MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Ralstonia eutropha JMP134 plasmid 1

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007337	CCTGGG	2	12	215	226	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	72384245
2	NC_007337	GCTCCT	2	12	236	247	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	72384245
3	NC_007337	GCTGCC	2	12	2292	2303	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	72384247
4	NC_007337	TCGCCG	2	12	2807	2818	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	72384248
5	NC_007337	GGCGCG	2	12	5399	5410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72384251
6	NC_007337	CCCAGC	2	12	6175	6186	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	72384253
7	NC_007337	TGGCTG	2	12	12004	12015	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	72384260
8	NC_007337	GCATCA	2	12	12091	12102	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	72384260
9	NC_007337	ACGATT	2	12	12534	12545	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	72384261
10	NC_007337	CGCGAA	2	12	12977	12988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72384261
11	NC_007337	GCCAGT	2	12	14106	14117	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	72384261
12	NC_007337	TCGACG	2	12	15955	15966	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	72384262
13	NC_007337	CAGGTC	2	12	18915	18926	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	72384264
14	NC_007337	CCCGTG	2	12	24273	24284	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	72384269
15	NC_007337	ACCGGC	2	12	25373	25384	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	72384271
16	NC_007337	ATTGGC	2	12	25523	25534	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	72384271
17	NC_007337	ACGCGA	2	12	26536	26547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72384271
18	NC_007337	AGGTCG	2	12	27646	27657	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	72384272
19	NC_007337	GCGTGC	2	12	29003	29014	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	72384273
20	NC_007337	CGACGG	2	12	29039	29050	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	72384273
21	NC_007337	CCGCGC	2	12	34925	34936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72384279
22	NC_007337	CGCCGG	2	12	35995	36006	0 %	0 %	50 %	50 %	72384280
23	NC_007337	CAAGGA	2	12	43201	43212	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	72384287
24	NC_007337	ACGTGG	2	12	43593	43604	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	72384287
25	NC_007337	CGCTGG	2	12	44227	44238	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	72384288
26	NC_007337	GCCCGG	2	12	44275	44286	0 %	0 %	50 %	50 %	72384288
27	NC_007337	ACCAAG	2	12	45429	45440	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	72384289
28	NC_007337	TCACGC	2	12	46068	46079	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	72384290
29	NC_007337	ACGCGC	2	12	46406	46417	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	72384290
30	NC_007337	CTTCAT	2	12	46720	46731	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	72384290
31	NC_007337	GGTGCT	2	12	46744	46755	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	72384290
32	NC_007337	TCGCGA	2	12	48243	48254	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	72384292
33	NC_007337	CAAGGT	2	12	52986	52997	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	72384297
34	NC_007337	CGATGG	2	12	53237	53248	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	72384297
35	NC_007337	CGAGGG	2	12	54715	54726	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	72384298
36	NC_007337	CTTCAT	2	12	60921	60932	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	72384307
37	NC_007337	TCGCCA	2	12	63495	63506	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	72384309
38	NC_007337	CGCCCT	2	12	64284	64295	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	72384310
39	NC_007337	GCCGAC	2	12	66865	66876	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	72384312
40	NC_007337	CCGGCA	2	12	68301	68312	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	72384314
41	NC_007337	AGGGCA	2	12	68536	68547	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	72384314
42	NC_007337	TGCCGA	2	12	68845	68856	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	72384314
43	NC_007337	CGCGAG	2	12	72324	72335	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	72384320
44	NC_007337	CGCCTG	2	12	72448	72459	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	72384321
45	NC_007337	CTGCCG	2	12	72628	72639	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	72384321
46	NC_007337	TGTCGG	2	12	76313	76324	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	72384323
47	NC_007337	GCGCTC	2	12	79404	79415	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	72384325
48	NC_007337	TCGCGG	2	12	79969	79980	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	72384325
49	NC_007337	CGGCGA	2	12	80848	80859	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	72384326
50	NC_007337	GTAGCC	2	12	80897	80908	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	72384326
51	NC_007337	GCCACG	2	12	82763	82774	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	72384327
52	NC_007337	GATGTG	2	12	84948	84959	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	72384328

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.