MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Ralstonia eutropha JMP134 plasmid 1

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007337	CGGCG	2	10	1742	1751	0 %	0 %	60 %	40 %	72384247
2	NC_007337	CGTTG	2	10	3198	3207	0 %	40 %	40 %	20 %	72384248
3	NC_007337	GTAGG	2	10	5103	5112	20 %	20 %	60 %	0 %	72384250
4	NC_007337	CCGGC	2	10	5670	5679	0 %	0 %	40 %	60 %	72384252
5	NC_007337	GCAGG	2	10	9841	9850	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_007337	GCTCA	2	10	10572	10581	20 %	20 %	20 %	40 %	72384260
7	NC_007337	CCGGC	2	10	12775	12784	0 %	0 %	40 %	60 %	72384261
8	NC_007337	CGATG	2	10	13195	13204	20 %	20 %	40 %	20 %	72384261
9	NC_007337	ATTGT	2	10	14710	14719	20 %	60 %	20 %	0 %	72384261
10	NC_007337	TTGAT	2	10	15992	16001	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007337	TCAGT	2	10	16883	16892	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_007337	ACGTC	2	10	17535	17544	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_007337	GCCTT	2	10	17555	17564	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_007337	TGCGC	2	10	18248	18257	0 %	20 %	40 %	40 %	72384264
15	NC_007337	GCCGT	2	10	18448	18457	0 %	20 %	40 %	40 %	72384264
16	NC_007337	CGGCG	2	10	19266	19275	0 %	0 %	60 %	40 %	72384264
17	NC_007337	CAGTG	2	10	20204	20213	20 %	20 %	40 %	20 %	72384265
18	NC_007337	CTGCG	2	10	21651	21660	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_007337	AGACT	2	10	22872	22881	40 %	20 %	20 %	20 %	72384268
20	NC_007337	AGCTC	2	10	24130	24139	20 %	20 %	20 %	40 %	72384269
21	NC_007337	TCGGG	2	10	24644	24653	0 %	20 %	60 %	20 %	72384270
22	NC_007337	CGGCG	2	10	25394	25403	0 %	0 %	60 %	40 %	72384271
23	NC_007337	GGCCG	2	10	25460	25469	0 %	0 %	60 %	40 %	72384271
24	NC_007337	GCCCA	2	10	25500	25509	20 %	0 %	20 %	60 %	72384271
25	NC_007337	CTTCC	2	10	27932	27941	0 %	40 %	0 %	60 %	72384272
26	NC_007337	CCGCG	3	15	28113	28127	0 %	0 %	40 %	60 %	72384272
27	NC_007337	GGTCG	2	10	28544	28553	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
28	NC_007337	GCGCG	2	10	29426	29435	0 %	0 %	60 %	40 %	72384273
29	NC_007337	GAACG	2	10	29917	29926	40 %	0 %	40 %	20 %	72384274
30	NC_007337	CATCG	2	10	31656	31665	20 %	20 %	20 %	40 %	72384276
31	NC_007337	AGCGC	2	10	32668	32677	20 %	0 %	40 %	40 %	72384277
32	NC_007337	GCCGG	2	10	33154	33163	0 %	0 %	60 %	40 %	72384277
33	NC_007337	CGACG	2	10	34362	34371	20 %	0 %	40 %	40 %	72384278
34	NC_007337	GCCTG	2	10	34433	34442	0 %	20 %	40 %	40 %	72384278
35	NC_007337	CCCGG	2	10	36068	36077	0 %	0 %	40 %	60 %	72384280
36	NC_007337	CCTCC	2	10	36113	36122	0 %	20 %	0 %	80 %	72384280
37	NC_007337	ATGCC	2	10	37477	37486	20 %	20 %	20 %	40 %	72384281
