MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Ehrlichia canis str. Jake chromosome

Total Repeats: 1411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007354	TGTAT	2	10	11	20	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007354	TTGTA	2	10	1539	1548	20 %	60 %	20 %	0 %	73666634
3	NC_007354	AATGG	2	10	2981	2990	40 %	20 %	40 %	0 %	73666636
4	NC_007354	AAAAG	2	10	3653	3662	80 %	0 %	20 %	0 %	73666637
5	NC_007354	ACAAA	2	10	6215	6224	80 %	0 %	0 %	20 %	73666638
6	NC_007354	TGTAC	2	10	6429	6438	20 %	40 %	20 %	20 %	73666638
7	NC_007354	AAAAG	2	10	6554	6563	80 %	0 %	20 %	0 %	73666638
8	NC_007354	TCTTT	2	10	6848	6857	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_007354	TTACT	2	10	7439	7448	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_007354	TCCAT	2	10	8460	8469	20 %	40 %	0 %	40 %	73666640
11	NC_007354	TGTTA	2	10	8615	8624	20 %	60 %	20 %	0 %	73666640
12	NC_007354	TCAGA	2	10	8640	8649	40 %	20 %	20 %	20 %	73666640
13	NC_007354	GAAAA	2	10	8971	8980	80 %	0 %	20 %	0 %	73666640
14	NC_007354	ATATA	2	10	8985	8994	60 %	40 %	0 %	0 %	73666640
15	NC_007354	CATAA	2	10	9220	9229	60 %	20 %	0 %	20 %	73666641
16	NC_007354	TATTT	2	10	9326	9335	20 %	80 %	0 %	0 %	73666641
17	NC_007354	AAGTA	2	10	12668	12677	60 %	20 %	20 %	0 %	73666644
18	NC_007354	AACTA	2	10	12813	12822	60 %	20 %	0 %	20 %	73666645
19	NC_007354	AGAAT	2	10	13774	13783	60 %	20 %	20 %	0 %	73666646
20	NC_007354	CTATA	2	10	13932	13941	40 %	40 %	0 %	20 %	73666646
21	NC_007354	AATTG	2	10	15219	15228	40 %	40 %	20 %	0 %	73666647
22	NC_007354	AATAT	2	10	15428	15437	60 %	40 %	0 %	0 %	73666647
23	NC_007354	AGAAA	2	10	16032	16041	80 %	0 %	20 %	0 %	73666648
24	NC_007354	TAATA	2	10	19146	19155	60 %	40 %	0 %	0 %	73666650
25	NC_007354	TAATA	2	10	19394	19403	60 %	40 %	0 %	0 %	73666650
26	NC_007354	TATTT	2	10	20354	20363	20 %	80 %	0 %	0 %	73666651
27	NC_007354	TTTTG	2	10	23248	23257	0 %	80 %	20 %	0 %	73666653
28	NC_007354	TTTAT	2	10	24752	24761	20 %	80 %	0 %	0 %	73666654
29	NC_007354	TTTCT	2	10	25691	25700	0 %	80 %	0 %	20 %	73666655
30	NC_007354	GTTTG	2	10	26322	26331	0 %	60 %	40 %	0 %	73666656
31	NC_007354	TTATT	2	10	26346	26355	20 %	80 %	0 %	0 %	73666656
32	NC_007354	TTTTA	2	10	26587	26596	20 %	80 %	0 %	0 %	73666656
33	NC_007354	ATTAA	2	10	27336	27345	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007354	ATACT	2	10	27370	27379	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_007354	AAGTA	2	10	27447	27456	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007354	GTTTT	2	10	28362	28371	0 %	80 %	20 %	0 %	73666657
37	NC_007354	TACAT	2	10	28659	28668	40 %	40 %	0 %	20 %	73666657
38	NC_007354	TTTGA	2	10	28711	28720	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007354	GTTTC	2	10	30782	30791	0 %	60 %	20 %	20 %	73666660
40	NC_007354	AAATT	2	10	32880	32889	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007354	AAATT	2	10	33140	33149	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007354	TCTTT	2	10	34164	34173	0 %	80 %	0 %	20 %	73666662
43	NC_007354	TATAA	2	10	34191	34200	60 %	40 %	0 %	0 %	73666662
44	NC_007354	TTTTA	2	10	34291	34300	20 %	80 %	0 %	0 %	73666662
45	NC_007354	TTTAT	2	10	34355	34364	20 %	80 %	0 %	0 %	73666662
46	NC_007354	TGATT	2	10	34674	34683	20 %	60 %	20 %	0 %	73666662
47	NC_007354	ATATT	2	10	35440	35449	40 %	60 %	0 %	0 %	73666663
48	NC_007354	CTGAT	2	10	38015	38024	20 %	40 %	20 %	20 %	73666665
