MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Methanosarcina barkeri str. Fusaro

Total Repeats: 1360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007355	CGGTTG	2	12	4010	4021	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	73667562
2	NC_007355	TACAAC	2	12	6602	6613	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	73667564
3	NC_007355	TTTAAT	2	12	22211	22222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73667576
4	NC_007355	ACGGAG	2	12	26175	26186	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	73667578
5	NC_007355	AAAGTA	2	12	26814	26825	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	73667579
6	NC_007355	TTAAGT	2	12	30736	30747	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	73667581
7	NC_007355	TCAATA	2	12	32198	32209	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	73667582
8	NC_007355	CTTTAT	2	12	36253	36264	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	73667585
9	NC_007355	ATTAAA	2	12	50844	50855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73667597
10	NC_007355	TTAAAC	2	12	51042	51053	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	73667597
11	NC_007355	TATACT	2	12	51236	51247	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	73667597
12	NC_007355	TCTGGA	2	12	53346	53357	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	73667598
13	NC_007355	AGCTAA	2	12	59867	59878	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	73667606
14	NC_007355	TCCTCA	2	12	66748	66759	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	73667610
15	NC_007355	TTCGTT	2	12	67297	67308	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	73667610
16	NC_007355	GCTTGG	2	12	67434	67445	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	73667610
17	NC_007355	GGCGTG	2	12	71410	71421	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	73667613
18	NC_007355	CAAGGT	2	12	72753	72764	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	73667614
19	NC_007355	AACTCC	2	12	85876	85887	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	73667622
20	NC_007355	ATCGTA	2	12	88345	88356	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	73667624
21	NC_007355	ACTTTT	2	12	94565	94576	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	73667629
22	NC_007355	GCATCT	2	12	98911	98922	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	73667633
23	NC_007355	AGTTCA	2	12	102123	102134	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	73667635
24	NC_007355	AGCTCA	2	12	108980	108991	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	73667645
25	NC_007355	CTCTAG	2	12	114250	114261	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	73667657
26	NC_007355	TGAAGA	2	12	120565	120576	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	73667663
27	NC_007355	ACAGAA	2	12	120653	120664	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	73667663
28	NC_007355	ACAGAA	2	12	120713	120724	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	73667663
29	NC_007355	ACAGAA	2	12	120776	120787	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	73667663
30	NC_007355	AAACAG	2	12	120804	120815	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	73667663
31	NC_007355	ACAGAA	2	12	120839	120850	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	73667663
32	NC_007355	ACAGAA	2	12	120902	120913	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	73667663
33	NC_007355	ACAGAA	2	12	120965	120976	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	73667663
34	NC_007355	ACAGAA	2	12	120995	121006	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	73667663
35	NC_007355	ACAGAA	2	12	121058	121069	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	73667663
36	NC_007355	GAAAAA	2	12	127532	127543	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	73667666
37	NC_007355	TGTTCC	2	12	127978	127989	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	73667667
38	NC_007355	TGTATC	2	12	132745	132756	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	73667670
39	NC_007355	CAAGTA	2	12	133488	133499	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	73667671
40	NC_007355	TGCTTT	2	12	142775	142786	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	73667676
41	NC_007355	GAAAAT	2	12	143415	143426	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	73667676
42	NC_007355	ATTTTG	2	12	145139	145150	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	73667677
43	NC_007355	ATTACT	2	12	145956	145967	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	73667677
44	NC_007355	CCTTCC	2	12	153175	153186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73667684
45	NC_007355	AGGTGC	2	12	157850	157861	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	73667690
46	NC_007355	AGGGCC	2	12	161491	161502	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	73667692
47	NC_007355	AGAATA	2	12	168949	168960	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	73667701
48	NC_007355	CCAAGT	2	12	171260	171271	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	73667702
49	NC_007355	AAAATA	2	12	184703	184714	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	73667713
50	NC_007355	CCCAGG	2	12	187580	187591	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	73667715
51	NC_007355	TCAGCT	2	12	189128	189139	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	73667716
52	NC_007355	AAAGCG	2	12	195182	195193	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	73667722
53	NC_007355	GGAATA	2	12	195404	195415	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	73667722
54	NC_007355	GCTTCA	2	12	196190	196201	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	73667723
55	NC_007355	TCGGGA	2	12	196749	196760	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	73667724
56	NC_007355	AGGAGT	2	12	203529	203540	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	73667728
57	NC_007355	CAAAAT	2	12	217658	217669	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	73667736
58	NC_007355	TCTTCG	2	12	221034	221045	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	73667738
59	NC_007355	CCAGGA	2	12	225214	225225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73667741
60	NC_007355	CATATA	2	12	231859	231870	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	73667747
61	NC_007355	ATTTCA	2	12	233861	233872	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	73667748
