MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 plasmid C

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007412	TAATA	2	10	6	15	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007412	TAATA	2	10	34	43	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007412	TAATT	2	10	329	338	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007412	AATTA	2	10	10322	10331	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007412	AAATT	2	10	26832	26841	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007412	AATTT	2	10	35774	35783	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007412	AAATC	2	10	39951	39960	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_007412	TTAAC	2	10	71519	71528	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_007412	TAACA	2	10	86964	86973	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_007412	AATCA	2	10	106596	106605	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_007412	GATTG	2	10	115811	115820	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007412	CAGGG	2	10	117825	117834	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_007412	AAATT	2	10	122834	122843	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007412	ATCCA	2	10	122844	122853	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_007412	CATGA	2	10	122854	122863	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_007412	GTGGC	2	10	127701	127710	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_007412	CTAGG	2	10	127798	127807	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_007412	GCCAC	2	10	127921	127930	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_007412	TTCTT	2	10	167789	167798	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_007412	ATTGA	2	10	176112	176121	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007412	TACGC	2	10	176221	176230	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_007412	TAGCG	2	10	184572	184581	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_007412	GATTT	2	10	188606	188615	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007412	AATTA	2	10	191688	191697	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007412	GAAAA	2	10	199402	199411	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007412	ATCTA	2	10	207540	207549	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_007412	ATTAA	2	10	207599	207608	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007412	GGGAA	2	10	211436	211445	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007412	ATAAA	2	10	224046	224055	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007412	CAAAT	2	10	225359	225368	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_007412	TTGAA	2	10	230302	230311	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007412	TAAAT	2	10	234177	234186	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007412	AGCCA	2	10	234283	234292	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_007412	ATTTT	2	10	234390	234399	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007412	ATGAT	2	10	240088	240097	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.