MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 9368

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007384	CAGG	2	8	420	427	25 %	0 %	50 %	25 %	74310616
2	NC_007384	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	74310616
3	NC_007384	GCTG	2	8	975	982	0 %	25 %	50 %	25 %	74310616
4	NC_007384	GGAC	2	8	1013	1020	25 %	0 %	50 %	25 %	74310616
5	NC_007384	GCTG	2	8	1802	1809	0 %	25 %	50 %	25 %	74310616
6	NC_007384	CCAG	2	8	2003	2010	25 %	0 %	25 %	50 %	74310616
7	NC_007384	GCAA	2	8	3030	3037	50 %	0 %	25 %	25 %	74310617
8	NC_007384	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	74310617
9	NC_007384	CAGC	2	8	3283	3290	25 %	0 %	25 %	50 %	74310617
10	NC_007384	CTGG	2	8	3419	3426	0 %	25 %	50 %	25 %	74310617
11	NC_007384	TTCA	2	8	3428	3435	25 %	50 %	0 %	25 %	74310617
12	NC_007384	AGCG	2	8	3565	3572	25 %	0 %	50 %	25 %	74310617
13	NC_007384	CTGA	2	8	3851	3858	25 %	25 %	25 %	25 %	74310618
14	NC_007384	CAGT	2	8	5766	5773	25 %	25 %	25 %	25 %	74310620
15	NC_007384	AGCG	2	8	6270	6277	25 %	0 %	50 %	25 %	74310620
16	NC_007384	GCTG	2	8	7615	7622	0 %	25 %	50 %	25 %	74310621
17	NC_007384	TGGC	2	8	7748	7755	0 %	25 %	50 %	25 %	74310621
18	NC_007384	CAAC	2	8	9111	9118	50 %	0 %	0 %	50 %	74310622
19	NC_007384	TTGA	2	8	9164	9171	25 %	50 %	25 %	0 %	74310622
20	NC_007384	CGAC	2	8	9231	9238	25 %	0 %	25 %	50 %	74310622
21	NC_007384	AAGA	2	8	9587	9594	75 %	0 %	25 %	0 %	74310622
22	NC_007384	GCTG	2	8	9766	9773	0 %	25 %	50 %	25 %	74310622
23	NC_007384	AGAT	2	8	10771	10778	50 %	25 %	25 %	0 %	74310624
24	NC_007384	AGAA	2	8	11045	11052	75 %	0 %	25 %	0 %	74310624
25	NC_007384	GCAG	2	8	11448	11455	25 %	0 %	50 %	25 %	74310625
26	NC_007384	CATT	2	8	12126	12133	25 %	50 %	0 %	25 %	74310625
27	NC_007384	CAGT	2	8	12273	12280	25 %	25 %	25 %	25 %	74310626
28	NC_007384	ATGG	2	8	12993	13000	25 %	25 %	50 %	0 %	74310627
29	NC_007384	TGGT	2	8	13084	13091	0 %	50 %	50 %	0 %	74310627
30	NC_007384	ACCG	2	8	13451	13458	25 %	0 %	25 %	50 %	74310627
31	NC_007384	AAGA	2	8	13671	13678	75 %	0 %	25 %	0 %	74310627
32	NC_007384	GTGG	2	8	13956	13963	0 %	25 %	75 %	0 %	74310627
33	NC_007384	CCAT	2	8	14248	14255	25 %	25 %	0 %	50 %	74310627
34	NC_007384	GACA	2	8	17055	17062	50 %	0 %	25 %	25 %	74310630
35	NC_007384	TGCC	2	8	17556	17563	0 %	25 %	25 %	50 %	74310630
36	NC_007384	ACGG	2	8	18013	18020	25 %	0 %	50 %	25 %	74310631
37	NC_007384	GCCA	2	8	18049	18056	25 %	0 %	25 %	50 %	74310631
38	NC_007384	CGTC	2	8	18227	18234	0 %	25 %	25 %	50 %	74310631
39	NC_007384	GCTG	2	8	18538	18545	0 %	25 %	50 %	25 %	74310631
40	NC_007384	TCAA	2	8	18678	18685	50 %	25 %	0 %	25 %	74310631
41	NC_007384	CTGG	2	8	18996	19003	0 %	25 %	50 %	25 %	74310631
42	NC_007384	GTCA	2	8	19043	19050	25 %	25 %	25 %	25 %	74310631
43	NC_007384	GGCA	2	8	19234	19241	25 %	0 %	50 %	25 %	74310632
44	NC_007384	CTGG	2	8	19354	19361	0 %	25 %	50 %	25 %	74310632
45	NC_007384	CAAA	2	8	19682	19689	75 %	0 %	0 %	25 %	74310632
46	NC_007384	GGTT	2	8	20718	20725	0 %	50 %	50 %	0 %	74310634
47	NC_007384	GTGG	2	8	21342	21349	0 %	25 %	75 %	0 %	74310634
