MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 plasmid pSS_046

Total Repeats: 482

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007385	GTCA	2	8	499	506	25 %	25 %	25 %	25 %	74314839
2	NC_007385	TCTA	2	8	1349	1356	25 %	50 %	0 %	25 %	74314841
3	NC_007385	ACAA	2	8	1658	1665	75 %	0 %	0 %	25 %	74314841
4	NC_007385	TCTT	2	8	1781	1788	0 %	75 %	0 %	25 %	74314841
5	NC_007385	CGCT	2	8	2560	2567	0 %	25 %	25 %	50 %	74314842
6	NC_007385	TTAT	2	8	2771	2778	25 %	75 %	0 %	0 %	74314842
7	NC_007385	TTGG	2	8	2855	2862	0 %	50 %	50 %	0 %	74314842
8	NC_007385	ACGA	2	8	3757	3764	50 %	0 %	25 %	25 %	74314844
9	NC_007385	CCAT	2	8	3781	3788	25 %	25 %	0 %	50 %	74314844
10	NC_007385	GACT	2	8	3817	3824	25 %	25 %	25 %	25 %	74314844
11	NC_007385	GCTG	2	8	4546	4553	0 %	25 %	50 %	25 %	74314844
12	NC_007385	GGCA	2	8	4627	4634	25 %	0 %	50 %	25 %	74314844
13	NC_007385	TATT	2	8	5511	5518	25 %	75 %	0 %	0 %	74314845
14	NC_007385	TGTT	2	8	6471	6478	0 %	75 %	25 %	0 %	74314845
15	NC_007385	AAAT	2	8	6815	6822	75 %	25 %	0 %	0 %	74314845
16	NC_007385	ACAT	2	8	6862	6869	50 %	25 %	0 %	25 %	74314845
17	NC_007385	TTTA	2	8	7186	7193	25 %	75 %	0 %	0 %	74314845
18	NC_007385	CATG	2	8	8089	8096	25 %	25 %	25 %	25 %	74314846
19	NC_007385	CCTG	2	8	8835	8842	0 %	25 %	25 %	50 %	74314847
20	NC_007385	TCAT	2	8	9445	9452	25 %	50 %	0 %	25 %	74314848
21	NC_007385	TCTT	2	8	9784	9791	0 %	75 %	0 %	25 %	74314848
22	NC_007385	ACGA	2	8	10658	10665	50 %	0 %	25 %	25 %	74314849
23	NC_007385	CCAT	2	8	10682	10689	25 %	25 %	0 %	50 %	74314849
24	NC_007385	GACT	2	8	10718	10725	25 %	25 %	25 %	25 %	74314849
25	NC_007385	GCTG	2	8	11447	11454	0 %	25 %	50 %	25 %	74314849
26	NC_007385	GGCA	2	8	11528	11535	25 %	0 %	50 %	25 %	74314849
27	NC_007385	TTTG	2	8	11739	11746	0 %	75 %	25 %	0 %	74314850
28	NC_007385	CCAG	2	8	12393	12400	25 %	0 %	25 %	50 %	74314851
29	NC_007385	CTGT	2	8	12898	12905	0 %	50 %	25 %	25 %	74314853
30	NC_007385	TACT	2	8	13018	13025	25 %	50 %	0 %	25 %	74314853
31	NC_007385	CAGT	2	8	13086	13093	25 %	25 %	25 %	25 %	74314854
32	NC_007385	ACTG	2	8	13100	13107	25 %	25 %	25 %	25 %	74314854
33	NC_007385	CGTC	2	8	13539	13546	0 %	25 %	25 %	50 %	74314854
34	NC_007385	CTGG	2	8	13822	13829	0 %	25 %	50 %	25 %	74314855
35	NC_007385	TCCG	2	8	14530	14537	0 %	25 %	25 %	50 %	74314856
36	NC_007385	ATCC	2	8	15075	15082	25 %	25 %	0 %	50 %	74314856
37	NC_007385	ATTC	2	8	15315	15322	25 %	50 %	0 %	25 %	74314856
38	NC_007385	ATGA	2	8	16066	16073	50 %	25 %	25 %	0 %	74314857
39	NC_007385	TCAG	2	8	16148	16155	25 %	25 %	25 %	25 %	74314857
40	NC_007385	AATA	2	8	16959	16966	75 %	25 %	0 %	0 %	74314859
41	NC_007385	TTTC	2	8	17129	17136	0 %	75 %	0 %	25 %	74314859
42	NC_007385	CAGA	2	8	17561	17568	50 %	0 %	25 %	25 %	74314859
43	NC_007385	AAAT	2	8	18864	18871	75 %	25 %	0 %	0 %	74314861
44	NC_007385	GCAG	2	8	20114	20121	25 %	0 %	50 %	25 %	74314862
45	NC_007385	GCCT	2	8	20508	20515	0 %	25 %	25 %	50 %	74314863
46	NC_007385	GGCT	2	8	20606	20613	0 %	25 %	50 %	25 %	74314863
47	NC_007385	TCGC	2	8	22072	22079	0 %	25 %	25 %	50 %	74314864
