MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305 plasmid pSSP1

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007351	AAAT	2	8	1673	1680	75 %	25 %	0 %	0 %	73663759
2	NC_007351	TGCT	2	8	1934	1941	0 %	50 %	25 %	25 %	73663759
3	NC_007351	CTTT	2	8	2158	2165	0 %	75 %	0 %	25 %	73663759
4	NC_007351	TTAA	2	8	2695	2702	50 %	50 %	0 %	0 %	73663759
5	NC_007351	ACTT	2	8	2810	2817	25 %	50 %	0 %	25 %	73663759
6	NC_007351	TTGT	2	8	2940	2947	0 %	75 %	25 %	0 %	73663759
7	NC_007351	TTCA	2	8	3243	3250	25 %	50 %	0 %	25 %	73663759
8	NC_007351	GCTC	2	8	3397	3404	0 %	25 %	25 %	50 %	73663759
9	NC_007351	TTTA	2	8	3606	3613	25 %	75 %	0 %	0 %	73663759
10	NC_007351	TGCT	2	8	3789	3796	0 %	50 %	25 %	25 %	73663759
11	NC_007351	GAAG	2	8	4084	4091	50 %	0 %	50 %	0 %	73663759
12	NC_007351	AAAC	2	8	4862	4869	75 %	0 %	0 %	25 %	73663760
13	NC_007351	AAAT	2	8	4941	4948	75 %	25 %	0 %	0 %	73663760
14	NC_007351	CAAA	2	8	5097	5104	75 %	0 %	0 %	25 %	73663760
15	NC_007351	ATTT	2	8	5763	5770	25 %	75 %	0 %	0 %	73663760
16	NC_007351	AGAA	2	8	6280	6287	75 %	0 %	25 %	0 %	73663760
17	NC_007351	ATTT	2	8	6703	6710	25 %	75 %	0 %	0 %	73663761
18	NC_007351	CAAA	2	8	7063	7070	75 %	0 %	0 %	25 %	73663761
19	NC_007351	TAGC	2	8	7237	7244	25 %	25 %	25 %	25 %	73663761
20	NC_007351	TCAT	2	8	8007	8014	25 %	50 %	0 %	25 %	73663761
21	NC_007351	TAAT	2	8	8912	8919	50 %	50 %	0 %	0 %	73663763
22	NC_007351	CATA	2	8	9463	9470	50 %	25 %	0 %	25 %	73663764
23	NC_007351	CCAT	2	8	9643	9650	25 %	25 %	0 %	50 %	73663765
24	NC_007351	TTTC	2	8	9757	9764	0 %	75 %	0 %	25 %	73663765
25	NC_007351	ATTA	2	8	10011	10018	50 %	50 %	0 %	0 %	73663765
26	NC_007351	TTAA	2	8	10190	10197	50 %	50 %	0 %	0 %	73663766
27	NC_007351	AAAG	2	8	10876	10883	75 %	0 %	25 %	0 %	73663766
28	NC_007351	TAAA	2	8	10926	10933	75 %	25 %	0 %	0 %	73663766
29	NC_007351	TCTG	2	8	11162	11169	0 %	50 %	25 %	25 %	73663767
30	NC_007351	AATT	2	8	11446	11453	50 %	50 %	0 %	0 %	73663767
31	NC_007351	CACT	2	8	11559	11566	25 %	25 %	0 %	50 %	73663767
32	NC_007351	AAAT	2	8	11941	11948	75 %	25 %	0 %	0 %	73663768
33	NC_007351	TGTT	2	8	13980	13987	0 %	75 %	25 %	0 %	73663771
34	NC_007351	ATAC	2	8	14044	14051	50 %	25 %	0 %	25 %	73663771
35	NC_007351	AGTC	2	8	14979	14986	25 %	25 %	25 %	25 %	73663772
36	NC_007351	AAAT	2	8	15638	15645	75 %	25 %	0 %	0 %	73663773
37	NC_007351	AATT	2	8	16193	16200	50 %	50 %	0 %	0 %	73663773
38	NC_007351	TGAT	2	8	17023	17030	25 %	50 %	25 %	0 %	73663774
39	NC_007351	TAAA	2	8	17613	17620	75 %	25 %	0 %	0 %	73663774
40	NC_007351	TACT	2	8	18456	18463	25 %	50 %	0 %	25 %	73663774
41	NC_007351	CTTT	2	8	18471	18478	0 %	75 %	0 %	25 %	73663774
42	NC_007351	ATTT	2	8	18588	18595	25 %	75 %	0 %	0 %	73663774
43	NC_007351	CATC	2	8	18609	18616	25 %	25 %	0 %	50 %	73663774
44	NC_007351	ATTC	2	8	18787	18794	25 %	50 %	0 %	25 %	73663775
