MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 plasmid A

Total Repeats: 238

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007410	CATAA	2	10	103	112	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_007410	GTGTT	2	10	171	180	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007410	AGTTA	2	10	1062	1071	40 %	40 %	20 %	0 %	75812285
4	NC_007410	TGGAG	2	10	2445	2454	20 %	20 %	60 %	0 %	75812286
5	NC_007410	TAGTG	2	10	2625	2634	20 %	40 %	40 %	0 %	75812286
6	NC_007410	TATTT	2	10	6469	6478	20 %	80 %	0 %	0 %	75812290
7	NC_007410	ACTTC	2	10	11486	11495	20 %	40 %	0 %	40 %	75812292
8	NC_007410	TTTTA	2	10	13159	13168	20 %	80 %	0 %	0 %	75812293
9	NC_007410	AAGAA	2	10	16809	16818	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007410	CGGGT	2	10	17642	17651	0 %	20 %	60 %	20 %	75812295
11	NC_007410	TAAAT	2	10	18906	18915	60 %	40 %	0 %	0 %	75812295
12	NC_007410	AAATC	2	10	19805	19814	60 %	20 %	0 %	20 %	75812295
13	NC_007410	GGCTG	2	10	21253	21262	0 %	20 %	60 %	20 %	75812296
14	NC_007410	CGCCT	2	10	22030	22039	0 %	20 %	20 %	60 %	75812296
15	NC_007410	TTGCC	2	10	22833	22842	0 %	40 %	20 %	40 %	75812297
16	NC_007410	TGTTT	2	10	22912	22921	0 %	80 %	20 %	0 %	75812297
17	NC_007410	TTAGT	2	10	23115	23124	20 %	60 %	20 %	0 %	75812297
18	NC_007410	TCAAA	2	10	24396	24405	60 %	20 %	0 %	20 %	75812298
19	NC_007410	TAAAT	2	10	24954	24963	60 %	40 %	0 %	0 %	75812298
20	NC_007410	AAATT	2	10	26506	26515	60 %	40 %	0 %	0 %	75812300
21	NC_007410	TATGG	2	10	27653	27662	20 %	40 %	40 %	0 %	75812300
22	NC_007410	TTCAG	2	10	27705	27714	20 %	40 %	20 %	20 %	75812300
23	NC_007410	AAATT	2	10	28225	28234	60 %	40 %	0 %	0 %	75812300
24	NC_007410	ATTGA	2	10	30732	30741	40 %	40 %	20 %	0 %	75812302
25	NC_007410	TAGTT	2	10	31082	31091	20 %	60 %	20 %	0 %	75812302
26	NC_007410	TGGGG	2	10	35682	35691	0 %	20 %	80 %	0 %	75812307
27	NC_007410	AACAT	2	10	39005	39014	60 %	20 %	0 %	20 %	75812309
28	NC_007410	AAACT	2	10	39230	39239	60 %	20 %	0 %	20 %	75812309
29	NC_007410	TTTTA	2	10	43255	43264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007410	TCACT	2	10	43310	43319	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_007410	CTTGA	2	10	44424	44433	20 %	40 %	20 %	20 %	75812314
32	NC_007410	GCACT	2	10	44452	44461	20 %	20 %	20 %	40 %	75812314
33	NC_007410	ATAAA	2	10	45698	45707	80 %	20 %	0 %	0 %	75812316
34	NC_007410	TGGGA	2	10	53803	53812	20 %	20 %	60 %	0 %	75812325
35	NC_007410	AGCCA	2	10	55602	55611	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_007410	TAAAG	2	10	56449	56458	60 %	20 %	20 %	0 %	75812328
37	NC_007410	TTTAT	2	10	58282	58291	20 %	80 %	0 %	0 %	75812330
38	NC_007410	AAGAA	2	10	60222	60231	80 %	0 %	20 %	0 %	75812332
39	NC_007410	CAGAG	2	10	60852	60861	40 %	0 %	40 %	20 %	75812333
