MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Ehrlichia canis str. Jake chromosome

Total Repeats: 16284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007354	ATG	2	6	494	499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666634
2	NC_007354	AAT	2	6	528	533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666634
3	NC_007354	ATC	2	6	597	602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73666634
4	NC_007354	AGG	2	6	634	639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73666634
5	NC_007354	ACA	2	6	674	679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73666634
6	NC_007354	TAA	2	6	710	715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666634
7	NC_007354	ACA	2	6	913	918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73666634
8	NC_007354	CTA	2	6	919	924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73666634
9	NC_007354	ACT	2	6	930	935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73666634
10	NC_007354	CTG	2	6	941	946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73666634
11	NC_007354	ATT	2	6	1001	1006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666634
12	NC_007354	ATC	2	6	1043	1048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73666634
13	NC_007354	ATG	2	6	1109	1114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666634
14	NC_007354	TTA	2	6	1190	1195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666634
15	NC_007354	GCA	2	6	1324	1329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73666634
16	NC_007354	TAG	2	6	1391	1396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666634
17	NC_007354	ATA	2	6	1397	1402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666634
18	NC_007354	TAC	2	6	1503	1508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73666634
19	NC_007354	AAG	2	6	1557	1562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666634
20	NC_007354	ATT	2	6	1677	1682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666635
21	NC_007354	TTC	2	6	1773	1778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73666635
22	NC_007354	TTA	2	6	1837	1842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666635
23	NC_007354	TAA	2	6	1999	2004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666635
24	NC_007354	CAC	2	6	2005	2010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73666635
25	NC_007354	GAA	2	6	2104	2109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666635
26	NC_007354	AAC	2	6	2142	2147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73666635
27	NC_007354	TAA	2	6	2604	2609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666636
28	NC_007354	GCA	2	6	2678	2683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73666636
29	NC_007354	TTA	2	6	2754	2759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666636
30	NC_007354	CAT	2	6	2807	2812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73666636
31	NC_007354	TAA	2	6	2826	2831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666636
32	NC_007354	GAT	2	6	2924	2929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666636
33	NC_007354	GCA	2	6	3013	3018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73666636
34	NC_007354	AGG	2	6	3022	3027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73666636
35	NC_007354	GAT	2	6	3125	3130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666636
36	NC_007354	AAC	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73666636
37	NC_007354	AAC	2	6	3159	3164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73666636
38	NC_007354	AGC	2	6	3280	3285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73666636
39	NC_007354	TGT	2	6	3401	3406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73666636
40	NC_007354	AGA	2	6	3478	3483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666637
41	NC_007354	ACC	2	6	3487	3492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73666637
42	NC_007354	ACA	2	6	3618	3623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73666637
43	NC_007354	TCA	2	6	3635	3640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73666637
44	NC_007354	CAG	2	6	3675	3680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73666637
45	NC_007354	TAA	2	6	3715	3720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666637
46	NC_007354	TAA	2	6	3735	3740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666637
47	NC_007354	ATG	2	6	3756	3761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666637
48	NC_007354	TAT	2	6	3767	3772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666637
49	NC_007354	AAC	2	6	3785	3790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73666637
50	NC_007354	TCA	2	6	3818	3823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73666637
51	NC_007354	TAA	2	6	3906	3911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666637
52	NC_007354	AAG	2	6	4071	4076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666637
53	NC_007354	CAA	2	6	4097	4102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73666637
54	NC_007354	GAA	2	6	4118	4123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666637
55	NC_007354	AAT	2	6	4124	4129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666637
56	NC_007354	AAT	2	6	4142	4147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666637
57	NC_007354	GCT	2	6	4280	4285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73666637
58	NC_007354	GGT	2	6	4292	4297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73666637
59	NC_007354	TTA	2	6	4311	4316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666637
60	NC_007354	ATG	2	6	4335	4340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666637
61	NC_007354	TAA	2	6	4344	4349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666637
62	NC_007354	TAG	2	6	4503	4508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666637
63	NC_007354	TTC	2	6	4543	4548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73666637
64	NC_007354	TAA	2	6	4551	4556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666637
65	NC_007354	ATT	2	6	4634	4639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666637
66	NC_007354	GGA	2	6	4640	4645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73666637
67	NC_007354	CAA	2	6	4710	4715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73666637
68	NC_007354	CTT	2	6	4734	4739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73666637
69	NC_007354	AAG	2	6	4843	4848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666637
70	NC_007354	TTA	2	6	4863	4868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666637
71	NC_007354	ATT	2	6	4874	4879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666637
72	NC_007354	TAG	2	6	4911	4916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666637
73	NC_007354	CAA	2	6	4966	4971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73666637
74	NC_007354	AGA	2	6	5000	5005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666637
75	NC_007354	ATT	2	6	5012	5017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666637
76	NC_007354	AGA	2	6	5065	5070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666637
77	NC_007354	AGA	2	6	5080	5085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666637
78	NC_007354	TAA	2	6	5088	5093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666637
79	NC_007354	AAT	2	6	5120	5125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666637
80	NC_007354	ATA	2	6	5132	5137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666637
81	NC_007354	AAC	2	6	5177	5182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73666637
82	NC_007354	ATA	2	6	5192	5197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666637
83	NC_007354	AGA	2	6	5233	5238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666637
84	NC_007354	CAA	2	6	5253	5258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73666637
85	NC_007354	AAG	2	6	5273	5278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666637
86	NC_007354	GTT	2	6	5400	5405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73666637
87	NC_007354	TAT	2	6	5628	5633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666638
88	NC_007354	AGA	2	6	5666	5671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666638
89	NC_007354	TAA	2	6	5729	5734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666638
90	NC_007354	AGA	2	6	5741	5746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666638
91	NC_007354	ATG	2	6	5773	5778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666638