38	NC_007337	TCGGG	2	10	39420	39429	0 %	20 %	60 %	20 %	72384283
39	NC_007337	TGGCG	2	10	40697	40706	0 %	20 %	60 %	20 %	72384284
40	NC_007337	CGTTT	2	10	41688	41697	0 %	60 %	20 %	20 %	72384285
41	NC_007337	ATTCA	2	10	42958	42967	40 %	40 %	0 %	20 %	72384287
42	NC_007337	CGGCC	2	10	44060	44069	0 %	0 %	40 %	60 %	72384288
43	NC_007337	AGCGC	2	10	47771	47780	20 %	0 %	40 %	40 %	72384291
44	NC_007337	GCGCC	2	10	48126	48135	0 %	0 %	40 %	60 %	72384292
45	NC_007337	GGTGC	2	10	49622	49631	0 %	20 %	60 %	20 %	72384293
46	NC_007337	CGGTT	2	10	51062	51071	0 %	40 %	40 %	20 %	72384293
47	NC_007337	CGAGG	2	10	55043	55052	20 %	0 %	60 %	20 %	72384299
48	NC_007337	GCGCG	2	10	56362	56371	0 %	0 %	60 %	40 %	72384301
49	NC_007337	GGCCT	2	10	56985	56994	0 %	20 %	40 %	40 %	72384302
50	NC_007337	GAAGG	2	10	57947	57956	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007337	TGGAT	2	10	59019	59028	20 %	40 %	40 %	0 %	72384304
52	NC_007337	GCGCA	2	10	61771	61780	20 %	0 %	40 %	40 %	72384307
53	NC_007337	TCGCA	2	10	63821	63830	20 %	20 %	20 %	40 %	72384309
54	NC_007337	CCGGC	2	10	65043	65052	0 %	0 %	40 %	60 %	72384311
55	NC_007337	CGCAG	2	10	65340	65349	20 %	0 %	40 %	40 %	72384311
56	NC_007337	TCGGC	2	10	65901	65910	0 %	20 %	40 %	40 %	72384311
57	NC_007337	AGCCC	2	10	67166	67175	20 %	0 %	20 %	60 %	72384313
58	NC_007337	GCCTG	2	10	69035	69044	0 %	20 %	40 %	40 %	72384315
59	NC_007337	GCGGG	2	10	69414	69423	0 %	0 %	80 %	20 %	72384315
60	NC_007337	TGACG	2	10	69973	69982	20 %	20 %	40 %	20 %	72384316
61	NC_007337	CGGCG	2	10	72066	72075	0 %	0 %	60 %	40 %	72384320
62	NC_007337	CTGCG	2	10	72537	72546	0 %	20 %	40 %	40 %	72384321
63	NC_007337	CAGGG	2	10	73452	73461	20 %	0 %	60 %	20 %	72384322
64	NC_007337	CGTGG	2	10	74355	74364	0 %	20 %	60 %	20 %	72384323
65	NC_007337	CGGTG	2	10	77403	77412	0 %	20 %	60 %	20 %	72384323
66	NC_007337	GGCTC	2	10	77672	77681	0 %	20 %	40 %	40 %	72384323
67	NC_007337	ACGGC	2	10	79943	79952	20 %	0 %	40 %	40 %	72384325
68	NC_007337	GCATC	2	10	82128	82137	20 %	20 %	20 %	40 %	72384327
69	NC_007337	CACTT	2	10	83463	83472	20 %	40 %	0 %	40 %	72384328
70	NC_007337	GGCGC	2	10	84333	84342	0 %	0 %	60 %	40 %	72384328
71	NC_007337	CCGCG	2	10	84806	84815	0 %	0 %	40 %	60 %	72384328
72	NC_007337	CTTTG	2	10	85217	85226	0 %	60 %	20 %	20 %	72384328
73	NC_007337	TCGCC	2	10	85431	85440	0 %	20 %	20 %	60 %	72384329
74	NC_007337	GCCTC	2	10	85714	85723	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_007337	GCAAG	2	10	86508	86517	40 %	0 %	40 %	20 %	72384331
76	NC_007337	GGCGC	2	10	87566	87575	0 %	0 %	60 %	40 %	72384332

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.