MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Dehalococcoides sp. CBDB1 chromosome

Total Repeats: 3565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007356	CTTG	2	8	118	125	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007356	GGGA	2	8	248	255	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007356	ACAA	2	8	543	550	75 %	0 %	0 %	25 %	73747957
4	NC_007356	CCCA	2	8	980	987	25 %	0 %	0 %	75 %	73747957
5	NC_007356	AGGG	2	8	2293	2300	25 %	0 %	75 %	0 %	73747958
6	NC_007356	AGAT	2	8	2767	2774	50 %	25 %	25 %	0 %	73747958
7	NC_007356	TGGC	2	8	3017	3024	0 %	25 %	50 %	25 %	73747958
8	NC_007356	TAAA	2	8	3796	3803	75 %	25 %	0 %	0 %	73747959
9	NC_007356	CAGG	2	8	4573	4580	25 %	0 %	50 %	25 %	73747960
10	NC_007356	GCGG	2	8	4628	4635	0 %	0 %	75 %	25 %	73747960
11	NC_007356	ACGT	2	8	4838	4845	25 %	25 %	25 %	25 %	73747960
12	NC_007356	GTCA	2	8	5219	5226	25 %	25 %	25 %	25 %	73747960
13	NC_007356	TGGC	2	8	5999	6006	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_007356	ACCC	2	8	6230	6237	25 %	0 %	0 %	75 %	73747961
15	NC_007356	AGGT	2	8	6481	6488	25 %	25 %	50 %	0 %	73747961
16	NC_007356	GTTC	2	8	6714	6721	0 %	50 %	25 %	25 %	73747961
17	NC_007356	TCTT	2	8	6816	6823	0 %	75 %	0 %	25 %	73747961
18	NC_007356	GAAG	2	8	9521	9528	50 %	0 %	50 %	0 %	73747962
19	NC_007356	GGCA	2	8	9532	9539	25 %	0 %	50 %	25 %	73747962
20	NC_007356	CCAG	2	8	11082	11089	25 %	0 %	25 %	50 %	73747964
21	NC_007356	TGCC	2	8	11220	11227	0 %	25 %	25 %	50 %	73747964
22	NC_007356	CCCG	2	8	11292	11299	0 %	0 %	25 %	75 %	73747964
23	NC_007356	CTTT	2	8	12332	12339	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_007356	AGAT	2	8	12342	12349	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007356	AGGG	2	8	12426	12433	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007356	TAAA	2	8	12459	12466	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007356	GTCT	2	8	12885	12892	0 %	50 %	25 %	25 %	73747966
28	NC_007356	GCAG	2	8	13018	13025	25 %	0 %	50 %	25 %	73747966
29	NC_007356	CAGC	2	8	13028	13035	25 %	0 %	25 %	50 %	73747966
30	NC_007356	TATC	2	8	13046	13053	25 %	50 %	0 %	25 %	73747966
31	NC_007356	AAGG	2	8	13350	13357	50 %	0 %	50 %	0 %	73747966
32	NC_007356	AATA	2	8	13425	13432	75 %	25 %	0 %	0 %	73747966
33	NC_007356	GCAG	2	8	13723	13730	25 %	0 %	50 %	25 %	73747967
34	NC_007356	CACC	2	8	14162	14169	25 %	0 %	0 %	75 %	73747968
35	NC_007356	ATTT	2	8	14550	14557	25 %	75 %	0 %	0 %	73747968
36	NC_007356	AATC	2	8	15571	15578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_007356	TCTA	2	8	15621	15628	25 %	50 %	0 %	25 %	73747970
38	NC_007356	CAGC	2	8	16301	16308	25 %	0 %	25 %	50 %	73747970
39	NC_007356	GGCA	2	8	16377	16384	25 %	0 %	50 %	25 %	73747970
40	NC_007356	GTGA	2	8	17092	17099	25 %	25 %	50 %	0 %	73747971
41	NC_007356	TGTC	2	8	17182	17189	0 %	50 %	25 %	25 %	73747971
42	NC_007356	CAGG	2	8	17298	17305	25 %	0 %	50 %	25 %	73747971
43	NC_007356	AGCC	2	8	17725	17732	25 %	0 %	25 %	50 %	73747971
44	NC_007356	GACA	2	8	18143	18150	50 %	0 %	25 %	25 %	73747973
45	NC_007356	TCTT	2	8	18720	18727	0 %	75 %	0 %	25 %	73747974
46	NC_007356	CAAA	2	8	19050	19057	75 %	0 %	0 %	25 %	73747975
47	NC_007356	AACC	2	8	19472	19479	50 %	0 %	0 %	50 %	73747975