40	NC_007410	GTTAA	2	10	71417	71426	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007410	TTCAC	2	10	71464	71473	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_007410	ATGGA	2	10	71488	71497	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007410	AAAAT	2	10	71675	71684	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007410	AATGT	2	10	72282	72291	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007410	TGTAT	2	10	73493	73502	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007410	TCTTG	2	10	73586	73595	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_007410	ATAAA	2	10	75356	75365	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007410	CAAAT	2	10	76669	76678	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_007410	GTTTT	2	10	77488	77497	0 %	80 %	20 %	0 %	75812350
50	NC_007410	GTGCT	2	10	78233	78242	0 %	40 %	40 %	20 %	75812350
51	NC_007410	CAGTG	2	10	78425	78434	20 %	20 %	40 %	20 %	75812350
52	NC_007410	GTCTT	2	10	79671	79680	0 %	60 %	20 %	20 %	75812351
53	NC_007410	AGGCG	2	10	80446	80455	20 %	0 %	60 %	20 %	75812351
54	NC_007410	TTGAA	2	10	81612	81621	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007410	TTTCT	2	10	83371	83380	0 %	80 %	0 %	20 %	75812353
56	NC_007410	TTGAG	2	10	85780	85789	20 %	40 %	40 %	0 %	75812355
57	NC_007410	CTTTG	2	10	90319	90328	0 %	60 %	20 %	20 %	75812360
58	NC_007410	CAAGA	2	10	94012	94021	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_007410	ACTTC	2	10	97787	97796	20 %	40 %	0 %	40 %	75812371
60	NC_007410	TGGTG	2	10	98557	98566	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007410	ATGAT	2	10	100770	100779	40 %	40 %	20 %	0 %	75812372
62	NC_007410	AAATT	2	10	104924	104933	60 %	40 %	0 %	0 %	75812376
63	NC_007410	GACTC	2	10	106301	106310	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_007410	AGTGA	2	10	106888	106897	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007410	GCAGA	2	10	107314	107323	40 %	0 %	40 %	20 %	75812379
66	NC_007410	AACTT	2	10	107335	107344	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_007410	GTTAT	2	10	107561	107570	20 %	60 %	20 %	0 %	75812380
68	NC_007410	AGAAA	2	10	108523	108532	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007410	TCGTT	2	10	113380	113389	0 %	60 %	20 %	20 %	75812386
70	NC_007410	ATATT	2	10	115719	115728	40 %	60 %	0 %	0 %	75812387
71	NC_007410	TAGCG	2	10	115745	115754	20 %	20 %	40 %	20 %	75812387
72	NC_007410	ATGAA	2	10	115755	115764	60 %	20 %	20 %	0 %	75812387
73	NC_007410	TTTGA	2	10	115841	115850	20 %	60 %	20 %	0 %	75812387
74	NC_007410	CAAGT	2	10	117038	117047	40 %	20 %	20 %	20 %	75812388
75	NC_007410	TTGTG	2	10	117172	117181	0 %	60 %	40 %	0 %	75812388
76	NC_007410	TGCGT	2	10	117750	117759	0 %	40 %	40 %	20 %	75812388
77	NC_007410	CATTG	2	10	122792	122801	20 %	40 %	20 %	20 %	75812390
78	NC_007410	ATTTT	2	10	125965	125974	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007410	AAAAG	2	10	126265	126274	80 %	0 %	20 %	0 %	75812393
80	NC_007410	TTTGG	2	10	126824	126833	0 %	60 %	40 %	0 %	75812393
81	NC_007410	AAGGC	2	10	131902	131911	40 %	0 %	40 %	20 %	75812397
82	NC_007410	AGAAA	2	10	133203	133212	80 %	0 %	20 %	0 %	75812399
83	NC_007410	GAAAA	2	10	133735	133744	80 %	0 %	20 %	0 %	75812399
84	NC_007410	CAAAG	2	10	134854	134863	60 %	0 %	20 %	20 %	75812399
85	NC_007410	GAGCA	2	10	139944	139953	40 %	0 %	40 %	20 %	75812406
86	NC_007410	ATTGG	2	10	140502	140511	20 %	40 %	40 %	0 %	75812406
87	NC_007410	AGAAA	2	10	142091	142100	80 %	0 %	20 %	0 %	75812407
