MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Ralstonia eutropha JMP134 chromosome 2

Total Repeats: 2296

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007348	CGCGC	2	10	4	13	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2	NC_007348	AAGGC	2	10	914	923	40 %	0 %	40 %	20 %	73537299
3	NC_007348	GTGGC	2	10	3614	3623	0 %	20 %	60 %	20 %	73537300
4	NC_007348	CAAGC	2	10	4055	4064	40 %	0 %	20 %	40 %	73537301
5	NC_007348	GACAG	2	10	4767	4776	40 %	0 %	40 %	20 %	73537302
6	NC_007348	GGGCA	2	10	6153	6162	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_007348	CGGTT	2	10	7977	7986	0 %	40 %	40 %	20 %	73537304
8	NC_007348	TCGCC	2	10	9292	9301	0 %	20 %	20 %	60 %	73537306
9	NC_007348	ACGGC	2	10	10503	10512	20 %	0 %	40 %	40 %	73537307
10	NC_007348	GCGGG	2	10	12026	12035	0 %	0 %	80 %	20 %	73537308
11	NC_007348	ACGCG	2	10	14444	14453	20 %	0 %	40 %	40 %	73537312
12	NC_007348	CAACG	2	10	15209	15218	40 %	0 %	20 %	40 %	73537313
13	NC_007348	ATGGA	2	10	16646	16655	40 %	20 %	40 %	0 %	73537314
14	NC_007348	CTTGC	2	10	16916	16925	0 %	40 %	20 %	40 %	73537315
15	NC_007348	AGCGC	2	10	20513	20522	20 %	0 %	40 %	40 %	73537317
16	NC_007348	GCTGC	2	10	20541	20550	0 %	20 %	40 %	40 %	73537317
17	NC_007348	GGCCG	2	10	21181	21190	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18	NC_007348	GCCGG	2	10	21566	21575	0 %	0 %	60 %	40 %	73537318
19	NC_007348	CGTGC	2	10	21805	21814	0 %	20 %	40 %	40 %	73537318
20	NC_007348	GCAGC	2	10	23508	23517	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_007348	TGCCG	2	10	26513	26522	0 %	20 %	40 %	40 %	73537324
22	NC_007348	GCGCT	2	10	27444	27453	0 %	20 %	40 %	40 %	73537325
23	NC_007348	TGCCG	2	10	29820	29829	0 %	20 %	40 %	40 %	73537328
24	NC_007348	GCCGC	2	10	31428	31437	0 %	0 %	40 %	60 %	73537329
25	NC_007348	CCGCA	2	10	33049	33058	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_007348	GCCGA	2	10	33156	33165	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_007348	ATTCG	2	10	33949	33958	20 %	40 %	20 %	20 %	73537331
28	NC_007348	CCGTA	2	10	34909	34918	20 %	20 %	20 %	40 %	73537332
29	NC_007348	GGCCA	2	10	35081	35090	20 %	0 %	40 %	40 %	73537332
30	NC_007348	CGCTT	2	10	35310	35319	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_007348	CAACT	2	10	35446	35455	40 %	20 %	0 %	40 %	73537333
32	NC_007348	CGGGA	2	10	36229	36238	20 %	0 %	60 %	20 %	73537334
33	NC_007348	TGCCG	2	10	40593	40602	0 %	20 %	40 %	40 %	73537337
34	NC_007348	CGGCG	2	10	41632	41641	0 %	0 %	60 %	40 %	73537338
35	NC_007348	AACCT	2	10	44099	44108	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_007348	TCGTC	2	10	45272	45281	0 %	40 %	20 %	40 %	73537341
37	NC_007348	CGGCT	2	10	45439	45448	0 %	20 %	40 %	40 %	73537341
38	NC_007348	GCGCA	2	10	45684	45693	20 %	0 %	40 %	40 %	73537341
39	NC_007348	GCGCG	2	10	50028	50037	0 %	0 %	60 %	40 %	73537344
40	NC_007348	TGGCC	2	10	50516	50525	0 %	20 %	40 %	40 %	73537345
41	NC_007348	GCCGC	2	10	50793	50802	0 %	0 %	40 %	60 %	73537345
42	NC_007348	CGGCG	2	10	54353	54362	0 %	0 %	60 %	40 %	73537348
43	NC_007348	TGGCG	2	10	54841	54850	0 %	20 %	60 %	20 %	73537349
44	NC_007348	CGCGG	2	10	55515	55524	0 %	0 %	60 %	40 %	73537349
