MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanosarcina barkeri str. Fusaro

Total Repeats: 4887

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007355	ATTA	2	8	21	28	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007355	ATTT	2	8	83	90	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007355	TAGT	2	8	213	220	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007355	CCTT	2	8	1895	1902	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007355	CTTA	2	8	5450	5457	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_007355	TTTC	2	8	5467	5474	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_007355	TATT	2	8	6671	6678	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007355	TAAG	2	8	6712	6719	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007355	TTGA	2	8	8086	8093	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007355	ATAA	2	8	8139	8146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007355	AATT	2	8	8797	8804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007355	AGAA	2	8	8825	8832	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007355	TGCG	2	8	14268	14275	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_007355	CCCG	2	8	14314	14321	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_007355	CGAA	2	8	15713	15720	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_007355	TTAA	2	8	15969	15976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007355	ATGC	2	8	17315	17322	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_007355	AAGG	2	8	17360	17367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007355	AAAT	2	8	19239	19246	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007355	TCTT	2	8	21617	21624	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_007355	ATTA	2	8	21888	21895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007355	TTAA	2	8	21948	21955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007355	GAGT	2	8	21987	21994	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007355	TTAA	2	8	23332	23339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007355	GATA	2	8	23685	23692	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007355	ATTT	2	8	23849	23856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007355	TAAT	2	8	23888	23895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007355	TTAG	2	8	24248	24255	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007355	TTGA	2	8	24268	24275	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007355	ACTG	2	8	29441	29448	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_007355	GATT	3	12	30986	30997	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007355	ATTC	2	8	34472	34479	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_007355	TTTG	2	8	35647	35654	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007355	TGGT	2	8	40382	40389	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007355	TCGG	2	8	40399	40406	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_007355	CATT	2	8	40426	40433	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_007355	TAGT	2	8	40554	40561	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007355	ATTA	2	8	40797	40804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007355	TAAT	2	8	41186	41193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007355	GTAA	2	8	43591	43598	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007355	ATAA	2	8	45561	45568	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007355	TATT	2	8	45631	45638	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007355	AATG	2	8	45762	45769	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007355	ATAG	2	8	45863	45870	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007355	ACTC	2	8	45882	45889	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_007355	TAAT	2	8	45981	45988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007355	AAAT	2	8	47166	47173	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007355	TATT	2	8	47271	47278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007355	AAAG	2	8	48009	48016	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007355	AGAA	2	8	48860	48867	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007355	AAGT	2	8	48919	48926	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007355	CTAC	2	8	52926	52933	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_007355	TTCA	2	8	53753	53760	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_007355	TAAT	2	8	54360	54367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007355	AAAC	2	8	55336	55343	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_007355	CTTC	2	8	56997	57004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007355	AAGT	2	8	57379	57386	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007355	AAAG	2	8	57661	57668	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007355	TCAA	2	8	57779	57786	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_007355	AGGC	2	8	58571	58578	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_007355	TCAT	2	8	63419	63426	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_007355	AAAT	2	8	65897	65904	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007355	ATTA	2	8	66109	66116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007355	AGTT	2	8	66283	66290	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007355	ATTT	2	8	66398	66405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007355	AGAT	2	8	66457	66464	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007355	TGAA	2	8	66610	66617	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007355	AAAT	2	8	67911	67918	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007355	CATT	2	8	68052	68059	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_007355	TAAA	2	8	68181	68188	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007355	TAAA	2	8	68467	68474	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007355	ATTA	2	8	69017	69024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007355	TCAA	2	8	69196	69203	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_007355	CAAT	2	8	72266	72273	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_007355	AATA	2	8	72378	72385	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007355	AAAT	2	8	73352	73359	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007355	ACTT	2	8	76987	76994	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_007355	ATAA	2	8	77125	77132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007355	TCAG	2	8	77785	77792	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_007355	AGAA	2	8	78171	78178	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007355	ATCC	2	8	78292	78299	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007355	GTTT	2	8	78907	78914	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007355	ATTT	2	8	79259	79266	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007355	AAAG	2	8	79350	79357	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007355	CGCC	2	8	79450	79457	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
86	NC_007355	TCAA	2	8	80016	80023	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_007355	AACA	2	8	81284	81291	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_007355	AATT	2	8	82133	82140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007355	AGCC	2	8	82203	82210	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_007355	TTCC	2	8	89632	89639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_007355	TGCC	2	8	89667	89674	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_007355	AACA	2	8	90798	90805	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_007355	AAAT	2	8	90897	90904	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007355	AGAA	2	8	92044	92051	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007355	CTGG	2	8	92142	92149	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_007355	CTGG	2	8	92359	92366	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_007355	CAGT	2	8	95367	95374	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_007355	AAAT	2	8	96846	96853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007355	TGTT	2	8	99355	99362	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007355	AATC	2	8	99391	99398	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_007355	TCAA	2	8	99626	99633	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_007355	AAAT	2	8	101348	101355	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007355	AGCA	2	8	103473	103480	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_007355	ATAA	2	8	103904	103911	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007355	GTTT	2	8	104649	104656	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007355	AGGG	2	8	117934	117941	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007355	CCTG	2	8	117953	117960	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_007355	AGAA	2	8	118561	118568	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007355	AATA	2	8	118593	118600	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007355	TAGA	2	8	118746	118753	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007355	TAGA	2	8	118772	118779	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007355	AATT	2	8	118972	118979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007355	ACTT	2	8	119059	119066	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_007355	AAAT	2	8	119686	119693	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007355	AAGA	2	8	119851	119858	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007355	AGAA	2	8	119939	119946	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007355	GCAA	2	8	120108	120115	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_007355	TGTC	2	8	123940	123947	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_007355	AATT	2	8	128889	128896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007355	AATA	2	8	128993	129000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007355	ATTT	2	8	130392	130399	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007355	TTTC	2	8	132198	132205	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_007355	AAAG	2	8	132245	132252	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007355	AAGC	2	8	135493	135500	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_007355	GATA	2	8	136824	136831	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007355	ATCC	2	8	137280	137287	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_007355	ATTC	2	8	137305	137312	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_007355	CGTT	2	8	137322	137329	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_007355	AAAT	2	8	137389	137396	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007355	ATTA	2	8	137468	137475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007355	AATA	2	8	138086	138093	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007355	ACTA	2	8	138201	138208	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_007355	ACTA	2	8	138219	138226	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_007355	ACTA	2	8	138237	138244	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_007355	ACTA	2	8	138255	138262	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_007355	ACTA	2	8	138273	138280	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_007355	ACTA	2	8	138291	138298	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_007355	ACTA	2	8	138309	138316	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_007355	CAAA	2	8	139611	139618	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_007355	GATA	2	8	139654	139661	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007355	CTTT	2	8	141311	141318	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_007355	TTTC	2	8	141327	141334	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_007355	TAAG	2	8	141727	141734	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007355	GCAA	2	8	141908	141915	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_007355	ATAA	2	8	141966	141973	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007355	CGGG	2	8	142322	142329	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
147	NC_007355	GATT	2	8	142539	142546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007355	GATT	2	8	142591	142598	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007355	TTAG	2	8	144219	144226	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007355	TTTA	2	8	144287	144294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_007355	CATT	2	8	144383	144390	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_007355	TTAT	2	8	144505	144512	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_007355	ATTG	2	8	144710	144717	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_007355	TAAC	2	8	146632	146639	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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