48	NC_007385	CATT	2	8	22126	22133	25 %	50 %	0 %	25 %	74314864
49	NC_007385	GCTG	2	8	22639	22646	0 %	25 %	50 %	25 %	74314864
50	NC_007385	AGCC	2	8	22834	22841	25 %	0 %	25 %	50 %	74314864
51	NC_007385	AAAC	2	8	23158	23165	75 %	0 %	0 %	25 %	74314865
52	NC_007385	CAGC	2	8	23222	23229	25 %	0 %	25 %	50 %	74314865
53	NC_007385	ACGC	2	8	23401	23408	25 %	0 %	25 %	50 %	74314865
54	NC_007385	GGCA	2	8	25089	25096	25 %	0 %	50 %	25 %	74314866
55	NC_007385	TGTC	2	8	25590	25597	0 %	50 %	25 %	25 %	74314866
56	NC_007385	TAAG	2	8	26648	26655	50 %	25 %	25 %	0 %	74314868
57	NC_007385	GGAT	2	8	27528	27535	25 %	25 %	50 %	0 %	74314868
58	NC_007385	ACCG	2	8	27844	27851	25 %	0 %	25 %	50 %	74314869
59	NC_007385	ACAG	2	8	28025	28032	50 %	0 %	25 %	25 %	74314869
60	NC_007385	ACGT	2	8	28706	28713	25 %	25 %	25 %	25 %	74314869
61	NC_007385	CTGG	2	8	29183	29190	0 %	25 %	50 %	25 %	74314870
62	NC_007385	GGTT	2	8	29443	29450	0 %	50 %	50 %	0 %	74314870
63	NC_007385	TCCT	2	8	29890	29897	0 %	50 %	0 %	50 %	74314871
64	NC_007385	GCAT	2	8	30161	30168	25 %	25 %	25 %	25 %	74314871
65	NC_007385	TCCA	2	8	30429	30436	25 %	25 %	0 %	50 %	74314871
66	NC_007385	TCCA	2	8	30555	30562	25 %	25 %	0 %	50 %	74314872
67	NC_007385	ACGG	2	8	31685	31692	25 %	0 %	50 %	25 %	74314873
68	NC_007385	GCCA	2	8	31721	31728	25 %	0 %	25 %	50 %	74314873
69	NC_007385	CGTC	2	8	31899	31906	0 %	25 %	25 %	50 %	74314873
70	NC_007385	GCTG	2	8	32210	32217	0 %	25 %	50 %	25 %	74314873
71	NC_007385	TCAA	2	8	32350	32357	50 %	25 %	0 %	25 %	74314873
72	NC_007385	CTGG	2	8	32668	32675	0 %	25 %	50 %	25 %	74314873
73	NC_007385	GTCA	2	8	32715	32722	25 %	25 %	25 %	25 %	74314873
74	NC_007385	GGCA	2	8	32906	32913	25 %	0 %	50 %	25 %	74314874
75	NC_007385	CTGG	2	8	33026	33033	0 %	25 %	50 %	25 %	74314874
76	NC_007385	CAAA	2	8	33354	33361	75 %	0 %	0 %	25 %	74314874
77	NC_007385	CCAC	2	8	33997	34004	25 %	0 %	0 %	75 %	74314875
78	NC_007385	ATAC	2	8	34177	34184	50 %	25 %	0 %	25 %	74314875
79	NC_007385	GTAA	2	8	34364	34371	50 %	25 %	25 %	0 %	74314875
80	NC_007385	CCAC	2	8	34378	34385	25 %	0 %	0 %	75 %	74314875
81	NC_007385	TCTT	2	8	34620	34627	0 %	75 %	0 %	25 %	74314875
82	NC_007385	CCCG	2	8	35789	35796	0 %	0 %	25 %	75 %	74314877
83	NC_007385	TCCT	2	8	35833	35840	0 %	50 %	0 %	50 %	74314877
84	NC_007385	GCGG	2	8	35845	35852	0 %	0 %	75 %	25 %	74314877
85	NC_007385	TGCC	2	8	35988	35995	0 %	25 %	25 %	50 %	74314877
86	NC_007385	CGGC	2	8	36494	36501	0 %	0 %	50 %	50 %	74314877
87	NC_007385	GGAT	2	8	36776	36783	25 %	25 %	50 %	0 %	74314877
88	NC_007385	TCTT	2	8	37622	37629	0 %	75 %	0 %	25 %	74314878
89	NC_007385	GGCA	2	8	39103	39110	25 %	0 %	50 %	25 %	74314879
90	NC_007385	TGTC	2	8	39604	39611	0 %	50 %	25 %	25 %	74314879
91	NC_007385	CAGT	2	8	40154	40161	25 %	25 %	25 %	25 %	74314880
92	NC_007385	GAAG	2	8	40206	40213	50 %	0 %	50 %	0 %	74314880
93	NC_007385	GCGT	2	8	42003	42010	0 %	25 %	50 %	25 %	74314883
94	NC_007385	GCTG	2	8	42182	42189	0 %	25 %	50 %	25 %	74314883
95	NC_007385	GTTT	2	8	42246	42253	0 %	75 %	25 %	0 %	74314883
