MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrobacter winogradskyi Nb-255 chromosome

Total Repeats: 1519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007406	CAAA	2	8	292	299	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007406	TCAT	2	8	308	315	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_007406	CGGA	2	8	2197	2204	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007406	CTGA	2	8	9794	9801	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007406	CGAT	2	8	19798	19805	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_007406	CTCC	2	8	20378	20385	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_007406	CCGC	2	8	24010	24017	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_007406	GGGA	2	8	29572	29579	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007406	CTCC	2	8	32048	32055	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_007406	CGAC	2	8	33113	33120	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007406	GCGG	2	8	35517	35524	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_007406	TCGG	2	8	39177	39184	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_007406	ACCG	2	8	39334	39341	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007406	ATGT	2	8	39369	39376	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007406	CAGC	2	8	41018	41025	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_007406	TCCT	2	8	42236	42243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_007406	TCAA	2	8	44610	44617	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_007406	CGGC	2	8	45647	45654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007406	CGGC	2	8	63308	63315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007406	GCCG	2	8	63324	63331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_007406	TTTG	2	8	63334	63341	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007406	CCCT	2	8	63371	63378	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
23	NC_007406	CACC	2	8	66003	66010	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_007406	CATC	2	8	70191	70198	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007406	GTGC	2	8	71387	71394	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_007406	CGGC	2	8	72289	72296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_007406	GCAA	2	8	72338	72345	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_007406	CGAT	2	8	80133	80140	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_007406	GAAA	2	8	80926	80933	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007406	TCGA	2	8	81088	81095	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_007406	GCCG	2	8	81765	81772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007406	CCGG	2	8	82628	82635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007406	AAGA	2	8	87213	87220	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007406	GCTT	2	8	94917	94924	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_007406	ATGC	2	8	95119	95126	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_007406	CCAG	2	8	95255	95262	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_007406	CTGC	2	8	95833	95840	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_007406	TTTC	2	8	103806	103813	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_007406	CGCC	2	8	107070	107077	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_007406	ATTG	2	8	112604	112611	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007406	TCGC	2	8	120076	120083	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_007406	CGAT	2	8	120101	120108	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_007406	GGCC	2	8	126340	126347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_007406	CTCG	2	8	129390	129397	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_007406	TTGC	2	8	130788	130795	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_007406	TCAA	2	8	131462	131469	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007406	TTTC	2	8	131476	131483	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_007406	CGGG	2	8	135857	135864	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_007406	CCTG	2	8	135923	135930	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_007406	ATTT	2	8	135936	135943	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007406	AGCT	2	8	138382	138389	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_007406	GACG	2	8	140107	140114	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_007406	ACCT	2	8	148778	148785	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_007406	ATCG	2	8	151763	151770	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_007406	GAAA	2	8	152937	152944	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007406	AGCA	2	8	158453	158460	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_007406	AACC	2	8	160443	160450	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_007406	GGGA	2	8	163459	163466	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007406	GCCG	2	8	164787	164794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_007406	CGAT	2	8	164850	164857	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_007406	GGCG	2	8	167119	167126	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_007406	ACCC	2	8	168215	168222	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
63	NC_007406	CTTA	2	8	170269	170276	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_007406	CTTT	2	8	170375	170382	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_007406	CAGG	2	8	170758	170765	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_007406	GCTC	2	8	170845	170852	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_007406	TCAA	2	8	171186	171193	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_007406	CCAA	2	8	173285	173292	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_007406	TCAA	2	8	175813	175820	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_007406	AAAG	2	8	177553	177560	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007406	CCGT	2	8	178919	178926	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_007406	TGCC	2	8	180136	180143	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_007406	TCCG	2	8	183388	183395	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_007406	ATTG	2	8	185121	185128	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007406	GCGG	2	8	185962	185969	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_007406	TTGA	2	8	185987	185994	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007406	CCCG	2	8	194675	194682	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
78	NC_007406	GTTT	2	8	194784	194791	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007406	TGAT	2	8	194831	194838	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007406	TTGC	2	8	194850	194857	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_007406	ACGC	2	8	199942	199949	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007406	GCGG	2	8	201894	201901	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83	NC_007406	CAAT	2	8	207589	207596	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_007406	GGCG	2	8	207681	207688	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
