MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 plasmid C

Total Repeats: 226

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007412	TAATA	2	10	6	15	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007412	TAATA	2	10	34	43	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007412	TAATT	2	10	329	338	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007412	GCAAA	2	10	653	662	60 %	0 %	20 %	20 %	75812662
5	NC_007412	CTTTG	2	10	689	698	0 %	60 %	20 %	20 %	75812662
6	NC_007412	CCATT	2	10	1271	1280	20 %	40 %	0 %	40 %	75812662
7	NC_007412	CCAAA	2	10	1648	1657	60 %	0 %	0 %	40 %	75812662
8	NC_007412	CATCC	2	10	1837	1846	20 %	20 %	0 %	60 %	75812663
9	NC_007412	GGTTT	2	10	1850	1859	0 %	60 %	40 %	0 %	75812663
10	NC_007412	ATTTA	2	10	2633	2642	40 %	60 %	0 %	0 %	75812663
11	NC_007412	CACAA	2	10	4957	4966	60 %	0 %	0 %	40 %	75812663
12	NC_007412	TCAAA	2	10	6772	6781	60 %	20 %	0 %	20 %	75812663
13	NC_007412	GAATC	2	10	7156	7165	40 %	20 %	20 %	20 %	75812663
14	NC_007412	CTGTA	2	10	8989	8998	20 %	40 %	20 %	20 %	75812663
15	NC_007412	TCCTG	2	10	9393	9402	0 %	40 %	20 %	40 %	75812663
16	NC_007412	TCAAA	2	10	9865	9874	60 %	20 %	0 %	20 %	75812663
17	NC_007412	TTCTG	2	10	10221	10230	0 %	60 %	20 %	20 %	75812663
18	NC_007412	AATTA	2	10	10322	10331	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007412	ATTTT	2	10	10342	10351	20 %	80 %	0 %	0 %	75812664
20	NC_007412	TAAGT	2	10	10619	10628	40 %	40 %	20 %	0 %	75812664
21	NC_007412	TTGCA	2	10	10921	10930	20 %	40 %	20 %	20 %	75812664
22	NC_007412	AATTC	2	10	13075	13084	40 %	40 %	0 %	20 %	75812666
23	NC_007412	ACCAG	2	10	17394	17403	40 %	0 %	20 %	40 %	75812668
24	NC_007412	GTTTG	2	10	18558	18567	0 %	60 %	40 %	0 %	75812670
25	NC_007412	ACTCT	2	10	20187	20196	20 %	40 %	0 %	40 %	75812670
26	NC_007412	GACAA	2	10	20994	21003	60 %	0 %	20 %	20 %	75812670
27	NC_007412	AACTT	2	10	22064	22073	40 %	40 %	0 %	20 %	75812670
28	NC_007412	TAAGG	2	10	23500	23509	40 %	20 %	40 %	0 %	75812670
29	NC_007412	AAAGC	2	10	23591	23600	60 %	0 %	20 %	20 %	75812670
30	NC_007412	AAATT	2	10	26832	26841	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007412	AGTTG	2	10	27976	27985	20 %	40 %	40 %	0 %	75812671
32	NC_007412	TGGGG	2	10	30232	30241	0 %	20 %	80 %	0 %	75812672
33	NC_007412	TTGGG	2	10	30270	30279	0 %	40 %	60 %	0 %	75812672
34	NC_007412	ATCGC	2	10	30583	30592	20 %	20 %	20 %	40 %	75812672
35	NC_007412	CATTA	2	10	32490	32499	40 %	40 %	0 %	20 %	75812673
36	NC_007412	GACAG	2	10	33930	33939	40 %	0 %	40 %	20 %	75812675
37	NC_007412	CCCAG	2	10	34525	34534	20 %	0 %	20 %	60 %	75812675
38	NC_007412	AATTT	2	10	35774	35783	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007412	AAAAT	2	10	37445	37454	80 %	20 %	0 %	0 %	75812679
40	NC_007412	GTATT	2	10	38253	38262	20 %	60 %	20 %	0 %	75812681
41	NC_007412	TCTTT	2	10	38430	38439	0 %	80 %	0 %	20 %	75812681
42	NC_007412	GCAAT	2	10	39671	39680	40 %	20 %	20 %	20 %	75812683
43	NC_007412	AAATC	2	10	39951	39960	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_007412	TCCAT	2	10	41908	41917	20 %	40 %	0 %	40 %	75812685
45	NC_007412	TGAGA	2	10	47048	47057	40 %	20 %	40 %	0 %	75812690
46	NC_007412	ACAAT	2	10	48478	48487	60 %	20 %	0 %	20 %	75812691
47	NC_007412	GATAT	2	10	49767	49776	40 %	40 %	20 %	0 %	75812692
48	NC_007412	ATCAA	2	10	49794	49803	60 %	20 %	0 %	20 %	75812692
