MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305 plasmid pSSP2

Total Repeats: 326

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007352	TAA	2	6	77	82	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007352	AGG	2	6	170	175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007352	GAA	2	6	288	293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663803
4	NC_007352	GTA	2	6	307	312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663803
5	NC_007352	TAA	2	6	449	454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663803
6	NC_007352	ATC	2	6	479	484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663803
7	NC_007352	GCA	2	6	523	528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73663803
8	NC_007352	ATG	2	6	559	564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663803
9	NC_007352	AGT	2	6	621	626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663803
10	NC_007352	ATT	2	6	630	635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663803
11	NC_007352	TAG	2	6	688	693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663803
12	NC_007352	AAG	2	6	703	708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663803
13	NC_007352	ATA	2	6	715	720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663803
14	NC_007352	TCA	2	6	740	745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007352	AGT	2	6	872	877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007352	AGA	2	6	935	940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663804
17	NC_007352	TAA	2	6	961	966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663804
18	NC_007352	TTA	2	6	1013	1018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663804
19	NC_007352	ATC	2	6	1051	1056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663804
20	NC_007352	ATA	2	6	1073	1078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663804
21	NC_007352	ATA	2	6	1106	1111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007352	ATA	2	6	1160	1165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007352	CCG	2	6	1229	1234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_007352	AAC	2	6	1266	1271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007352	ATA	2	6	1362	1367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007352	TAT	2	6	1373	1378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007352	AAG	2	6	1389	1394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007352	GAT	2	6	1468	1473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007352	CAG	2	6	1599	1604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73663805
30	NC_007352	TTC	2	6	1618	1623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663805
31	NC_007352	ATC	2	6	1633	1638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663805
32	NC_007352	TCT	2	6	1652	1657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663805
33	NC_007352	TGT	2	6	1697	1702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663805
34	NC_007352	TTC	2	6	1750	1755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663805
35	NC_007352	CTT	2	6	1767	1772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663805
36	NC_007352	AAT	2	6	1815	1820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663805
37	NC_007352	TTA	2	6	1868	1873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663805
38	NC_007352	ATT	2	6	2014	2019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663805
39	NC_007352	CTT	3	9	2028	2036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663805
40	NC_007352	ATC	2	6	2053	2058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663805
41	NC_007352	TAC	2	6	2089	2094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663805
42	NC_007352	ATT	2	6	2167	2172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663805
43	NC_007352	TAT	2	6	2280	2285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007352	TTA	2	6	2291	2296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007352	TAT	2	6	2356	2361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007352	TTA	2	6	2540	2545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007352	TAA	2	6	2596	2601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007352	TTA	2	6	2639	2644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007352	ATT	2	6	2657	2662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007352	TTA	2	6	2701	2706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007352	AAT	2	6	2894	2899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663806
52	NC_007352	TAG	2	6	2968	2973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663806
53	NC_007352	TAA	2	6	3055	3060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663806
54	NC_007352	CAA	2	6	3113	3118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663806
55	NC_007352	TAA	2	6	3139	3144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663806
56	NC_007352	CAT	2	6	3212	3217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663806
57	NC_007352	AAT	2	6	3281	3286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663806
58	NC_007352	CAA	2	6	3321	3326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663806
59	NC_007352	ATC	2	6	3351	3356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663806
60	NC_007352	TAA	2	6	3370	3375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663806
61	NC_007352	GAA	2	6	3401	3406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663806
62	NC_007352	CAA	2	6	3413	3418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663806
63	NC_007352	TAT	2	6	3460	3465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663806
64	NC_007352	GAA	2	6	3487	3492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663806
65	NC_007352	TAA	2	6	3499	3504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663806
66	NC_007352	TAT	2	6	3518	3523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663806
67	NC_007352	AGA	2	6	3529	3534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663806
68	NC_007352	TGC	2	6	3579	3584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73663806
69	NC_007352	GAA	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663806
70	NC_007352	CGT	2	6	3674	3679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73663806
71	NC_007352	ACA	2	6	3691	3696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663806
72	NC_007352	AAT	2	6	3711	3716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663806
73	NC_007352	TCA	2	6	3765	3770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007352	ATT	2	6	3772	3777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007352	TGA	2	6	3932	3937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663807
76	NC_007352	ACA	2	6	3945	3950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663807
77	NC_007352	GAA	3	9	3954	3962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663807
78	NC_007352	ATT	2	6	4006	4011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663807
79	NC_007352	ATT	2	6	4082	4087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007352	AAT	2	6	4105	4110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007352	TAA	2	6	4137	4142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007352	TAA	2	6	4166	4171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007352	CTA	2	6	4486	4491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007352	TAG	2	6	4501	4506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007352	GTA	2	6	4531	4536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007352	TGC	2	6	4600	4605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007352	CGA	2	6	4640	4645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007352	ACG	2	6	4719	4724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007352	TAA	2	6	4835	4840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007352	TAA	2	6	4871	4876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007352	TCA	2	6	5005	5010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663808
92	NC_007352	GGT	2	6	5090	5095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73663808
93	NC_007352	TGT	2	6	5317	5322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663808
94	NC_007352	TAA	2	6	5347	5352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663808
95	NC_007352	ATT	2	6	5356	5361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663808
96	NC_007352	CAT	2	6	5561	5566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663808
97	NC_007352	GAA	2	6	5567	5572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663808
98	NC_007352	AAG	2	6	5575	5580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663808
99	NC_007352	GAA	2	6	5642	5647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663808
