MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305 plasmid pSSP1

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007351	AACAA	2	10	863	872	80 %	0 %	0 %	20 %	73663758
2	NC_007351	ATAAG	2	10	1124	1133	60 %	20 %	20 %	0 %	73663758
3	NC_007351	GTATT	2	10	2228	2237	20 %	60 %	20 %	0 %	73663759
4	NC_007351	ACATC	2	10	2525	2534	40 %	20 %	0 %	40 %	73663759
5	NC_007351	TTACA	2	10	6496	6505	40 %	40 %	0 %	20 %	73663760
6	NC_007351	TTGTC	2	10	9428	9437	0 %	60 %	20 %	20 %	73663764
7	NC_007351	TAACT	2	10	9503	9512	40 %	40 %	0 %	20 %	73663764
8	NC_007351	CATTT	2	10	9527	9536	20 %	60 %	0 %	20 %	73663764
9	NC_007351	GCGTT	2	10	9944	9953	0 %	40 %	40 %	20 %	73663765
10	NC_007351	AATAA	2	10	10490	10499	80 %	20 %	0 %	0 %	73663766
11	NC_007351	GTTCT	2	10	11535	11544	0 %	60 %	20 %	20 %	73663767
12	NC_007351	CATTC	2	10	13510	13519	20 %	40 %	0 %	40 %	73663770
13	NC_007351	AATTA	2	10	15057	15066	60 %	40 %	0 %	0 %	73663772
14	NC_007351	AATTA	2	10	16022	16031	60 %	40 %	0 %	0 %	73663773
15	NC_007351	ACTTA	2	10	24667	24676	40 %	40 %	0 %	20 %	73663782
16	NC_007351	ATTTA	2	10	27043	27052	40 %	60 %	0 %	0 %	73663785
17	NC_007351	CATTT	2	10	29574	29583	20 %	60 %	0 %	20 %	73663790
18	NC_007351	TTGAT	2	10	30229	30238	20 %	60 %	20 %	0 %	73663791
19	NC_007351	TAATA	2	10	34264	34273	60 %	40 %	0 %	0 %	73663795
20	NC_007351	AGAAA	2	10	36159	36168	80 %	0 %	20 %	0 %	73663799

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.