 %	0 %	0 %	75994541
143	NC_007414	GT	3	6	84221	84226	0 %	50 %	50 %	0 %	75994541
144	NC_007414	CA	3	6	84358	84363	50 %	0 %	0 %	50 %	75994541
145	NC_007414	AT	4	8	84370	84377	50 %	50 %	0 %	0 %	75994541
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.