MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Ralstonia eutropha JMP134 chromosome 1

Total Repeats: 454

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007347	ACAAA	2	10	23175	23184	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_007347	ATTTG	2	10	23317	23326	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007347	TGCGC	2	10	50029	50038	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_007347	CGGCG	2	10	62274	62283	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5	NC_007347	GCGCC	2	10	72743	72752	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6	NC_007347	TCTGT	3	15	76574	76588	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_007347	TGAAT	2	10	80017	80026	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007347	GCGCA	2	10	80136	80145	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_007347	GGCAA	2	10	88039	88048	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_007347	GGGGC	2	10	100905	100914	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
11	NC_007347	CTGGC	2	10	103771	103780	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_007347	CCAGG	2	10	103788	103797	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_007347	GTCAC	2	10	111529	111538	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_007347	TCGTC	2	10	121174	121183	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_007347	TTATC	2	10	133239	133248	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_007347	ATCGA	2	10	133656	133665	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_007347	TGGAA	2	10	137800	137809	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007347	GCTTT	2	10	148696	148705	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_007347	CGCGG	2	10	153052	153061	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
20	NC_007347	CGCAG	2	10	173240	173249	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_007347	ACAAA	2	10	189492	189501	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_007347	GCACA	2	10	192322	192331	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_007347	GTCCG	2	10	201337	201346	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_007347	GGATC	2	10	225656	225665	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_007347	CTTCA	2	10	228136	228145	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_007347	GGGAA	2	10	268253	268262	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007347	GCTGC	2	10	277039	277048	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_007347	CAACC	2	10	277485	277494	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
29	NC_007347	GACCG	2	10	288673	288682	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_007347	CATTC	2	10	304997	305006	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_007347	GCCGC	2	10	314152	314161	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
32	NC_007347	TGGCG	2	10	314179	314188	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_007347	CAGGA	2	10	335099	335108	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_007347	ACCCA	2	10	337843	337852	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
35	NC_007347	GGCAG	2	10	341916	341925	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
36	NC_007347	GACAG	2	10	345891	345900	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_007347	ATCGC	2	10	349993	350002	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_007347	CGGCA	2	10	354332	354341	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_007347	GGGAT	2	10	357591	357600	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007347	GGTTG	2	10	358477	358486	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007347	CGTGG	2	10	360849	360858	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
42	NC_007347	GGCCG	2	10	360997	361006	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
43	NC_007347	ACGGT	2	10	368351	368360	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_007347	CGGGG	2	10	383323	383332	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
45	NC_007347	CCGCG	2	10	384079	384088	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
46	NC_007347	GCCGC	2	10	391947	391956	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
47	NC_007347	CAGCG	2	10	403570	403579	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_007347	CAAGG	2	10	422280	422289	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_007347	CAGTG	2	10	425879	425888	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_007347	GCCGC	2	10	426134	426143	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
51	NC_007347	GAACC	4	20	426156	426175	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_007347	GATCT	2	10	431481	431490	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_007347	CGACA	2	10	435774	435783	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_007347	ACGGG	3	15	456349	456363	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
55	NC_007347	GCTTG	2	10	462605	462614	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_007347	CCGCG	2	10	472056	472065	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
57	NC_007347	CGGCG	2	10	481233	481242	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
58	NC_007347	CCGCG	2	10	484396	484405	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
59	NC_007347	CAGGG	2	10	512285	512294	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
60	NC_007347	GCCGC	2	10	523611	523620	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
61	NC_007347	TGCCG	2	10	524436	524445	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_007347	GCAAA	2	10	568429	568438	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_007347	GAAAA	2	10	568628	568637	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007347	CAAAG	2	10	579371	579380	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_007347	GTGCA	2	10	579627	579636	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_007347	CCAAC	2	10	584988	584997	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
67	NC_007347	CAGGC	2	10	587039	587048	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_007347	GCCCC	2	10	606801	606810	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
