MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 chromosome

Total Repeats: 1118

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007413	ATTAA	2	10	9531	9540	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007413	ATTTT	2	10	16703	16712	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007413	CTTCT	2	10	27947	27956	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_007413	AATGC	2	10	45308	45317	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_007413	AACGT	2	10	45485	45494	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_007413	TTAAT	2	10	45709	45718	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007413	ATTTG	2	10	52394	52403	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007413	AGCGA	2	10	58976	58985	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_007413	TGATT	2	10	61919	61928	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007413	AAAGA	2	10	69737	69746	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007413	AAATT	2	10	88377	88386	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007413	AACTG	2	10	100223	100232	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_007413	ATACT	2	10	106780	106789	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_007413	CAGCA	2	10	112296	112305	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_007413	ACGCT	2	10	112319	112328	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_007413	AGCGA	2	10	118100	118109	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_007413	GAAAA	2	10	121212	121221	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007413	CAAAG	2	10	130499	130508	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_007413	TTCCC	2	10	131436	131445	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
20	NC_007413	TTCAA	2	10	139600	139609	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_007413	GCTAA	2	10	142691	142700	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_007413	GGCTT	2	10	153402	153411	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_007413	GCGTC	2	10	156045	156054	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_007413	AATTG	2	10	156082	156091	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007413	GAAAA	2	10	156481	156490	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007413	ATTAA	2	10	158043	158052	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007413	GTTTA	2	10	165415	165424	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007413	ATTAA	2	10	171411	171420	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007413	GGGGA	2	10	183442	183451	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007413	ATTTT	2	10	189257	189266	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007413	CTTTT	2	10	193196	193205	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_007413	AATTT	2	10	195337	195346	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007413	TTTTA	2	10	195435	195444	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007413	CAAAG	2	10	199827	199836	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_007413	ATGCA	2	10	208092	208101	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_007413	AAAAG	2	10	210749	210758	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007413	AAATT	2	10	212494	212503	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007413	TGGCA	2	10	212511	212520	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_007413	TGATT	2	10	223165	223174	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007413	TAAAA	2	10	223432	223441	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007413	ACATA	2	10	226188	226197	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_007413	TTTAA	2	10	243197	243206	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007413	CAAAC	2	10	243611	243620	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_007413	AATTG	2	10	252459	252468	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007413	GATTA	2	10	257834	257843	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007413	ACTTG	2	10	259455	259464	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_007413	TGAAT	2	10	260721	260730	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007413	CTATC	2	10	260777	260786	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_007413	GGGAT	2	10	261496	261505	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007413	CTTGG	2	10	263410	263419	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_007413	CAATT	2	10	267319	267328	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_007413	TACAG	2	10	271070	271079	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_007413	GGATG	2	10	275122	275131	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007413	AATTG	2	10	276440	276449	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007413	TAAAA	2	10	285426	285435	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007413	ATACT	2	10	285852	285861	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_007413	TATTT	2	10	287111	287120	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007413	AAGGG	2	10	296036	296045	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007413	TAAAA	2	10	299147	299156	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007413	ATTAC	2	10	299323	299332	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_007413	CTACC	2	10	312149	312158	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
62	NC_007413	CCCTT	2	10	314041	314050	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_007413	GCGTC	2	10	320975	320984	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_007413	AATTG	2	10	321015	321024	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007413	AATTT	2	10	330349	330358	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007413	AGTCA	2	10	330422	330431	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_007413	TAAAA	2	10	333689	333698	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007413	AAATG	2	10	337271	337280	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007413	GTAGG	2	10	342582	342591	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007413	TTTCA	2	10	345330	345339	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_007413	TAAAT	2	10	345428	345437	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007413	AAAGT	2	10	352180	352189	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007413	AATTA	2	10	353286	353295	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007413	ATTTA	2	10	353992	354001	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007413	TTAAA	2	10	354178	354187	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007413	TTACG	2	10	360196	360205	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_007413	ACCAC	2	10	368551	368560	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
78	NC_007413	TTATT	2	10	368613	368622	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007413	AAAAC	2	10	381076	381085	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_007413	ATTTG	2	10	386471	386480	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007413	TTCCA	2	10	386920	386929	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_007413	CATAG	2	10	387298	387307	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_007413	TAATT	2	10	420776	420785	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007413	AAAAT	2	10	426271	426280	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007413	TGCAA	2	10	432129	432138	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_007413	AATTA	2	10	434235	434244	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007413	AGAAC	2	10	436778	436787	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_007413	TAAAG	2	10	451990	451999	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007413	GTTCT	2	10	465752	465761	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_007413	ACTTG	2	10	466147	466156	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_007413	GTTCC	2	10	470693	470702	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_007413	GTTCC	2	10	470754	470763	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_007413	GTCTA	2	10	470784	470793	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_007413	GGAGA	2	10	470971	470980	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007413	AAGGG	2	10	472857	472866	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007413	AAGCC	2	10	482882	482891	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_007413	CTCGC	2	10	491352	491361	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
