MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Ehrlichia canis str. Jake chromosome

Total Repeats: 446

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007354	TAAAGT	2	12	1796	1807	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	73666635
2	NC_007354	ATTATA	2	12	1809	1820	50 %	50 %	0 %	0 %	73666635
3	NC_007354	TATAAA	2	12	2021	2032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666635
4	NC_007354	AATAAA	2	12	2091	2102	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	73666635
5	NC_007354	AAAAGT	2	12	6506	6517	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	73666638
6	NC_007354	TGTTTG	2	12	16396	16407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73666648
7	NC_007354	TGTTTT	2	12	20266	20277	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	73666651
8	NC_007354	TGCTGT	2	12	20947	20958	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	73666651
9	NC_007354	TTAATT	2	12	22196	22207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666652
10	NC_007354	TCCTTA	2	12	23276	23287	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	73666653
11	NC_007354	TCTTTG	2	12	23309	23320	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	73666653
12	NC_007354	TTGCTT	2	12	24019	24030	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	73666653
13	NC_007354	TTAATT	2	12	26909	26920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666656
14	NC_007354	TCATCT	2	12	45363	45374	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	73666669
15	NC_007354	CATATT	2	12	48515	48526	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	73666672
16	NC_007354	AGTGAT	2	12	49075	49086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666673
17	NC_007354	AGCTAA	2	12	50299	50310	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	73666674
18	NC_007354	TGCTAC	2	12	57784	57795	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	73666680
19	NC_007354	CTACTG	2	12	60113	60124	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	73666681
20	NC_007354	GGATGT	2	12	68004	68015	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	73666687
21	NC_007354	TGAAAG	2	12	72219	72230	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	73666690
22	NC_007354	ATAAGT	2	12	80118	80129	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	73666693
23	NC_007354	TAATGA	2	12	85054	85065	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	73666693
24	NC_007354	GTGATT	2	12	85491	85502	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	73666693
25	NC_007354	AAGAAA	2	12	90744	90755	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	73666695
26	NC_007354	AAAATA	2	12	99901	99912	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	73666699
27	NC_007354	AAGCTA	3	18	107255	107272	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	73666702
28	NC_007354	ACAAGT	2	12	112606	112617	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	73666705
29	NC_007354	AAGAAA	2	12	112767	112778	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	73666705
30	NC_007354	AAGAAA	2	12	113293	113304	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	73666705
31	NC_007354	AGCAGA	2	12	113712	113723	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	73666705
32	NC_007354	AGATAC	2	12	117534	117545	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	73666707
33	NC_007354	CTACTG	2	12	119290	119301	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	73666708
34	NC_007354	TTGGAA	2	12	119607	119618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666708
35	NC_007354	TATTTC	2	12	122394	122405	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	73666710
36	NC_007354	ATTATC	2	12	122898	122909	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	73666710
37	NC_007354	TGATTA	2	12	123841	123852	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	73666711
38	NC_007354	TAGTAA	2	12	124672	124683	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	73666711
39	NC_007354	TGAATA	2	12	126483	126494	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	73666713
40	NC_007354	AGGAAG	2	12	128288	128299	50 %	0 %	50 %	0 %	73666715
41	NC_007354	GAGTTA	2	12	130107	130118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666717
42	NC_007354	AGCTAA	2	12	131560	131571	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	73666719
43	NC_007354	CTGGTA	2	12	141863	141874	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	73666723
44	NC_007354	ACCTTC	2	12	144615	144626	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	73666725
45	NC_007354	ACATCC	2	12	146717	146728	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	73666726
46	NC_007354	GTACTT	2	12	147846	147857	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	73666727
47	NC_007354	TCCAAA	2	12	150706	150717	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	73666728
48	NC_007354	TATTGT	2	12	163685	163696	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	73666737
49	NC_007354	TTATTT	2	12	165745	165756	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	73666739
50	NC_007354	GTTGAT	2	12	166859	166870	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	73666741
51	NC_007354	ACTTTA	2	12	168096	168107	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	73666742
52	NC_007354	TAGATT	2	12	168489	168500	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	73666742
53	NC_007354	GATGCT	2	12	169738	169749	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	73666743
