MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 plasmid A

Total Repeats: 145

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007410	ATTAAC	2	12	2477	2488	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	75812286
2	NC_007410	CATTTA	2	12	2950	2961	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	75812286
3	NC_007410	AAATAC	2	12	8215	8226	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	75812290
4	NC_007410	GCCTCT	2	12	20770	20781	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	75812295
5	NC_007410	AAAGCC	2	12	23652	23663	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	75812298
6	NC_007410	GCATTA	2	12	29224	29235	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	75812301
7	NC_007410	ATTTAG	2	12	31982	31993	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	75812303
8	NC_007410	GGTGAT	2	12	32307	32318	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	75812304
9	NC_007410	AGCGAT	2	12	38962	38973	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	75812309
10	NC_007410	AATAAA	2	12	39412	39423	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	75812309
11	NC_007410	ATTTGA	2	12	40365	40376	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	75812309
12	NC_007410	AGAATT	2	12	41358	41369	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	75812309
13	NC_007410	CTCTAT	2	12	41581	41592	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	75812310
14	NC_007410	GCAACA	3	18	42110	42127	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	75812310
15	NC_007410	TGCTCA	2	12	52390	52401	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	75812323
16	NC_007410	AACTCA	2	12	54112	54123	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	75812325
17	NC_007410	GAGCTA	2	12	56474	56485	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	75812328
18	NC_007410	GAAAAA	2	12	58243	58254	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	75812330
19	NC_007410	GCAGAA	2	12	60631	60642	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	75812332
20	NC_007410	ACTTGG	2	12	62631	62642	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	75812333
21	NC_007410	ACAATA	2	12	64187	64198	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	75812335
22	NC_007410	CCCAAG	2	12	66008	66019	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	75812337
23	NC_007410	TTTGAA	2	12	67856	67867	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	75812339
24	NC_007410	CAAATC	2	12	73640	73651	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	75812346
25	NC_007410	TCGGTA	2	12	81005	81016	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	75812351
26	NC_007410	TTCGGT	2	12	81133	81144	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	75812351
27	NC_007410	GTTTTG	2	12	81223	81234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812351
28	NC_007410	GTTGCT	2	12	81462	81473	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	75812351
29	NC_007410	AGCTTT	2	12	85800	85811	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	75812355
30	NC_007410	TGCGGC	2	12	95222	95233	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	75812369
31	NC_007410	AATATA	2	12	99983	99994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812372
32	NC_007410	ATGTTG	2	12	101125	101136	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	75812373
33	NC_007410	AGAACC	2	12	105651	105662	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	75812377
34	NC_007410	TTCCCA	2	12	106375	106386	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	75812378
35	NC_007410	CCAAAA	2	12	106810	106821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812378
36	NC_007410	GAAGGT	2	12	107741	107752	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	75812380
37	NC_007410	AAGCTG	2	12	108089	108100	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	75812380
38	NC_007410	TAGCAT	2	12	113395	113406	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	75812386
39	NC_007410	CTGGTG	2	12	113419	113430	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	75812386
40	NC_007410	CTGGTG	2	12	114199	114210	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	75812386
41	NC_007410	GCGATC	2	12	116209	116220	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	75812388
42	NC_007410	CTGTTG	2	12	117160	117171	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	75812388
43	NC_007410	TGAGGG	2	12	125132	125143	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	75812391
44	NC_007410	TAGCAG	2	12	127858	127869	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	75812394
45	NC_007410	GATTCA	2	12	129578	129589	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	75812395
46	NC_007410	CATCTA	2	12	129930	129941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812395
47	NC_007410	TAGCTT	2	12	130290	130301	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	75812395
48	NC_007410	ATCTAA	2	12	131230	131241	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	75812396
49	NC_007410	GATATC	2	12	132432	132443	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	75812397
50	NC_007410	TTTTGA	2	12	138810	138821	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	75812404
51	NC_007410	GAAAAA	2	12	140082	140093	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	75812406
52	NC_007410	AATTCA	2	12	140977	140988	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	75812406
53	NC_007410	CTTTTC	2	12	142506	142517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812408
54	NC_007410	TGTTGG	2	12	146742	146753	0 %	50 %	50 %	0 %	75812412
55	NC_007410	TGGCAG	2	12	147763	147774	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	75812413
56	NC_007410	TTGATG	2	12	150066	150077	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	75812414
57	NC_007410	TAAAAC	2	12	153122	153133	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	75812417
58	NC_007410	TTCTCT	2	12	154385	154396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812419
59	NC_007410	CCACCG	2	12	160718	160729	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	75812427
60	NC_007410	GATTGA	2	12	161546	161557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812428
61	NC_007410	CTGCAC	2	12	162366	162377	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	75812429
62	NC_007410	CTTCAG	2	12	163016	163027	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	75812429
63	NC_007410	TTTGAA	2	12	168416	168427	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	75812432
64	NC_007410	TGATTT	2	12	173766	173777	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	75812438
65	NC_007410	TTTAAC	2	12	178552	178563	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	75812441
66	NC_007410	TAGAAT	2	12	178890	178901	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	75812442
67	NC_007410	CATTTA	2	12	178967	178978	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	75812442
68	NC_007410	AAAATC	2	12	179843	179854	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	75812443
69	NC_007410	ACACCC	2	12	179969	179980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75812443
70	NC_007410	TGCAAA	2	12	181166	181177	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	75812444
71	NC_007410	GATTTA	2	12	182626	182637	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	75812445
72	NC_007410	GCAGAA	2	12	190167	190178	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	75812451