49	NC_007354	TATTT	2	10	38721	38730	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007354	TATTT	2	10	38918	38927	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007354	TATTT	2	10	39126	39135	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007354	TATTT	2	10	39322	39331	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007354	TATTT	2	10	39519	39528	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007354	ATTAT	2	10	40898	40907	40 %	60 %	0 %	0 %	73666667
55	NC_007354	CTTAA	2	10	41641	41650	40 %	40 %	0 %	20 %	73666667
56	NC_007354	TTTGC	2	10	41887	41896	0 %	60 %	20 %	20 %	73666667
57	NC_007354	AAATT	2	10	43166	43175	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007354	ATTTT	2	10	43698	43707	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007354	GTTGA	2	10	44202	44211	20 %	40 %	40 %	0 %	73666668
60	NC_007354	ATTTT	2	10	44551	44560	20 %	80 %	0 %	0 %	73666668
61	NC_007354	CAATA	2	10	46399	46408	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_007354	TAATA	2	10	46479	46488	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007354	ATTAT	2	10	46553	46562	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007354	TTTAA	2	10	46582	46591	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007354	GAATG	2	10	47793	47802	40 %	20 %	40 %	0 %	73666672
66	NC_007354	TATGA	2	10	49439	49448	40 %	40 %	20 %	0 %	73666673
67	NC_007354	TTTAA	2	10	49840	49849	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007354	TATGC	2	10	53552	53561	20 %	40 %	20 %	20 %	73666677
69	NC_007354	TCCAT	2	10	53850	53859	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_007354	ATGTC	2	10	56116	56125	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_007354	CATAA	2	10	56383	56392	60 %	20 %	0 %	20 %	73666679
72	NC_007354	TCCAA	2	10	56799	56808	40 %	20 %	0 %	40 %	73666679
73	NC_007354	GTACT	2	10	56912	56921	20 %	40 %	20 %	20 %	73666679
74	NC_007354	AATTT	2	10	61076	61085	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007354	TTATG	2	10	61414	61423	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007354	TATAA	2	10	62572	62581	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007354	TTACA	2	10	63975	63984	40 %	40 %	0 %	20 %	73666684
78	NC_007354	TGTAT	2	10	64298	64307	20 %	60 %	20 %	0 %	73666684
79	NC_007354	GTTTT	2	10	64463	64472	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007354	CTTTT	2	10	66750	66759	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_007354	TGCTT	2	10	67181	67190	0 %	60 %	20 %	20 %	73666686
82	NC_007354	TATTT	2	10	67565	67574	20 %	80 %	0 %	0 %	73666686
83	NC_007354	ATTTT	2	10	68223	68232	20 %	80 %	0 %	0 %	73666687
84	NC_007354	TCTGA	2	10	68799	68808	20 %	40 %	20 %	20 %	73666687
85	NC_007354	ATGTA	2	10	69465	69474	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007354	ATGTT	2	10	69965	69974	20 %	60 %	20 %	0 %	73666688
87	NC_007354	ATAAA	2	10	70533	70542	80 %	20 %	0 %	0 %	73666688
88	NC_007354	GATGT	2	10	70713	70722	20 %	40 %	40 %	0 %	73666688
89	NC_007354	TCTGG	2	10	70760	70769	0 %	40 %	40 %	20 %	73666688
90	NC_007354	AAGTT	2	10	72174	72183	40 %	40 %	20 %	0 %	73666690
91	NC_007354	TCTGA	2	10	72340	72349	20 %	40 %	20 %	20 %	73666690
92	NC_007354	TGCTA	2	10	75299	75308	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_007354	GTATG	2	10	75610	75619	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007354	CAATA	2	10	75684	75693	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_007354	TGATT	2	10	75897	75906	20 %	60 %	20 %	0 %	73666692
96	NC_007354	AATAA	2	10	76757	76766	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007354	ATTTA	2	10	77658	77667	40 %	60 %	0 %	0 %	73666693
98	NC_007354	TATTG	2	10	80167	80176	20 %	60 %	20 %	0 %	73666693
99	NC_007354	TTTGG	2	10	81904	81913	0 %	60 %	40 %	0 %	73666693
100	NC_007354	AATAT	2	10	82554	82563	60 %	40 %	0 %	0 %	73666693
