MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305 plasmid pSSP2

Total Repeats: 236

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007352	GAA	2	6	288	293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663803
2	NC_007352	GTA	2	6	307	312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663803
3	NC_007352	TAA	2	6	449	454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663803
4	NC_007352	ATC	2	6	479	484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663803
5	NC_007352	GCA	2	6	523	528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73663803
6	NC_007352	ATG	2	6	559	564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663803
7	NC_007352	AGT	2	6	621	626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663803
8	NC_007352	ATT	2	6	630	635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663803
9	NC_007352	TAG	2	6	688	693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663803
10	NC_007352	AAG	2	6	703	708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663803
11	NC_007352	ATA	2	6	715	720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663803
12	NC_007352	AGA	2	6	935	940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663804
13	NC_007352	TAA	2	6	961	966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663804
14	NC_007352	TTA	2	6	1013	1018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663804
15	NC_007352	ATC	2	6	1051	1056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663804
16	NC_007352	ATA	2	6	1073	1078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663804
17	NC_007352	CAG	2	6	1599	1604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73663805
18	NC_007352	TTC	2	6	1618	1623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663805
19	NC_007352	ATC	2	6	1633	1638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663805
20	NC_007352	TCT	2	6	1652	1657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663805
21	NC_007352	TGT	2	6	1697	1702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663805
22	NC_007352	TTC	2	6	1750	1755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663805
23	NC_007352	CTT	2	6	1767	1772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663805
24	NC_007352	AAT	2	6	1815	1820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663805
25	NC_007352	TTA	2	6	1868	1873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663805
26	NC_007352	ATT	2	6	2014	2019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663805
27	NC_007352	CTT	3	9	2028	2036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663805
28	NC_007352	ATC	2	6	2053	2058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663805
29	NC_007352	TAC	2	6	2089	2094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663805
30	NC_007352	ATT	2	6	2167	2172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663805
31	NC_007352	AAT	2	6	2894	2899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663806
32	NC_007352	TAG	2	6	2968	2973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663806
33	NC_007352	TAA	2	6	3055	3060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663806
34	NC_007352	CAA	2	6	3113	3118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663806
35	NC_007352	TAA	2	6	3139	3144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663806
36	NC_007352	CAT	2	6	3212	3217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663806
37	NC_007352	AAT	2	6	3281	3286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663806
38	NC_007352	CAA	2	6	3321	3326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663806
39	NC_007352	ATC	2	6	3351	3356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663806
40	NC_007352	TAA	2	6	3370	3375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663806
41	NC_007352	GAA	2	6	3401	3406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663806
42	NC_007352	CAA	2	6	3413	3418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663806
43	NC_007352	TAT	2	6	3460	3465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663806
44	NC_007352	GAA	2	6	3487	3492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663806
45	NC_007352	TAA	2	6	3499	3504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663806
46	NC_007352	TAT	2	6	3518	3523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663806
47	NC_007352	AGA	2	6	3529	3534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663806
48	NC_007352	TGC	2	6	3579	3584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73663806
49	NC_007352	GAA	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663806
50	NC_007352	CGT	2	6	3674	3679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73663806
51	NC_007352	ACA	2	6	3691	3696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663806
52	NC_007352	AAT	2	6	3711	3716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663806
53	NC_007352	TGA	2	6	3932	3937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663807
54	NC_007352	ACA	2	6	3945	3950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663807
55	NC_007352	GAA	3	9	3954	3962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663807
56	NC_007352	ATT	2	6	4006	4011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663807
57	NC_007352	TCA	2	6	5005	5010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663808
58	NC_007352	GGT	2	6	5090	5095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73663808
59	NC_007352	TGT	2	6	5317	5322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663808
60	NC_007352	TAA	2	6	5347	5352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663808
61	NC_007352	ATT	2	6	5356	5361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663808
62	NC_007352	CAT	2	6	5561	5566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663808
63	NC_007352	GAA	2	6	5567	5572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663808
64	NC_007352	AAG	2	6	5575	5580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663808
65	NC_007352	GAA	2	6	5642	5647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663808
66	NC_007352	GAT	2	6	5949	5954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663809
67	NC_007352	GAA	2	6	5982	5987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663809
