MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 plasmid B

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007411	AAAT	2	8	253	260	75 %	25 %	0 %	0 %	75812630
2	NC_007411	TTGG	3	12	294	305	0 %	50 %	50 %	0 %	75812630
3	NC_007411	GTTG	2	8	638	645	0 %	50 %	50 %	0 %	75812630
4	NC_007411	TAAT	2	8	897	904	50 %	50 %	0 %	0 %	75812630
5	NC_007411	CATT	2	8	1570	1577	25 %	50 %	0 %	25 %	75812631
6	NC_007411	CTGT	2	8	1625	1632	0 %	50 %	25 %	25 %	75812631
7	NC_007411	TGCT	2	8	1643	1650	0 %	50 %	25 %	25 %	75812631
8	NC_007411	TCTT	2	8	1875	1882	0 %	75 %	0 %	25 %	75812631
9	NC_007411	TAAG	2	8	2312	2319	50 %	25 %	25 %	0 %	75812631
10	NC_007411	GTTG	2	8	3364	3371	0 %	50 %	50 %	0 %	75812632
11	NC_007411	GCTT	2	8	4758	4765	0 %	50 %	25 %	25 %	75812633
12	NC_007411	GGAT	2	8	6157	6164	25 %	25 %	50 %	0 %	75812635
13	NC_007411	AGTA	2	8	6350	6357	50 %	25 %	25 %	0 %	75812635
14	NC_007411	TAAA	2	8	6394	6401	75 %	25 %	0 %	0 %	75812635
15	NC_007411	TAAA	2	8	6415	6422	75 %	25 %	0 %	0 %	75812635
16	NC_007411	ATCA	2	8	7199	7206	50 %	25 %	0 %	25 %	75812635
17	NC_007411	GTTT	2	8	7333	7340	0 %	75 %	25 %	0 %	75812635
18	NC_007411	AATC	2	8	8685	8692	50 %	25 %	0 %	25 %	75812636
19	NC_007411	TTGA	2	8	8819	8826	25 %	50 %	25 %	0 %	75812636
20	NC_007411	TAAA	2	8	8917	8924	75 %	25 %	0 %	0 %	75812637
21	NC_007411	GATT	2	8	9061	9068	25 %	50 %	25 %	0 %	75812637
22	NC_007411	ATTT	2	8	9587	9594	25 %	75 %	0 %	0 %	75812637
23	NC_007411	ATTT	2	8	9848	9855	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007411	AAGA	2	8	10075	10082	75 %	0 %	25 %	0 %	75812638
25	NC_007411	TTGG	2	8	10195	10202	0 %	50 %	50 %	0 %	75812638
26	NC_007411	AACT	2	8	10482	10489	50 %	25 %	0 %	25 %	75812638
27	NC_007411	TAAT	2	8	10748	10755	50 %	50 %	0 %	0 %	75812639
28	NC_007411	CAGA	2	8	11320	11327	50 %	0 %	25 %	25 %	75812639
29	NC_007411	TCTT	2	8	11840	11847	0 %	75 %	0 %	25 %	75812639
30	NC_007411	AGCC	2	8	12721	12728	25 %	0 %	25 %	50 %	75812640
31	NC_007411	TCAT	2	8	12898	12905	25 %	50 %	0 %	25 %	75812640
32	NC_007411	GTCA	2	8	13181	13188	25 %	25 %	25 %	25 %	75812641
33	NC_007411	GTTC	2	8	13375	13382	0 %	50 %	25 %	25 %	75812641
34	NC_007411	TTTA	2	8	13442	13449	25 %	75 %	0 %	0 %	75812641
35	NC_007411	AATA	2	8	13676	13683	75 %	25 %	0 %	0 %	75812641
36	NC_007411	ATAA	2	8	13891	13898	75 %	25 %	0 %	0 %	75812641
37	NC_007411	GAAC	2	8	14241	14248	50 %	0 %	25 %	25 %	75812641
38	NC_007411	GCTG	2	8	15090	15097	0 %	25 %	50 %	25 %	75812641
39	NC_007411	ATTA	2	8	16008	16015	50 %	50 %	0 %	0 %	75812642
40	NC_007411	TAAA	2	8	16434	16441	75 %	25 %	0 %	0 %	75812643
41	NC_007411	TCTT	2	8	17013	17020	0 %	75 %	0 %	25 %	75812643
42	NC_007411	AAGA	2	8	17851	17858	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007411	AGAA	2	8	18438	18445	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007411	ATAC	2	8	18456	18463	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_007411	AACC	2	8	18520	18527	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_007411	GTCG	2	8	18821	18828	0 %	25 %	50 %	25 %	75812645
47	NC_007411	ATCT	2	8	19003	19010	25 %	50 %	0 %	25 %	75812645
48	NC_007411	TTTA	2	8	19316	19323	25 %	75 %	0 %	0 %	75812646
49	NC_007411	TATG	2	8	19385	19392	25 %	50 %	25 %	0 %	75812646
50	NC_007411	GTTG	2	8	19575	19582	0 %	50 %	50 %	0 %	75812646
51	NC_007411	ACTG	2	8	19603	19610	25 %	25 %	25 %	25 %	75812646
