MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 plasmid C

Total Repeats: 191

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007412	GCAAA	2	10	653	662	60 %	0 %	20 %	20 %	75812662
2	NC_007412	CTTTG	2	10	689	698	0 %	60 %	20 %	20 %	75812662
3	NC_007412	CCATT	2	10	1271	1280	20 %	40 %	0 %	40 %	75812662
4	NC_007412	CCAAA	2	10	1648	1657	60 %	0 %	0 %	40 %	75812662
5	NC_007412	CATCC	2	10	1837	1846	20 %	20 %	0 %	60 %	75812663
6	NC_007412	GGTTT	2	10	1850	1859	0 %	60 %	40 %	0 %	75812663
7	NC_007412	ATTTA	2	10	2633	2642	40 %	60 %	0 %	0 %	75812663
8	NC_007412	CACAA	2	10	4957	4966	60 %	0 %	0 %	40 %	75812663
9	NC_007412	TCAAA	2	10	6772	6781	60 %	20 %	0 %	20 %	75812663
10	NC_007412	GAATC	2	10	7156	7165	40 %	20 %	20 %	20 %	75812663
11	NC_007412	CTGTA	2	10	8989	8998	20 %	40 %	20 %	20 %	75812663
12	NC_007412	TCCTG	2	10	9393	9402	0 %	40 %	20 %	40 %	75812663
13	NC_007412	TCAAA	2	10	9865	9874	60 %	20 %	0 %	20 %	75812663
14	NC_007412	TTCTG	2	10	10221	10230	0 %	60 %	20 %	20 %	75812663
15	NC_007412	ATTTT	2	10	10342	10351	20 %	80 %	0 %	0 %	75812664
16	NC_007412	TAAGT	2	10	10619	10628	40 %	40 %	20 %	0 %	75812664
17	NC_007412	TTGCA	2	10	10921	10930	20 %	40 %	20 %	20 %	75812664
18	NC_007412	AATTC	2	10	13075	13084	40 %	40 %	0 %	20 %	75812666
19	NC_007412	ACCAG	2	10	17394	17403	40 %	0 %	20 %	40 %	75812668
20	NC_007412	GTTTG	2	10	18558	18567	0 %	60 %	40 %	0 %	75812670
21	NC_007412	ACTCT	2	10	20187	20196	20 %	40 %	0 %	40 %	75812670
22	NC_007412	GACAA	2	10	20994	21003	60 %	0 %	20 %	20 %	75812670
23	NC_007412	AACTT	2	10	22064	22073	40 %	40 %	0 %	20 %	75812670
24	NC_007412	TAAGG	2	10	23500	23509	40 %	20 %	40 %	0 %	75812670
25	NC_007412	AAAGC	2	10	23591	23600	60 %	0 %	20 %	20 %	75812670
26	NC_007412	AGTTG	2	10	27976	27985	20 %	40 %	40 %	0 %	75812671
27	NC_007412	TGGGG	2	10	30232	30241	0 %	20 %	80 %	0 %	75812672
28	NC_007412	TTGGG	2	10	30270	30279	0 %	40 %	60 %	0 %	75812672
29	NC_007412	ATCGC	2	10	30583	30592	20 %	20 %	20 %	40 %	75812672
30	NC_007412	CATTA	2	10	32490	32499	40 %	40 %	0 %	20 %	75812673
31	NC_007412	GACAG	2	10	33930	33939	40 %	0 %	40 %	20 %	75812675
32	NC_007412	CCCAG	2	10	34525	34534	20 %	0 %	20 %	60 %	75812675
33	NC_007412	AAAAT	2	10	37445	37454	80 %	20 %	0 %	0 %	75812679
34	NC_007412	GTATT	2	10	38253	38262	20 %	60 %	20 %	0 %	75812681
35	NC_007412	TCTTT	2	10	38430	38439	0 %	80 %	0 %	20 %	75812681
36	NC_007412	GCAAT	2	10	39671	39680	40 %	20 %	20 %	20 %	75812683
37	NC_007412	TCCAT	2	10	41908	41917	20 %	40 %	0 %	40 %	75812685
38	NC_007412	TGAGA	2	10	47048	47057	40 %	20 %	40 %	0 %	75812690
39	NC_007412	ACAAT	2	10	48478	48487	60 %	20 %	0 %	20 %	75812691
40	NC_007412	GATAT	2	10	49767	49776	40 %	40 %	20 %	0 %	75812692
41	NC_007412	ATCAA	2	10	49794	49803	60 %	20 %	0 %	20 %	75812692
42	NC_007412	TACTC	2	10	50405	50414	20 %	40 %	0 %	40 %	75812693
43	NC_007412	TCAAA	2	10	52092	52101	60 %	20 %	0 %	20 %	75812694
44	NC_007412	TAAAT	2	10	52650	52659	60 %	40 %	0 %	0 %	75812694
45	NC_007412	GAAAT	2	10	57070	57079	60 %	20 %	20 %	0 %	75812697
46	NC_007412	CACCC	2	10	58117	58126	20 %	0 %	0 %	80 %	75812697
