MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 plasmid C

Total Repeats: 454

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007412	GTT	2	6	108	113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007412	ATT	2	6	144	149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007412	TAA	2	6	187	192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007412	TAA	2	6	227	232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007412	TAT	2	6	368	373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007412	TAC	2	6	12254	12259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_007412	TGA	2	6	12322	12327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007412	ATT	2	6	26745	26750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007412	GTT	2	6	26774	26779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007412	AAT	2	6	26780	26785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007412	TGT	2	6	26923	26928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007412	ATC	2	6	26973	26978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007412	CTG	2	6	27039	27044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007412	TAT	2	6	27186	27191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007412	ACC	2	6	27232	27237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_007412	TTG	2	6	27365	27370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007412	TGA	2	6	31723	31728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007412	GTT	2	6	33673	33678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007412	TAA	2	6	33720	33725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007412	TAA	2	6	35479	35484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007412	TAC	2	6	35487	35492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007412	TGA	2	6	35553	35558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007412	AGT	2	6	35581	35586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007412	AAT	2	6	35796	35801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007412	AAG	2	6	35805	35810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007412	ATC	2	6	35835	35840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007412	CAT	2	6	36807	36812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007412	TTA	2	6	36895	36900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007412	TCA	2	6	36907	36912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007412	AGC	2	6	36975	36980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007412	GAT	2	6	37103	37108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007412	TCA	2	6	37684	37689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007412	TAT	2	6	37707	37712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007412	TAT	2	6	38226	38231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007412	TTC	2	6	39808	39813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007412	GAC	2	6	39879	39884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007412	AAC	2	6	40015	40020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007412	AGT	2	6	41818	41823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007412	GCT	2	6	44983	44988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007412	AAT	2	6	45008	45013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007412	AAT	2	6	46020	46025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007412	ATC	2	6	46102	46107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007412	TTG	2	6	46148	46153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007412	AGA	2	6	46821	46826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007412	AAG	2	6	46827	46832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007412	ACA	2	6	47497	47502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007412	CAA	2	6	47515	47520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_007412	TCA	2	6	49306	49311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007412	CAA	2	6	49993	49998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007412	ATT	2	6	50103	50108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007412	GAT	2	6	50190	50195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007412	TTA	2	6	50203	50208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007412	AAT	2	6	50218	50223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007412	AAT	2	6	50330	50335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007412	GAA	2	6	51023	51028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007412	ACG	2	6	51130	51135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007412	ACC	2	6	51312	51317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_007412	AAG	2	6	53254	53259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007412	GAG	2	6	53270	53275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007412	AGA	2	6	53310	53315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007412	CCA	2	6	53450	53455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_007412	TCA	2	6	53483	53488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007412	GCT	2	6	53860	53865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007412	AAT	2	6	56866	56871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007412	AGT	2	6	58224	58229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007412	AGA	2	6	58276	58281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007412	AAT	2	6	58291	58296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007412	AAG	2	6	58310	58315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007412	ATT	2	6	58362	58367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007412	ATA	2	6	59173	59178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007412	TTC	2	6	60752	60757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007412	AGA	2	6	65694	65699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007412	GAA	2	6	65750	65755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007412	ATT	2	6	67648	67653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007412	CAA	2	6	70270	70275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007412	TAC	2	6	70336	70341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007412	GTA	2	6	70366	70371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007412	TTA	2	6	70469	70474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007412	CAG	2	6	72983	72988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007412	TAA	2	6	72989	72994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007412	TGT	2	6	73870	73875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007412	TAA	2	6	73880	73885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007412	ACA	2	6	73889	73894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007412	TAG	2	6	81096	81101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007412	ATT	2	6	81120	81125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007412	CGC	2	6	81159	81164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_007412	TGC	2	6	81177	81182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007412	GCA	2	6	81212	81217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007412	ACT	2	6	81240	81245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007412	CGC	2	6	81259	81264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_007412	TGC	2	6	81277	81282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007412	GAC	2	6	81346	81351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007412	AGA	2	6	81433	81438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007412	CGC	2	6	82332	82337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_007412	TGC	2	6	82350	82355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_007412	ACA	2	6	86870	86875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_007412	CTA	2	6	86880	86885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_007412	TGC	2	6	86913	86918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_007412	TTA	2	6	86925	86930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007412	ACA	2	6	86951	86956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007412	GGT	2	6	86975	86980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007412	ACA	2	6	86992	86997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007412	CAA	2	6	89830	89835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007412	ACT	2	6	89844	89849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007412	ATT	2	6	92645	92650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007412	TGA	2	6	92692	92697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007412	AAT	2	6	93762	93767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007412	AAG	2	6	100622	100627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007412	TCG	2	6	100663	100668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_007412	ACC	2	6	100745	100750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_007412	TCT	2	6	100772	100777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007412	GCT	2	6	101204	101209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007412	TAC	2	6	102157	102162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_007412	TAA	2	6	102279	102284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007412	TAA	2	6	102330	102335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007412	CTT	2	6	102394	102399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007412	GAA	2	6	102454	102459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007412	ATC	2	6	102544	102549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007412	ATT	2	6	102595	102600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007412	ATG	2	6	102647	102652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007412	GTC	2	6	102694	102699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_007412	TAA	2	6	102701	102706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007412	GAC	2	6	102709	102714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_007412	CAT	2	6	103824	103829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007412	ATC	2	6	105238	105243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007412	AGG	2	6	106545	106550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007412	TAC	2	6	106615	106620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_007412	CAG	2	6	106623	106628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_007412	TTC	2	6	108181	108186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_007412	CAT	2	6	108710	108715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007412	AGG	2	6	108760	108765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007412	TAA	2	6	110504	110509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007412	TAA	2	6	110597	110602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007412	CTT	2	6	110636	110641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007412	ACC	2	6	110648	110653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_007412	ATG	2	6	110669	110674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007412	TAA	2	6	113346	113351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007412	GCA	2	6	113388	113393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_007412	CTG	2	6	113411	113416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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153	NC_007412	GCT	2	6	122775	122780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.