62	NC_007355	TCTGCA	2	12	236299	236310	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	73667750
63	NC_007355	CCTCTT	2	12	236660	236671	0 %	50 %	0 %	50 %	73667751
64	NC_007355	GTTTCC	2	12	238113	238124	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	73667752
65	NC_007355	TCTTCC	2	12	238519	238530	0 %	50 %	0 %	50 %	73667753
66	NC_007355	CATCCT	2	12	239167	239178	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	73667753
67	NC_007355	ATAAAA	2	12	252963	252974	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	73667764
68	NC_007355	TTGTGT	2	12	253644	253655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73667764
69	NC_007355	AAAAAC	2	12	254617	254628	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	73667765
70	NC_007355	TCACGC	2	12	259992	260003	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	73667769
71	NC_007355	TGATCT	2	12	261328	261339	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	73667770
72	NC_007355	TGAAAT	2	12	265284	265295	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	73667775
73	NC_007355	ACAGGG	2	12	266479	266490	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	73667776
74	NC_007355	ACTCCT	2	12	268154	268165	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	73667777
75	NC_007355	CTGAAG	2	12	272061	272072	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	73667779
76	NC_007355	AAAAAC	2	12	274743	274754	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	73667782
77	NC_007355	TACTGC	2	12	277386	277397	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	73667785
78	NC_007355	TCATAT	2	12	279042	279053	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	73667785
79	NC_007355	TATGCA	2	12	290575	290586	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	73667792
80	NC_007355	AGAAAA	2	12	292534	292545	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	73667794
81	NC_007355	AAAACA	2	12	294187	294198	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	73667795
82	NC_007355	CGATTT	2	12	295645	295656	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	73667797
83	NC_007355	CTGTAA	2	12	304778	304789	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	73667804
84	NC_007355	CGATGC	2	12	309293	309304	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	73667808
85	NC_007355	TGGCAA	2	12	309584	309595	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	73667808
86	NC_007355	TATTGA	2	12	316208	316219	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	73667814
87	NC_007355	TGAATA	2	12	320920	320931	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	73667819
88	NC_007355	GCAGGA	2	12	330764	330775	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	73667829
89	NC_007355	GCAAAA	2	12	332191	332202	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	73667829
90	NC_007355	AGGCTC	2	12	332685	332696	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	73667829
91	NC_007355	GATCAA	2	12	333401	333412	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	73667829
92	NC_007355	TTCAAG	2	12	340320	340331	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	73667839
93	NC_007355	GAGAAA	2	12	354236	354247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73667851
94	NC_007355	GATAGA	2	12	354797	354808	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	73667851
95	NC_007355	TCTCTT	2	12	355552	355563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73667852
96	NC_007355	TATCTT	2	12	362608	362619	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	73667857
97	NC_007355	CCAGAT	2	12	365080	365091	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	73667858
98	NC_007355	TTTGTA	2	12	365892	365903	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	73667860
99	NC_007355	GTTAAA	2	12	366950	366961	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	73667861
100	NC_007355	CCCTGG	2	12	369202	369213	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	73667864
101	NC_007355	CTTCCC	2	12	371467	371478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73667866
102	NC_007355	CGGCAC	2	12	378770	378781	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	73667870
103	NC_007355	AAAAGG	2	12	393688	393699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73667887
104	NC_007355	CAATAA	2	12	398847	398858	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	73667892
105	NC_007355	AGGAAA	2	12	402007	402018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73667894
106	NC_007355	CAATTC	2	12	402041	402052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73667894
107	NC_007355	ATGTTG	2	12	402889	402900	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	73667895
108	NC_007355	AAGCTA	2	12	418948	418959	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	73667908
109	NC_007355	TTCGAA	2	12	420259	420270	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	73667909
110	NC_007355	ACTTGC	2	12	421279	421290	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	73667909
111	NC_007355	AAAGAA	2	12	421295	421306	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	73667909
112	NC_007355	GAAATT	2	12	421382	421393	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	73667909
113	NC_007355	AAAACA	2	12	421536	421547	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	73667909
114	NC_007355	AGGAAA	2	12	422205	422216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73667909
115	NC_007355	GGCATC	2	12	427853	427864	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	73667915
116	NC_007355	CCCCAT	2	12	427934	427945	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	73667915
117	NC_007355	TCGGCA	2	12	428250	428261	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	73667915
118	NC_007355	CTTCCC	2	12	428440	428451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73667915
119	NC_007355	TCAATA	2	12	430288	430299	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	73667916
120	NC_007355	AGGGAT	2	12	430542	430553	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	73667916
121	NC_007355	TCAAAG	2	12	432196	432207	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	73667917
122	NC_007355	GTTCTG	2	12	436187	436198	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	73667919
123	NC_007355	GCTAAA	2	12	438951	438962	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	73667921
124	NC_007355	TCGATG	2	12	440863	440874	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	73667921