47	NC_007412	AAGCA	2	10	58156	58165	60 %	0 %	20 %	20 %	75812697
48	NC_007412	TTACT	2	10	58444	58453	20 %	60 %	0 %	20 %	75812698
49	NC_007412	TATCT	2	10	60882	60891	20 %	60 %	0 %	20 %	75812701
50	NC_007412	AACAA	2	10	61414	61423	80 %	0 %	0 %	20 %	75812701
51	NC_007412	AAAGA	2	10	62638	62647	80 %	0 %	20 %	0 %	75812702
52	NC_007412	ACCAA	2	10	63521	63530	60 %	0 %	0 %	40 %	75812703
53	NC_007412	ACAAA	2	10	64574	64583	80 %	0 %	0 %	20 %	75812704
54	NC_007412	ACTTC	2	10	65763	65772	20 %	40 %	0 %	40 %	75812705
55	NC_007412	TCAAA	2	10	68611	68620	60 %	20 %	0 %	20 %	75812706
56	NC_007412	CAGAA	2	10	71243	71252	60 %	0 %	20 %	20 %	75812707
57	NC_007412	AAGAA	3	15	73171	73185	80 %	0 %	20 %	0 %	75812710
58	NC_007412	CGATC	2	10	74334	74343	20 %	20 %	20 %	40 %	75812711
59	NC_007412	ATCGT	2	10	74555	74564	20 %	40 %	20 %	20 %	75812711
60	NC_007412	CAGCA	2	10	82869	82878	40 %	0 %	20 %	40 %	75812713
61	NC_007412	TCTTG	2	10	83746	83755	0 %	60 %	20 %	20 %	75812714
62	NC_007412	CTCCG	2	10	84114	84123	0 %	20 %	20 %	60 %	75812714
63	NC_007412	AACGA	2	10	85131	85140	60 %	0 %	20 %	20 %	75812714
64	NC_007412	GGAAT	2	10	86159	86168	40 %	20 %	40 %	0 %	75812715
65	NC_007412	ATCCA	2	10	88044	88053	40 %	20 %	0 %	40 %	75812719
66	NC_007412	ACTGC	2	10	89021	89030	20 %	20 %	20 %	40 %	75812720
67	NC_007412	ATAGC	2	10	89328	89337	40 %	20 %	20 %	20 %	75812720
68	NC_007412	CTTTA	2	10	89985	89994	20 %	60 %	0 %	20 %	75812721
69	NC_007412	ATCCC	2	10	90178	90187	20 %	20 %	0 %	60 %	75812721
70	NC_007412	TTTCT	2	10	90331	90340	0 %	80 %	0 %	20 %	75812721
71	NC_007412	GTCGA	2	10	92824	92833	20 %	20 %	40 %	20 %	75812722
72	NC_007412	TGCAA	2	10	93397	93406	40 %	20 %	20 %	20 %	75812722
73	NC_007412	TTAAC	2	10	95049	95058	40 %	40 %	0 %	20 %	75812725
74	NC_007412	CTGTA	2	10	95684	95693	20 %	40 %	20 %	20 %	75812726
75	NC_007412	ACTCA	2	10	96258	96267	40 %	20 %	0 %	40 %	75812727
76	NC_007412	AGAAA	2	10	97919	97928	80 %	0 %	20 %	0 %	75812730
77	NC_007412	GTCAG	2	10	104042	104051	20 %	20 %	40 %	20 %	75812736
78	NC_007412	GATTG	2	10	106060	106069	20 %	40 %	40 %	0 %	75812737
79	NC_007412	TAAAC	2	10	107035	107044	60 %	20 %	0 %	20 %	75812739
80	NC_007412	CCTTA	2	10	111570	111579	20 %	40 %	0 %	40 %	75812744
81	NC_007412	ATCCT	2	10	112145	112154	20 %	40 %	0 %	40 %	75812745
82	NC_007412	TAGAT	2	10	112939	112948	40 %	40 %	20 %	0 %	75812746
83	NC_007412	TGAGA	2	10	114534	114543	40 %	20 %	40 %	0 %	75812748
84	NC_007412	TCACC	2	10	116962	116971	20 %	20 %	0 %	60 %	75812753
85	NC_007412	TCAAC	2	10	119192	119201	40 %	20 %	0 %	40 %	75812757
86	NC_007412	CCGAG	2	10	120839	120848	20 %	0 %	40 %	40 %	75812759
87	NC_007412	CCACG	2	10	121557	121566	20 %	0 %	20 %	60 %	75812760
88	NC_007412	TTCCG	2	10	121884	121893	0 %	40 %	20 %	40 %	75812760
89	NC_007412	GGTTC	2	10	122339	122348	0 %	40 %	40 %	20 %	75812761
90	NC_007412	TTGAG	2	10	124397	124406	20 %	40 %	40 %	0 %	75812763
91	NC_007412	TGATC	2	10	128129	128138	20 %	40 %	20 %	20 %	75812767
92	NC_007412	TGTCC	2	10	128881	128890	0 %	40 %	20 %	40 %	75812767
93	NC_007412	GTTGC	2	10	135779	135788	0 %	40 %	40 %	20 %	75812773
94	NC_007412	ATACA	2	10	141612	141621	60 %	20 %	0 %	20 %	75812777