100	NC_007352	GAA	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007352	TTA	2	6	5838	5843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007352	GAT	2	6	5949	5954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663809
103	NC_007352	GAA	2	6	5982	5987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663809
104	NC_007352	TCT	2	6	5994	5999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663809
105	NC_007352	GGT	2	6	6003	6008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73663809
106	NC_007352	ATA	2	6	6091	6096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663809
107	NC_007352	TTG	2	6	6118	6123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663809
108	NC_007352	TAA	2	6	6134	6139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663809
109	NC_007352	ATT	2	6	6175	6180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663809
110	NC_007352	GTT	2	6	6291	6296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663809
111	NC_007352	ATA	2	6	6298	6303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663809
112	NC_007352	TCT	2	6	6506	6511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007352	TTC	2	6	6658	6663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_007352	TAA	2	6	6730	6735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007352	AGA	2	6	6960	6965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663810
116	NC_007352	GTG	2	6	7004	7009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73663810
117	NC_007352	CTA	2	6	7016	7021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663810
118	NC_007352	GTT	2	6	7024	7029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663810
119	NC_007352	ATG	2	6	7113	7118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663811
120	NC_007352	GAT	2	6	7264	7269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663811
121	NC_007352	TCA	2	6	7545	7550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663811
122	NC_007352	TAA	2	6	7563	7568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663811
123	NC_007352	TTC	2	6	7584	7589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663811
124	NC_007352	ATG	2	6	7643	7648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663811
125	NC_007352	TAG	2	6	7713	7718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663811
126	NC_007352	AAC	2	6	7859	7864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007352	GAA	3	9	7869	7877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007352	TAA	2	6	7914	7919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007352	ATC	2	6	7962	7967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_007352	ATA	2	6	8025	8030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007352	TAT	2	6	8258	8263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007352	AGT	2	6	8485	8490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007352	TAA	2	6	8539	8544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007352	TCT	2	6	8649	8654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007352	TGA	2	6	8678	8683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007352	GAA	2	6	8714	8719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007352	CTC	2	6	8730	8735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_007352	TTA	2	6	8765	8770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_007352	GAT	3	9	19572	19580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663824
270	NC_007352	TGT	2	6	19661	19666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663824
271	NC_007352	TAT	2	6	19811	19816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663824
272	NC_007352	TGA	2	6	19972	19977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663824
273	NC_007352	ACT	2	6	19999	20004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663824
274	NC_007352	GCA	2	6	20187	20192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73663824
275	NC_007352	CAT	2	6	20218	20223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663824
276	NC_007352	ATT	2	6	20228	20233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663824
277	NC_007352	TTA	2	6	20242	20247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663824
278	NC_007352	TAT	2	6	20351	20356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663824
279	NC_007352	CAT	2	6	20384	20389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663824
280	NC_007352	TGA	2	6	20477	20482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663824
281	NC_007352	ATA	2	6	20569	20574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663824
282	NC_007352	AGA	2	6	20588	20593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663824
283	NC_007352	TAA	2	6	20636	20641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663824
284	NC_007352	GTT	2	6	20651	20656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663824
285	NC_007352	GAA	2	6	20670	20675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663824
286	NC_007352	CAA	2	6	20692	20697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663824
287	NC_007352	ATG	2	6	20812	20817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663824
288	NC_007352	TTA	2	6	20862	20867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663824
289	NC_007352	AAT	2	6	20885	20890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663824
290	NC_007352	GAA	2	6	21099	21104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663824
291	NC_007352	TAG	2	6	21169	21174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663824
292	NC_007352	GAT	2	6	21222	21227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663824
293	NC_007352	ATT	2	6	21320	21325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663824
294	NC_007352	AAG	2	6	21403	21408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663824
295	NC_007352	GAA	2	6	21463	21468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663824
296	NC_007352	ATG	2	6	21478	21483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663824
297	NC_007352	CAA	2	6	21488	21493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663824
298	NC_007352	CAT	2	6	21526	21531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663824
299	NC_007352	GAA	2	6	21570	21575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663824
300	NC_007352	ATA	2	6	21637	21642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663824
301	NC_007352	ACA	2	6	21661	21666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663824
302	NC_007352	AAG	2	6	21667	21672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663824
303	NC_007352	AAT	2	6	21789	21794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663824
304	NC_007352	AAT	2	6	21816	21821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663824
305	NC_007352	AGG	2	6	21855	21860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
306	NC_007352	TTA	2	6	21861	21866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
307	NC_007352	TAT	2	6	21928	21933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663825
308	NC_007352	AGG	2	6	21983	21988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	73663825
309	NC_007352	CAG	2	6	22024	22029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73663825
310	NC_007352	AAC	2	6	22082	22087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663825
311	NC_007352	ATA	2	6	22303	22308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663825
312	NC_007352	GAC	2	6	22350	22355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73663825
313	NC_007352	TAA	2	6	22421	22426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663825
314	NC_007352	TCT	2	6	22428	22433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663825
315	NC_007352	GAA	2	6	22437	22442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663825
316	NC_007352	TGT	2	6	22444	22449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663825
317	NC_007352	ATT	2	6	22485	22490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663825
318	NC_007352	GAA	2	6	22521	22526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663825
319	NC_007352	GTG	2	6	22570	22575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73663825
320	NC_007352	TAA	2	6	22598	22603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663825
321	NC_007352	CTG	2	6	22624	22629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73663825
322	NC_007352	TGA	2	6	22655	22660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663825
323	NC_007352	GAA	2	6	22668	22673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663825
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325	NC_007352	GAA	2	6	22734	22739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663825
326	NC_007352	CAG	2	6	22788	22793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73663825

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.