45	NC_007348	TGCGA	2	10	55883	55892	20 %	20 %	40 %	20 %	73537349
46	NC_007348	CGGCG	2	10	55972	55981	0 %	0 %	60 %	40 %	73537349
47	NC_007348	CGGCG	2	10	57347	57356	0 %	0 %	60 %	40 %	73537350
48	NC_007348	GGCGC	2	10	57949	57958	0 %	0 %	60 %	40 %	73537352
49	NC_007348	GCGCA	2	10	58868	58877	20 %	0 %	40 %	40 %	73537352
50	NC_007348	GATGC	2	10	58913	58922	20 %	20 %	40 %	20 %	73537352
51	NC_007348	CCCAT	2	10	62084	62093	20 %	20 %	0 %	60 %	73537356
52	NC_007348	AGCCG	2	10	62702	62711	20 %	0 %	40 %	40 %	73537356
53	NC_007348	CGCAG	2	10	65358	65367	20 %	0 %	40 %	40 %	73537359
54	NC_007348	GTGCG	2	10	66999	67008	0 %	20 %	60 %	20 %	73537360
55	NC_007348	CGGGT	2	10	67105	67114	0 %	20 %	60 %	20 %	73537360
56	NC_007348	GTCCA	2	10	67195	67204	20 %	20 %	20 %	40 %	73537360
57	NC_007348	TGCGC	2	10	69218	69227	0 %	20 %	40 %	40 %	73537360
58	NC_007348	TGCGC	2	10	70780	70789	0 %	20 %	40 %	40 %	73537361
59	NC_007348	GCGAC	2	10	72079	72088	20 %	0 %	40 %	40 %	161611273
60	NC_007348	GCAAT	2	10	73889	73898	40 %	20 %	20 %	20 %	161611273
61	NC_007348	GCCAT	2	10	74037	74046	20 %	20 %	20 %	40 %	161611273
62	NC_007348	GGGCA	2	10	75975	75984	20 %	0 %	60 %	20 %	73537364
63	NC_007348	CGGCG	2	10	76987	76996	0 %	0 %	60 %	40 %	73537365
64	NC_007348	CGCAG	2	10	78744	78753	20 %	0 %	40 %	40 %	73537367
65	NC_007348	GCGAG	2	10	82216	82225	20 %	0 %	60 %	20 %	73537370
66	NC_007348	GCGCG	2	10	82370	82379	0 %	0 %	60 %	40 %	73537370
67	NC_007348	CGGTC	2	10	84647	84656	0 %	20 %	40 %	40 %	73537372
68	NC_007348	TCGGC	2	10	84991	85000	0 %	20 %	40 %	40 %	73537372
69	NC_007348	TGACC	2	10	85265	85274	20 %	20 %	20 %	40 %	73537372
70	NC_007348	TGCTT	2	10	85570	85579	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_007348	GCTGC	2	10	85924	85933	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
72	NC_007348	CGCGC	2	10	87100	87109	0 %	0 %	40 %	60 %	73537374
73	NC_007348	CGGGT	2	10	89173	89182	0 %	20 %	60 %	20 %	73537375
74	NC_007348	GTTCT	2	10	91532	91541	0 %	60 %	20 %	20 %	73537377
75	NC_007348	ATGGC	2	10	92154	92163	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_007348	GCCGC	2	10	94589	94598	0 %	0 %	40 %	60 %	73537380
77	NC_007348	GGCCG	2	10	95173	95182	0 %	0 %	60 %	40 %	73537381
78	NC_007348	GGCCA	2	10	95810	95819	20 %	0 %	40 %	40 %	73537381
79	NC_007348	AGCCG	2	10	96526	96535	20 %	0 %	40 %	40 %	73537382
80	NC_007348	CGGCG	2	10	97514	97523	0 %	0 %	60 %	40 %	73537382
81	NC_007348	GGTCG	2	10	97670	97679	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
82	NC_007348	CGAGC	2	10	101453	101462	20 %	0 %	40 %	40 %	73537385
83	NC_007348	ACGCG	2	10	101660	101669	20 %	0 %	40 %	40 %	73537385
84	NC_007348	CAGCG	2	10	101946	101955	20 %	0 %	40 %	40 %	73537386
85	NC_007348	ACGCA	2	10	103702	103711	40 %	0 %	20 %	40 %	73537387
86	NC_007348	TCCGC	2	10	104758	104767	0 %	20 %	20 %	60 %	73537388
87	NC_007348	GAAGC	2	10	105647	105656	40 %	0 %	40 %	20 %	73537388
88	NC_007348	GTTTC	2	10	109229	109238	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_007348	CCGCG	2	10	109282	109291	0 %	0 %	40 %	60 %	73537391
90	NC_007348	TCGGC	2	10	109807	109816	0 %	20 %	40 %	40 %	73537391
91	NC_007348	CGCGC	2	10	110580	110589	0 %	0 %	40 %	60 %	73537392
