MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 chromosome

Total Repeats: 4214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007413	GTTTT	2	10	6101703	6101712	0 %	80 %	20 %	0 %	75911042
4002	NC_007413	AAGCA	2	10	6102757	6102766	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4003	NC_007413	AAATA	2	10	6103402	6103411	80 %	20 %	0 %	0 %	75911043
4004	NC_007413	AAGGG	2	10	6104243	6104252	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_007413	CAACC	2	10	6104989	6104998	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4006	NC_007413	CACAA	2	10	6106253	6106262	60 %	0 %	0 %	40 %	75911045
4007	NC_007413	GGCTT	2	10	6107157	6107166	0 %	40 %	40 %	20 %	75911045
4008	NC_007413	AACAC	2	10	6107770	6107779	60 %	0 %	0 %	40 %	75911045
4009	NC_007413	CCCTT	2	10	6108167	6108176	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4010	NC_007413	AAAGA	2	10	6111059	6111068	80 %	0 %	20 %	0 %	75911047
4011	NC_007413	TATTT	2	10	6111189	6111198	20 %	80 %	0 %	0 %	75911047
4012	NC_007413	AGAAA	2	10	6111730	6111739	80 %	0 %	20 %	0 %	75911047
4013	NC_007413	TACAA	2	10	6111938	6111947	60 %	20 %	0 %	20 %	75911047
4014	NC_007413	CTTGG	2	10	6113458	6113467	0 %	40 %	40 %	20 %	75911047
4015	NC_007413	ATTTG	2	10	6113623	6113632	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_007413	TCACT	2	10	6114885	6114894	20 %	40 %	0 %	40 %	75911049
4017	NC_007413	GTTGG	2	10	6116043	6116052	0 %	40 %	60 %	0 %	75911050
4018	NC_007413	TTTTG	2	10	6116508	6116517	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_007413	CCTAC	2	10	6117200	6117209	20 %	20 %	0 %	60 %	75911051
4020	NC_007413	AATTA	2	10	6118513	6118522	60 %	40 %	0 %	0 %	75911051
4021	NC_007413	TCCCA	2	10	6120198	6120207	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4022	NC_007413	ATGAC	2	10	6125216	6125225	40 %	20 %	20 %	20 %	75911057
4023	NC_007413	CGGTT	2	10	6126254	6126263	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4024	NC_007413	GAGAA	2	10	6126303	6126312	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_007413	TGGGG	2	10	6126822	6126831	0 %	20 %	80 %	0 %	75911058
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4029	NC_007413	TCGCT	2	10	6134126	6134135	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4030	NC_007413	CCTAA	2	10	6134950	6134959	40 %	20 %	0 %	40 %	75911063
4031	NC_007413	GTATT	2	10	6135790	6135799	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_007413	AAATG	2	10	6136543	6136552	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_007413	GGTCA	2	10	6137627	6137636	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4034	NC_007413	GGGGA	2	10	6138128	6138137	20 %	0 %	80 %	0 %	75911067
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4037	NC_007413	GGAAA	2	10	6146742	6146751	60 %	0 %	40 %	0 %	75911077
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4041	NC_007413	GAGTA	2	10	6153933	6153942	40 %	20 %	40 %	0 %	75911082
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4045	NC_007413	ATTTT	2	10	6157557	6157566	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4049	NC_007413	TTCTC	2	10	6160322	6160331	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4050	NC_007413	TTTTA	2	10	6162101	6162110	20 %	80 %	0 %	0 %	75911089
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4059	NC_007413	ATTTT	2	10	6170654	6170663	20 %	80 %	0 %	0 %	75911096
4060	NC_007413	GTAGC	2	10	6171371	6171380	20 %	20 %	40 %	20 %	75911096
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4065	NC_007413	CGCCT	2	10	6177347	6177356	0 %	20 %	20 %	60 %	75911102
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4069	NC_007413	AATGA	2	10	6180430	6180439	60 %	20 %	20 %	0 %	75911106
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4098	NC_007413	GTGCT	2	10	6217589	6217598	0 %	40 %	40 %	20 %	75911141
4099	NC_007413	CAGTG	2	10	6217781	6217790	20 %	20 %	40 %	20 %	75911141
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4101	NC_007413	AGGCG	2	10	6219802	6219811	20 %	0 %	60 %	20 %	75911142
4102	NC_007413	TTGAA	2	10	6220968	6220977	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4109	NC_007413	TCTAG	2	10	6230816	6230825	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4110	NC_007413	GAAGT	2	10	6231389	6231398	40 %	20 %	40 %	0 %	75911148
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4112	NC_007413	TGTTT	2	10	6235928	6235937	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_007413	CTCAT	2	10	6237504	6237513	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4114	NC_007413	GTTAG	2	10	6237557	6237566	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_007413	ACTTT	2	10	6237642	6237651	20 %	60 %	0 %	20 %	75911155
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4126	NC_007413	GGCAA	2	10	6253925	6253934	40 %	0 %	40 %	20 %	75911168
4127	NC_007413	AAGGG	2	10	6254764	6254773	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.