MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanosarcina barkeri str. Fusaro

Total Repeats: 638

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007355	AGATTA	2	12	14246	14257	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007355	TTCTTT	2	12	15792	15803	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_007355	TCATGA	2	12	30974	30985	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_007355	ATAAAT	2	12	40178	40189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007355	GTTTTT	2	12	41052	41063	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007355	ATAAAT	2	12	47428	47439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007355	TTATAT	2	12	54480	54491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007355	TAATTA	2	12	58461	58472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007355	AATTTA	2	12	63268	63279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007355	TAAAAA	2	12	66513	66524	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007355	AAAGGA	2	12	73301	73312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007355	GAAAAA	2	12	117892	117903	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007355	ATCTTT	2	12	135587	135598	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_007355	AGTATC	2	12	137788	137799	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_007355	TATATT	2	12	172209	172220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007355	GAAAAA	2	12	176350	176361	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007355	TATAAT	2	12	193684	193695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007355	ATAAAC	2	12	196511	196522	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_007355	AATATT	2	12	232638	232649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007355	GTATCT	2	12	235599	235610	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_007355	CCATTT	2	12	250540	250551	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007355	AAATAA	2	12	250579	250590	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007355	ATAATT	2	12	250833	250844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007355	TGTGAG	2	12	257247	257258	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007355	GTTCAA	2	12	280263	280274	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_007355	CATCTA	2	12	298362	298373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007355	ATATAA	2	12	322285	322296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007355	TTTAGA	2	12	323591	323602	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007355	ACTTTT	2	12	330555	330566	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_007355	TAGTAA	2	12	343894	343905	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007355	AAAATT	2	12	344690	344701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007355	TTGTTT	2	12	350831	350842	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007355	AAAAAC	2	12	358352	358363	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_007355	GGATTT	2	12	372037	372048	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007355	TAATAT	2	12	372217	372228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007355	AAATCA	2	12	372376	372387	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_007355	TATTTT	2	12	372827	372838	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007355	ACTAAA	2	12	376617	376628	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_007355	GAAAAG	2	12	382897	382908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007355	ACTTTC	2	12	387367	387378	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007355	TAAACT	2	12	395503	395514	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_007355	AAATTA	2	12	413399	413410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007355	ATTTTT	2	12	445178	445189	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007355	TTATAA	2	12	445577	445588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007355	CTTACT	2	12	470732	470743	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007355	TGAGAT	2	12	499239	499250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007355	AATATT	2	12	520320	520331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007355	ATAAAA	2	12	529375	529386	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007355	AAAAAT	2	12	530010	530021	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007355	CTGCCA	2	12	532923	532934	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_007355	CTTTCT	2	12	534570	534581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007355	TTTCTT	2	12	537339	537350	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_007355	TTTAGG	2	12	539005	539016	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007355	GTAGTT	2	12	543258	543269	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007355	TATTAG	2	12	546591	546602	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007355	CTTGAT	2	12	552020	552031	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_007355	TGAACT	2	12	575420	575431	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_007355	TGTTAA	2	12	581817	581828	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007355	GCTATC	2	12	588123	588134	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007355	GTTTTT	2	12	588227	588238	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007355	ATTTTC	2	12	601121	601132	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_007355	ATTTTC	2	12	601166	601177	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_007355	ATTTTC	2	12	601181	601192	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_007355	ATTTTC	2	12	601196	601207	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_007355	GGAAAA	2	12	618544	618555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007355	TACTTT	2	12	634332	634343	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_007355	AAGTTT	2	12	638941	638952	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007355	AAGAAA	2	12	664833	664844	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007355	AACAAA	2	12	664849	664860	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_007355	AGTAAT	2	12	665288	665299	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007355	AAAGCC	2	12	668193	668204	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007355	GAATTT	2	12	699641	699652	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007355	GATAGT	2	12	700456	700467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007355	ATAAAT	2	12	705382	705393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007355	CGAAAG	2	12	706236	706247	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_007355	ATTTTT	2	12	725361	725372	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007355	ATATTT	2	12	728613	728624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007355	AAGTTA	2	12	732747	732758	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007355	TCACAT	2	12	734517	734528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007355	TTATTT	2	12	739825	739836	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007355	TTATAT	2	12	748460	748471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007355	CGTGGT	2	12	750948	750959	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_007355	TAGGAA	2	12	751386	751397	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007355	AATTAC	2	12	756324	756335	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_007355	TCCAAT	2	12	793002	793013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_007355	TAGGAA	2	12	795100	795111	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007355	TCATGA	2	12	801275	801286	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_007355	CTCAAA	2	12	809340	809351	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007355	ATAGTT	2	12	811307	811318	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007355	ATAACA	2	12	820483	820494	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_007355	TAAATA	2	12	820927	820938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007355	TATAAA	2	12	822679	822690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007355	AGAGAA	2	12	825651	825662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007355	ACATAA	2	12	847256	847267	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_007355	TTCAAA	2	12	849814	849825	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_007355	CTAAAG	2	12	857457	857468	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_007355	GTTATA	2	12	868054	868065	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007355	AATTAT	2	12	905230	905241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007355	AATTTT	2	12	906306	906317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007355	TCTCTT	2	12	913692	913703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007355	ATTCTG	2	12	914046	914057	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_007355	TTTCTT	2	12	923144	923155	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_007355	TTCTTT	2	12	923156	923167	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_007355	TCTTTT	2	12	923168	923179	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_007355	TTTTAT	2	12	943609	943620	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007355	ATTAAA	2	12	954317	954328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007355	AAAATT	2	12	956315	956326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007355	TATAAA	2	12	957098	957109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007355	GTAACT	2	12	963558	963569	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_007355	ATCAAT	2	12	964193	964204	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_007355	ATTTTT	2	12	982339	982350	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007355	GTTTCT	2	12	990469	990480	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_007355	ATATAG	2	12	991718	991729	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007355	AATTTG	2	12	991964	991975	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007355	ATTTTA	2	12	995352	995363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007355	TACAGG	2	12	995534	995545	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_007355	TGAGAT	2	12	997099	997110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007355	TATAAA	2	12	1007714	1007725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007355	TTTTTC	2	12	1043778	1043789	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_007355	TAACTT	2	12	1045909	1045920	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_007355	TTATAA	2	12	1060789	1060800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007355	AAAAAG	2	12	1066985	1066996	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007355	TATTTT	2	12	1071259	1071270	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007355	TTTTAT	2	12	1094677	1094688	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007355	ATTATA	2	12	1126655	1126666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007355	CTTGGG	2	12	1140123	1140134	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_007355	ACCCGT	2	12	1142684	1142695	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
128	NC_007355	AAAGAA	2	12	1147383	1147394	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007355	GCATAG	2	12	1172419	1172430	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_007355	GGCTTC	2	12	1174212	1174223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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132	NC_007355	TTTTAA	2	12	1189407	1189418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_007355	CTTTTT	2	12	1945260	1945271	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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253	NC_007355	CTTAAA	2	12	1962100	1962111	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
254	NC_007355	AACTTA	2	12	1962113	1962124	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
255	NC_007355	TTAAAC	2	12	1962131	1962142	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
256	NC_007355	GCTTTT	2	12	1965548	1965559	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
257	NC_007355	TCAAAC	2	12	1967747	1967758	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_007355	ACTTTT	2	12	1967974	1967985	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
259	NC_007355	AGAGTA	2	12	1971799	1971810	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_007355	CAAAAA	2	12	3750838	3750849	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
500	NC_007355	AATATA	2	12	3756396	3756407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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