101	NC_007354	GAAGT	2	10	82956	82965	40 %	20 %	40 %	0 %	73666693
102	NC_007354	GTTCT	2	10	83325	83334	0 %	60 %	20 %	20 %	73666693
103	NC_007354	GTTCT	2	10	83616	83625	0 %	60 %	20 %	20 %	73666693
104	NC_007354	TATCT	2	10	85018	85027	20 %	60 %	0 %	20 %	73666693
105	NC_007354	TCAAG	2	10	85334	85343	40 %	20 %	20 %	20 %	73666693
106	NC_007354	TTAAT	2	10	88826	88835	40 %	60 %	0 %	0 %	73666694
107	NC_007354	TTATA	2	10	90078	90087	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007354	TAGCA	2	10	90128	90137	40 %	20 %	20 %	20 %	73666695
109	NC_007354	TAAGT	2	10	90212	90221	40 %	40 %	20 %	0 %	73666695
110	NC_007354	GTCGG	2	10	93623	93632	0 %	20 %	60 %	20 %	73666696
111	NC_007354	CATAT	2	10	97706	97715	40 %	40 %	0 %	20 %	73666698
112	NC_007354	CATGC	2	10	97870	97879	20 %	20 %	20 %	40 %	73666698
113	NC_007354	AAGCA	2	10	99345	99354	60 %	0 %	20 %	20 %	73666699
114	NC_007354	AGAAA	2	10	99404	99413	80 %	0 %	20 %	0 %	73666699
115	NC_007354	AGAAA	2	10	99695	99704	80 %	0 %	20 %	0 %	73666699
116	NC_007354	ATTTA	2	10	101627	101636	40 %	60 %	0 %	0 %	73666699
117	NC_007354	TATGA	2	10	101676	101685	40 %	40 %	20 %	0 %	73666699
118	NC_007354	AAGAA	2	10	102219	102228	80 %	0 %	20 %	0 %	73666700
119	NC_007354	TAAGT	2	10	102811	102820	40 %	40 %	20 %	0 %	73666700
120	NC_007354	ATATT	2	10	103577	103586	40 %	60 %	0 %	0 %	73666700
121	NC_007354	TGTAT	2	10	106431	106440	20 %	60 %	20 %	0 %	73666701
122	NC_007354	GCTAT	2	10	109764	109773	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_007354	TGAAA	2	10	111235	111244	60 %	20 %	20 %	0 %	73666704
124	NC_007354	ATATT	2	10	111456	111465	40 %	60 %	0 %	0 %	73666704
125	NC_007354	AGAGT	2	10	112688	112697	40 %	20 %	40 %	0 %	73666705
126	NC_007354	AAAGA	2	10	114080	114089	80 %	0 %	20 %	0 %	73666705
127	NC_007354	TTGAT	2	10	114758	114767	20 %	60 %	20 %	0 %	73666705
128	NC_007354	GTTTT	2	10	116057	116066	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007354	TTTAT	2	10	116224	116233	20 %	80 %	0 %	0 %	73666707
130	NC_007354	AAATA	2	10	117033	117042	80 %	20 %	0 %	0 %	73666707
131	NC_007354	ATATA	2	10	118811	118820	60 %	40 %	0 %	0 %	73666708
132	NC_007354	TACAT	2	10	119258	119267	40 %	40 %	0 %	20 %	73666708
133	NC_007354	TTATT	2	10	119639	119648	20 %	80 %	0 %	0 %	73666708
134	NC_007354	GATAT	2	10	120018	120027	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007354	TATGG	2	10	120968	120977	20 %	40 %	40 %	0 %	73666709
136	NC_007354	ATCTT	2	10	121962	121971	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_007354	TATAT	2	10	122195	122204	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007354	TTTGT	2	10	122859	122868	0 %	80 %	20 %	0 %	73666710
139	NC_007354	AAAAT	2	10	124338	124347	80 %	20 %	0 %	0 %	73666711
140	NC_007354	GTAAT	2	10	124413	124422	40 %	40 %	20 %	0 %	73666711
141	NC_007354	AATTA	2	10	125629	125638	60 %	40 %	0 %	0 %	73666712
142	NC_007354	CAAAA	2	10	125872	125881	80 %	0 %	0 %	20 %	73666713
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157	NC_007354	AGTAA	2	10	146114	146123	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_007354	TTATG	2	10	258804	258813	20 %	60 %	20 %	0 %	73666804
280	NC_007354	TGTAT	2	10	258973	258982	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
281	NC_007354	AGGTT	2	10	259720	259729	20 %	40 %	40 %	0 %	73666805
282	NC_007354	ATGTT	2	10	260061	260070	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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415	NC_007354	TAATG	2	10	398527	398536	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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