92	NC_007348	GCACG	2	10	110970	110979	20 %	0 %	40 %	40 %	73537392
93	NC_007348	CGGAT	2	10	112318	112327	20 %	20 %	40 %	20 %	73537393
94	NC_007348	GCCGT	2	10	112517	112526	0 %	20 %	40 %	40 %	73537394
95	NC_007348	GGCCT	2	10	112890	112899	0 %	20 %	40 %	40 %	73537394
96	NC_007348	GCGCG	2	10	114482	114491	0 %	0 %	60 %	40 %	73537396
97	NC_007348	CGCGG	2	10	115099	115108	0 %	0 %	60 %	40 %	73537396
98	NC_007348	CGGCC	2	10	117557	117566	0 %	0 %	40 %	60 %	73537398
99	NC_007348	AGCGC	2	10	118103	118112	20 %	0 %	40 %	40 %	73537398
100	NC_007348	TGCGG	2	10	118299	118308	0 %	20 %	60 %	20 %	73537398
101	NC_007348	CGGCC	2	10	119027	119036	0 %	0 %	40 %	60 %	73537398
102	NC_007348	CGGCC	2	10	120215	120224	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
103	NC_007348	GGCCG	2	10	120226	120235	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
104	NC_007348	TCCGC	2	10	121375	121384	0 %	20 %	20 %	60 %	73537400
105	NC_007348	GGCGC	2	10	122726	122735	0 %	0 %	60 %	40 %	73537401
106	NC_007348	GCGCC	2	10	127137	127146	0 %	0 %	40 %	60 %	73537405
107	NC_007348	GGCCT	2	10	127280	127289	0 %	20 %	40 %	40 %	73537406
108	NC_007348	CGCCA	2	10	130930	130939	20 %	0 %	20 %	60 %	73537410
109	NC_007348	CGACC	2	10	131283	131292	20 %	0 %	20 %	60 %	73537410
110	NC_007348	ACGCG	2	10	132917	132926	20 %	0 %	40 %	40 %	73537412
111	NC_007348	GAAGG	2	10	134238	134247	40 %	0 %	60 %	0 %	73537412
112	NC_007348	GCGCG	2	10	135374	135383	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
113	NC_007348	AGACA	2	10	136504	136513	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_007348	GGATG	2	10	138583	138592	20 %	20 %	60 %	0 %	73537416
115	NC_007348	CGCGC	2	10	141766	141775	0 %	0 %	40 %	60 %	73537419
116	NC_007348	AGGAC	2	10	141944	141953	40 %	0 %	40 %	20 %	73537419
117	NC_007348	TGAAC	2	10	142738	142747	40 %	20 %	20 %	20 %	73537420
118	NC_007348	TCCCT	2	10	143809	143818	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
119	NC_007348	CGGCG	2	10	145855	145864	0 %	0 %	60 %	40 %	73537423
120	NC_007348	ATTTC	2	10	147085	147094	20 %	60 %	0 %	20 %	73537424
121	NC_007348	GCGCA	2	10	148351	148360	20 %	0 %	40 %	40 %	73537425
122	NC_007348	TGCCG	2	10	149747	149756	0 %	20 %	40 %	40 %	73537426
123	NC_007348	CCGAC	2	10	151510	151519	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
124	NC_007348	CCGGC	2	10	151762	151771	0 %	0 %	40 %	60 %	73537428
125	NC_007348	CCGCA	2	10	152820	152829	20 %	0 %	20 %	60 %	73537429
126	NC_007348	CGCGT	2	10	152937	152946	0 %	20 %	40 %	40 %	73537429
127	NC_007348	CGGCG	2	10	153870	153879	0 %	0 %	60 %	40 %	73537429
128	NC_007348	GAAGC	2	10	154176	154185	40 %	0 %	40 %	20 %	73537429
129	NC_007348	CGGCG	2	10	154748	154757	0 %	0 %	60 %	40 %	73537429
130	NC_007348	TGCGC	2	10	155043	155052	0 %	20 %	40 %	40 %	73537430
131	NC_007348	CCCAA	2	10	156109	156118	40 %	0 %	0 %	60 %	73537431
132	NC_007348	CGGTC	2	10	156865	156874	0 %	20 %	40 %	40 %	73537432
133	NC_007348	ACCGC	2	10	157109	157118	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
134	NC_007348	GGCGC	2	10	157295	157304	0 %	0 %	60 %	40 %	73537433
135	NC_007348	CCTCG	2	10	157433	157442	0 %	20 %	20 %	60 %	73537433
