MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 plasmid pSS_046

Total Repeats: 394

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007385	A	6	6	1271	1276	100 %	0 %	0 %	0 %	74314841
2	NC_007385	T	7	7	1309	1315	0 %	100 %	0 %	0 %	74314841
3	NC_007385	A	6	6	1423	1428	100 %	0 %	0 %	0 %	74314841
4	NC_007385	A	7	7	1535	1541	100 %	0 %	0 %	0 %	74314841
5	NC_007385	T	7	7	1808	1814	0 %	100 %	0 %	0 %	74314841
6	NC_007385	A	7	7	1844	1850	100 %	0 %	0 %	0 %	74314841
7	NC_007385	T	6	6	2393	2398	0 %	100 %	0 %	0 %	74314842
8	NC_007385	A	6	6	3061	3066	100 %	0 %	0 %	0 %	74314842
9	NC_007385	T	6	6	3498	3503	0 %	100 %	0 %	0 %	74314843
10	NC_007385	A	6	6	3507	3512	100 %	0 %	0 %	0 %	74314843
11	NC_007385	A	6	6	4689	4694	100 %	0 %	0 %	0 %	74314844
12	NC_007385	A	6	6	5495	5500	100 %	0 %	0 %	0 %	74314845
13	NC_007385	T	7	7	5532	5538	0 %	100 %	0 %	0 %	74314845
14	NC_007385	T	6	6	5720	5725	0 %	100 %	0 %	0 %	74314845
15	NC_007385	T	6	6	5804	5809	0 %	100 %	0 %	0 %	74314845
16	NC_007385	G	6	6	5843	5848	0 %	0 %	100 %	0 %	74314845
17	NC_007385	A	6	6	6025	6030	100 %	0 %	0 %	0 %	74314845
18	NC_007385	A	7	7	6556	6562	100 %	0 %	0 %	0 %	74314845
19	NC_007385	T	8	8	6755	6762	0 %	100 %	0 %	0 %	74314845
20	NC_007385	A	8	8	6771	6778	100 %	0 %	0 %	0 %	74314845
21	NC_007385	T	6	6	6852	6857	0 %	100 %	0 %	0 %	74314845
22	NC_007385	T	6	6	6869	6874	0 %	100 %	0 %	0 %	74314845
23	NC_007385	T	6	6	7154	7159	0 %	100 %	0 %	0 %	74314845
24	NC_007385	A	7	7	8150	8156	100 %	0 %	0 %	0 %	74314846
25	NC_007385	T	6	6	8338	8343	0 %	100 %	0 %	0 %	74314846
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27	NC_007385	T	6	6	9912	9917	0 %	100 %	0 %	0 %	74314848
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30	NC_007385	T	6	6	12615	12620	0 %	100 %	0 %	0 %	74314852
31	NC_007385	A	7	7	13058	13064	100 %	0 %	0 %	0 %	74314853
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.