54	NC_007354	AATTGT	2	12	174212	174223	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	73666747
55	NC_007354	TTTATC	2	12	177639	177650	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	73666750
56	NC_007354	ACCAGA	2	12	177744	177755	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	73666750
57	NC_007354	TGGTGC	2	12	179283	179294	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	73666751
58	NC_007354	TGATAT	2	12	182993	183004	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	73666752
59	NC_007354	TACATT	2	12	184807	184818	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	73666753
60	NC_007354	GTTAAT	2	12	195627	195638	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	73666760
61	NC_007354	ATTGCT	2	12	202435	202446	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	73666765
62	NC_007354	AGAAAG	2	12	205061	205072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666769
63	NC_007354	TGGATT	2	12	205903	205914	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	73666770
64	NC_007354	TTTTCT	2	12	210242	210253	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	73666771
65	NC_007354	GAAATG	2	12	211703	211714	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	73666772
66	NC_007354	CTGCTA	2	12	212138	212149	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	73666772
67	NC_007354	GTCTTG	2	12	215575	215586	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	73666775
68	NC_007354	CATTGC	2	12	221038	221049	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	73666779
69	NC_007354	GAGTAA	2	12	221935	221946	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	73666779
70	NC_007354	AAAGCT	2	12	227727	227738	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	73666783
71	NC_007354	AAGCTA	2	12	228978	228989	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	73666784
72	NC_007354	TGATTT	2	12	230126	230137	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	73666785
73	NC_007354	TTATCT	2	12	230511	230522	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	73666786
74	NC_007354	AAACTG	2	12	232005	232016	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	73666787
75	NC_007354	AGTATA	2	12	232152	232163	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	73666787
76	NC_007354	AAGAAA	2	12	242211	242222	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	73666794
77	NC_007354	GCTGTA	2	12	242351	242362	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	73666794
78	NC_007354	TTAATA	2	12	246769	246780	50 %	50 %	0 %	0 %	73666799
79	NC_007354	AGAAAG	2	12	248989	249000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666802
80	NC_007354	TGATCC	2	12	256111	256122	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	73666803
81	NC_007354	TTTCTT	2	12	257860	257871	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	73666804
82	NC_007354	GGTGCT	2	12	257949	257960	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	73666804
83	NC_007354	AAATCT	2	12	258611	258622	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	73666804
84	NC_007354	TTTATT	2	12	260544	260555	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	73666806
85	NC_007354	ATTTTA	2	12	262882	262893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666807
86	NC_007354	ACAGTA	2	12	263228	263239	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	73666807
87	NC_007354	TGATAC	2	12	268844	268855	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	73666810
88	NC_007354	CTGTTG	2	12	272132	272143	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	73666813
89	NC_007354	AGAAAA	2	12	273966	273977	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	73666814
90	NC_007354	CATTTT	2	12	274093	274104	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	73666814
91	NC_007354	GAATGT	2	12	280144	280155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666819
92	NC_007354	AATGTG	2	12	280163	280174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666819
93	NC_007354	AGATAA	2	12	283064	283075	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	73666820
94	NC_007354	TAAAAA	2	12	285615	285626	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	73666821
95	NC_007354	CTTTTT	2	12	289100	289111	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	73666824
96	NC_007354	AAAAAG	2	12	289714	289725	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	73666824
97	NC_007354	CTTCTG	2	12	290501	290512	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	73666825
98	NC_007354	ATAACT	2	12	297180	297191	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	73666830
99	NC_007354	ATATTG	2	12	300790	300801	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	73666833
100	NC_007354	TTTGTT	2	12	305001	305012	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	73666836
101	NC_007354	AGAAAA	2	12	305514	305525	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	73666836
102	NC_007354	CATGTT	2	12	305740	305751	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	73666836
103	NC_007354	TATTGA	2	12	311018	311029	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	73666839
104	NC_007354	CATTAT	2	12	312386	312397	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	73666840
105	NC_007354	TCTTTT	2	12	315017	315028	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	73666841
106	NC_007354	AGTATA	2	12	315151	315162	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	73666841
107	NC_007354	GATTAT	2	12	317947	317958	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	73666843
