MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Shigella sonnei Ss046 chromosome

Total Repeats: 7496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007384	TG	3	6	37	42	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007384	CT	3	6	445	450	0 %	50 %	0 %	50 %	74310616
3	NC_007384	GC	3	6	1333	1338	0 %	0 %	50 %	50 %	74310616
4	NC_007384	TG	3	6	1435	1440	0 %	50 %	50 %	0 %	74310616
5	NC_007384	CG	4	8	2526	2533	0 %	0 %	50 %	50 %	74310616
6	NC_007384	GC	3	6	3961	3966	0 %	0 %	50 %	50 %	74310618
7	NC_007384	GC	3	6	4442	4447	0 %	0 %	50 %	50 %	74310618
8	NC_007384	TG	3	6	4815	4820	0 %	50 %	50 %	0 %	74310618
9	NC_007384	AG	3	6	4882	4887	50 %	0 %	50 %	0 %	74310618
10	NC_007384	AT	3	6	5613	5618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007384	CG	3	6	8330	8335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007384	CG	3	6	8522	8527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007384	TA	3	6	8801	8806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007384	TC	3	6	9122	9127	0 %	50 %	0 %	50 %	74310622
15	NC_007384	CG	3	6	9209	9214	0 %	0 %	50 %	50 %	74310622
16	NC_007384	TG	3	6	10254	10259	0 %	50 %	50 %	0 %	74310623
17	NC_007384	AG	3	6	12389	12394	50 %	0 %	50 %	0 %	74310626
18	NC_007384	AT	3	6	12918	12923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007384	CG	3	6	14335	14340	0 %	0 %	50 %	50 %	74310627
20	NC_007384	CG	3	6	15278	15283	0 %	0 %	50 %	50 %	74310628
21	NC_007384	CT	3	6	16333	16338	0 %	50 %	0 %	50 %	74310629
22	NC_007384	CT	3	6	16496	16501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007384	AG	3	6	17930	17935	50 %	0 %	50 %	0 %	74310631
24	NC_007384	TG	3	6	18449	18454	0 %	50 %	50 %	0 %	74310631
25	NC_007384	TG	3	6	18894	18899	0 %	50 %	50 %	0 %	74310631
26	NC_007384	AG	3	6	19612	19617	50 %	0 %	50 %	0 %	74310632
27	NC_007384	GA	3	6	19787	19792	50 %	0 %	50 %	0 %	74310632
28	NC_007384	CT	3	6	21117	21122	0 %	50 %	0 %	50 %	74310634
29	NC_007384	TG	3	6	21167	21172	0 %	50 %	50 %	0 %	74310634
30	NC_007384	GA	3	6	21791	21796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007384	TA	3	6	23600	23605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007384	AT	4	8	23722	23729	50 %	50 %	0 %	0 %	74310637
33	NC_007384	TA	3	6	23936	23941	50 %	50 %	0 %	0 %	74310637
34	NC_007384	AT	3	6	24371	24376	50 %	50 %	0 %	0 %	74310637
35	NC_007384	AT	3	6	26498	26503	50 %	50 %	0 %	0 %	74310640
36	NC_007384	TA	3	6	27068	27073	50 %	50 %	0 %	0 %	74310640
37	NC_007384	TC	3	6	27279	27284	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_007384	GT	3	6	27893	27898	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007384	TC	3	6	27899	27904	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_007384	GC	3	6	28213	28218	0 %	0 %	50 %	50 %	74310641
41	NC_007384	GT	3	6	28623	28628	0 %	50 %	50 %	0 %	74310643
42	NC_007384	CG	3	6	28669	28674	0 %	0 %	50 %	50 %	74310643
43	NC_007384	CG	3	6	30055	30060	0 %	0 %	50 %	50 %	74310644
44	NC_007384	GC	3	6	30728	30733	0 %	0 %	50 %	50 %	74310644
45	NC_007384	CG	3	6	30802	30807	0 %	0 %	50 %	50 %	74310644
46	NC_007384	CG	3	6	31530	31535	0 %	0 %	50 %	50 %	74310644
47	NC_007384	GC	3	6	32692	32697	0 %	0 %	50 %	50 %	74310645
