MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Ralstonia eutropha JMP134 plasmid 1

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007337	CGGCG	2	10	1742	1751	0 %	0 %	60 %	40 %	72384247
2	NC_007337	CGTTG	2	10	3198	3207	0 %	40 %	40 %	20 %	72384248
3	NC_007337	GTAGG	2	10	5103	5112	20 %	20 %	60 %	0 %	72384250
4	NC_007337	CCGGC	2	10	5670	5679	0 %	0 %	40 %	60 %	72384252
5	NC_007337	GCTCA	2	10	10572	10581	20 %	20 %	20 %	40 %	72384260
6	NC_007337	CCGGC	2	10	12775	12784	0 %	0 %	40 %	60 %	72384261
7	NC_007337	CGATG	2	10	13195	13204	20 %	20 %	40 %	20 %	72384261
8	NC_007337	ATTGT	2	10	14710	14719	20 %	60 %	20 %	0 %	72384261
9	NC_007337	TGCGC	2	10	18248	18257	0 %	20 %	40 %	40 %	72384264
10	NC_007337	GCCGT	2	10	18448	18457	0 %	20 %	40 %	40 %	72384264
11	NC_007337	CGGCG	2	10	19266	19275	0 %	0 %	60 %	40 %	72384264
12	NC_007337	CAGTG	2	10	20204	20213	20 %	20 %	40 %	20 %	72384265
13	NC_007337	AGACT	2	10	22872	22881	40 %	20 %	20 %	20 %	72384268
14	NC_007337	AGCTC	2	10	24130	24139	20 %	20 %	20 %	40 %	72384269
15	NC_007337	TCGGG	2	10	24644	24653	0 %	20 %	60 %	20 %	72384270
16	NC_007337	CGGCG	2	10	25394	25403	0 %	0 %	60 %	40 %	72384271
17	NC_007337	GGCCG	2	10	25460	25469	0 %	0 %	60 %	40 %	72384271
18	NC_007337	GCCCA	2	10	25500	25509	20 %	0 %	20 %	60 %	72384271
19	NC_007337	CTTCC	2	10	27932	27941	0 %	40 %	0 %	60 %	72384272
20	NC_007337	CCGCG	3	15	28113	28127	0 %	0 %	40 %	60 %	72384272
21	NC_007337	GCGCG	2	10	29426	29435	0 %	0 %	60 %	40 %	72384273
22	NC_007337	GAACG	2	10	29917	29926	40 %	0 %	40 %	20 %	72384274
23	NC_007337	CATCG	2	10	31656	31665	20 %	20 %	20 %	40 %	72384276
24	NC_007337	AGCGC	2	10	32668	32677	20 %	0 %	40 %	40 %	72384277
25	NC_007337	GCCGG	2	10	33154	33163	0 %	0 %	60 %	40 %	72384277
26	NC_007337	CGACG	2	10	34362	34371	20 %	0 %	40 %	40 %	72384278
27	NC_007337	GCCTG	2	10	34433	34442	0 %	20 %	40 %	40 %	72384278
28	NC_007337	CCCGG	2	10	36068	36077	0 %	0 %	40 %	60 %	72384280
29	NC_007337	CCTCC	2	10	36113	36122	0 %	20 %	0 %	80 %	72384280
30	NC_007337	ATGCC	2	10	37477	37486	20 %	20 %	20 %	40 %	72384281
31	NC_007337	TCGGG	2	10	39420	39429	0 %	20 %	60 %	20 %	72384283
32	NC_007337	TGGCG	2	10	40697	40706	0 %	20 %	60 %	20 %	72384284
33	NC_007337	CGTTT	2	10	41688	41697	0 %	60 %	20 %	20 %	72384285
34	NC_007337	ATTCA	2	10	42958	42967	40 %	40 %	0 %	20 %	72384287
35	NC_007337	CGGCC	2	10	44060	44069	0 %	0 %	40 %	60 %	72384288
36	NC_007337	AGCGC	2	10	47771	47780	20 %	0 %	40 %	40 %	72384291
37	NC_007337	GCGCC	2	10	48126	48135	0 %	0 %	40 %	60 %	72384292
38	NC_007337	GGTGC	2	10	49622	49631	0 %	20 %	60 %	20 %	72384293
39	NC_007337	CGGTT	2	10	51062	51071	0 %	40 %	40 %	20 %	72384293
40	NC_007337	CGAGG	2	10	55043	55052	20 %	0 %	60 %	20 %	72384299
41	NC_007337	GCGCG	2	10	56362	56371	0 %	0 %	60 %	40 %	72384301
42	NC_007337	GGCCT	2	10	56985	56994	0 %	20 %	40 %	40 %	72384302
43	NC_007337	TGGAT	2	10	59019	59028	20 %	40 %	40 %	0 %	72384304
44	NC_007337	GCGCA	2	10	61771	61780	20 %	0 %	40 %	40 %	72384307
45	NC_007337	TCGCA	2	10	63821	63830	20 %	20 %	20 %	40 %	72384309
46	NC_007337	CCGGC	2	10	65043	65052	0 %	0 %	40 %	60 %	72384311
47	NC_007337	CGCAG	2	10	65340	65349	20 %	0 %	40 %	40 %	72384311
48	NC_007337	TCGGC	2	10	65901	65910	0 %	20 %	40 %	40 %	72384311
49	NC_007337	AGCCC	2	10	67166	67175	20 %	0 %	20 %	60 %	72384313
50	NC_007337	GCCTG	2	10	69035	69044	0 %	20 %	40 %	40 %	72384315
51	NC_007337	GCGGG	2	10	69414	69423	0 %	0 %	80 %	20 %	72384315
52	NC_007337	TGACG	2	10	69973	69982	20 %	20 %	40 %	20 %	72384316
53	NC_007337	CGGCG	2	10	72066	72075	0 %	0 %	60 %	40 %	72384320
54	NC_007337	CTGCG	2	10	72537	72546	0 %	20 %	40 %	40 %	72384321
55	NC_007337	CAGGG	2	10	73452	73461	20 %	0 %	60 %	20 %	72384322
56	NC_007337	CGTGG	2	10	74355	74364	0 %	20 %	60 %	20 %	72384323
57	NC_007337	CGGTG	2	10	77403	77412	0 %	20 %	60 %	20 %	72384323
58	NC_007337	GGCTC	2	10	77672	77681	0 %	20 %	40 %	40 %	72384323
59	NC_007337	ACGGC	2	10	79943	79952	20 %	0 %	40 %	40 %	72384325
60	NC_007337	GCATC	2	10	82128	82137	20 %	20 %	20 %	40 %	72384327
61	NC_007337	CACTT	2	10	83463	83472	20 %	40 %	0 %	40 %	72384328
62	NC_007337	GGCGC	2	10	84333	84342	0 %	0 %	60 %	40 %	72384328
63	NC_007337	CCGCG	2	10	84806	84815	0 %	0 %	40 %	60 %	72384328
64	NC_007337	CTTTG	2	10	85217	85226	0 %	60 %	20 %	20 %	72384328
65	NC_007337	TCGCC	2	10	85431	85440	0 %	20 %	20 %	60 %	72384329
66	NC_007337	GCAAG	2	10	86508	86517	40 %	0 %	40 %	20 %	72384331
67	NC_007337	GGCGC	2	10	87566	87575	0 %	0 %	60 %	40 %	72384332

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.