MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 plasmid B

Total Repeats: 406

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007411	TTA	2	6	50	55	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812630
2	NC_007411	TGT	2	6	60	65	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812630
3	NC_007411	CAT	2	6	129	134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812630
4	NC_007411	TTA	2	6	146	151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812630
5	NC_007411	ATT	2	6	181	186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812630
6	NC_007411	TAG	2	6	236	241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812630
7	NC_007411	TTA	4	12	483	494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812630
8	NC_007411	CTT	2	6	519	524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812630
9	NC_007411	ATA	2	6	537	542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812630
10	NC_007411	TCC	2	6	739	744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	75812630
11	NC_007411	ATA	3	9	848	856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812630
12	NC_007411	TAA	2	6	873	878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812630
13	NC_007411	GCT	2	6	1126	1131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812631
14	NC_007411	TTA	2	6	1147	1152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812631
15	NC_007411	AAC	2	6	1207	1212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812631
16	NC_007411	AGT	2	6	1251	1256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812631
17	NC_007411	TGT	2	6	1336	1341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812631
18	NC_007411	TAA	2	6	1431	1436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812631
19	NC_007411	TTG	2	6	1473	1478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812631
20	NC_007411	TAC	2	6	1491	1496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812631
21	NC_007411	ACA	2	6	1534	1539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812631
22	NC_007411	AAT	2	6	1555	1560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812631
23	NC_007411	ACC	2	6	1668	1673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75812631
24	NC_007411	TGT	2	6	1726	1731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812631
25	NC_007411	CTA	2	6	1841	1846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812631
26	NC_007411	AGA	2	6	1890	1895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75812631
27	NC_007411	GTT	2	6	1973	1978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812631
28	NC_007411	AAT	2	6	1996	2001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812631
29	NC_007411	ACT	2	6	2016	2021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812631
30	NC_007411	TTG	2	6	2041	2046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812631
31	NC_007411	AAT	2	6	2069	2074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812631
32	NC_007411	TTC	2	6	2247	2252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812631
33	NC_007411	GTT	2	6	2287	2292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812631
34	NC_007411	TAC	2	6	2327	2332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812631
35	NC_007411	CAG	2	6	2339	2344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812631
36	NC_007411	TCT	2	6	2374	2379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812631
37	NC_007411	TCA	2	6	2428	2433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812631
38	NC_007411	TCT	2	6	2512	2517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812631
39	NC_007411	TAA	2	6	2585	2590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812631
40	NC_007411	CTG	2	6	2600	2605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812631
41	NC_007411	CTG	2	6	2857	2862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812631
42	NC_007411	ACT	2	6	3081	3086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812632
43	NC_007411	TCG	2	6	3107	3112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812632
44	NC_007411	ACC	2	6	3183	3188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75812632
45	NC_007411	TTC	2	6	3195	3200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812632
46	NC_007411	TGT	2	6	3312	3317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812632
47	NC_007411	AGT	2	6	3321	3326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812632
48	NC_007411	ATT	2	6	3403	3408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812632
49	NC_007411	GAA	2	6	3416	3421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75812632
50	NC_007411	AGA	2	6	3435	3440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75812632
51	NC_007411	CAT	2	6	3500	3505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812632
52	NC_007411	TCT	3	9	3709	3717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812633
53	NC_007411	TTG	2	6	3825	3830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812633
54	NC_007411	TTC	2	6	3846	3851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812633
55	NC_007411	TTG	2	6	3859	3864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812633
56	NC_007411	TTC	2	6	3903	3908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812633
57	NC_007411	CTT	2	6	3992	3997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812633
58	NC_007411	CAA	2	6	4028	4033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812633
59	NC_007411	ACT	2	6	4039	4044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812633
60	NC_007411	TCA	2	6	4171	4176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812633
61	NC_007411	TAA	2	6	4304	4309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812633
62	NC_007411	CTT	2	6	4310	4315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812633
63	NC_007411	AAT	2	6	4338	4343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812633
64	NC_007411	TCT	2	6	4447	4452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812633
65	NC_007411	TAG	2	6	4496	4501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812633
66	NC_007411	TCA	2	6	4534	4539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812633
67	NC_007411	ACC	2	6	4638	4643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75812633
68	NC_007411	ATC	2	6	4728	4733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812633
69	NC_007411	GTT	2	6	4885	4890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812633
70	NC_007411	GTA	2	6	4945	4950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812633
71	NC_007411	CTT	2	6	4970	4975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812633
72	NC_007411	TTG	2	6	4976	4981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812633
73	NC_007411	TGG	2	6	5151	5156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75812634
