MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305 plasmid pSSP2

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007352	TC	3	6	25	30	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007352	AT	3	6	109	114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007352	TA	3	6	382	387	50 %	50 %	0 %	0 %	73663803
4	NC_007352	AT	3	6	432	437	50 %	50 %	0 %	0 %	73663803
5	NC_007352	TA	3	6	911	916	50 %	50 %	0 %	0 %	73663804
6	NC_007352	TG	3	6	928	933	0 %	50 %	50 %	0 %	73663804
7	NC_007352	TA	3	6	1035	1040	50 %	50 %	0 %	0 %	73663804
8	NC_007352	TA	3	6	1448	1453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007352	CT	3	6	1610	1615	0 %	50 %	0 %	50 %	73663805
10	NC_007352	TA	4	8	1956	1963	50 %	50 %	0 %	0 %	73663805
11	NC_007352	TA	3	6	1974	1979	50 %	50 %	0 %	0 %	73663805
12	NC_007352	TA	3	6	2272	2277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007352	TA	3	6	2327	2332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007352	TA	3	6	2349	2354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007352	TA	3	6	2416	2421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007352	TA	3	6	2507	2512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007352	AT	4	8	2549	2556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007352	TA	3	6	2621	2626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007352	TA	3	6	2643	2648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007352	AT	3	6	2919	2924	50 %	50 %	0 %	0 %	73663806
21	NC_007352	TA	3	6	3063	3068	50 %	50 %	0 %	0 %	73663806
22	NC_007352	TA	3	6	3266	3271	50 %	50 %	0 %	0 %	73663806
23	NC_007352	AT	3	6	4345	4350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007352	TA	3	6	4382	4387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007352	TA	3	6	5489	5494	50 %	50 %	0 %	0 %	73663808
26	NC_007352	AT	3	6	5517	5522	50 %	50 %	0 %	0 %	73663808
27	NC_007352	AG	3	6	6357	6362	50 %	0 %	50 %	0 %	73663809
28	NC_007352	TA	3	6	6523	6528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007352	TA	3	6	6665	6670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007352	TA	3	6	6679	6684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007352	TA	3	6	7174	7179	50 %	50 %	0 %	0 %	73663811
32	NC_007352	AT	3	6	7188	7193	50 %	50 %	0 %	0 %	73663811
33	NC_007352	AT	3	6	7681	7686	50 %	50 %	0 %	0 %	73663811
34	NC_007352	CT	3	6	8242	8247	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_007352	AG	3	6	8922	8927	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007352	AT	3	6	9157	9162	50 %	50 %	0 %	0 %	73663812
37	NC_007352	TA	3	6	9664	9669	50 %	50 %	0 %	0 %	73663812
38	NC_007352	TC	3	6	9809	9814	0 %	50 %	0 %	50 %	73663813
39	NC_007352	TA	3	6	10055	10060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007352	TA	3	6	10181	10186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007352	CT	3	6	11671	11676	0 %	50 %	0 %	50 %	73663815
42	NC_007352	AT	3	6	11996	12001	50 %	50 %	0 %	0 %	73663816
43	NC_007352	TA	3	6	12503	12508	50 %	50 %	0 %	0 %	73663816
44	NC_007352	TA	4	8	12650	12657	50 %	50 %	0 %	0 %	73663817
45	NC_007352	TC	3	6	12910	12915	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_007352	TA	3	6	13126	13131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007352	TA	3	6	13228	13233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007352	AT	3	6	13393	13398	50 %	50 %	0 %	0 %	73663818
49	NC_007352	TA	3	6	13577	13582	50 %	50 %	0 %	0 %	73663818
50	NC_007352	TA	3	6	13832	13837	50 %	50 %	0 %	0 %	73663818
51	NC_007352	AC	3	6	15066	15071	50 %	0 %	0 %	50 %	73663819
52	NC_007352	AC	3	6	16671	16676	50 %	0 %	0 %	50 %	73663820
53	NC_007352	TA	3	6	17000	17005	50 %	50 %	0 %	0 %	73663821
54	NC_007352	TC	3	6	17529	17534	0 %	50 %	0 %	50 %	73663821
55	NC_007352	CA	3	6	18397	18402	50 %	0 %	0 %	50 %	73663823
56	NC_007352	TA	3	6	18524	18529	50 %	50 %	0 %	0 %	73663823
57	NC_007352	AT	3	6	18963	18968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007352	AT	3	6	19120	19125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007352	TA	3	6	19279	19284	50 %	50 %	0 %	0 %	73663824
60	NC_007352	AT	3	6	21590	21595	50 %	50 %	0 %	0 %	73663824
61	NC_007352	TA	3	6	21715	21720	50 %	50 %	0 %	0 %	73663824

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.