48	NC_007384	AT	3	6	33539	33544	50 %	50 %	0 %	0 %	74310647
49	NC_007384	TG	3	6	33889	33894	0 %	50 %	50 %	0 %	74310647
50	NC_007384	CG	3	6	34163	34168	0 %	0 %	50 %	50 %	74310647
51	NC_007384	CT	3	6	37108	37113	0 %	50 %	0 %	50 %	74310650
52	NC_007384	CG	3	6	37258	37263	0 %	0 %	50 %	50 %	74310650
53	NC_007384	GC	3	6	38071	38076	0 %	0 %	50 %	50 %	74310651
54	NC_007384	GC	3	6	38275	38280	0 %	0 %	50 %	50 %	74310651
55	NC_007384	CG	3	6	38411	38416	0 %	0 %	50 %	50 %	74310651
56	NC_007384	CA	3	6	38428	38433	50 %	0 %	0 %	50 %	74310651
57	NC_007384	TC	3	6	38573	38578	0 %	50 %	0 %	50 %	74310651
58	NC_007384	GC	5	10	39933	39942	0 %	0 %	50 %	50 %	74310651
59	NC_007384	CG	3	6	41043	41048	0 %	0 %	50 %	50 %	74310651
60	NC_007384	AT	3	6	42156	42161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007384	TG	3	6	42243	42248	0 %	50 %	50 %	0 %	161986601
62	NC_007384	AG	3	6	42323	42328	50 %	0 %	50 %	0 %	161986601
63	NC_007384	CG	3	6	42502	42507	0 %	0 %	50 %	50 %	161986601
64	NC_007384	CT	3	6	43099	43104	0 %	50 %	0 %	50 %	74310654
65	NC_007384	CA	3	6	43167	43172	50 %	0 %	0 %	50 %	74310654
66	NC_007384	TC	3	6	44056	44061	0 %	50 %	0 %	50 %	74310655
67	NC_007384	AT	3	6	46297	46302	50 %	50 %	0 %	0 %	74310657
68	NC_007384	CA	3	6	46753	46758	50 %	0 %	0 %	50 %	74310658
69	NC_007384	CG	3	6	48597	48602	0 %	0 %	50 %	50 %	74310659
70	NC_007384	GC	3	6	48936	48941	0 %	0 %	50 %	50 %	74310659
71	NC_007384	CG	3	6	49208	49213	0 %	0 %	50 %	50 %	74310659
72	NC_007384	TG	3	6	49411	49416	0 %	50 %	50 %	0 %	74310659
73	NC_007384	GC	4	8	50086	50093	0 %	0 %	50 %	50 %	74310660
74	NC_007384	CG	3	6	51969	51974	0 %	0 %	50 %	50 %	161986600
75	NC_007384	GC	3	6	53071	53076	0 %	0 %	50 %	50 %	74310662
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77	NC_007384	CG	3	6	55047	55052	0 %	0 %	50 %	50 %	74310664
78	NC_007384	TC	3	6	56487	56492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_007384	AT	3	6	56530	56535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007384	CT	3	6	56680	56685	0 %	50 %	0 %	50 %	74310665
81	NC_007384	CT	3	6	57649	57654	0 %	50 %	0 %	50 %	74310666
82	NC_007384	CG	3	6	58806	58811	0 %	0 %	50 %	50 %	74310666
83	NC_007384	GA	3	6	59040	59045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007384	TA	3	6	59837	59842	50 %	50 %	0 %	0 %	74310668
85	NC_007384	CG	4	8	60147	60154	0 %	0 %	50 %	50 %	74310668
86	NC_007384	CG	4	8	60435	60442	0 %	0 %	50 %	50 %	74310668
87	NC_007384	AC	3	6	60919	60924	50 %	0 %	0 %	50 %	74310669
88	NC_007384	GA	3	6	63051	63056	50 %	0 %	50 %	0 %	74310672
89	NC_007384	GC	4	8	63437	63444	0 %	0 %	50 %	50 %	74310672
90	NC_007384	AT	3	6	64455	64460	50 %	50 %	0 %	0 %	74310673
91	NC_007384	GC	4	8	64909	64916	0 %	0 %	50 %	50 %	74310673
92	NC_007384	GT	3	6	66679	66684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007384	AT	3	6	66696	66701	50 %	50 %	0 %	0 %	74310674
94	NC_007384	GC	3	6	68433	68438	0 %	0 %	50 %	50 %	74310676
95	NC_007384	CG	3	6	69739	69744	0 %	0 %	50 %	50 %	74310676
96	NC_007384	AG	3	6	70619	70624	50 %	0 %	50 %	0 %	74310676
97	NC_007384	CG	3	6	70693	70698	0 %	0 %	50 %	50 %	74310676