49	NC_007412	TACTC	2	10	50405	50414	20 %	40 %	0 %	40 %	75812693
50	NC_007412	TCAAA	2	10	52092	52101	60 %	20 %	0 %	20 %	75812694
51	NC_007412	TAAAT	2	10	52650	52659	60 %	40 %	0 %	0 %	75812694
52	NC_007412	GAAAT	2	10	57070	57079	60 %	20 %	20 %	0 %	75812697
53	NC_007412	CACCC	2	10	58117	58126	20 %	0 %	0 %	80 %	75812697
54	NC_007412	AAGCA	2	10	58156	58165	60 %	0 %	20 %	20 %	75812697
55	NC_007412	TTACT	2	10	58444	58453	20 %	60 %	0 %	20 %	75812698
56	NC_007412	TATCT	2	10	60882	60891	20 %	60 %	0 %	20 %	75812701
57	NC_007412	AACAA	2	10	61414	61423	80 %	0 %	0 %	20 %	75812701
58	NC_007412	AAAGA	2	10	62638	62647	80 %	0 %	20 %	0 %	75812702
59	NC_007412	ACCAA	2	10	63521	63530	60 %	0 %	0 %	40 %	75812703
60	NC_007412	ACAAA	2	10	64574	64583	80 %	0 %	0 %	20 %	75812704
61	NC_007412	ACTTC	2	10	65763	65772	20 %	40 %	0 %	40 %	75812705
62	NC_007412	TCAAA	2	10	68611	68620	60 %	20 %	0 %	20 %	75812706
63	NC_007412	CAGAA	2	10	71243	71252	60 %	0 %	20 %	20 %	75812707
64	NC_007412	TTAAC	2	10	71519	71528	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_007412	AAGAA	3	15	73171	73185	80 %	0 %	20 %	0 %	75812710
66	NC_007412	CGATC	2	10	74334	74343	20 %	20 %	20 %	40 %	75812711
67	NC_007412	ATCGT	2	10	74555	74564	20 %	40 %	20 %	20 %	75812711
68	NC_007412	CAGCA	2	10	82869	82878	40 %	0 %	20 %	40 %	75812713
69	NC_007412	TCTTG	2	10	83746	83755	0 %	60 %	20 %	20 %	75812714
70	NC_007412	CTCCG	2	10	84114	84123	0 %	20 %	20 %	60 %	75812714
71	NC_007412	AACGA	2	10	85131	85140	60 %	0 %	20 %	20 %	75812714
72	NC_007412	GGAAT	2	10	86159	86168	40 %	20 %	40 %	0 %	75812715
73	NC_007412	TAACA	2	10	86964	86973	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_007412	ATCCA	2	10	88044	88053	40 %	20 %	0 %	40 %	75812719
75	NC_007412	ACTGC	2	10	89021	89030	20 %	20 %	20 %	40 %	75812720
76	NC_007412	ATAGC	2	10	89328	89337	40 %	20 %	20 %	20 %	75812720
77	NC_007412	CTTTA	2	10	89985	89994	20 %	60 %	0 %	20 %	75812721
78	NC_007412	ATCCC	2	10	90178	90187	20 %	20 %	0 %	60 %	75812721
79	NC_007412	TTTCT	2	10	90331	90340	0 %	80 %	0 %	20 %	75812721
80	NC_007412	GTCGA	2	10	92824	92833	20 %	20 %	40 %	20 %	75812722
81	NC_007412	TGCAA	2	10	93397	93406	40 %	20 %	20 %	20 %	75812722
82	NC_007412	TTAAC	2	10	95049	95058	40 %	40 %	0 %	20 %	75812725
83	NC_007412	CTGTA	2	10	95684	95693	20 %	40 %	20 %	20 %	75812726
84	NC_007412	ACTCA	2	10	96258	96267	40 %	20 %	0 %	40 %	75812727
85	NC_007412	AGAAA	2	10	97919	97928	80 %	0 %	20 %	0 %	75812730
86	NC_007412	GTCAG	2	10	104042	104051	20 %	20 %	40 %	20 %	75812736
87	NC_007412	GATTG	2	10	106060	106069	20 %	40 %	40 %	0 %	75812737
88	NC_007412	AATCA	2	10	106596	106605	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_007412	TAAAC	2	10	107035	107044	60 %	20 %	0 %	20 %	75812739
90	NC_007412	CCTTA	2	10	111570	111579	20 %	40 %	0 %	40 %	75812744
91	NC_007412	ATCCT	2	10	112145	112154	20 %	40 %	0 %	40 %	75812745
92	NC_007412	TAGAT	2	10	112939	112948	40 %	40 %	20 %	0 %	75812746
93	NC_007412	TGAGA	2	10	114534	114543	40 %	20 %	40 %	0 %	75812748
94	NC_007412	GATTG	2	10	115811	115820	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007412	TCACC	2	10	116962	116971	20 %	20 %	0 %	60 %	75812753
96	NC_007412	CAGGG	2	10	117825	117834	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_007412	TCAAC	2	10	119192	119201	40 %	20 %	0 %	40 %	75812757
98	NC_007412	CCGAG	2	10	120839	120848	20 %	0 %	40 %	40 %	75812759
