MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Dehalococcoides sp. CBDB1 chromosome

Total Repeats: 892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007356	CTTTA	2	10	3497	3506	20 %	60 %	0 %	20 %	73747959
2	NC_007356	GCTGG	2	10	3508	3517	0 %	20 %	60 %	20 %	73747959
3	NC_007356	ATTTC	2	10	5814	5823	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_007356	GTTTG	2	10	7262	7271	0 %	60 %	40 %	0 %	73747961
5	NC_007356	GCATG	2	10	8603	8612	20 %	20 %	40 %	20 %	73747962
6	NC_007356	GCTCA	2	10	9426	9435	20 %	20 %	20 %	40 %	73747962
7	NC_007356	ACTGA	2	10	12514	12523	40 %	20 %	20 %	20 %	73747966
8	NC_007356	CTTAG	2	10	12850	12859	20 %	40 %	20 %	20 %	73747966
9	NC_007356	GGGGT	2	10	13784	13793	0 %	20 %	80 %	0 %	73747967
10	NC_007356	TCGGG	2	10	14639	14648	0 %	20 %	60 %	20 %	73747968
11	NC_007356	CTGAA	2	10	15483	15492	40 %	20 %	20 %	20 %	73747969
12	NC_007356	ATGAA	2	10	16748	16757	60 %	20 %	20 %	0 %	73747971
13	NC_007356	CGCTC	2	10	17536	17545	0 %	20 %	20 %	60 %	73747971
14	NC_007356	TATTC	2	10	17837	17846	20 %	60 %	0 %	20 %	73747972
15	NC_007356	TAAAA	2	10	18501	18510	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007356	GGCCT	2	10	18602	18611	0 %	20 %	40 %	40 %	73747974
17	NC_007356	TTTCT	2	10	20990	20999	0 %	80 %	0 %	20 %	73747978
18	NC_007356	CTGTG	2	10	21391	21400	0 %	40 %	40 %	20 %	73747979
19	NC_007356	CGGCA	2	10	21863	21872	20 %	0 %	40 %	40 %	73747979
20	NC_007356	GGCAG	2	10	22081	22090	20 %	0 %	60 %	20 %	73747979
21	NC_007356	CAGGT	2	10	22092	22101	20 %	20 %	40 %	20 %	73747979
22	NC_007356	CATAT	2	10	23462	23471	40 %	40 %	0 %	20 %	73747980
23	NC_007356	GGGCA	2	10	23596	23605	20 %	0 %	60 %	20 %	73747980
24	NC_007356	CGGGG	2	10	24203	24212	0 %	0 %	80 %	20 %	73747981
25	NC_007356	TTGCT	2	10	30124	30133	0 %	60 %	20 %	20 %	73747988
26	NC_007356	ACCGC	2	10	32144	32153	20 %	0 %	20 %	60 %	73747991
27	NC_007356	ATTTC	2	10	34457	34466	20 %	60 %	0 %	20 %	73747993
28	NC_007356	ATGGT	2	10	36924	36933	20 %	40 %	40 %	0 %	73747998
29	NC_007356	TATCT	2	10	41930	41939	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_007356	GGCGG	2	10	42844	42853	0 %	0 %	80 %	20 %	73748005
31	NC_007356	CTGAA	2	10	44160	44169	40 %	20 %	20 %	20 %	73748005
32	NC_007356	CTGAT	2	10	44421	44430	20 %	40 %	20 %	20 %	73748005
33	NC_007356	CAGCT	2	10	47050	47059	20 %	20 %	20 %	40 %	73748008
34	NC_007356	GTGAA	2	10	48507	48516	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007356	TCCCG	2	10	50815	50824	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
36	NC_007356	GCTTT	2	10	50903	50912	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_007356	GTTCG	2	10	52771	52780	0 %	40 %	40 %	20 %	73748009
38	NC_007356	TAAAA	2	10	53617	53626	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007356	GGAAT	2	10	54082	54091	40 %	20 %	40 %	0 %	73748010
40	NC_007356	TGAAA	2	10	54787	54796	60 %	20 %	20 %	0 %	73748010
41	NC_007356	GCCGC	2	10	54952	54961	0 %	0 %	40 %	60 %	73748010
42	NC_007356	TACCT	2	10	56699	56708	20 %	40 %	0 %	40 %	73748013
43	NC_007356	ATTCA	2	10	60375	60384	40 %	40 %	0 %	20 %	73748016
44	NC_007356	CAACC	2	10	61257	61266	40 %	0 %	0 %	60 %	73748016
45	NC_007356	GAGTT	2	10	61314	61323	20 %	40 %	40 %	0 %	73748016
46	NC_007356	TCCAC	2	10	61459	61468	20 %	20 %	0 %	60 %	73748017
47	NC_007356	GGATT	2	10	61495	61504	20 %	40 %	40 %	0 %	73748017