68	NC_007352	TCT	2	6	5994	5999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663809
69	NC_007352	GGT	2	6	6003	6008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73663809
70	NC_007352	ATA	2	6	6091	6096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663809
71	NC_007352	TTG	2	6	6118	6123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663809
72	NC_007352	TAA	2	6	6134	6139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663809
73	NC_007352	ATT	2	6	6175	6180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663809
74	NC_007352	GTT	2	6	6291	6296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663809
75	NC_007352	ATA	2	6	6298	6303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663809
76	NC_007352	AGA	2	6	6960	6965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663810
77	NC_007352	GTG	2	6	7004	7009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73663810
78	NC_007352	CTA	2	6	7016	7021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663810
79	NC_007352	GTT	2	6	7024	7029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663810
80	NC_007352	ATG	2	6	7113	7118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663811
81	NC_007352	GAT	2	6	7264	7269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663811
82	NC_007352	TCA	2	6	7545	7550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663811
83	NC_007352	TAA	2	6	7563	7568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663811
84	NC_007352	TTC	2	6	7584	7589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663811
85	NC_007352	ATG	2	6	7643	7648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663811
86	NC_007352	TAG	2	6	7713	7718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663811
87	NC_007352	CTA	2	6	9125	9130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663812
88	NC_007352	GTG	2	6	9181	9186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73663812
89	NC_007352	TCA	2	6	9194	9199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663812
90	NC_007352	GAA	2	6	9254	9259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663812
91	NC_007352	TTA	2	6	9275	9280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663812
92	NC_007352	TGA	2	6	9293	9298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663812
93	NC_007352	CAT	2	6	9725	9730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663812
94	NC_007352	CTT	2	6	9802	9807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663813
95	NC_007352	GTT	2	6	9822	9827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663813
96	NC_007352	TAG	2	6	9885	9890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663813
97	NC_007352	TAT	2	6	9891	9896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663813
98	NC_007352	ATA	2	6	10223	10228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663814
99	NC_007352	TTC	2	6	10259	10264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663814
100	NC_007352	CAG	2	6	10275	10280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73663814
101	NC_007352	AAT	2	6	10348	10353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663814
102	NC_007352	TAA	2	6	10443	10448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663814
103	NC_007352	ACA	2	6	10646	10651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663814
104	NC_007352	ATT	2	6	10771	10776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663814
105	NC_007352	AAT	2	6	10884	10889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663814
106	NC_007352	TAC	2	6	11442	11447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663815
107	NC_007352	TCA	2	6	11519	11524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663815
108	NC_007352	TAT	2	6	11571	11576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663815
109	NC_007352	ATT	2	6	11627	11632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663815
110	NC_007352	TCA	2	6	11684	11689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663815
111	NC_007352	AGC	2	6	11818	11823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73663815
112	NC_007352	GTT	2	6	11835	11840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	73663815
113	NC_007352	TCT	2	6	11900	11905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	73663815
114	NC_007352	CTA	2	6	11964	11969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663816
115	NC_007352	GTG	2	6	12020	12025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	73663816
116	NC_007352	TCA	2	6	12033	12038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663816
117	NC_007352	GAA	2	6	12093	12098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	73663816
118	NC_007352	TTA	2	6	12114	12119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663816
119	NC_007352	TGA	2	6	12132	12137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663816
120	NC_007352	CAT	2	6	12564	12569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663816
121	NC_007352	AAT	2	6	12680	12685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663817
122	NC_007352	TAC	2	6	13675	13680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663818
123	NC_007352	AGT	2	6	13746	13751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663818
124	NC_007352	GCT	2	6	13938	13943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	73663818
125	NC_007352	TCA	2	6	14085	14090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663819
126	NC_007352	TAG	2	6	14118	14123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663819
127	NC_007352	ATT	2	6	14189	14194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	73663819
128	NC_007352	ATC	2	6	14281	14286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663819
129	NC_007352	GCA	2	6	14363	14368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	73663819
130	NC_007352	CAT	2	6	14379	14384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	73663819
131	NC_007352	TGA	2	6	14564	14569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	73663819
132	NC_007352	AAT	2	6	14650	14655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	73663819
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.