98	NC_007413	ACTTG	2	10	493939	493948	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_007413	AGTAA	2	10	505393	505402	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007413	ATTAA	2	10	510837	510846	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007413	ATGAG	2	10	511347	511356	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007413	TATAG	2	10	521716	521725	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007413	AAAAT	2	10	526748	526757	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007413	AAGGG	2	10	535515	535524	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007413	AGCGA	2	10	537564	537573	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_007413	TGAGA	2	10	541293	541302	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007413	GAGAT	2	10	542140	542149	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007413	GAGAA	2	10	543706	543715	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007413	AGGGA	2	10	555719	555728	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007413	AGAGG	2	10	563536	563545	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007413	TTTGA	2	10	566464	566473	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007413	CATCA	2	10	567131	567140	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_007413	TCGCT	2	10	568982	568991	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_007413	TAATT	2	10	571288	571297	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007413	TTAAG	2	10	571651	571660	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007413	GTTTT	2	10	572174	572183	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007413	AAGGG	2	10	577652	577661	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007413	ATTTT	2	10	580226	580235	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007413	ATAGC	2	10	584826	584835	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_007413	TCAAA	2	10	590448	590457	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_007413	GGAGT	2	10	592069	592078	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007413	TTTTG	2	10	594422	594431	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007413	TTTAC	2	10	601351	601360	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_007413	CTGAT	2	10	602616	602625	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_007413	TAATT	2	10	605619	605628	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007413	CTGTA	2	10	623543	623552	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_007413	AAGTG	2	10	624371	624380	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007413	TCTCC	2	10	645379	645388	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
129	NC_007413	TCCTC	2	10	649816	649825	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
130	NC_007413	CGCTA	2	10	651849	651858	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_007413	ATATT	2	10	652969	652978	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007413	AAATT	2	10	654667	654676	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007413	CTTAA	2	10	660097	660106	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_007413	TGATT	2	10	660299	660308	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007413	TCTCA	2	10	660682	660691	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_007413	TCAAT	2	10	665688	665697	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_007413	AATAT	2	10	672280	672289	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007413	TAGCG	2	10	700419	700428	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_007413	TACTC	2	10	702043	702052	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_007413	GTGTT	2	10	709976	709985	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007413	ATCTT	2	10	712631	712640	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_007413	TTTTG	2	10	717507	717516	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007413	AAGGG	2	10	717632	717641	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007413	CTTAG	2	10	750598	750607	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_007413	GATTT	2	10	750743	750752	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007413	ATCTG	2	10	758169	758178	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_007413	AAACT	2	10	758188	758197	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_007413	TTAGT	2	10	758231	758240	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007413	AACAA	2	10	764024	764033	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_007413	TCTTA	2	10	764906	764915	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_007413	TTAAT	2	10	770638	770647	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_007413	CTCTC	2	10	780131	780140	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
153	NC_007413	TGCAA	2	10	780382	780391	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
154	NC_007413	TTCTT	2	10	780557	780566	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
155	NC_007413	GAGTG	2	10	785815	785824	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
156	NC_007413	AATTA	2	10	786125	786134	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_007413	CAGTT	2	10	786541	786550	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
158	NC_007413	TACAG	2	10	791104	791113	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
159	NC_007413	ATTTA	2	10	813003	813012	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_007413	ATTTT	2	10	823806	823815	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_007413	GAGAA	2	10	828111	828120	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
163	NC_007413	TTAAC	2	10	840314	840323	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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165	NC_007413	AAGGG	2	10	840362	840371	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_007413	TTCTT	2	10	860585	860594	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
168	NC_007413	TTTTA	2	10	860705	860714	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_007413	ACAAA	2	10	881105	881114	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
170	NC_007413	TTTTG	2	10	891817	891826	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
171	NC_007413	ATTTA	2	10	892052	892061	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_007413	CAAAT	2	10	892134	892143	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
173	NC_007413	TATTT	2	10	903168	903177	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_007413	TTTTA	2	10	919129	919138	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_007413	AATTT	2	10	986224	986233	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_007413	TAGCC	2	10	992027	992036	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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190	NC_007413	TCGTG	2	10	1003932	1003941	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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193	NC_007413	GAATG	2	10	1007243	1007252	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_007413	AATTT	2	10	1044241	1044250	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_007413	CCCTT	2	10	1046007	1046016	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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259	NC_007413	ATTTG	2	10	1445743	1445752	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_007413	GTTTA	2	10	1517819	1517828	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_007413	TGATA	2	10	1585394	1585403	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
283	NC_007413	ATATT	2	10	1623371	1623380	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_007413	AATTA	2	10	1634314	1634323	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_007413	TTCAA	2	10	1640118	1640127	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
286	NC_007413	ATTTG	2	10	1645061	1645070	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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424	NC_007413	CATTA	2	10	2520536	2520545	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
425	NC_007413	TAGTT	2	10	2536904	2536913	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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487	NC_007413	ATTAA	2	10	2891916	2891925	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
488	NC_007413	AGAAA	2	10	2897006	2897015	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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