98	NC_007384	CG	4	8	70812	70819	0 %	0 %	50 %	50 %	74310676
99	NC_007384	GC	3	6	74821	74826	0 %	0 %	50 %	50 %	74310679
100	NC_007384	TG	3	6	75435	75440	0 %	50 %	50 %	0 %	74310679
101	NC_007384	CG	3	6	75750	75755	0 %	0 %	50 %	50 %	74310679
102	NC_007384	CG	3	6	76489	76494	0 %	0 %	50 %	50 %	74310680
103	NC_007384	GC	3	6	77644	77649	0 %	0 %	50 %	50 %	74310680
104	NC_007384	AG	3	6	77917	77922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007384	GA	3	6	78444	78449	50 %	0 %	50 %	0 %	74310681
106	NC_007384	CG	3	6	78513	78518	0 %	0 %	50 %	50 %	74310681
107	NC_007384	CG	3	6	80128	80133	0 %	0 %	50 %	50 %	74310683
108	NC_007384	GC	3	6	80936	80941	0 %	0 %	50 %	50 %	74310684
109	NC_007384	AG	3	6	82096	82101	50 %	0 %	50 %	0 %	74310684
110	NC_007384	GA	3	6	82109	82114	50 %	0 %	50 %	0 %	74310684
111	NC_007384	TC	3	6	83742	83747	0 %	50 %	0 %	50 %	74310686
112	NC_007384	CG	3	6	84324	84329	0 %	0 %	50 %	50 %	74310686
113	NC_007384	GC	3	6	85538	85543	0 %	0 %	50 %	50 %	74310687
114	NC_007384	TC	3	6	87542	87547	0 %	50 %	0 %	50 %	74310689
115	NC_007384	GC	3	6	87890	87895	0 %	0 %	50 %	50 %	74310689
116	NC_007384	TG	3	6	87987	87992	0 %	50 %	50 %	0 %	74310689
117	NC_007384	CG	3	6	88354	88359	0 %	0 %	50 %	50 %	74310690
118	NC_007384	CG	3	6	88474	88479	0 %	0 %	50 %	50 %	74310690
119	NC_007384	GC	3	6	89185	89190	0 %	0 %	50 %	50 %	74310690
120	NC_007384	GC	3	6	89288	89293	0 %	0 %	50 %	50 %	74310690
121	NC_007384	AT	3	6	89345	89350	50 %	50 %	0 %	0 %	74310690
122	NC_007384	GC	3	6	90236	90241	0 %	0 %	50 %	50 %	161986599
123	NC_007384	AT	3	6	92629	92634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007384	TC	3	6	93791	93796	0 %	50 %	0 %	50 %	161986598
125	NC_007384	TG	3	6	93949	93954	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007384	CT	3	6	93957	93962	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_007384	GC	4	8	94373	94380	0 %	0 %	50 %	50 %	74310695
128	NC_007384	GC	3	6	94780	94785	0 %	0 %	50 %	50 %	74310695
129	NC_007384	GC	3	6	95260	95265	0 %	0 %	50 %	50 %	74310695
130	NC_007384	GA	3	6	95903	95908	50 %	0 %	50 %	0 %	74310695
131	NC_007384	GC	3	6	96152	96157	0 %	0 %	50 %	50 %	74310696
132	NC_007384	CG	3	6	96383	96388	0 %	0 %	50 %	50 %	74310696
133	NC_007384	GC	3	6	97144	97149	0 %	0 %	50 %	50 %	74310698
134	NC_007384	CG	3	6	97213	97218	0 %	0 %	50 %	50 %	74310698
135	NC_007384	CA	3	6	98643	98648	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_007384	AG	3	6	100354	100359	50 %	0 %	50 %	0 %	74310701
137	NC_007384	AG	3	6	101979	101984	50 %	0 %	50 %	0 %	74310703
138	NC_007384	GA	3	6	102570	102575	50 %	0 %	50 %	0 %	74310704
139	NC_007384	AT	3	6	102652	102657	50 %	50 %	0 %	0 %	74310704
140	NC_007384	CG	3	6	103507	103512	0 %	0 %	50 %	50 %	74310704
141	NC_007384	GC	3	6	103622	103627	0 %	0 %	50 %	50 %	74310704
142	NC_007384	GC	3	6	104290	104295	0 %	0 %	50 %	50 %	74310705
143	NC_007384	CG	3	6	106351	106356	0 %	0 %	50 %	50 %	74310706
144	NC_007384	CG	3	6	107286	107291	0 %	0 %	50 %	50 %	74310707
145	NC_007384	GC	3	6	107498	107503	0 %	0 %	50 %	50 %	74310707
146	NC_007384	TC	3	6	107755	107760	0 %	50 %	0 %	50 %	74310708
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