96	NC_007385	TCCT	2	8	42698	42705	0 %	50 %	0 %	50 %	74314885
97	NC_007385	GCGG	2	8	42710	42717	0 %	0 %	75 %	25 %	74314885
98	NC_007385	TGCC	2	8	42853	42860	0 %	25 %	25 %	50 %	74314885
99	NC_007385	CGGC	2	8	43359	43366	0 %	0 %	50 %	50 %	74314885
100	NC_007385	GGAT	2	8	43641	43648	25 %	25 %	50 %	0 %	74314885
101	NC_007385	TACA	2	8	44806	44813	50 %	25 %	0 %	25 %	74314886
102	NC_007385	TTTC	2	8	45843	45850	0 %	75 %	0 %	25 %	74314886
103	NC_007385	AATA	2	8	46137	46144	75 %	25 %	0 %	0 %	74314886
104	NC_007385	ATAA	2	8	46531	46538	75 %	25 %	0 %	0 %	74314887
105	NC_007385	TGTC	2	8	46665	46672	0 %	50 %	25 %	25 %	74314887
106	NC_007385	AGTG	2	8	46773	46780	25 %	25 %	50 %	0 %	74314887
107	NC_007385	GACA	2	8	47137	47144	50 %	0 %	25 %	25 %	74314887
108	NC_007385	TTAT	2	8	47204	47211	25 %	75 %	0 %	0 %	74314887
109	NC_007385	GGAA	2	8	47445	47452	50 %	0 %	50 %	0 %	74314887
110	NC_007385	AATA	2	8	47544	47551	75 %	25 %	0 %	0 %	74314887
111	NC_007385	ACAG	2	8	47606	47613	50 %	0 %	25 %	25 %	74314887
112	NC_007385	TTGT	2	8	47890	47897	0 %	75 %	25 %	0 %	74314887
113	NC_007385	ATTA	2	8	48021	48028	50 %	50 %	0 %	0 %	74314887
114	NC_007385	ACGA	2	8	51251	51258	50 %	0 %	25 %	25 %	74314893
115	NC_007385	CCAT	2	8	51275	51282	25 %	25 %	0 %	50 %	74314893
116	NC_007385	GACT	2	8	51311	51318	25 %	25 %	25 %	25 %	74314893
117	NC_007385	GCTG	2	8	52040	52047	0 %	25 %	50 %	25 %	74314893
118	NC_007385	GGCA	2	8	52121	52128	25 %	0 %	50 %	25 %	74314893
119	NC_007385	CTGA	2	8	53761	53768	25 %	25 %	25 %	25 %	74314895
120	NC_007385	CTGC	2	8	53953	53960	0 %	25 %	25 %	50 %	74314895
121	NC_007385	GTTC	2	8	54040	54047	0 %	50 %	25 %	25 %	74314895
122	NC_007385	ACAA	2	8	54524	54531	75 %	0 %	0 %	25 %	74314895
123	NC_007385	GAAT	2	8	55071	55078	50 %	25 %	25 %	0 %	74314895
124	NC_007385	GCAG	2	8	55149	55156	25 %	0 %	50 %	25 %	74314895
125	NC_007385	TGAC	2	8	55307	55314	25 %	25 %	25 %	25 %	74314895
126	NC_007385	TTCA	2	8	56182	56189	25 %	50 %	0 %	25 %	74314896
127	NC_007385	AGGT	2	8	56421	56428	25 %	25 %	50 %	0 %	74314896
128	NC_007385	ACAA	2	8	56715	56722	75 %	0 %	0 %	25 %	74314896
129	NC_007385	GAAT	2	8	57262	57269	50 %	25 %	25 %	0 %	74314896
130	NC_007385	GCAG	2	8	57340	57347	25 %	0 %	50 %	25 %	74314896
131	NC_007385	TGAC	2	8	57498	57505	25 %	25 %	25 %	25 %	74314896
132	NC_007385	TTAC	2	8	58304	58311	25 %	50 %	0 %	25 %	74314898
133	NC_007385	GTAT	2	8	58491	58498	25 %	50 %	25 %	0 %	74314898
134	NC_007385	GTGG	2	8	58671	58678	0 %	25 %	75 %	0 %	74314898
135	NC_007385	CCCG	2	8	59357	59364	0 %	0 %	25 %	75 %	74314899
136	NC_007385	TCCT	2	8	59401	59408	0 %	50 %	0 %	50 %	74314899
137	NC_007385	GCGG	2	8	59413	59420	0 %	0 %	75 %	25 %	74314899
138	NC_007385	TGCC	2	8	59556	59563	0 %	25 %	25 %	50 %	74314899
139	NC_007385	CGGC	2	8	60062	60069	0 %	0 %	50 %	50 %	74314899
140	NC_007385	TAAA	2	8	61826	61833	75 %	25 %	0 %	0 %	74314902
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142	NC_007385	ATTT	2	8	62921	62928	25 %	75 %	0 %	0 %	74314902
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