48	NC_007384	CGTT	2	8	21714	21721	0 %	50 %	25 %	25 %	74310634
49	NC_007384	TTTA	2	8	21886	21893	25 %	75 %	0 %	0 %	74310635
50	NC_007384	CCAC	2	8	22189	22196	25 %	0 %	0 %	75 %	74310635
51	NC_007384	AATA	2	8	22819	22826	75 %	25 %	0 %	0 %	74310636
52	NC_007384	CTTC	2	8	22841	22848	0 %	50 %	0 %	50 %	74310636
53	NC_007384	TGTT	2	8	24115	24122	0 %	75 %	25 %	0 %	74310637
54	NC_007384	GCTG	2	8	24922	24929	0 %	25 %	50 %	25 %	74310638
55	NC_007384	TGGC	2	8	25055	25062	0 %	25 %	50 %	25 %	74310638
56	NC_007384	TGGC	2	8	25352	25359	0 %	25 %	50 %	25 %	74310639
57	NC_007384	TAAA	2	8	26786	26793	75 %	25 %	0 %	0 %	74310640
58	NC_007384	CATA	2	8	28590	28597	50 %	25 %	0 %	25 %	74310643
59	NC_007384	TGCG	2	8	28846	28853	0 %	25 %	50 %	25 %	74310643
60	NC_007384	GCGT	2	8	29054	29061	0 %	25 %	50 %	25 %	74310643
61	NC_007384	CCGC	2	8	29477	29484	0 %	0 %	25 %	75 %	74310643
62	NC_007384	CTGG	2	8	29834	29841	0 %	25 %	50 %	25 %	74310644
63	NC_007384	CTGC	2	8	30295	30302	0 %	25 %	25 %	50 %	74310644
64	NC_007384	TGCG	2	8	30845	30852	0 %	25 %	50 %	25 %	74310644
65	NC_007384	TGGT	2	8	31257	31264	0 %	50 %	50 %	0 %	74310644
66	NC_007384	GTGG	2	8	32050	32057	0 %	25 %	75 %	0 %	74310644
67	NC_007384	GCTG	2	8	32404	32411	0 %	25 %	50 %	25 %	74310645
68	NC_007384	ATGG	2	8	33301	33308	25 %	25 %	50 %	0 %	74310646
69	NC_007384	TTGA	2	8	34172	34179	25 %	50 %	25 %	0 %	74310647
70	NC_007384	TGGC	2	8	34715	34722	0 %	25 %	50 %	25 %	74310648
71	NC_007384	CTGG	2	8	35175	35182	0 %	25 %	50 %	25 %	74310648
72	NC_007384	GCTG	2	8	35692	35699	0 %	25 %	50 %	25 %	74310649
73	NC_007384	CGTG	2	8	36169	36176	0 %	25 %	50 %	25 %	74310649
74	NC_007384	TCCT	2	8	36951	36958	0 %	50 %	0 %	50 %	74310650
75	NC_007384	CTTA	2	8	36979	36986	25 %	50 %	0 %	25 %	74310650
76	NC_007384	AGCC	2	8	37881	37888	25 %	0 %	25 %	50 %	74310650
77	NC_007384	GACC	2	8	38147	38154	25 %	0 %	25 %	50 %	74310651
78	NC_007384	CGCA	2	8	39147	39154	25 %	0 %	25 %	50 %	74310651
79	NC_007384	CTGT	2	8	39321	39328	0 %	50 %	25 %	25 %	74310651
80	NC_007384	GGCG	2	8	39497	39504	0 %	0 %	75 %	25 %	74310651
81	NC_007384	ACCG	2	8	39651	39658	25 %	0 %	25 %	50 %	74310651
82	NC_007384	CGTC	2	8	40125	40132	0 %	25 %	25 %	50 %	74310651
83	NC_007384	GGCG	2	8	40334	40341	0 %	0 %	75 %	25 %	74310651
84	NC_007384	TGGC	2	8	40588	40595	0 %	25 %	50 %	25 %	74310651
85	NC_007384	GCTG	2	8	40601	40608	0 %	25 %	50 %	25 %	74310651
86	NC_007384	GCCA	2	8	41565	41572	25 %	0 %	25 %	50 %	74310652
87	NC_007384	CAGC	2	8	41698	41705	25 %	0 %	25 %	50 %	74310652
88	NC_007384	GGTG	2	8	42309	42316	0 %	25 %	75 %	0 %	161986601
89	NC_007384	AAGA	2	8	42544	42551	75 %	0 %	25 %	0 %	161986601
90	NC_007384	CCAT	2	8	43120	43127	25 %	25 %	0 %	50 %	74310654
91	NC_007384	ATTT	2	8	44334	44341	25 %	75 %	0 %	0 %	74310655
92	NC_007384	TTCT	2	8	44346	44353	0 %	75 %	0 %	25 %	74310656
93	NC_007384	TTCA	2	8	44477	44484	25 %	50 %	0 %	25 %	74310656
94	NC_007384	AGCC	2	8	44691	44698	25 %	0 %	25 %	50 %	74310656
95	NC_007384	CCCG	2	8	44853	44860	0 %	0 %	25 %	75 %	74310656