69	NC_007347	GAAGG	2	10	608138	608147	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007347	GCGAG	2	10	636797	636806	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_007347	CGCGG	2	10	642415	642424	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
72	NC_007347	GCGGA	2	10	650421	650430	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_007347	CAACA	2	10	652844	652853	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_007347	CGCTT	2	10	653060	653069	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_007347	CGCAG	2	10	653137	653146	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_007347	GCCAT	2	10	656143	656152	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_007347	CGCAC	2	10	657480	657489	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
78	NC_007347	CAGAA	2	10	665869	665878	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_007347	GCGCC	2	10	672143	672152	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
80	NC_007347	TGCGC	2	10	674430	674439	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_007347	CTTTC	2	10	674472	674481	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_007347	GCAGG	2	10	682026	682035	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
83	NC_007347	GCTGC	2	10	684270	684279	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
84	NC_007347	TGCCT	2	10	692609	692618	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_007347	GGTCA	2	10	694885	694894	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_007347	GCGTC	2	10	700141	700150	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_007347	GGATG	2	10	701118	701127	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007347	GGCCA	2	10	702261	702270	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
89	NC_007347	GCGCG	2	10	717496	717505	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
90	NC_007347	CCATT	2	10	724923	724932	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_007347	GGCAG	2	10	728711	728720	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
92	NC_007347	GGGCG	2	10	738522	738531	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
93	NC_007347	GGCGA	2	10	756023	756032	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
94	NC_007347	GACCC	2	10	795315	795324	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
95	NC_007347	CACGG	2	10	795325	795334	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
96	NC_007347	ATTTA	2	10	796068	796077	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007347	CCCAT	2	10	819592	819601	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
98	NC_007347	CTGCA	2	10	826420	826429	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_007347	GCGCG	2	10	826435	826444	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
100	NC_007347	GGCGC	2	10	836271	836280	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
101	NC_007347	GCGCC	2	10	839603	839612	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
102	NC_007347	GCGCG	2	10	867443	867452	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
103	NC_007347	TTGCC	2	10	873882	873891	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_007347	GGCAT	2	10	874110	874119	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_007347	GCACA	2	10	886695	886704	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_007347	GAAGC	2	10	896853	896862	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_007347	CGGGG	2	10	897279	897288	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
108	NC_007347	GACGC	2	10	898325	898334	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
109	NC_007347	GCCGC	2	10	899442	899451	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
110	NC_007347	GGTGC	2	10	915602	915611	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
111	NC_007347	CAGGT	2	10	935652	935661	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_007347	CGGGG	2	10	935732	935741	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
113	NC_007347	TGGGG	2	10	935806	935815	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007347	GCTGC	2	10	936092	936101	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
115	NC_007347	CGGTG	2	10	940229	940238	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
116	NC_007347	CGGAA	2	10	946144	946153	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_007347	CTGGC	2	10	957413	957422	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_007347	ACCCC	2	10	957461	957470	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
119	NC_007347	GATCG	2	10	963012	963021	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_007347	CTACA	2	10	965102	965111	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_007347	GCCAT	2	10	965182	965191	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_007347	GCCGT	2	10	977333	977342	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_007347	CCGGC	2	10	985477	985486	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
124	NC_007347	CCGGG	2	10	993687	993696	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
125	NC_007347	CGGCG	2	10	995953	995962	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
126	NC_007347	ACAGC	2	10	997220	997229	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_007347	GCAAA	2	10	1001812	1001821	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_007347	ACTGA	2	10	1003097	1003106	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_007347	GCGCC	2	10	1003199	1003208	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
130	NC_007347	GCGCC	2	10	1009928	1009937	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
131	NC_007347	TGCCA	2	10	1020108	1020117	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_007347	GCCGC	2	10	1037056	1037065	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
133	NC_007347	CCGGC	2	10	1058114	1058123	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
134	NC_007347	GTTGC	2	10	1069661	1069670	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_007347	AACCA	2	10	1070040	1070049	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_007347	GGCAG	2	10	1113096	1113105	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
137	NC_007347	GCAGG	2	10	1113908	1113917	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