88	NC_007410	AAGTG	2	10	142426	142435	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007410	TCGCT	2	10	144336	144345	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_007410	CCCTT	2	10	144775	144784	0 %	40 %	0 %	60 %	75812411
91	NC_007410	TTACC	2	10	144964	144973	20 %	40 %	0 %	40 %	75812411
92	NC_007410	GAACC	2	10	146590	146599	40 %	0 %	20 %	40 %	75812412
93	NC_007410	CCGCC	2	10	146999	147008	0 %	0 %	20 %	80 %	75812412
94	NC_007410	ACAAG	2	10	148076	148085	60 %	0 %	20 %	20 %	75812413
95	NC_007410	ATGAT	2	10	152855	152864	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007410	TTATT	2	10	154725	154734	20 %	80 %	0 %	0 %	75812419
97	NC_007410	AGTTT	2	10	155144	155153	20 %	60 %	20 %	0 %	75812420
98	NC_007410	TTGAG	2	10	155191	155200	20 %	40 %	40 %	0 %	75812420
99	NC_007410	ATTCT	2	10	155418	155427	20 %	60 %	0 %	20 %	75812420
100	NC_007410	AATTC	2	10	157545	157554	40 %	40 %	0 %	20 %	75812422
101	NC_007410	CACTC	2	10	161089	161098	20 %	20 %	0 %	60 %	75812428
102	NC_007410	ACACC	2	10	162051	162060	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
103	NC_007410	TTCAT	2	10	162300	162309	20 %	60 %	0 %	20 %	75812429
104	NC_007410	AAGTT	2	10	163296	163305	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007410	GCAAC	2	10	163956	163965	40 %	0 %	20 %	40 %	75812430
106	NC_007410	ATTGA	2	10	167777	167786	40 %	40 %	20 %	0 %	75812432
107	NC_007410	TGATT	2	10	171536	171545	20 %	60 %	20 %	0 %	75812434
108	NC_007410	TTGTC	2	10	171989	171998	0 %	60 %	20 %	20 %	75812435
109	NC_007410	CCAAT	2	10	173323	173332	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_007410	TCAAC	2	10	173518	173527	40 %	20 %	0 %	40 %	75812437
111	NC_007410	TTTAC	2	10	175714	175723	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_007410	TAAAT	2	10	178393	178402	60 %	40 %	0 %	0 %	75812441
113	NC_007410	TTTGA	2	10	178517	178526	20 %	60 %	20 %	0 %	75812441
114	NC_007410	GGTTG	2	10	178639	178648	0 %	40 %	60 %	0 %	75812441
115	NC_007410	CTCCG	2	10	179649	179658	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
116	NC_007410	GAACT	2	10	187703	187712	40 %	20 %	20 %	20 %	75812449
117	NC_007410	CCATA	2	10	189849	189858	40 %	20 %	0 %	40 %	75812451
118	NC_007410	GATTC	2	10	190011	190020	20 %	40 %	20 %	20 %	75812451
119	NC_007410	GTTTG	2	10	193852	193861	0 %	60 %	40 %	0 %	75812455
120	NC_007410	GGAAA	2	10	198441	198450	60 %	0 %	40 %	0 %	75812458
121	NC_007410	AAATA	2	10	199568	199577	80 %	20 %	0 %	0 %	75812459
122	NC_007410	TCCTC	2	10	200211	200220	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
123	NC_007410	TGGGC	2	10	201538	201547	0 %	20 %	60 %	20 %	75812460
124	NC_007410	TTTCA	2	10	202889	202898	20 %	60 %	0 %	20 %	75812461
125	NC_007410	GTAAG	2	10	203949	203958	40 %	20 %	40 %	0 %	75812463
126	NC_007410	TAAGT	2	10	204174	204183	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007410	GGCTT	2	10	207668	207677	0 %	40 %	40 %	20 %	75812467
128	NC_007410	TCAAT	2	10	209250	209259	40 %	40 %	0 %	20 %	75812467
129	NC_007410	GTAAA	2	10	210972	210981	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007410	AGAGT	2	10	214601	214610	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007410	TAACT	2	10	215343	215352	40 %	40 %	0 %	20 %	75812473