73	NC_007410	CCAGTT	2	12	191116	191127	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	75812453
74	NC_007410	AGTGTG	2	12	191802	191813	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	75812453
75	NC_007410	GAATTT	2	12	192620	192631	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	75812454
76	NC_007410	GCTCTA	2	12	193061	193072	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	75812454
77	NC_007410	ATAAGG	2	12	198982	198993	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	75812458
78	NC_007410	CAAACA	2	12	200852	200863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75812460
79	NC_007410	TTTTTC	2	12	205599	205610	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	75812465
80	NC_007410	AAAGTT	2	12	209044	209055	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	75812467
81	NC_007410	GGATCA	2	12	210795	210806	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	75812468
82	NC_007410	TTCTCC	2	12	211317	211328	0 %	50 %	0 %	50 %	75812469
83	NC_007410	ATCAGT	2	12	211493	211504	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	75812469
84	NC_007410	CTAATC	2	12	215435	215446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812473
85	NC_007410	AATTCC	2	12	215526	215537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812473
86	NC_007410	TATTTT	2	12	217298	217309	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	75812475
87	NC_007410	TTTTGC	2	12	219098	219109	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	75812478
88	NC_007410	TGGTTG	2	12	219189	219200	0 %	50 %	50 %	0 %	75812478
89	NC_007410	CTACTC	2	12	223407	223418	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	75812482
90	NC_007410	CACCTG	2	12	223830	223841	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	75812482
91	NC_007410	GCAATA	2	12	230343	230354	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	75812489
92	NC_007410	TTAGTA	2	12	231453	231464	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	75812489
93	NC_007410	CTGCAA	2	12	233161	233172	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	75812490
94	NC_007410	AGTTTT	2	12	233749	233760	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	75812491
95	NC_007410	TGCAAC	2	12	233896	233907	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	75812491
96	NC_007410	CTAAAT	2	12	238899	238910	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	75812495
97	NC_007410	ACCCAA	2	12	239190	239201	50 %	0 %	0 %	50 %	75812496
98	NC_007410	GTCAGT	2	12	240723	240734	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	75812497
99	NC_007410	AAGCAG	2	12	241020	241031	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	75812498
100	NC_007410	GGCTGG	2	12	241501	241512	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	75812498
101	NC_007410	GAGTGA	2	12	243830	243841	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	75812499
102	NC_007410	AATCCA	2	12	245447	245458	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	75812500
103	NC_007410	CATCAG	2	12	246297	246308	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	75812500
104	NC_007410	TCGAGA	2	12	246476	246487	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	75812500
105	NC_007410	AATGGC	2	12	254341	254352	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	75812508
106	NC_007410	TAGTGA	2	12	257523	257534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75812510
107	NC_007410	TTGGAG	2	12	264422	264433	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	75812518
108	NC_007410	TGGCTA	2	12	264622	264633	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	75812518
109	NC_007410	TCTTTG	2	12	264635	264646	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	75812518
110	NC_007410	AGTATT	2	12	267845	267856	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	75812519
111	NC_007410	TCCTCA	2	12	269466	269477	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	75812519
112	NC_007410	GCTACG	2	12	270158	270169	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	75812520
113	NC_007410	ATTTCC	2	12	280456	280467	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	75812529
114	NC_007410	GAAAAA	2	12	281904	281915	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	75812532
115	NC_007410	AATTCA	2	12	282799	282810	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	75812532
116	NC_007410	CCCAAA	2	12	287075	287086	50 %	0 %	0 %	50 %	75812539
117	NC_007410	CCCTAA	2	12	289496	289507	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	75812543
118	NC_007410	TGTTCT	2	12	292049	292060	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	75812548
119	NC_007410	TGAGGT	2	12	301759	301770	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	75812562
120	NC_007410	AGGCTG	2	12	301890	301901	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	75812562
121	NC_007410	ATAAAT	2	12	302926	302937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75812563
122	NC_007410	GATATT	2	12	304469	304480	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	75812563
123	NC_007410	ATCCCT	2	12	310223	310234	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	75812569
124	NC_007410	ATCCCT	2	12	311527	311538	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	75812571
125	NC_007410	AAGCCA	2	12	315668	315679	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	75812575
126	NC_007410	GAAAAA	2	12	321105	321116	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	75812581
127	NC_007410	AATTCA	2	12	322000	322011	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	75812581
128	NC_007410	TTCGTC	2	12	324407	324418	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	75812584
129	NC_007410	AGGTAA	2	12	325723	325734	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	75812585
130	NC_007410	TTTAAC	2	12	326086	326097	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	75812585
131	NC_007410	TCAATA	2	12	326935	326946	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	75812586
132	NC_007410	TCAAGT	2	12	327082	327093	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	75812586
133	NC_007410	CAATTC	2	12	329477	329488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75812587
134	NC_007410	TTTCCT	2	12	330021	330032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75812588
135	NC_007410	ATTTAT	2	12	330195	330206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75812588
136	NC_007410	GAAATA	2	12	337441	337452	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	75812592
137	NC_007410	GTTGCA	2	12	343069	343080	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	75812596
138	NC_007410	TCCGAA	2	12	344134	344145	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	75812597
139	NC_007410	AAATCG	2	12	348507	348518	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	75812603
140	NC_007410	TAGTAT	2	12	350248	350259	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	75812605
141	NC_007410	TTTGGT	2	12	357351	357362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75812613
142	NC_007410	CGTAAA	2	12	362592	362603	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	75812622
143	NC_007410	TTGGTC	2	12	363638	363649	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	75812623
144	NC_007410	CAAACC	2	12	364640	364651	50 %	0 %	0 %	50 %	75812625
145	NC_007410	GACAGC	2	12	364788	364799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75812625

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.