92	NC_007354	AGC	2	6	5801	5806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73666638
93	NC_007354	TGC	2	6	5840	5845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73666638
94	NC_007354	TGG	3	9	5915	5923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73666638
95	NC_007354	AGG	2	6	5936	5941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73666638
96	NC_007354	AGA	2	6	5955	5960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666638
97	NC_007354	TGC	2	6	5969	5974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73666638
98	NC_007354	AAG	2	6	6030	6035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666638
99	NC_007354	ACA	2	6	6152	6157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73666638
100	NC_007354	AAG	2	6	6353	6358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666638
101	NC_007354	TGC	2	6	6455	6460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73666638
102	NC_007354	GTG	2	6	6535	6540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73666638
103	NC_007354	TCA	2	6	6582	6587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73666638
104	NC_007354	TGA	3	9	6671	6679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666638
105	NC_007354	CTT	2	6	7587	7592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73666639
106	NC_007354	TGT	2	6	7681	7686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73666639
107	NC_007354	TAA	2	6	7688	7693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666639
108	NC_007354	TTC	2	6	7721	7726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73666639
109	NC_007354	CAT	2	6	7849	7854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73666639
110	NC_007354	TGT	2	6	8013	8018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73666639
111	NC_007354	TCT	2	6	8163	8168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73666639
112	NC_007354	AAT	2	6	8235	8240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666639
113	NC_007354	TAG	2	6	8248	8253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666639
114	NC_007354	TCT	2	6	8277	8282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73666639
115	NC_007354	ATA	2	6	8410	8415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666640
116	NC_007354	GTA	2	6	8574	8579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666640
117	NC_007354	ATT	2	6	8669	8674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666640
118	NC_007354	ATA	2	6	8799	8804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666640
119	NC_007354	TCA	2	6	8826	8831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73666640
120	NC_007354	GTC	2	6	8834	8839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73666640
121	NC_007354	TAT	2	6	8840	8845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666640
122	NC_007354	TAT	2	6	8858	8863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666640
123	NC_007354	GTT	2	6	8864	8869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73666640
124	NC_007354	ATT	2	6	8881	8886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666640
125	NC_007354	CTA	2	6	8922	8927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73666640
126	NC_007354	ACA	2	6	8936	8941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73666640
127	NC_007354	ATT	2	6	9002	9007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666641
128	NC_007354	TGA	2	6	9158	9163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666641
129	NC_007354	CTT	2	6	9265	9270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73666641
130	NC_007354	ATA	2	6	9412	9417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666641
131	NC_007354	CAA	2	6	9518	9523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73666642
132	NC_007354	GCA	2	6	9538	9543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73666642
133	NC_007354	ATT	2	6	9804	9809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666642
134	NC_007354	AGT	2	6	9853	9858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666642
135	NC_007354	CCA	2	6	10113	10118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	73666642
136	NC_007354	ATG	2	6	10266	10271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666642
137	NC_007354	ATT	2	6	10291	10296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666642
138	NC_007354	ATT	2	6	10451	10456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666643
139	NC_007354	CTA	2	6	10545	10550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73666643
140	NC_007354	TGA	2	6	10579	10584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666643
141	NC_007354	TCT	2	6	10649	10654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73666643
142	NC_007354	ATT	2	6	10670	10675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666643
143	NC_007354	TAT	2	6	10756	10761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666643
144	NC_007354	TTA	2	6	10845	10850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666643
145	NC_007354	AAG	2	6	10962	10967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666643
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147	NC_007354	CGC	2	6	11200	11205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	73666643
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149	NC_007354	CCT	2	6	11355	11360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73666643
150	NC_007354	GTT	2	6	11361	11366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73666643
151	NC_007354	ATA	2	6	11839	11844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666644
152	NC_007354	TGA	2	6	11852	11857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666644
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154	NC_007354	TAA	2	6	12106	12111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666644
155	NC_007354	ACA	2	6	12154	12159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73666644
156	NC_007354	TCC	2	6	12248	12253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	73666644
157	NC_007354	TCT	2	6	12291	12296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73666644
158	NC_007354	TGG	2	6	12329	12334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73666644
159	NC_007354	GAG	2	6	12369	12374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73666644
160	NC_007354	TGA	2	6	12392	12397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73666644
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162	NC_007354	ATA	2	6	12439	12444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73666644
163	NC_007354	AGA	2	6	12482	12487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666644
164	NC_007354	AGA	2	6	12518	12523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666644
165	NC_007354	GGT	2	6	12540	12545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73666644
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171	NC_007354	CTT	2	6	12944	12949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73666645
172	NC_007354	TAT	2	6	12998	13003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73666645
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200	NC_007354	TTG	2	6	15376	15381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73666647
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260	NC_007354	AGA	2	6	18642	18647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73666650
261	NC_007354	CTG	2	6	18656	18661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73666650
262	NC_007354	TCA	2	6	18682	18687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73666650
263	NC_007354	CTG	2	6	18764	18769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73666650
264	NC_007354	TCA	2	6	18790	18795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73666650
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267	NC_007354	CTG	2	6	18872	18877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73666650
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276	NC_007354	TGT	2	6	19875	19880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73666651
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280	NC_007354	TCT	2	6	19952	19957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73666651
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282	NC_007354	TCT	3	9	19994	20002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73666651
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292	NC_007354	TCT	3	9	20147	20155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73666651
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