95	NC_007412	GCTTG	2	10	141629	141638	0 %	40 %	40 %	20 %	75812777
96	NC_007412	TTGCC	2	10	142542	142551	0 %	40 %	20 %	40 %	75812777
97	NC_007412	GCCTT	2	10	143011	143020	0 %	40 %	20 %	40 %	75812777
98	NC_007412	TAAGG	2	10	143592	143601	40 %	20 %	40 %	0 %	75812777
99	NC_007412	GATCG	2	10	143798	143807	20 %	20 %	40 %	20 %	75812777
100	NC_007412	ATTGA	2	10	144978	144987	40 %	40 %	20 %	0 %	75812777
101	NC_007412	TTTTG	2	10	145967	145976	0 %	80 %	20 %	0 %	75812777
102	NC_007412	TAGTC	2	10	152101	152110	20 %	40 %	20 %	20 %	75812783
103	NC_007412	CAACA	2	10	152880	152889	60 %	0 %	0 %	40 %	75812784
104	NC_007412	CCCAA	2	10	153885	153894	40 %	0 %	0 %	60 %	75812785
105	NC_007412	CTTCA	2	10	154625	154634	20 %	40 %	0 %	40 %	75812786
106	NC_007412	GCCGC	2	10	154884	154893	0 %	0 %	40 %	60 %	75812786
107	NC_007412	GCCGA	2	10	154899	154908	20 %	0 %	40 %	40 %	75812786
108	NC_007412	GCCGA	2	10	155228	155237	20 %	0 %	40 %	40 %	75812786
109	NC_007412	TTGCC	2	10	156454	156463	0 %	40 %	20 %	40 %	75812786
110	NC_007412	GTGAC	2	10	157738	157747	20 %	20 %	40 %	20 %	75812788
111	NC_007412	AACCG	2	10	159166	159175	40 %	0 %	20 %	40 %	75812790
112	NC_007412	TTTAG	2	10	161735	161744	20 %	60 %	20 %	0 %	75812792
113	NC_007412	TGCGC	2	10	162273	162282	0 %	20 %	40 %	40 %	75812792
114	NC_007412	ACCAC	2	10	163274	163283	40 %	0 %	0 %	60 %	75812793
115	NC_007412	ATTGC	2	10	166602	166611	20 %	40 %	20 %	20 %	75812797
116	NC_007412	CGATC	2	10	166980	166989	20 %	20 %	20 %	40 %	75812798
117	NC_007412	CAGTC	2	10	167459	167468	20 %	20 %	20 %	40 %	75812798
118	NC_007412	ATCAA	2	10	177760	177769	60 %	20 %	0 %	20 %	75812808
119	NC_007412	AAAGA	2	10	177977	177986	80 %	0 %	20 %	0 %	75812808
120	NC_007412	CGCTG	2	10	178048	178057	0 %	20 %	40 %	40 %	75812808
121	NC_007412	AAATG	2	10	179259	179268	60 %	20 %	20 %	0 %	75812809
122	NC_007412	TAGGA	2	10	180407	180416	40 %	20 %	40 %	0 %	75812811
123	NC_007412	AGTAA	2	10	181435	181444	60 %	20 %	20 %	0 %	75812811
124	NC_007412	GCCCA	2	10	182977	182986	20 %	0 %	20 %	60 %	75812813
125	NC_007412	TCTGC	2	10	186303	186312	0 %	40 %	20 %	40 %	75812816
126	NC_007412	CGTGC	2	10	186690	186699	0 %	20 %	40 %	40 %	75812816
127	NC_007412	ATGGG	2	10	186719	186728	20 %	20 %	60 %	0 %	75812816
128	NC_007412	CCAAG	2	10	187088	187097	40 %	0 %	20 %	40 %	75812816
129	NC_007412	TAAAG	2	10	189704	189713	60 %	20 %	20 %	0 %	75812817
130	NC_007412	ACCAA	2	10	190494	190503	60 %	0 %	0 %	40 %	75812819
131	NC_007412	CCTAG	2	10	190839	190848	20 %	20 %	20 %	40 %	75812819
132	NC_007412	CAGGT	2	10	192232	192241	20 %	20 %	40 %	20 %	75812820
133	NC_007412	CAGCC	2	10	194399	194408	20 %	0 %	20 %	60 %	75812821
134	NC_007412	CAAAC	2	10	195194	195203	60 %	0 %	0 %	40 %	75812822
135	NC_007412	CCGTG	2	10	196595	196604	0 %	20 %	40 %	40 %	75812823
136	NC_007412	TGCCT	2	10	196707	196716	0 %	40 %	20 %	40 %	75812823
137	NC_007412	TAATT	2	10	200088	200097	40 %	60 %	0 %	0 %	75812828
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187	NC_007412	TGTTT	2	10	291924	291933	0 %	80 %	20 %	0 %	75812894
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.