132	NC_007410	CCCAA	2	10	215939	215948	40 %	0 %	0 %	60 %	75812473
133	NC_007410	GCTTG	2	10	217880	217889	0 %	40 %	40 %	20 %	75812476
134	NC_007410	TTCTT	2	10	218285	218294	0 %	80 %	0 %	20 %	75812477
135	NC_007410	AATAA	2	10	220575	220584	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007410	ACTAC	2	10	220676	220685	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_007410	AAAGC	2	10	221143	221152	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_007410	TTTTA	2	10	221331	221340	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007410	TGATT	2	10	222383	222392	20 %	60 %	20 %	0 %	75812481
140	NC_007410	CTTTT	2	10	222912	222921	0 %	80 %	0 %	20 %	75812481
141	NC_007410	ATTTT	2	10	223147	223156	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007410	TAGTT	2	10	225738	225747	20 %	60 %	20 %	0 %	75812484
143	NC_007410	ACCGA	2	10	229447	229456	40 %	0 %	20 %	40 %	75812488
144	NC_007410	CGGCG	2	10	233215	233224	0 %	0 %	60 %	40 %	75812490
145	NC_007410	TTTAA	2	10	234936	234945	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007410	CTGGG	2	10	238191	238200	0 %	20 %	60 %	20 %	75812495
147	NC_007410	ACCCA	2	10	239603	239612	40 %	0 %	0 %	60 %	75812496
148	NC_007410	GATTG	2	10	240021	240030	20 %	40 %	40 %	0 %	75812497
149	NC_007410	TGTAA	2	10	240111	240120	40 %	40 %	20 %	0 %	75812497
150	NC_007410	CAAAG	2	10	240197	240206	60 %	0 %	20 %	20 %	75812497
151	NC_007410	GATGC	2	10	241264	241273	20 %	20 %	40 %	20 %	75812498
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153	NC_007410	GGTTG	2	10	244578	244587	0 %	40 %	60 %	0 %	75812499
154	NC_007410	GAAAG	2	10	244797	244806	60 %	0 %	40 %	0 %	75812499
155	NC_007410	CTTTT	2	10	247714	247723	0 %	80 %	0 %	20 %	75812500
156	NC_007410	CAACA	2	10	249046	249055	60 %	0 %	0 %	40 %	75812502
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158	NC_007410	CTTCA	2	10	251842	251851	20 %	40 %	0 %	40 %	75812506
159	NC_007410	TTTCC	2	10	252063	252072	0 %	60 %	0 %	40 %	75812506
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161	NC_007410	AAATC	2	10	253665	253674	60 %	20 %	0 %	20 %	75812507
162	NC_007410	TACCG	2	10	259748	259757	20 %	20 %	20 %	40 %	75812513
163	NC_007410	ACGCC	2	10	261665	261674	20 %	0 %	20 %	60 %	75812515
164	NC_007410	TTTAC	2	10	262685	262694	20 %	60 %	0 %	20 %	75812516
165	NC_007410	TCAAT	2	10	263916	263925	40 %	40 %	0 %	20 %	75812516
166	NC_007410	TTTGA	2	10	263952	263961	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
167	NC_007410	GTTGT	2	10	266477	266486	0 %	60 %	40 %	0 %	75812518
168	NC_007410	GAGTT	2	10	266529	266538	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
169	NC_007410	ATTCC	2	10	267946	267955	20 %	40 %	0 %	40 %	75812519
170	NC_007410	TGTGG	2	10	269880	269889	0 %	40 %	60 %	0 %	75812520
171	NC_007410	TCAAC	2	10	271441	271450	40 %	20 %	0 %	40 %	75812520
172	NC_007410	AACCA	2	10	271496	271505	60 %	0 %	0 %	40 %	75812520
173	NC_007410	CAACT	2	10	271729	271738	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
174	NC_007410	ATGGG	2	10	272604	272613	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