136	NC_007348	GCGCC	2	10	157560	157569	0 %	0 %	40 %	60 %	73537433
137	NC_007348	GGTTG	2	10	159936	159945	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007348	GCCGA	2	10	164141	164150	20 %	0 %	40 %	40 %	73537439
139	NC_007348	CCTGG	2	10	164587	164596	0 %	20 %	40 %	40 %	73537439
140	NC_007348	CGCGG	2	10	167157	167166	0 %	0 %	60 %	40 %	73537441
141	NC_007348	CAGGC	2	10	169766	169775	20 %	0 %	40 %	40 %	73537441
142	NC_007348	CGGCG	2	10	170927	170936	0 %	0 %	60 %	40 %	73537443
143	NC_007348	TCGGT	2	10	175451	175460	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_007348	GCGCG	2	10	175494	175503	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
145	NC_007348	CGGTC	2	10	176780	176789	0 %	20 %	40 %	40 %	73537449
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147	NC_007348	TGCGC	2	10	178787	178796	0 %	20 %	40 %	40 %	73537451
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149	NC_007348	CGGCG	2	10	179442	179451	0 %	0 %	60 %	40 %	73537451
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151	NC_007348	TCGTG	2	10	181397	181406	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
152	NC_007348	TTGGT	2	10	182118	182127	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
153	NC_007348	GGGAG	2	10	182876	182885	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
154	NC_007348	CTCAT	2	10	184876	184885	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
155	NC_007348	GCGAT	2	10	186118	186127	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
156	NC_007348	TGGCG	2	10	186864	186873	0 %	20 %	60 %	20 %	73537452
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158	NC_007348	CGGCG	2	10	190010	190019	0 %	0 %	60 %	40 %	73537455
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162	NC_007348	CCGCG	2	10	197319	197328	0 %	0 %	40 %	60 %	73537462
163	NC_007348	TTGCT	2	10	198294	198303	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
164	NC_007348	GATCG	2	10	201684	201693	20 %	20 %	40 %	20 %	73537463
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167	NC_007348	GCGCC	2	10	205341	205350	0 %	0 %	40 %	60 %	73537467
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171	NC_007348	CGTCG	2	10	209142	209151	0 %	20 %	40 %	40 %	73537472
172	NC_007348	CGGCG	2	10	209500	209509	0 %	0 %	60 %	40 %	73537472
173	NC_007348	GGCGC	2	10	210481	210490	0 %	0 %	60 %	40 %	73537473
174	NC_007348	GGCAG	2	10	211931	211940	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
175	NC_007348	CGCAA	2	10	213085	213094	40 %	0 %	20 %	40 %	73537475
176	NC_007348	GCGCC	2	10	213099	213108	0 %	0 %	40 %	60 %	73537475
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178	NC_007348	GGGCA	2	10	214942	214951	20 %	0 %	60 %	20 %	73537476
179	NC_007348	TGCGC	2	10	215107	215116	0 %	20 %	40 %	40 %	73537476
180	NC_007348	GGTGG	2	10	216897	216906	0 %	20 %	80 %	0 %	73537476
181	NC_007348	GCCGC	2	10	217638	217647	0 %	0 %	40 %	60 %	73537477
182	NC_007348	GGCAT	2	10	218762	218771	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
183	NC_007348	GCGCG	2	10	220207	220216	0 %	0 %	60 %	40 %	73537479
184	NC_007348	GCCCG	2	10	220667	220676	0 %	0 %	40 %	60 %	73537479