48	NC_007356	GGGC	2	8	19717	19724	0 %	0 %	75 %	25 %	73747976
49	NC_007356	CAGC	2	8	19832	19839	25 %	0 %	25 %	50 %	73747976
50	NC_007356	TTTA	2	8	19941	19948	25 %	75 %	0 %	0 %	73747976
51	NC_007356	TAAA	2	8	20158	20165	75 %	25 %	0 %	0 %	73747976
52	NC_007356	GCTT	2	8	20302	20309	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_007356	TGCC	2	8	20448	20455	0 %	25 %	25 %	50 %	73747977
54	NC_007356	GTGA	2	8	20652	20659	25 %	25 %	50 %	0 %	73747977
55	NC_007356	TTAA	2	8	20761	20768	50 %	50 %	0 %	0 %	73747977
56	NC_007356	CCGA	2	8	21195	21202	25 %	0 %	25 %	50 %	73747979
57	NC_007356	GGGT	2	8	21648	21655	0 %	25 %	75 %	0 %	73747979
58	NC_007356	GAAA	2	8	21845	21852	75 %	0 %	25 %	0 %	73747979
59	NC_007356	GGCA	2	8	22181	22188	25 %	0 %	50 %	25 %	73747979
60	NC_007356	AGAC	2	8	22429	22436	50 %	0 %	25 %	25 %	73747979
61	NC_007356	GCCA	2	8	23247	23254	25 %	0 %	25 %	50 %	73747979
62	NC_007356	TCGC	2	8	23570	23577	0 %	25 %	25 %	50 %	73747980
63	NC_007356	TAAA	2	8	24051	24058	75 %	25 %	0 %	0 %	73747980
64	NC_007356	ACAT	2	8	24769	24776	50 %	25 %	0 %	25 %	73747981
65	NC_007356	CCAC	2	8	27084	27091	25 %	0 %	0 %	75 %	73747984
66	NC_007356	TTAT	2	8	27126	27133	25 %	75 %	0 %	0 %	73747984
67	NC_007356	TTTA	2	8	27142	27149	25 %	75 %	0 %	0 %	73747985
68	NC_007356	CGGT	2	8	27630	27637	0 %	25 %	50 %	25 %	73747985
69	NC_007356	ACTC	2	8	27964	27971	25 %	25 %	0 %	50 %	73747985
70	NC_007356	GAGG	2	8	28915	28922	25 %	0 %	75 %	0 %	73747987
71	NC_007356	CCAG	2	8	29376	29383	25 %	0 %	25 %	50 %	73747987
72	NC_007356	ATTT	2	8	29386	29393	25 %	75 %	0 %	0 %	73747987
73	NC_007356	GAAA	2	8	29847	29854	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007356	AAAT	2	8	29855	29862	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007356	AGTT	2	8	29986	29993	25 %	50 %	25 %	0 %	73747988
76	NC_007356	ATTC	2	8	30165	30172	25 %	50 %	0 %	25 %	73747988
77	NC_007356	TTTA	2	8	30189	30196	25 %	75 %	0 %	0 %	73747988
78	NC_007356	GCTG	2	8	30248	30255	0 %	25 %	50 %	25 %	73747988
79	NC_007356	TGGT	2	8	30614	30621	0 %	50 %	50 %	0 %	73747989
80	NC_007356	GCGT	2	8	31244	31251	0 %	25 %	50 %	25 %	73747989
81	NC_007356	GTTT	2	8	31490	31497	0 %	75 %	25 %	0 %	73747989
82	NC_007356	AAAT	2	8	31745	31752	75 %	25 %	0 %	0 %	73747990
83	NC_007356	GTAT	2	8	32604	32611	25 %	50 %	25 %	0 %	73747992
84	NC_007356	GTTA	2	8	33100	33107	25 %	50 %	25 %	0 %	73747992
85	NC_007356	ATTT	2	8	33632	33639	25 %	75 %	0 %	0 %	73747993
86	NC_007356	TAAA	2	8	33760	33767	75 %	25 %	0 %	0 %	73747993
87	NC_007356	GCCT	2	8	34015	34022	0 %	25 %	25 %	50 %	73747993
88	NC_007356	CAAG	2	8	34124	34131	50 %	0 %	25 %	25 %	73747993
89	NC_007356	CTGA	2	8	34964	34971	25 %	25 %	25 %	25 %	73747994
90	NC_007356	CTTT	2	8	35065	35072	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_007356	GAGG	2	8	35269	35276	25 %	0 %	75 %	0 %	73747995
92	NC_007356	TCGT	2	8	35338	35345	0 %	50 %	25 %	25 %	73747995
93	NC_007356	CCAG	2	8	35429	35436	25 %	0 %	25 %	50 %	73747995
94	NC_007356	ACTT	2	8	35770	35777	25 %	50 %	0 %	25 %	73747996
95	NC_007356	GGCA	2	8	35953	35960	25 %	0 %	50 %	25 %	73747996
96	NC_007356	CTGA	2	8	36902	36909	25 %	25 %	25 %	25 %	73747998
97	NC_007356	GGGC	2	8	37078	37085	0 %	0 %	75 %	25 %	73747998