74	NC_007411	TAA	2	6	5259	5264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812634
75	NC_007411	CTT	2	6	5300	5305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812634
76	NC_007411	TAG	2	6	5599	5604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812635
77	NC_007411	CTT	2	6	5731	5736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812635
78	NC_007411	TAA	2	6	5834	5839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812635
79	NC_007411	ATC	2	6	5916	5921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812635
80	NC_007411	GCA	2	6	5988	5993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812635
81	NC_007411	CCG	2	6	6021	6026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75812635
82	NC_007411	TAC	2	6	6028	6033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812635
83	NC_007411	AAT	2	6	6039	6044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812635
84	NC_007411	TCC	2	6	6083	6088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	75812635
85	NC_007411	GAT	2	6	6119	6124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812635
86	NC_007411	ATA	2	6	6232	6237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812635
87	NC_007411	AAT	2	6	6257	6262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812635
88	NC_007411	AGC	2	6	6299	6304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812635
89	NC_007411	CAC	2	6	6334	6339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75812635
90	NC_007411	GAC	2	6	6580	6585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812635
91	NC_007411	CCA	2	6	6654	6659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75812635
92	NC_007411	AGC	2	6	6728	6733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812635
93	NC_007411	AAG	2	6	6787	6792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75812635
94	NC_007411	ATA	2	6	6928	6933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812635
95	NC_007411	TGC	2	6	6974	6979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812635
96	NC_007411	ACC	2	6	7004	7009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75812635
97	NC_007411	ACG	2	6	7127	7132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812635
98	NC_007411	GGC	2	6	7148	7153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	75812635
99	NC_007411	GAA	2	6	7191	7196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75812635
100	NC_007411	TTG	2	6	7229	7234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812635
101	NC_007411	CGC	2	6	7286	7291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	75812635
102	NC_007411	TAG	2	6	7325	7330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812635
103	NC_007411	ATC	2	6	7486	7491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812636
104	NC_007411	CAG	2	6	7542	7547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812636
105	NC_007411	CAT	2	6	7548	7553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812636
106	NC_007411	ACG	2	6	7663	7668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812636
107	NC_007411	CTT	2	6	7673	7678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812636
108	NC_007411	TGC	2	6	7695	7700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812636
109	NC_007411	AGT	2	6	7765	7770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812636
110	NC_007411	TGC	2	6	7800	7805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812636
111	NC_007411	CAG	2	6	7827	7832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812636
112	NC_007411	CAT	2	6	7836	7841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812636
113	NC_007411	ATC	2	6	8036	8041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812636
114	NC_007411	AAT	2	6	8120	8125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812636
115	NC_007411	CAG	2	6	8180	8185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812636
116	NC_007411	CCA	2	6	8247	8252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75812636
117	NC_007411	ACA	2	6	8258	8263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812636
118	NC_007411	ATT	2	6	8425	8430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812636
119	NC_007411	GTA	2	6	8474	8479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812636
120	NC_007411	TGA	2	6	8543	8548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812636
121	NC_007411	GTT	2	6	8602	8607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812636
122	NC_007411	ATA	2	6	8620	8625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812636
123	NC_007411	TTA	2	6	8711	8716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812636
124	NC_007411	AAT	2	6	8870	8875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812637
125	NC_007411	TTC	2	6	8988	8993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812637
126	NC_007411	GTT	2	6	9017	9022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812637
127	NC_007411	TAG	2	6	9131	9136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812637
128	NC_007411	AGC	2	6	9213	9218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812637
129	NC_007411	GAA	2	6	9386	9391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75812637
130	NC_007411	CAC	2	6	9476	9481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75812637
131	NC_007411	ATT	2	6	9736	9741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812637
132	NC_007411	AAT	2	6	9742	9747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812637
133	NC_007411	ATT	2	6	9760	9765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812637
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385	NC_007411	TTA	2	6	34005	34010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812660
386	NC_007411	GCT	2	6	34088	34093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812660
387	NC_007411	TGT	2	6	34122	34127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812660
388	NC_007411	TAA	2	6	34140	34145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812660
389	NC_007411	ACT	2	6	34187	34192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812660
390	NC_007411	TTG	2	6	34408	34413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812660
391	NC_007411	TGC	2	6	34483	34488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75812660
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393	NC_007411	AGC	2	6	34597	34602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812660
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402	NC_007411	TAT	2	6	35337	35342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812660
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406	NC_007411	CAG	2	6	35625	35630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812660

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.