MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 chromosome

Total Repeats: 85424

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007413	TCT	2	6	81	86	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007413	AGC	2	6	99	104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007413	GGT	2	6	108	113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007413	AAT	2	6	233	238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75906226
5	NC_007413	TAA	2	6	246	251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75906226
6	NC_007413	ACT	2	6	299	304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906226
7	NC_007413	TGG	2	6	388	393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75906226
8	NC_007413	TAA	2	6	511	516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75906226
9	NC_007413	TGG	2	6	589	594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75906226
10	NC_007413	GCT	2	6	758	763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75906226
11	NC_007413	TGT	2	6	768	773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75906226
12	NC_007413	TAG	2	6	774	779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75906226
13	NC_007413	AAG	2	6	816	821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75906226
14	NC_007413	AGT	2	6	865	870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75906226
15	NC_007413	CCA	2	6	887	892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75906226
16	NC_007413	CTA	2	6	1053	1058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906226
17	NC_007413	AGC	2	6	1186	1191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75906226
18	NC_007413	CGG	2	6	1268	1273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75906226
19	NC_007413	GAG	2	6	1349	1354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75906226
20	NC_007413	TGG	2	6	1357	1362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75906226
21	NC_007413	TAG	2	6	1410	1415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75906226
22	NC_007413	CAT	2	6	1491	1496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906226
23	NC_007413	ATT	2	6	2140	2145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75906227
24	NC_007413	GAT	2	6	2189	2194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75906227
25	NC_007413	ATT	2	6	2374	2379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75906227
26	NC_007413	CGA	2	6	2392	2397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75906227
27	NC_007413	AGA	2	6	2512	2517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75906227
28	NC_007413	GCC	2	6	2591	2596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75906227
29	NC_007413	ATA	2	6	2802	2807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75906227
30	NC_007413	GGT	2	6	3032	3037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75906227
31	NC_007413	TGC	2	6	3408	3413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75906228
32	NC_007413	TGA	2	6	3428	3433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75906228
33	NC_007413	GCT	2	6	3490	3495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75906228
34	NC_007413	CCG	2	6	3568	3573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75906228
35	NC_007413	CCA	3	9	3776	3784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75906228
36	NC_007413	CCA	2	6	3817	3822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75906228
37	NC_007413	GGT	2	6	3886	3891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75906228
38	NC_007413	ACA	2	6	3952	3957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75906228
39	NC_007413	AAT	2	6	3966	3971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75906228
40	NC_007413	TAC	2	6	3978	3983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906228
41	NC_007413	CTT	2	6	4028	4033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75906228
42	NC_007413	ATT	2	6	4121	4126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75906229
43	NC_007413	CAC	2	6	4224	4229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75906229
44	NC_007413	TAA	2	6	4260	4265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75906229
45	NC_007413	ATA	2	6	4522	4527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75906229
46	NC_007413	TTG	2	6	4530	4535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75906229
47	NC_007413	ATA	3	9	4621	4629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75906229
48	NC_007413	GAA	2	6	4644	4649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75906229
49	NC_007413	AGT	2	6	4680	4685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75906229
50	NC_007413	AGC	2	6	4767	4772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75906229
51	NC_007413	TGT	2	6	4788	4793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75906229
52	NC_007413	CTG	2	6	4946	4951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75906229
53	NC_007413	TAG	2	6	5055	5060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75906229
54	NC_007413	CCG	2	6	5448	5453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75906230
55	NC_007413	ATA	2	6	5468	5473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75906230
56	NC_007413	CGT	2	6	5492	5497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75906230
57	NC_007413	CTA	2	6	5574	5579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906230
58	NC_007413	GCT	2	6	5643	5648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75906230
59	NC_007413	AAC	2	6	5704	5709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75906230
60	NC_007413	AGC	2	6	5726	5731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75906230
61	NC_007413	GTC	2	6	5759	5764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75906230
62	NC_007413	GGT	2	6	5770	5775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75906230
63	NC_007413	GAT	2	6	5787	5792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75906230
64	NC_007413	AAT	2	6	5935	5940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75906230
65	NC_007413	TCA	2	6	6069	6074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906230
66	NC_007413	TAA	2	6	6083	6088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75906230
67	NC_007413	CAG	2	6	6112	6117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75906230
