MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305 plasmid pSSP1

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007351	CTATTA	2	12	3055	3066	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	73663759
2	NC_007351	GCTTTA	2	12	7209	7220	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	73663761
3	NC_007351	TATTTT	2	12	7987	7998	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	73663761
4	NC_007351	TTCTTG	2	12	10501	10512	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	73663766
5	NC_007351	TATTTC	2	12	12455	12466	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	73663769
6	NC_007351	CCCATA	2	12	13940	13951	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	73663771
7	NC_007351	GATAAA	2	12	14620	14631	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	73663771
8	NC_007351	GAAAAA	2	12	15109	15120	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	73663772
9	NC_007351	CTAAAT	2	12	15625	15636	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	73663773
10	NC_007351	ATCAAT	2	12	15827	15838	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	73663773
11	NC_007351	TGTTCT	2	12	20090	20101	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	73663778
12	NC_007351	ATCTTT	2	12	21347	21358	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	73663780
13	NC_007351	TTTTGT	2	12	24428	24439	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	73663782
14	NC_007351	TTAAAC	2	12	26336	26347	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	73663784
15	NC_007351	TATTTC	2	12	27061	27072	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	73663786
16	NC_007351	TGCACC	2	12	28514	28525	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	73663788
17	NC_007351	TTAAAC	2	12	33674	33685	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	73663794
18	NC_007351	GAACTT	2	12	34195	34206	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	73663795
19	NC_007351	AGTTAA	2	12	34484	34495	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	73663795
20	NC_007351	ATAAAA	2	12	36366	36377	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	73663799
21	NC_007351	AAACCA	2	12	36412	36423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	73663799
22	NC_007351	TTAAAC	2	12	38108	38119	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	73663801

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.