108	NC_007354	AGTACC	2	12	320142	320153	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	73666844
109	NC_007354	TTGTTT	2	12	320247	320258	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	73666844
110	NC_007354	GGTATA	2	12	323343	323354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666846
111	NC_007354	ATGCTA	2	12	323950	323961	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	73666847
112	NC_007354	TGTGTT	2	12	336876	336887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73666855
113	NC_007354	TTTTAC	2	12	338954	338965	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	73666857
114	NC_007354	CATGAG	2	12	340700	340711	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	73666858
115	NC_007354	TAAGTA	2	12	341317	341328	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	73666858
116	NC_007354	TAAATT	2	12	342410	342421	50 %	50 %	0 %	0 %	73666859
117	NC_007354	TTTTTG	2	12	344378	344389	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	73666861
118	NC_007354	AATGTT	2	12	348558	348569	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	73666863
119	NC_007354	TACCTG	2	12	351245	351256	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	73666864
120	NC_007354	AATATT	2	12	351265	351276	50 %	50 %	0 %	0 %	73666864
121	NC_007354	ATGCAG	2	12	352023	352034	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	73666865
122	NC_007354	CTGTTG	2	12	354902	354913	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	73666866
123	NC_007354	TAAATT	2	12	355491	355502	50 %	50 %	0 %	0 %	73666867
124	NC_007354	ATGCTA	2	12	361523	361534	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	73666870
125	NC_007354	TGGTTG	3	18	361935	361952	0 %	50 %	50 %	0 %	73666870
126	NC_007354	TCAAGT	2	12	364063	364074	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	73666870
127	NC_007354	TAGGTA	2	12	370039	370050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666876
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129	NC_007354	ATTTTG	2	12	380391	380402	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	73666882
130	NC_007354	AGCTTT	2	12	387108	387119	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	73666884
131	NC_007354	GTTAAT	2	12	393795	393806	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	73666889
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133	NC_007354	TGAATT	2	12	408623	408634	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	73666896
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135	NC_007354	GTTACA	2	12	417511	417522	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	73666901
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140	NC_007354	ATAGAT	2	12	428168	428179	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	73666911
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149	NC_007354	ATGAAA	2	12	442615	442626	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	73666923
150	NC_007354	TTAATA	2	12	443125	443136	50 %	50 %	0 %	0 %	73666923
151	NC_007354	TAACTT	2	12	446137	446148	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	73666926
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223	NC_007354	AATTTA	2	12	631926	631937	50 %	50 %	0 %	0 %	73667051
224	NC_007354	TAAATG	2	12	640348	640359	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	73667056
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226	NC_007354	AATTAT	2	12	642734	642745	50 %	50 %	0 %	0 %	73667058
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233	NC_007354	ATTAAT	2	12	664903	664914	50 %	50 %	0 %	0 %	73667074
234	NC_007354	AGTTGA	2	12	672146	672157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73667081
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352	NC_007354	GTTGAG	2	12	1035369	1035380	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	73667345
353	NC_007354	TCAGGT	2	12	1035389	1035400	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	73667345
354	NC_007354	AGATTT	2	12	1040402	1040413	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	73667350
355	NC_007354	TGTTCT	2	12	1042121	1042132	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	73667352
356	NC_007354	TACATT	2	12	1044663	1044674	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	73667355
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359	NC_007354	TTCCTT	2	12	1053694	1053705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73667366
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364	NC_007354	GACGAT	2	12	1063180	1063191	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	73667373
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381	NC_007354	CAGGTA	2	12	1112701	1112712	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	73667405
382	NC_007354	AGAGGC	2	12	1112831	1112842	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	73667405
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441	NC_007354	CTAATG	2	12	1307276	1307287	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	73667552
442	NC_007354	TCAAGC	2	12	1308425	1308436	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	73667553
443	NC_007354	AATAGA	2	12	1309891	1309902	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	73667555
444	NC_007354	AGAAAA	2	12	1310194	1310205	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	73667555
445	NC_007354	TAGCAT	2	12	1311535	1311546	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	73667557
446	NC_007354	AGTTTC	2	12	1314258	1314269	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	73667558