MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 plasmid pSS_046

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007385	AG	3	6	65	70	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007385	AT	3	6	1156	1161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007385	AT	3	6	8375	8380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007385	AT	5	10	10001	10010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007385	CT	3	6	10491	10496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_007385	AT	3	6	16797	16802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007385	TC	3	6	17670	17675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007385	TG	3	6	17683	17688	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007385	CT	3	6	18593	18598	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007385	AG	3	6	18604	18609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007385	AT	3	6	19398	19403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007385	GA	3	6	19706	19711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007385	GT	3	6	25994	25999	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007385	GC	3	6	26523	26528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_007385	GA	3	6	29771	29776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007385	AG	3	6	31602	31607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007385	CT	3	6	35605	35610	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_007385	AG	4	8	37043	37050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007385	AT	3	6	40847	40852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007385	AG	3	6	40911	40916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007385	AT	3	6	40960	40965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007385	AT	3	6	41032	41037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007385	AT	3	6	41087	41092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007385	AG	4	8	43908	43915	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007385	CA	3	6	44229	44234	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_007385	TA	3	6	44319	44324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007385	TA	3	6	44613	44618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007385	TA	4	8	44650	44657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007385	AT	3	6	46201	46206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007385	AT	3	6	46470	46475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007385	GT	3	6	52844	52849	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007385	CA	3	6	53289	53294	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007385	CT	3	6	59173	59178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007385	TG	3	6	60261	60266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007385	CG	3	6	60328	60333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_007385	AG	4	8	60441	60448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007385	AT	3	6	61526	61531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007385	AT	4	8	63184	63191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007385	AG	3	6	63328	63333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007385	TC	4	8	64967	64974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_007385	CG	3	6	65083	65088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_007385	CT	3	6	76448	76453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007385	AT	3	6	76737	76742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007385	TG	3	6	78169	78174	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007385	TG	3	6	78225	78230	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007385	AT	3	6	78591	78596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007385	AT	3	6	83331	83336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007385	AT	3	6	89322	89327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007385	AT	3	6	89329	89334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007385	AT	3	6	89463	89468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007385	AG	3	6	89492	89497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007385	CA	3	6	103791	103796	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_007385	AG	3	6	109073	109078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007385	TA	3	6	109109	109114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007385	AT	3	6	114270	114275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007385	AC	3	6	114283	114288	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007385	TA	3	6	115118	115123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007385	AG	3	6	116176	116181	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007385	AG	3	6	118262	118267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007385	AT	4	8	125573	125580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007385	AT	3	6	125937	125942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007385	AT	3	6	125979	125984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007385	AT	3	6	125991	125996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007385	GA	3	6	133645	133650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007385	TA	4	8	138374	138381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007385	AT	3	6	138508	138513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007385	AC	3	6	138585	138590	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_007385	AT	3	6	139580	139585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007385	TC	3	6	140250	140255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_007385	CT	3	6	145173	145178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_007385	AT	3	6	146211	146216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007385	TA	3	6	148270	148275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007385	TA	3	6	148281	148286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007385	GT	3	6	160638	160643	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007385	GC	3	6	162672	162677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_007385	AG	3	6	177277	177282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007385	TG	3	6	177784	177789	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007385	TC	4	8	183267	183274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_007385	AG	3	6	184708	184713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007385	TC	3	6	187267	187272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_007385	AT	3	6	187308	187313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007385	AT	3	6	187422	187427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007385	TC	4	8	191251	191258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_007385	CT	3	6	206707	206712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_007385	GA	3	6	212799	212804	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.