175	NC_007410	CAATT	2	10	273416	273425	40 %	40 %	0 %	20 %	75812522
176	NC_007410	AAACC	2	10	274794	274803	60 %	0 %	0 %	40 %	75812524
177	NC_007410	TCACT	2	10	276000	276009	20 %	40 %	0 %	40 %	75812524
178	NC_007410	ACTGA	2	10	277114	277123	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
179	NC_007410	GAGCA	2	10	281766	281775	40 %	0 %	40 %	20 %	75812532
180	NC_007410	ATTGG	2	10	282324	282333	20 %	40 %	40 %	0 %	75812532
181	NC_007410	TAATT	2	10	286105	286114	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_007410	AGCAG	2	10	286193	286202	40 %	0 %	40 %	20 %	75812537
183	NC_007410	TGTTT	2	10	287473	287482	0 %	80 %	20 %	0 %	75812540
184	NC_007410	TAAAT	2	10	288626	288635	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_007410	TTTTC	2	10	289320	289329	0 %	80 %	0 %	20 %	75812543
186	NC_007410	GACAT	2	10	292541	292550	40 %	20 %	20 %	20 %	75812548
187	NC_007410	GCTGT	2	10	293445	293454	0 %	40 %	40 %	20 %	75812551
188	NC_007410	AATCC	2	10	294362	294371	40 %	20 %	0 %	40 %	75812552
189	NC_007410	TGTTT	2	10	295283	295292	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
190	NC_007410	AGTGG	2	10	295350	295359	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
191	NC_007410	GCGTT	2	10	296701	296710	0 %	40 %	40 %	20 %	75812558
192	NC_007410	CGGTA	2	10	301298	301307	20 %	20 %	40 %	20 %	75812562
193	NC_007410	GTGAT	2	10	302235	302244	20 %	40 %	40 %	0 %	75812562
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198	NC_007410	CTGAC	2	10	306830	306839	20 %	20 %	20 %	40 %	75812566
199	NC_007410	CTTCC	2	10	307127	307136	0 %	40 %	0 %	60 %	75812566
200	NC_007410	TTTGA	2	10	307725	307734	20 %	60 %	20 %	0 %	75812566
201	NC_007410	TCCCT	2	10	308211	308220	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
202	NC_007410	CCATA	2	10	308405	308414	40 %	20 %	0 %	40 %	75812567
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213	NC_007410	ATATT	2	10	324678	324687	40 %	60 %	0 %	0 %	75812584
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223	NC_007410	GTAAT	2	10	335225	335234	40 %	40 %	20 %	0 %	75812591
224	NC_007410	TTTAT	2	10	339446	339455	20 %	80 %	0 %	0 %	75812593
225	NC_007410	ACACT	2	10	342077	342086	40 %	20 %	0 %	40 %	75812595
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228	NC_007410	AAATT	2	10	351092	351101	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
229	NC_007410	AAGAA	2	10	351496	351505	80 %	0 %	20 %	0 %	75812607
230	NC_007410	CCAAC	2	10	352075	352084	40 %	0 %	0 %	60 %	75812607
231	NC_007410	AGTCA	2	10	353572	353581	40 %	20 %	20 %	20 %	75812608
232	NC_007410	TATGA	2	10	355810	355819	40 %	40 %	20 %	0 %	75812611
233	NC_007410	TTACC	2	10	357501	357510	20 %	40 %	0 %	40 %	75812614
234	NC_007410	ATTGC	2	10	358274	358283	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
235	NC_007410	AAGGT	2	10	359232	359241	40 %	20 %	40 %	0 %	75812616
236	NC_007410	ATTAG	2	10	364431	364440	40 %	40 %	20 %	0 %	75812624
237	NC_007410	TATAC	2	10	365842	365851	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
238	NC_007410	TCATA	2	10	366287	366296	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.