MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 plasmid pSS_046

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007385	A	6	6	1022	1027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007385	T	7	7	1076	1082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007385	A	6	6	2179	2184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007385	T	6	6	2253	2258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007385	T	6	6	2301	2306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007385	T	6	6	2320	2325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007385	T	6	6	3584	3589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007385	T	6	6	4928	4933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007385	T	7	7	4969	4975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007385	T	7	7	5053	5059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007385	T	6	6	11923	11928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007385	A	6	6	15817	15822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007385	A	6	6	16512	16517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007385	T	7	7	16871	16877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007385	T	8	8	16926	16933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007385	A	6	6	17794	17799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007385	T	6	6	18583	18588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007385	A	6	6	21186	21191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007385	A	6	6	21252	21257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007385	G	6	6	22881	22886	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007385	C	6	6	24249	24254	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22	NC_007385	T	8	8	26585	26592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007385	T	8	8	28883	28890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007385	A	6	6	37006	37011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007385	T	6	6	38150	38155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007385	A	6	6	40449	40454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007385	T	7	7	40461	40467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007385	A	6	6	40499	40504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007385	G	8	8	41147	41154	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007385	A	6	6	43871	43876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007385	A	7	7	44294	44300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007385	A	7	7	44345	44351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007385	A	6	6	44384	44389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007385	T	7	7	44466	44472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007385	A	6	6	44537	44542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007385	C	6	6	46324	46329	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37	NC_007385	C	6	6	46355	46360	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
38	NC_007385	T	6	6	49835	49840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007385	T	7	7	53356	53362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007385	A	7	7	53506	53512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007385	T	6	6	55496	55501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007385	T	7	7	55728	55734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007385	A	6	6	60404	60409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007385	A	6	6	63281	63286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007385	T	6	6	65007	65012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007385	G	9	9	67354	67362	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007385	C	6	6	71183	71188	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48	NC_007385	G	6	6	73511	73516	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007385	C	6	6	74879	74884	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50	NC_007385	C	6	6	76104	76109	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51	NC_007385	A	6	6	76967	76972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007385	T	6	6	78074	78079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007385	G	6	6	78111	78116	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007385	T	6	6	78606	78611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007385	T	6	6	78643	78648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007385	A	7	7	78663	78669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007385	A	6	6	80139	80144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007385	T	6	6	89518	89523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007385	A	10	10	103807	103816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007385	G	6	6	114436	114441	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007385	C	6	6	114987	114992	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
62	NC_007385	A	6	6	115892	115897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007385	T	6	6	121055	121060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007385	T	6	6	123834	123839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007385	T	7	7	124300	124306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007385	T	7	7	125893	125899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007385	T	7	7	129873	129879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007385	A	6	6	138427	138432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007385	A	6	6	145300	145305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007385	A	7	7	146123	146129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007385	A	6	6	146139	146144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007385	T	6	6	146179	146184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007385	T	7	7	146324	146330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007385	A	6	6	146361	146366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007385	T	7	7	150117	150123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007385	C	6	6	154936	154941	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
77	NC_007385	T	7	7	155129	155135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007385	T	6	6	176589	176594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007385	T	6	6	177738	177743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007385	G	6	6	177802	177807	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007385	A	6	6	180153	180158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007385	A	6	6	181686	181691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007385	A	6	6	181706	181711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007385	C	6	6	181745	181750	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
85	NC_007385	A	6	6	182052	182057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007385	T	6	6	183307	183312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007385	T	7	7	187383	187389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007385	T	7	7	187427	187433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007385	T	6	6	187494	187499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007385	T	8	8	187607	187614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007385	T	6	6	187696	187701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007385	A	6	6	187761	187766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007385	T	7	7	187771	187777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007385	A	7	7	187809	187815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007385	A	7	7	187969	187975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007385	T	6	6	188077	188082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007385	T	6	6	191291	191296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007385	T	6	6	193349	193354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007385	A	7	7	195876	195882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007385	T	6	6	208266	208271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007385	A	6	6	212274	212279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007385	T	8	8	212921	212928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007385	A	6	6	213060	213065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007385	A	6	6	214215	214220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.