48	NC_007356	ATTAT	2	10	61757	61766	40 %	60 %	0 %	0 %	73748017
49	NC_007356	CTATA	2	10	62195	62204	40 %	40 %	0 %	20 %	73748017
50	NC_007356	CTAAA	2	10	63282	63291	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_007356	GATAC	2	10	64385	64394	40 %	20 %	20 %	20 %	73748019
52	NC_007356	GAAAA	2	10	66426	66435	80 %	0 %	20 %	0 %	73748020
53	NC_007356	GTATC	2	10	71806	71815	20 %	40 %	20 %	20 %	73748025
54	NC_007356	TCTCT	2	10	76808	76817	0 %	60 %	0 %	40 %	73748030
55	NC_007356	GGGTA	2	10	77724	77733	20 %	20 %	60 %	0 %	73748031
56	NC_007356	TTGGA	2	10	78576	78585	20 %	40 %	40 %	0 %	73748031
57	NC_007356	CCAAT	2	10	80449	80458	40 %	20 %	0 %	40 %	73748034
58	NC_007356	CTTTT	2	10	80619	80628	0 %	80 %	0 %	20 %	73748034
59	NC_007356	ACTCC	2	10	81167	81176	20 %	20 %	0 %	60 %	73748035
60	NC_007356	ACCAG	2	10	81235	81244	40 %	0 %	20 %	40 %	73748035
61	NC_007356	CTTGG	2	10	81327	81336	0 %	40 %	40 %	20 %	73748035
62	NC_007356	ATTAA	2	10	83778	83787	60 %	40 %	0 %	0 %	73748037
63	NC_007356	AAGGC	2	10	84263	84272	40 %	0 %	40 %	20 %	73748039
64	NC_007356	CGGAT	2	10	88573	88582	20 %	20 %	40 %	20 %	73748042
65	NC_007356	ATCAA	2	10	90142	90151	60 %	20 %	0 %	20 %	73748043
66	NC_007356	GATGA	2	10	94023	94032	40 %	20 %	40 %	0 %	73748047
67	NC_007356	AGCAA	2	10	94108	94117	60 %	0 %	20 %	20 %	73748047
68	NC_007356	TCGAT	2	10	95080	95089	20 %	40 %	20 %	20 %	73748047
69	NC_007356	GAAAA	2	10	96488	96497	80 %	0 %	20 %	0 %	73748048
70	NC_007356	CGAGG	2	10	100332	100341	20 %	0 %	60 %	20 %	73748050
71	NC_007356	GGAAT	2	10	101222	101231	40 %	20 %	40 %	0 %	73748050
72	NC_007356	TATAA	2	10	102528	102537	60 %	40 %	0 %	0 %	73748050
73	NC_007356	AGTTT	2	10	102552	102561	20 %	60 %	20 %	0 %	73748050
74	NC_007356	GATTC	2	10	105714	105723	20 %	40 %	20 %	20 %	73748051
75	NC_007356	GATTT	2	10	108546	108555	20 %	60 %	20 %	0 %	73748053
76	NC_007356	TAGGG	2	10	111674	111683	20 %	20 %	60 %	0 %	73748055
77	NC_007356	GAACC	2	10	114045	114054	40 %	0 %	20 %	40 %	73748056
78	NC_007356	ATAAA	2	10	116332	116341	80 %	20 %	0 %	0 %	73748058
79	NC_007356	GCTGG	2	10	118483	118492	0 %	20 %	60 %	20 %	73748060
80	NC_007356	GCTGT	2	10	118646	118655	0 %	40 %	40 %	20 %	73748060
81	NC_007356	TTCGG	2	10	120333	120342	0 %	40 %	40 %	20 %	73748062
82	NC_007356	CGCGG	2	10	124660	124669	0 %	0 %	60 %	40 %	73748065
83	NC_007356	GTAAA	2	10	126549	126558	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007356	AAATG	2	10	126743	126752	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007356	TCATC	2	10	127521	127530	20 %	40 %	0 %	40 %	73748067
86	NC_007356	CCGGC	2	10	130970	130979	0 %	0 %	40 %	60 %	73748071
87	NC_007356	GTAAA	2	10	132711	132720	60 %	20 %	20 %	0 %	73748072
88	NC_007356	GAAGC	2	10	132965	132974	40 %	0 %	40 %	20 %	73748072
89	NC_007356	GGGCT	2	10	134309	134318	0 %	20 %	60 %	20 %	73748073
90	NC_007356	TCATT	2	10	134630	134639	20 %	60 %	0 %	20 %	73748073
91	NC_007356	ATGAA	2	10	134662	134671	60 %	20 %	20 %	0 %	73748073
92	NC_007356	TTCTT	2	10	135319	135328	0 %	80 %	0 %	20 %	73748075
93	NC_007356	GAAGG	2	10	136705	136714	40 %	0 %	60 %	0 %	73748075
94	NC_007356	GGCAG	2	10	136797	136806	20 %	0 %	60 %	20 %	73748075
95	NC_007356	GCAGG	2	10	137856	137865	20 %	0 %	60 %	20 %	73748077
96	NC_007356	AGGGA	2	10	138480	138489	40 %	0 %	60 %	0 %	73748077