45	NC_007351	ACAA	2	8	19400	19407	75 %	0 %	0 %	25 %	73663776
46	NC_007351	ATGA	2	8	19505	19512	50 %	25 %	25 %	0 %	73663777
47	NC_007351	AAGC	2	8	20375	20382	50 %	0 %	25 %	25 %	73663778
48	NC_007351	ATTT	2	8	20452	20459	25 %	75 %	0 %	0 %	73663778
49	NC_007351	ATTA	2	8	20629	20636	50 %	50 %	0 %	0 %	73663778
50	NC_007351	AATT	2	8	21275	21282	50 %	50 %	0 %	0 %	73663780
51	NC_007351	TTCT	2	8	21385	21392	0 %	75 %	0 %	25 %	73663780
52	NC_007351	AAAG	2	8	21558	21565	75 %	0 %	25 %	0 %	73663780
53	NC_007351	ATGA	2	8	21867	21874	50 %	25 %	25 %	0 %	73663780
54	NC_007351	ATTG	2	8	23251	23258	25 %	50 %	25 %	0 %	73663781
55	NC_007351	ATGA	2	8	23810	23817	50 %	25 %	25 %	0 %	73663781
56	NC_007351	ATGA	2	8	23819	23826	50 %	25 %	25 %	0 %	73663781
57	NC_007351	CGTT	2	8	24020	24027	0 %	50 %	25 %	25 %	73663781
58	NC_007351	ATCA	2	8	24555	24562	50 %	25 %	0 %	25 %	73663782
59	NC_007351	AAAG	2	8	24866	24873	75 %	0 %	25 %	0 %	73663782
60	NC_007351	CTTT	2	8	24981	24988	0 %	75 %	0 %	25 %	73663783
61	NC_007351	TACG	2	8	25057	25064	25 %	25 %	25 %	25 %	73663783
62	NC_007351	TCAT	2	8	25167	25174	25 %	50 %	0 %	25 %	73663783
63	NC_007351	ACAT	2	8	26181	26188	50 %	25 %	0 %	25 %	73663784
64	NC_007351	ACCA	2	8	26896	26903	50 %	0 %	0 %	50 %	73663785
65	NC_007351	AATG	2	8	27446	27453	50 %	25 %	25 %	0 %	73663787
66	NC_007351	CAAG	2	8	27525	27532	50 %	0 %	25 %	25 %	73663787
67	NC_007351	CATC	2	8	27925	27932	25 %	25 %	0 %	50 %	73663788
68	NC_007351	ATTA	2	8	28208	28215	50 %	50 %	0 %	0 %	73663788
69	NC_007351	TATT	2	8	28336	28343	25 %	75 %	0 %	0 %	73663788
70	NC_007351	TTAA	2	8	29457	29464	50 %	50 %	0 %	0 %	73663790
71	NC_007351	TCTA	2	8	30171	30178	25 %	50 %	0 %	25 %	73663791
72	NC_007351	ATGC	2	8	30566	30573	25 %	25 %	25 %	25 %	73663791
73	NC_007351	TCTA	2	8	30588	30595	25 %	50 %	0 %	25 %	73663791
74	NC_007351	GACT	2	8	30616	30623	25 %	25 %	25 %	25 %	73663791
75	NC_007351	CTTC	2	8	30696	30703	0 %	50 %	0 %	50 %	73663792
76	NC_007351	TTTC	2	8	30717	30724	0 %	75 %	0 %	25 %	73663792
77	NC_007351	TAGC	2	8	31757	31764	25 %	25 %	25 %	25 %	73663793
78	NC_007351	TGTA	2	8	31980	31987	25 %	50 %	25 %	0 %	73663793
79	NC_007351	ATTT	2	8	32559	32566	25 %	75 %	0 %	0 %	73663793
80	NC_007351	TTCA	2	8	33054	33061	25 %	50 %	0 %	25 %	73663793
81	NC_007351	ACAT	2	8	33519	33526	50 %	25 %	0 %	25 %	73663794
82	NC_007351	AAGA	2	8	33753	33760	75 %	0 %	25 %	0 %	73663794
83	NC_007351	GATA	2	8	33970	33977	50 %	25 %	25 %	0 %	73663795
84	NC_007351	ATTT	2	8	34294	34301	25 %	75 %	0 %	0 %	73663795
85	NC_007351	TATG	2	8	34844	34851	25 %	50 %	25 %	0 %	73663796
86	NC_007351	AAAT	2	8	36185	36192	75 %	25 %	0 %	0 %	73663799
87	NC_007351	ACAT	2	8	37953	37960	50 %	25 %	0 %	25 %	73663801
88	NC_007351	AAGA	2	8	38187	38194	75 %	0 %	25 %	0 %	73663801

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.