68	NC_007413	TTG	2	6	6160	6165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75906230
69	NC_007413	GAT	2	6	6190	6195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75906230
70	NC_007413	TTG	2	6	6207	6212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75906230
71	NC_007413	TTG	2	6	6406	6411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007413	AGA	2	6	6555	6560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75906231
73	NC_007413	GAA	2	6	6814	6819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75906231
74	NC_007413	GAA	2	6	6832	6837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75906231
75	NC_007413	CGG	2	6	6846	6851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75906231
76	NC_007413	GGT	3	9	7040	7048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75906232
77	NC_007413	AGC	2	6	7072	7077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75906232
78	NC_007413	AAG	2	6	7095	7100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75906232
79	NC_007413	ATT	2	6	7184	7189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75906232
80	NC_007413	CAT	2	6	7262	7267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906232
81	NC_007413	ATT	2	6	7344	7349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75906232
82	NC_007413	TTC	2	6	7453	7458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007413	TAC	3	9	7549	7557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007413	ATT	2	6	7643	7648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75906233
85	NC_007413	TTG	2	6	7664	7669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75906233
86	NC_007413	CAA	2	6	7690	7695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75906233
87	NC_007413	GGA	2	6	7702	7707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75906233
88	NC_007413	AGT	2	6	7744	7749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75906233
89	NC_007413	TAA	2	6	7831	7836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75906233
90	NC_007413	TCA	2	6	7837	7842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906233
91	NC_007413	TCA	2	6	7881	7886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007413	CAG	2	6	7994	7999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007413	TTC	2	6	8014	8019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007413	TTC	2	6	8085	8090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_007413	TGA	2	6	8122	8127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007413	ATC	2	6	8184	8189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_007413	TCA	2	6	8214	8219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906234
98	NC_007413	GTA	2	6	8289	8294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75906234
99	NC_007413	CTG	2	6	8390	8395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75906234
100	NC_007413	TCA	2	6	8404	8409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906234
101	NC_007413	TCC	2	6	8637	8642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	75906234
102	NC_007413	TCA	2	6	8701	8706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007413	ACT	2	6	8708	8713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007413	ATG	2	6	8766	8771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007413	CAA	2	6	8824	8829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_007413	ATT	2	6	8837	8842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007413	TAC	2	6	8934	8939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906235
108	NC_007413	AGA	2	6	8999	9004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75906235
109	NC_007413	GGT	2	6	9205	9210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75906235
110	NC_007413	ATT	2	6	9260	9265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75906235
111	NC_007413	CTA	2	6	9303	9308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906235
112	NC_007413	CAG	2	6	9312	9317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75906235
113	NC_007413	AGC	2	6	9320	9325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75906235
114	NC_007413	AGT	2	6	9342	9347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75906235
115	NC_007413	TGG	2	6	9418	9423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75906235
116	NC_007413	CGT	2	6	9435	9440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75906235
117	NC_007413	TAT	2	6	9520	9525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007413	ACT	2	6	9542	9547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007413	ATT	2	6	9650	9655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007413	AGT	2	6	9798	9803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007413	TTC	2	6	9832	9837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_007413	TAC	2	6	9896	9901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906236
123	NC_007413	GGT	2	6	9926	9931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75906236
124	NC_007413	TAG	3	9	10052	10060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75906236
125	NC_007413	GGA	2	6	10299	10304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007413	AAC	2	6	10341	10346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007413	TTG	2	6	10427	10432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75906237
128	NC_007413	ATT	2	6	10473	10478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75906237
129	NC_007413	TGA	2	6	10513	10518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75906237
130	NC_007413	TGC	2	6	10574	10579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75906237
131	NC_007413	CCA	2	6	10624	10629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75906237
132	NC_007413	TGG	2	6	10817	10822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75906237
133	NC_007413	TCA	2	6	10920	10925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906237
134	NC_007413	AAT	2	6	10958	10963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75906237
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143	NC_007413	ATT	2	6	11509	11514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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258	NC_007413	ATC	3	9	20259	20267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906247
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