MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 plasmid B

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007411	AAT	2	6	989	994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007411	ATT	2	6	2899	2904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007411	TAA	2	6	2922	2927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007411	TGT	2	6	3561	3566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007411	ATT	2	6	3678	3683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007411	TCA	2	6	5124	5129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_007411	TTA	2	6	7378	7383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007411	AAT	2	6	9788	9793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007411	TTG	2	6	9860	9865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007411	CTC	2	6	17021	17026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_007411	TAA	2	6	17895	17900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007411	CTT	2	6	18132	18137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007411	TAG	2	6	18188	18193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007411	GAA	2	6	18199	18204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007411	AAG	2	6	18221	18226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007411	CTT	2	6	18237	18242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007411	AGA	2	6	18313	18318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007411	AGG	2	6	18378	18383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007411	ACG	2	6	18540	18545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007411	CCA	2	6	18552	18557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_007411	TAC	2	6	19020	19025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007411	TTA	2	6	19027	19032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007411	ATT	2	6	19674	19679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007411	CAT	2	6	19680	19685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007411	ATC	2	6	19796	19801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007411	CTA	2	6	19874	19879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007411	CTC	2	6	19910	19915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_007411	AAG	2	6	20087	20092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007411	AGT	2	6	20173	20178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007411	CGT	2	6	20232	20237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007411	GTT	2	6	20270	20275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007411	TCT	2	6	20281	20286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007411	TTC	2	6	21742	21747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007411	CGA	2	6	21805	21810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007411	ACA	2	6	23744	23749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007411	TCT	2	6	23936	23941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007411	TCC	2	6	23973	23978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_007411	GTA	2	6	24100	24105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007411	TTG	2	6	24111	24116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007411	TGG	2	6	24135	24140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007411	TCT	2	6	24170	24175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007411	TCA	2	6	24194	24199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007411	TTG	2	6	24213	24218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007411	TTA	2	6	25424	25429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007411	ATT	2	6	25588	25593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007411	CAG	2	6	25604	25609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007411	GTT	2	6	25630	25635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007411	CAA	2	6	28505	28510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007411	TTA	2	6	28658	28663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007411	GCA	2	6	28688	28693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007411	TGA	2	6	31231	31236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007411	GCA	2	6	31253	31258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007411	ACA	2	6	31845	31850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007411	ATA	2	6	31973	31978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007411	CTG	2	6	33195	33200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007411	AAT	2	6	33269	33274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007411	ACC	2	6	33561	33566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_007411	TTG	2	6	33570	33575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007411	AAG	2	6	33609	33614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.