MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 plasmid A

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007410	CATAA	2	10	103	112	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_007410	GTGTT	2	10	171	180	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007410	AAGAA	2	10	16809	16818	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007410	TTTTA	2	10	43255	43264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007410	TCACT	2	10	43310	43319	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_007410	AGCCA	2	10	55602	55611	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_007410	GTTAA	2	10	71417	71426	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007410	TTCAC	2	10	71464	71473	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_007410	ATGGA	2	10	71488	71497	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007410	AAAAT	2	10	71675	71684	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007410	AATGT	2	10	72282	72291	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007410	TGTAT	2	10	73493	73502	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007410	TCTTG	2	10	73586	73595	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_007410	ATAAA	2	10	75356	75365	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007410	CAAAT	2	10	76669	76678	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_007410	TTGAA	2	10	81612	81621	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007410	CAAGA	2	10	94012	94021	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_007410	TGGTG	2	10	98557	98566	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007410	GACTC	2	10	106301	106310	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_007410	AGTGA	2	10	106888	106897	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007410	AACTT	2	10	107335	107344	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_007410	AGAAA	2	10	108523	108532	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007410	ATTTT	2	10	125965	125974	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007410	AAGTG	2	10	142426	142435	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007410	TCGCT	2	10	144336	144345	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_007410	ATGAT	2	10	152855	152864	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007410	ACACC	2	10	162051	162060	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
28	NC_007410	AAGTT	2	10	163296	163305	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007410	CCAAT	2	10	173323	173332	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_007410	TTTAC	2	10	175714	175723	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_007410	CTCCG	2	10	179649	179658	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_007410	TCCTC	2	10	200211	200220	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
33	NC_007410	TAAGT	2	10	204174	204183	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007410	GTAAA	2	10	210972	210981	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007410	AGAGT	2	10	214601	214610	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007410	AATAA	2	10	220575	220584	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007410	ACTAC	2	10	220676	220685	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_007410	AAAGC	2	10	221143	221152	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_007410	TTTTA	2	10	221331	221340	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007410	ATTTT	2	10	223147	223156	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007410	TTTAA	2	10	234936	234945	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007410	TTTGA	2	10	263952	263961	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007410	GAGTT	2	10	266529	266538	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007410	CAACT	2	10	271729	271738	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_007410	ATGGG	2	10	272604	272613	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007410	ACTGA	2	10	277114	277123	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_007410	TAATT	2	10	286105	286114	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007410	TAAAT	2	10	288626	288635	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007410	TGTTT	2	10	295283	295292	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007410	AGTGG	2	10	295350	295359	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007410	TCCCT	2	10	308211	308220	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
52	NC_007410	GTCAA	2	10	323475	323484	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_007410	AAATT	2	10	351092	351101	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007410	ATTGC	2	10	358274	358283	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_007410	TATAC	2	10	365842	365851	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_007410	TCATA	2	10	366287	366296	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.