99	NC_007412	CCACG	2	10	121557	121566	20 %	0 %	20 %	60 %	75812760
100	NC_007412	TTCCG	2	10	121884	121893	0 %	40 %	20 %	40 %	75812760
101	NC_007412	GGTTC	2	10	122339	122348	0 %	40 %	40 %	20 %	75812761
102	NC_007412	AAATT	2	10	122834	122843	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007412	ATCCA	2	10	122844	122853	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_007412	CATGA	2	10	122854	122863	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_007412	TTGAG	2	10	124397	124406	20 %	40 %	40 %	0 %	75812763
106	NC_007412	GTGGC	2	10	127701	127710	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
107	NC_007412	CTAGG	2	10	127798	127807	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_007412	GCCAC	2	10	127921	127930	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
109	NC_007412	TGATC	2	10	128129	128138	20 %	40 %	20 %	20 %	75812767
110	NC_007412	TGTCC	2	10	128881	128890	0 %	40 %	20 %	40 %	75812767
111	NC_007412	GTTGC	2	10	135779	135788	0 %	40 %	40 %	20 %	75812773
112	NC_007412	ATACA	2	10	141612	141621	60 %	20 %	0 %	20 %	75812777
113	NC_007412	GCTTG	2	10	141629	141638	0 %	40 %	40 %	20 %	75812777
114	NC_007412	TTGCC	2	10	142542	142551	0 %	40 %	20 %	40 %	75812777
115	NC_007412	GCCTT	2	10	143011	143020	0 %	40 %	20 %	40 %	75812777
116	NC_007412	TAAGG	2	10	143592	143601	40 %	20 %	40 %	0 %	75812777
117	NC_007412	GATCG	2	10	143798	143807	20 %	20 %	40 %	20 %	75812777
118	NC_007412	ATTGA	2	10	144978	144987	40 %	40 %	20 %	0 %	75812777
119	NC_007412	TTTTG	2	10	145967	145976	0 %	80 %	20 %	0 %	75812777
120	NC_007412	TAGTC	2	10	152101	152110	20 %	40 %	20 %	20 %	75812783
121	NC_007412	CAACA	2	10	152880	152889	60 %	0 %	0 %	40 %	75812784
122	NC_007412	CCCAA	2	10	153885	153894	40 %	0 %	0 %	60 %	75812785
123	NC_007412	CTTCA	2	10	154625	154634	20 %	40 %	0 %	40 %	75812786
124	NC_007412	GCCGC	2	10	154884	154893	0 %	0 %	40 %	60 %	75812786
125	NC_007412	GCCGA	2	10	154899	154908	20 %	0 %	40 %	40 %	75812786
126	NC_007412	GCCGA	2	10	155228	155237	20 %	0 %	40 %	40 %	75812786
127	NC_007412	TTGCC	2	10	156454	156463	0 %	40 %	20 %	40 %	75812786
128	NC_007412	GTGAC	2	10	157738	157747	20 %	20 %	40 %	20 %	75812788
129	NC_007412	AACCG	2	10	159166	159175	40 %	0 %	20 %	40 %	75812790
130	NC_007412	TTTAG	2	10	161735	161744	20 %	60 %	20 %	0 %	75812792
131	NC_007412	TGCGC	2	10	162273	162282	0 %	20 %	40 %	40 %	75812792
132	NC_007412	ACCAC	2	10	163274	163283	40 %	0 %	0 %	60 %	75812793
133	NC_007412	ATTGC	2	10	166602	166611	20 %	40 %	20 %	20 %	75812797
134	NC_007412	CGATC	2	10	166980	166989	20 %	20 %	20 %	40 %	75812798
135	NC_007412	CAGTC	2	10	167459	167468	20 %	20 %	20 %	40 %	75812798
136	NC_007412	TTCTT	2	10	167789	167798	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_007412	ATTGA	2	10	176112	176121	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007412	TACGC	2	10	176221	176230	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_007412	ATCAA	2	10	177760	177769	60 %	20 %	0 %	20 %	75812808
140	NC_007412	AAAGA	2	10	177977	177986	80 %	0 %	20 %	0 %	75812808
141	NC_007412	CGCTG	2	10	178048	178057	0 %	20 %	40 %	40 %	75812808
142	NC_007412	AAATG	2	10	179259	179268	60 %	20 %	20 %	0 %	75812809
143	NC_007412	TAGGA	2	10	180407	180416	40 %	20 %	40 %	0 %	75812811
144	NC_007412	AGTAA	2	10	181435	181444	60 %	20 %	20 %	0 %	75812811