85	NC_007406	CCCG	2	8	216340	216347	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
86	NC_007406	ATCG	2	8	218228	218235	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_007406	GCCC	2	8	218268	218275	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
88	NC_007406	CGAG	2	8	219500	219507	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_007406	CCCG	2	8	219549	219556	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
90	NC_007406	TGTT	2	8	229099	229106	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007406	GCGA	2	8	229127	229134	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_007406	GCCT	2	8	230375	230382	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_007406	ACGA	2	8	231037	231044	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_007406	GCAG	2	8	232771	232778	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_007406	CCGG	2	8	238038	238045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_007406	TCCG	2	8	241526	241533	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_007406	CGAC	2	8	241960	241967	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_007406	CCGC	2	8	242957	242964	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
99	NC_007406	TCGG	2	8	247025	247032	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_007406	TGTC	2	8	249775	249782	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_007406	CGCC	2	8	250972	250979	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
102	NC_007406	CGCC	2	8	255207	255214	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
103	NC_007406	TGCG	2	8	265513	265520	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_007406	AAAC	2	8	267055	267062	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_007406	TGGC	2	8	268431	268438	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_007406	CTTT	2	8	268629	268636	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_007406	ACTC	2	8	269761	269768	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_007406	ATCG	2	8	269792	269799	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_007406	GATC	2	8	269812	269819	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_007406	TTCG	2	8	270613	270620	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_007406	AGAA	2	8	273442	273449	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007406	CGGA	2	8	274747	274754	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_007406	CGGA	2	8	275074	275081	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_007406	GCCG	2	8	276642	276649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_007406	ATGC	2	8	278929	278936	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_007406	GTCG	2	8	279722	279729	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_007406	CAGT	2	8	280114	280121	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_007406	GCAG	2	8	287902	287909	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_007406	TTTC	2	8	306940	306947	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_007406	AAAT	2	8	308979	308986	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007406	GCCG	2	8	324206	324213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_007406	ATCC	2	8	336395	336402	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_007406	CGGA	2	8	340008	340015	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_007406	GGCG	2	8	343680	343687	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_007406	TTCA	2	8	345940	345947	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_007406	AGGC	2	8	350596	350603	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_007406	CGGG	2	8	354894	354901	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
128	NC_007406	CAGG	2	8	354971	354978	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_007406	GGCC	2	8	355602	355609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_007406	ATTG	2	8	357210	357217	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007406	GCCT	2	8	362602	362609	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_007406	GCCG	2	8	369238	369245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_007406	CACG	2	8	380047	380054	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_007406	CGGC	2	8	382524	382531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_007406	CGGA	2	8	383673	383680	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_007406	GCAA	2	8	385981	385988	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_007406	TCCT	2	8	390271	390278	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_007406	CTTT	2	8	398821	398828	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_007406	CGGG	2	8	409726	409733	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
140	NC_007406	CGAA	2	8	413993	414000	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_007406	AGCA	2	8	416202	416209	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_007406	ACCG	2	8	416227	416234	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_007406	CCGT	2	8	416726	416733	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_007406	ATCC	2	8	417257	417264	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_007406	CTCG	2	8	418700	418707	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_007406	CCGC	2	8	420359	420366	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
147	NC_007406	GTTT	2	8	420379	420386	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007406	TTTG	2	8	420440	420447	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007406	ATCC	2	8	420573	420580	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_007406	CATT	2	8	420639	420646	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_007406	GCCG	2	8	420674	420681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_007406	CGGA	2	8	423076	423083	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
153	NC_007406	TCCC	2	8	425380	425387	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
154	NC_007406	CGCC	2	8	425634	425641	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
155	NC_007406	GCGA	2	8	430754	430761	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
156	NC_007406	GATG	2	8	433474	433481	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
157	NC_007406	GGCC	2	8	434597	434604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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161	NC_007406	GCCG	2	8	447594	447601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
162	NC_007406	TCCG	2	8	447642	447649	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
163	NC_007406	GGCG	2	8	447938	447945	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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165	NC_007406	GCCG	2	8	447985	447992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
166	NC_007406	GAGC	2	8	450547	450554	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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500	NC_007406	CCGG	2	8	1091303	1091310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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