97	NC_007356	GGGTG	2	10	138950	138959	0 %	20 %	80 %	0 %	73748078
98	NC_007356	GGGCA	2	10	144930	144939	20 %	0 %	60 %	20 %	73748081
99	NC_007356	GGGGC	2	10	147001	147010	0 %	0 %	80 %	20 %	73748085
100	NC_007356	ACGGA	2	10	148871	148880	40 %	0 %	40 %	20 %	73748088
101	NC_007356	TAAAC	2	10	152395	152404	60 %	20 %	0 %	20 %	73748091
102	NC_007356	ATTTC	2	10	154135	154144	20 %	60 %	0 %	20 %	73748093
103	NC_007356	TAAAA	2	10	154190	154199	80 %	20 %	0 %	0 %	73748094
104	NC_007356	ACTAT	2	10	154768	154777	40 %	40 %	0 %	20 %	73748094
105	NC_007356	GGACT	2	10	154820	154829	20 %	20 %	40 %	20 %	73748094
106	NC_007356	GCTTG	2	10	158902	158911	0 %	40 %	40 %	20 %	73748099
107	NC_007356	CTGAC	2	10	158997	159006	20 %	20 %	20 %	40 %	73748099
108	NC_007356	TAAAA	2	10	160613	160622	80 %	20 %	0 %	0 %	73748101
109	NC_007356	TAACA	2	10	162762	162771	60 %	20 %	0 %	20 %	73748105
110	NC_007356	GGTGC	2	10	164139	164148	0 %	20 %	60 %	20 %	73748106
111	NC_007356	CCCGG	2	10	164959	164968	0 %	0 %	40 %	60 %	73748107
112	NC_007356	TATAT	2	10	165296	165305	40 %	60 %	0 %	0 %	73748107
113	NC_007356	TTTTA	2	10	170098	170107	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007356	AGGTG	2	10	170148	170157	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007356	AGAAA	2	10	173931	173940	80 %	0 %	20 %	0 %	73748116
116	NC_007356	GTTCT	2	10	174652	174661	0 %	60 %	20 %	20 %	73748117
117	NC_007356	TAAGC	2	10	175360	175369	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_007356	GCAGG	2	10	176037	176046	20 %	0 %	60 %	20 %	73748118
119	NC_007356	CTGGC	2	10	180053	180062	0 %	20 %	40 %	40 %	73748120
120	NC_007356	AACCG	2	10	182588	182597	40 %	0 %	20 %	40 %	73748124
121	NC_007356	GGCAG	2	10	183471	183480	20 %	0 %	60 %	20 %	73748125
122	NC_007356	CATTC	2	10	184454	184463	20 %	40 %	0 %	40 %	73748126
123	NC_007356	CATTA	2	10	186093	186102	40 %	40 %	0 %	20 %	73748126
124	NC_007356	TTGAT	2	10	187174	187183	20 %	60 %	20 %	0 %	73748127
125	NC_007356	GGGGC	2	10	187196	187205	0 %	0 %	80 %	20 %	73748127
126	NC_007356	GCTGA	2	10	188671	188680	20 %	20 %	40 %	20 %	73748129
127	NC_007356	CTTTT	2	10	191765	191774	0 %	80 %	0 %	20 %	73748133
128	NC_007356	CACCC	2	10	192362	192371	20 %	0 %	0 %	80 %	73748134
129	NC_007356	CGGAG	2	10	192423	192432	20 %	0 %	60 %	20 %	73748134
130	NC_007356	ACCTT	2	10	193147	193156	20 %	40 %	0 %	40 %	73748135
131	NC_007356	ATCAA	2	10	193810	193819	60 %	20 %	0 %	20 %	73748136
132	NC_007356	TAAAA	2	10	195227	195236	80 %	20 %	0 %	0 %	73748138
133	NC_007356	ATGAA	2	10	197687	197696	60 %	20 %	20 %	0 %	73748139
134	NC_007356	GCTGG	2	10	199958	199967	0 %	20 %	60 %	20 %	73748141
135	NC_007356	GCGGG	2	10	200340	200349	0 %	0 %	80 %	20 %	73748142
136	NC_007356	GTCAG	2	10	202396	202405	20 %	20 %	40 %	20 %	73748143
137	NC_007356	CCGCC	2	10	208686	208695	0 %	0 %	20 %	80 %	73748151
138	NC_007356	ACTCC	2	10	209397	209406	20 %	20 %	0 %	60 %	73748151
139	NC_007356	CAAAT	2	10	213632	213641	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_007356	TGGAG	2	10	217188	217197	20 %	20 %	60 %	0 %	73748159
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142	NC_007356	AATAT	2	10	223709	223718	60 %	40 %	0 %	0 %	73748166
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165	NC_007356	CCTGA	2	10	260311	260320	20 %	20 %	20 %	40 %	73748202
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