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146	NC_007412	TAGCG	2	10	184572	184581	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_007412	TCTGC	2	10	186303	186312	0 %	40 %	20 %	40 %	75812816
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149	NC_007412	ATGGG	2	10	186719	186728	20 %	20 %	60 %	0 %	75812816
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152	NC_007412	TAAAG	2	10	189704	189713	60 %	20 %	20 %	0 %	75812817
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154	NC_007412	CCTAG	2	10	190839	190848	20 %	20 %	20 %	40 %	75812819
155	NC_007412	AATTA	2	10	191688	191697	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_007412	CAGGT	2	10	192232	192241	20 %	20 %	40 %	20 %	75812820
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160	NC_007412	TGCCT	2	10	196707	196716	0 %	40 %	20 %	40 %	75812823
161	NC_007412	GAAAA	2	10	199402	199411	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
162	NC_007412	TAATT	2	10	200088	200097	40 %	60 %	0 %	0 %	75812828
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170	NC_007412	ATTAA	2	10	207599	207608	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_007412	TAGTT	2	10	209084	209093	20 %	60 %	20 %	0 %	75812838
172	NC_007412	ATTTT	2	10	210745	210754	20 %	80 %	0 %	0 %	75812840
173	NC_007412	AATAA	2	10	210798	210807	80 %	20 %	0 %	0 %	75812840
174	NC_007412	GGGAA	2	10	211436	211445	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
175	NC_007412	CTCAA	2	10	215080	215089	40 %	20 %	0 %	40 %	75812843
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178	NC_007412	ACTAT	2	10	217202	217211	40 %	40 %	0 %	20 %	75812843
179	NC_007412	CCTCA	2	10	219318	219327	20 %	20 %	0 %	60 %	75812843
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181	NC_007412	CGTGG	2	10	220703	220712	0 %	20 %	60 %	20 %	75812843
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185	NC_007412	ATAAA	2	10	224046	224055	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_007412	CAAAT	2	10	225359	225368	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
187	NC_007412	GTTTT	2	10	226178	226187	0 %	80 %	20 %	0 %	75812849
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192	NC_007412	TTGAA	2	10	230302	230311	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
193	NC_007412	GCATT	2	10	233060	233069	20 %	40 %	20 %	20 %	75812853
194	NC_007412	TAAAT	2	10	234177	234186	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_007412	AGCCA	2	10	234283	234292	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
196	NC_007412	ATTTT	2	10	234390	234399	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_007412	GGAAA	2	10	234631	234640	60 %	0 %	40 %	0 %	75812855
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199	NC_007412	GTTGT	2	10	237752	237761	0 %	60 %	40 %	0 %	75812857
200	NC_007412	ATGAT	2	10	240088	240097	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
201	NC_007412	AAACA	2	10	241288	241297	80 %	0 %	0 %	20 %	75812860
202	NC_007412	AAGAT	2	10	242012	242021	60 %	20 %	20 %	0 %	75812861
203	NC_007412	CAATA	2	10	242686	242695	60 %	20 %	0 %	20 %	75812861
204	NC_007412	AGTAA	2	10	245262	245271	60 %	20 %	20 %	0 %	75812864
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225	NC_007412	CTTTG	2	10	296987	296996	0 %	60 %	20 %	20 %	75812900
226	NC_007412	AAAAC	2	10	299873	299882	80 %	0 %	0 %	20 %	75812903

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.