138	NC_007347	TTTTG	2	10	1113950	1113959	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007347	TTCGG	2	10	1115169	1115178	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_007347	TTTCG	2	10	1115294	1115303	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_007347	CGCGG	2	10	1117872	1117881	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
142	NC_007347	GCCGG	2	10	1125229	1125238	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
143	NC_007347	TGCGG	2	10	1179807	1179816	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
144	NC_007347	ACACG	2	10	1210216	1210225	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_007347	TCACA	2	10	1213964	1213973	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_007347	GTTTT	2	10	1220269	1220278	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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221	NC_007347	TCAGA	2	10	1950362	1950371	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
222	NC_007347	CCATC	2	10	1990577	1990586	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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260	NC_007347	CAAAA	2	10	2343256	2343265	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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265	NC_007347	TGCGG	2	10	2374378	2374387	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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279	NC_007347	CGGGC	2	10	2423679	2423688	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
280	NC_007347	TCCTT	2	10	2427816	2427825	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
281	NC_007347	GCCAC	2	10	2428010	2428019	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
282	NC_007347	TCTTG	2	10	2450959	2450968	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
283	NC_007347	GCCCC	2	10	2451973	2451982	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
284	NC_007347	GCGCG	2	10	2461681	2461690	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
285	NC_007347	CAAGG	2	10	2462811	2462820	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
286	NC_007347	CAGTG	2	10	2476347	2476356	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
287	NC_007347	TTGAT	2	10	2479714	2479723	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
288	NC_007347	CCGGG	2	10	2479729	2479738	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
289	NC_007347	TTGGT	2	10	2493085	2493094	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
290	NC_007347	TCGCT	2	10	2506068	2506077	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
291	NC_007347	GCGCT	2	10	2522340	2522349	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
292	NC_007347	GCGCC	2	10	2531147	2531156	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
293	NC_007347	GTGCA	2	10	2531804	2531813	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
294	NC_007347	CGCGG	2	10	2535523	2535532	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
295	NC_007347	TGCTT	2	10	2539861	2539870	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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297	NC_007347	AAAAG	2	10	2550276	2550285	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
298	NC_007347	GCAGC	2	10	2550291	2550300	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
299	NC_007347	TGCGC	2	10	2553867	2553876	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
300	NC_007347	CCGGC	2	10	2570141	2570150	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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303	NC_007347	TTGCG	2	10	2598935	2598944	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
304	NC_007347	CTTCA	2	10	2604916	2604925	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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331	NC_007347	TTGCC	2	10	2807926	2807935	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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382	NC_007347	GCTCA	2	10	3194723	3194732	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
383	NC_007347	AGGCC	2	10	3198616	3198625	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
384	NC_007347	GGCAC	2	10	3199296	3199305	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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404	NC_007347	ACAGG	2	10	3381715	3381724	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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409	NC_007347	CGAAC	2	10	3436785	3436794	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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413	NC_007347	AGTTT	2	10	3460379	3460388	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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421	NC_007347	CACGA	2	10	3507787	3507796	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
422	NC_007347	TTCGT	2	10	3509139	3509148	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
423	NC_007347	CACGA	2	10	3509481	3509490	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
424	NC_007347	TGCCA	2	10	3519795	3519804	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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441	NC_007347	CGTTG	2	10	3718862	3718871	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
442	NC_007347	GCCGG	2	10	3719891	3719900	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
443	NC_007347	TGCGC	2	10	3720594	3720603	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
444	NC_007347	GTGGC	2	10	3727990	3727999	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
445	NC_007347	CCCCT	2	10	3747170	3747179	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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449	NC_007347	ACTGG	2	10	3766944	3766953	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
450	NC_007347	CCAAA	2	10	3769505	3769514	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
451	NC_007347	CCCCG	2	10	3778030	3778039	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
452	NC_007347	CTTGT	2	10	3790258	3790267	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
453	NC_007347	TCTCC	2	10	3802407	3802416	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
454	NC_007347	AGGCG	2	10	3805805	3805814	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.