98	NC_007356	TTGC	2	8	37292	37299	0 %	50 %	25 %	25 %	73747999
99	NC_007356	ACGG	2	8	38230	38237	25 %	0 %	50 %	25 %	73748000
100	NC_007356	GGCA	2	8	38431	38438	25 %	0 %	50 %	25 %	73748000
101	NC_007356	CAAA	2	8	39420	39427	75 %	0 %	0 %	25 %	73748002
102	NC_007356	CAAC	2	8	39552	39559	50 %	0 %	0 %	50 %	73748002
103	NC_007356	GAAG	2	8	39991	39998	50 %	0 %	50 %	0 %	73748002
104	NC_007356	GCCG	2	8	40533	40540	0 %	0 %	50 %	50 %	73748003
105	NC_007356	GACG	2	8	40933	40940	25 %	0 %	50 %	25 %	73748004
106	NC_007356	GCTT	2	8	41024	41031	0 %	50 %	25 %	25 %	73748004
107	NC_007356	CAGG	2	8	41587	41594	25 %	0 %	50 %	25 %	73748004
108	NC_007356	TATT	2	8	41687	41694	25 %	75 %	0 %	0 %	73748004
109	NC_007356	GCCA	2	8	42200	42207	25 %	0 %	25 %	50 %	73748005
110	NC_007356	GGAA	2	8	42369	42376	50 %	0 %	50 %	0 %	73748005
111	NC_007356	CCGG	2	8	42434	42441	0 %	0 %	50 %	50 %	73748005
112	NC_007356	CTGC	2	8	42611	42618	0 %	25 %	25 %	50 %	73748005
113	NC_007356	GCCT	2	8	42722	42729	0 %	25 %	25 %	50 %	73748005
114	NC_007356	CGGG	2	8	44059	44066	0 %	0 %	75 %	25 %	73748005
115	NC_007356	ATGA	2	8	44919	44926	50 %	25 %	25 %	0 %	73748006
116	NC_007356	CTGA	2	8	45321	45328	25 %	25 %	25 %	25 %	73748007
117	NC_007356	GGGC	2	8	45617	45624	0 %	0 %	75 %	25 %	73748007
118	NC_007356	GGCT	2	8	46039	46046	0 %	25 %	50 %	25 %	73748007
119	NC_007356	CATA	2	8	46049	46056	50 %	25 %	0 %	25 %	73748007
120	NC_007356	GGCA	2	8	46408	46415	25 %	0 %	50 %	25 %	73748008
121	NC_007356	GCCT	2	8	46868	46875	0 %	25 %	25 %	50 %	73748008
122	NC_007356	CAGA	2	8	47266	47273	50 %	0 %	25 %	25 %	73748008
123	NC_007356	TTAA	2	8	47459	47466	50 %	50 %	0 %	0 %	73748008
124	NC_007356	GCGA	2	8	47973	47980	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_007356	TTCT	2	8	48167	48174	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_007356	TGGA	2	8	50081	50088	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007356	GGTC	2	8	50382	50389	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_007356	TTCA	2	8	50913	50920	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_007356	TTAA	2	8	50954	50961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007356	CTTT	2	8	51024	51031	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_007356	AAAC	2	8	51526	51533	75 %	0 %	0 %	25 %	73748009
132	NC_007356	CAGA	2	8	53114	53121	50 %	0 %	25 %	25 %	73748009
133	NC_007356	TCCG	2	8	53193	53200	0 %	25 %	25 %	50 %	73748009
134	NC_007356	TAAA	2	8	53244	53251	75 %	25 %	0 %	0 %	73748009
135	NC_007356	TCTA	2	8	54208	54215	25 %	50 %	0 %	25 %	73748010
136	NC_007356	CCTG	2	8	54526	54533	0 %	25 %	25 %	50 %	73748010
137	NC_007356	GGCA	2	8	54849	54856	25 %	0 %	50 %	25 %	73748010
138	NC_007356	GCCG	2	8	55087	55094	0 %	0 %	50 %	50 %	73748010
139	NC_007356	TGAA	2	8	55387	55394	50 %	25 %	25 %	0 %	73748010
140	NC_007356	GGGT	2	8	55915	55922	0 %	25 %	75 %	0 %	73748011
141	NC_007356	CGGG	2	8	56440	56447	0 %	0 %	75 %	25 %	73748012
142	NC_007356	CGGC	2	8	56488	56495	0 %	0 %	50 %	50 %	73748012
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144	NC_007356	AGAT	2	8	57198	57205	50 %	25 %	25 %	0 %	73748013
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