125	NC_007355	GACTAC	2	12	441817	441828	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	73667922
126	NC_007355	AAAAGA	2	12	449476	449487	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	73667928
127	NC_007355	AAAGAT	2	12	449519	449530	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	73667928
128	NC_007355	CCTGAA	2	12	455099	455110	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	73667933
129	NC_007355	CAGGAA	2	12	455504	455515	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	73667934
130	NC_007355	CAAGAA	2	12	459857	459868	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	73667939
131	NC_007355	CCGAAT	2	12	469739	469750	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	73667945
132	NC_007355	AAGTTC	2	12	470304	470315	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	73667945
133	NC_007355	GCCTGC	2	12	481105	481116	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	73667952
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135	NC_007355	CCAGAA	2	12	489910	489921	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	73667956
136	NC_007355	CCACTG	2	12	502004	502015	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	73667964
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139	NC_007355	TCTGCA	2	12	519062	519073	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	73667976
140	NC_007355	ATTTCA	2	12	521543	521554	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	73667977
141	NC_007355	CCTCTT	2	12	524658	524669	0 %	50 %	0 %	50 %	73667980
142	NC_007355	CATCGG	2	12	527783	527794	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	73667982
143	NC_007355	TCAAGT	2	12	533462	533473	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	73667984
144	NC_007355	ATCTTA	2	12	549593	549604	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	73667997
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146	NC_007355	AAATTT	2	12	551807	551818	50 %	50 %	0 %	0 %	73668000
147	NC_007355	CCAGAT	2	12	556163	556174	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	73668007
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230	NC_007355	CAAAAT	2	12	874206	874217	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	73668267
231	NC_007355	AAATGG	2	12	874452	874463	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	73668268
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233	NC_007355	AAATGG	2	12	876543	876554	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	73668269
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335	NC_007355	ATCTTG	2	12	1208568	1208579	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	73668524
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339	NC_007355	GTTTCT	2	12	1219519	1219530	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	73668531
340	NC_007355	TTGCAT	2	12	1223271	1223282	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	73668535
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343	NC_007355	TTTTGT	2	12	1228676	1228687	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	73668538
344	NC_007355	GTTCCT	2	12	1229594	1229605	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	73668539
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456	NC_007355	ATAGCC	2	12	1617344	1617355	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	73668835
457	NC_007355	CGTAAA	2	12	1618177	1618188	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	73668836
458	NC_007355	GGATAT	2	12	1621011	1621022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73668840
459	NC_007355	AGCCGA	2	12	1622745	1622756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73668841
460	NC_007355	TTTTAA	2	12	1629383	1629394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73668847
461	NC_007355	TAAAGA	2	12	1637528	1637539	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	73668853
462	NC_007355	CCCAGA	2	12	1644010	1644021	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	73668859
463	NC_007355	AGCTCC	2	12	1644992	1645003	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	73668860
464	NC_007355	GAAAAC	2	12	1649253	1649264	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	73668864
465	NC_007355	TGGCCT	2	12	1651434	1651445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73668866
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468	NC_007355	TCCGCC	2	12	1677306	1677317	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	73668887
469	NC_007355	GCTTCG	2	12	1682649	1682660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73668890
470	NC_007355	TCGATA	2	12	1682985	1682996	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	73668890
471	NC_007355	TCCTTC	2	12	1684363	1684374	0 %	50 %	0 %	50 %	73668891
472	NC_007355	TTTCCT	2	12	1690877	1690888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73668895
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475	NC_007355	GGTCAA	2	12	1697167	1697178	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	73668900
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481	NC_007355	TTAAAA	2	12	1730560	1730571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73668927
482	NC_007355	AAAAGT	2	12	1733174	1733185	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	73668929
483	NC_007355	TATAAA	2	12	1733549	1733560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73668929
484	NC_007355	TTAAAA	2	12	1741536	1741547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73668937
485	NC_007355	TATGAT	2	12	1744269	1744280	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	73668939
486	NC_007355	GGAAAC	2	12	1746009	1746020	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	73668940
487	NC_007355	GCTGCA	2	12	1747676	1747687	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	73668941
488	NC_007355	CCTGAA	2	12	1752975	1752986	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	73668945
489	NC_007355	AGCTCC	2	12	1753076	1753087	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	73668945
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492	NC_007355	CGGGTT	2	12	1763146	1763157	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	73668956
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499	NC_007355	GTGATC	2	12	1793438	1793449	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	73668980
500	NC_007355	TGAACT	2	12	1803642	1803653	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	73668991

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