52	NC_007411	ACTA	2	8	19616	19623	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_007411	TTGT	2	8	19764	19771	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007411	ATTT	2	8	19902	19909	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007411	AGTA	2	8	20002	20009	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007411	GGTG	2	8	20010	20017	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007411	AATT	2	8	20019	20026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007411	GTGC	2	8	21014	21021	0 %	25 %	50 %	25 %	75812647
59	NC_007411	AGAA	2	8	21139	21146	75 %	0 %	25 %	0 %	75812647
60	NC_007411	TTGA	2	8	21449	21456	25 %	50 %	25 %	0 %	75812648
61	NC_007411	ATTT	2	8	21761	21768	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007411	AATT	2	8	21873	21880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007411	CGAA	3	12	22281	22292	50 %	0 %	25 %	25 %	75812649
64	NC_007411	TTGA	2	8	22680	22687	25 %	50 %	25 %	0 %	75812649
65	NC_007411	AAGG	2	8	23264	23271	50 %	0 %	50 %	0 %	75812650
66	NC_007411	GGAT	2	8	23426	23433	25 %	25 %	50 %	0 %	75812650
67	NC_007411	TTGC	2	8	23457	23464	0 %	50 %	25 %	25 %	75812650
68	NC_007411	TGTT	2	8	23891	23898	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007411	TCCC	2	8	23996	24003	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
70	NC_007411	TTTC	2	8	24921	24928	0 %	75 %	0 %	25 %	75812651
71	NC_007411	CCTG	2	8	24969	24976	0 %	25 %	25 %	50 %	75812651
72	NC_007411	TTAC	2	8	25476	25483	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_007411	CAGA	2	8	26390	26397	50 %	0 %	25 %	25 %	75812653
74	NC_007411	CTAA	2	8	26623	26630	50 %	25 %	0 %	25 %	75812653
75	NC_007411	AGAA	2	8	26689	26696	75 %	0 %	25 %	0 %	75812653
76	NC_007411	TGTT	2	8	26844	26851	0 %	75 %	25 %	0 %	75812653
77	NC_007411	TTGC	2	8	27886	27893	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_007411	TTTG	2	8	27917	27924	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007411	CGCC	2	8	28928	28935	0 %	0 %	25 %	75 %	75812656
80	NC_007411	GCGA	2	8	29372	29379	25 %	0 %	50 %	25 %	75812656
81	NC_007411	AGCA	2	8	29700	29707	50 %	0 %	25 %	25 %	75812656
82	NC_007411	GTGA	2	8	29862	29869	25 %	25 %	50 %	0 %	75812657
83	NC_007411	AAAT	2	8	30020	30027	75 %	25 %	0 %	0 %	75812657
84	NC_007411	ATAA	2	8	30210	30217	75 %	25 %	0 %	0 %	75812657
85	NC_007411	CAAT	2	8	30597	30604	50 %	25 %	0 %	25 %	75812657
86	NC_007411	TGGT	2	8	30715	30722	0 %	50 %	50 %	0 %	75812657
87	NC_007411	GGGC	2	8	31028	31035	0 %	0 %	75 %	25 %	75812657
88	NC_007411	AGTA	2	8	31151	31158	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007411	AGGT	2	8	31176	31183	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007411	TGAC	2	8	31309	31316	25 %	25 %	25 %	25 %	75812658
91	NC_007411	TTCT	2	8	32079	32086	0 %	75 %	0 %	25 %	75812659
92	NC_007411	CTGG	2	8	32575	32582	0 %	25 %	50 %	25 %	75812659
93	NC_007411	TAAA	2	8	33398	33405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007411	CTTG	2	8	34040	34047	0 %	50 %	25 %	25 %	75812660
95	NC_007411	GCTT	3	12	34171	34182	0 %	50 %	25 %	25 %	75812660
96	NC_007411	AAAT	2	8	34764	34771	75 %	25 %	0 %	0 %	75812660
97	NC_007411	AATT	2	8	34789	34796	50 %	50 %	0 %	0 %	75812660
98	NC_007411	TAAG	2	8	35326	35333	50 %	25 %	25 %	0 %	75812660

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.