96	NC_007384	TCGG	2	8	45325	45332	0 %	25 %	50 %	25 %	74310656
97	NC_007384	GGCG	2	8	45604	45611	0 %	0 %	75 %	25 %	74310656
98	NC_007384	CCGA	2	8	49044	49051	25 %	0 %	25 %	50 %	74310659
99	NC_007384	CCCG	2	8	49440	49447	0 %	0 %	25 %	75 %	74310659
100	NC_007384	TCCA	2	8	49492	49499	25 %	25 %	0 %	50 %	74310659
101	NC_007384	TTAA	2	8	49745	49752	50 %	50 %	0 %	0 %	74310660
102	NC_007384	TATC	2	8	50138	50145	25 %	50 %	0 %	25 %	74310660
103	NC_007384	CACC	2	8	50289	50296	25 %	0 %	0 %	75 %	74310660
104	NC_007384	AGCC	2	8	50856	50863	25 %	0 %	25 %	50 %	74310660
105	NC_007384	CCAG	2	8	51056	51063	25 %	0 %	25 %	50 %	74310660
106	NC_007384	AACC	2	8	51064	51071	50 %	0 %	0 %	50 %	74310660
107	NC_007384	GTGC	2	8	51760	51767	0 %	25 %	50 %	25 %	161986600
108	NC_007384	TGAT	2	8	51996	52003	25 %	50 %	25 %	0 %	161986600
109	NC_007384	CTGC	2	8	52256	52263	0 %	25 %	25 %	50 %	161986600
110	NC_007384	GTCG	2	8	53122	53129	0 %	25 %	50 %	25 %	74310662
111	NC_007384	ATGG	2	8	53229	53236	25 %	25 %	50 %	0 %	74310662
112	NC_007384	TGGT	2	8	53324	53331	0 %	50 %	50 %	0 %	74310662
113	NC_007384	GTTA	2	8	53606	53613	25 %	50 %	25 %	0 %	74310663
114	NC_007384	CACC	2	8	54157	54164	25 %	0 %	0 %	75 %	74310663
115	NC_007384	GTTG	2	8	54386	54393	0 %	50 %	50 %	0 %	74310663
116	NC_007384	ATTG	2	8	54404	54411	25 %	50 %	25 %	0 %	74310663
117	NC_007384	CCTT	2	8	54616	54623	0 %	50 %	0 %	50 %	74310663
118	NC_007384	TGCG	2	8	57349	57356	0 %	25 %	50 %	25 %	74310666
119	NC_007384	ATGA	2	8	57504	57511	50 %	25 %	25 %	0 %	74310666
120	NC_007384	GGCG	2	8	57845	57852	0 %	0 %	75 %	25 %	74310666
121	NC_007384	GGAT	2	8	58459	58466	25 %	25 %	50 %	0 %	74310666
122	NC_007384	AACC	2	8	58529	58536	50 %	0 %	0 %	50 %	74310666
123	NC_007384	CAGG	2	8	58626	58633	25 %	0 %	50 %	25 %	74310666
124	NC_007384	TGGC	2	8	58892	58899	0 %	25 %	50 %	25 %	74310666
125	NC_007384	CCTG	2	8	59227	59234	0 %	25 %	25 %	50 %	74310667
126	NC_007384	TAAA	2	8	59265	59272	75 %	25 %	0 %	0 %	74310667
127	NC_007384	AATC	2	8	59301	59308	50 %	25 %	0 %	25 %	74310667
128	NC_007384	GCAG	2	8	59790	59797	25 %	0 %	50 %	25 %	74310668
129	NC_007384	AATG	2	8	60567	60574	50 %	25 %	25 %	0 %	74310669
130	NC_007384	GGCA	2	8	62015	62022	25 %	0 %	50 %	25 %	74310671
131	NC_007384	CGGT	2	8	62616	62623	0 %	25 %	50 %	25 %	74310671
132	NC_007384	GTCA	2	8	63139	63146	25 %	25 %	25 %	25 %	74310672
133	NC_007384	GCTT	2	8	64308	64315	0 %	50 %	25 %	25 %	74310673
134	NC_007384	ACCT	2	8	64388	64395	25 %	25 %	0 %	50 %	74310673
135	NC_007384	AGTA	2	8	64606	64613	50 %	25 %	25 %	0 %	74310673
136	NC_007384	CACC	2	8	65782	65789	25 %	0 %	0 %	75 %	74310673
137	NC_007384	CTAC	2	8	65892	65899	25 %	25 %	0 %	50 %	74310673
138	NC_007384	GTAC	2	8	66138	66145	25 %	25 %	25 %	25 %	74310673
139	NC_007384	GCCA	2	8	66937	66944	25 %	0 %	25 %	50 %	74310674
140	NC_007384	GATG	2	8	67978	67985	25 %	25 %	50 %	0 %	74310675
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142	NC_007384	AACC	2	8	68247	68254	50 %	0 %	0 %	50 %	74310675
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