185	NC_007348	GCCGC	2	10	221163	221172	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
186	NC_007348	CTCCG	2	10	221319	221328	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
187	NC_007348	CGGCA	2	10	221981	221990	20 %	0 %	40 %	40 %	73537481
188	NC_007348	CGTTG	2	10	222541	222550	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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198	NC_007348	TCCGA	2	10	231861	231870	20 %	20 %	20 %	40 %	73537489
199	NC_007348	CGCAG	2	10	233063	233072	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
200	NC_007348	GGCCG	2	10	233795	233804	0 %	0 %	60 %	40 %	73537490
201	NC_007348	CGGCC	2	10	234851	234860	0 %	0 %	40 %	60 %	73537490
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214	NC_007348	GGACT	2	10	248597	248606	20 %	20 %	40 %	20 %	73537501
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219	NC_007348	GCACT	2	10	252370	252379	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
220	NC_007348	CGATC	2	10	260276	260285	20 %	20 %	20 %	40 %	73537513
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230	NC_007348	GGATC	2	10	271405	271414	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
231	NC_007348	GCGCT	2	10	272877	272886	0 %	20 %	40 %	40 %	73537523
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233	NC_007348	GCAGC	2	10	273594	273603	20 %	0 %	40 %	40 %	73537524
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248	NC_007348	GGCCG	2	10	293602	293611	0 %	0 %	60 %	40 %	73537541
249	NC_007348	CATGG	2	10	294563	294572	20 %	20 %	40 %	20 %	73537542
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251	NC_007348	TGCGC	2	10	295450	295459	0 %	20 %	40 %	40 %	73537542
252	NC_007348	CGTGC	2	10	295942	295951	0 %	20 %	40 %	40 %	73537543
253	NC_007348	GCCGC	2	10	296206	296215	0 %	0 %	40 %	60 %	73537543
254	NC_007348	GCGCG	2	10	297039	297048	0 %	0 %	60 %	40 %	73537544
255	NC_007348	GGAAC	2	10	297721	297730	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
256	NC_007348	GCTGC	2	10	298639	298648	0 %	20 %	40 %	40 %	73537545
257	NC_007348	CACAA	2	10	299983	299992	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
258	NC_007348	TACCG	2	10	304207	304216	20 %	20 %	20 %	40 %	73537550
259	NC_007348	TGCGG	2	10	304617	304626	0 %	20 %	60 %	20 %	73537550
260	NC_007348	GCCGT	2	10	306484	306493	0 %	20 %	40 %	40 %	73537552
261	NC_007348	GGATC	2	10	308175	308184	20 %	20 %	40 %	20 %	73537553
262	NC_007348	AAGCC	2	10	309320	309329	40 %	0 %	20 %	40 %	73537555
263	NC_007348	CCGAA	2	10	312344	312353	40 %	0 %	20 %	40 %	73537557
264	NC_007348	TTGCT	2	10	313079	313088	0 %	60 %	20 %	20 %	73537558
265	NC_007348	GGCCG	2	10	313165	313174	0 %	0 %	60 %	40 %	73537558
266	NC_007348	TGCCG	2	10	313771	313780	0 %	20 %	40 %	40 %	73537558
267	NC_007348	CAGCA	2	10	314249	314258	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
268	NC_007348	CGTGG	2	10	314457	314466	0 %	20 %	60 %	20 %	73537559
269	NC_007348	GTGGC	2	10	315389	315398	0 %	20 %	60 %	20 %	73537559
270	NC_007348	CTGGC	2	10	316469	316478	0 %	20 %	40 %	40 %	73537560
271	NC_007348	CTGAC	2	10	316767	316776	20 %	20 %	20 %	40 %	73537560
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