MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Ralstonia eutropha JMP134 plasmid 1

Total Repeats: 230

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007337	TTGC	2	8	228	235	0 %	50 %	25 %	25 %	72384245
2	NC_007337	CCTT	2	8	379	386	0 %	50 %	0 %	50 %	72384245
3	NC_007337	CGCC	2	8	1101	1108	0 %	0 %	25 %	75 %	72384246
4	NC_007337	GCCG	2	8	1439	1446	0 %	0 %	50 %	50 %	72384247
5	NC_007337	GGTC	2	8	1697	1704	0 %	25 %	50 %	25 %	72384247
6	NC_007337	CTGG	2	8	2238	2245	0 %	25 %	50 %	25 %	72384247
7	NC_007337	TGCG	2	8	2249	2256	0 %	25 %	50 %	25 %	72384247
8	NC_007337	GGCC	2	8	2339	2346	0 %	0 %	50 %	50 %	72384247
9	NC_007337	GCCG	2	8	2699	2706	0 %	0 %	50 %	50 %	72384248
10	NC_007337	GCCA	2	8	2954	2961	25 %	0 %	25 %	50 %	72384248
11	NC_007337	GCAC	2	8	3664	3671	25 %	0 %	25 %	50 %	72384249
12	NC_007337	AGGG	2	8	4009	4016	25 %	0 %	75 %	0 %	72384249
13	NC_007337	GGCC	2	8	4235	4242	0 %	0 %	50 %	50 %	72384249
14	NC_007337	CCGG	2	8	5070	5077	0 %	0 %	50 %	50 %	72384250
15	NC_007337	GGCC	2	8	5334	5341	0 %	0 %	50 %	50 %	72384251
16	NC_007337	GTCG	2	8	5840	5847	0 %	25 %	50 %	25 %	72384252
17	NC_007337	CGGT	2	8	6248	6255	0 %	25 %	50 %	25 %	72384253
18	NC_007337	CGGC	2	8	6269	6276	0 %	0 %	50 %	50 %	72384253
19	NC_007337	TTCG	2	8	6314	6321	0 %	50 %	25 %	25 %	72384253
20	NC_007337	CGCT	2	8	6621	6628	0 %	25 %	25 %	50 %	72384254
21	NC_007337	GCCC	2	8	6657	6664	0 %	0 %	25 %	75 %	72384254
22	NC_007337	GCCA	2	8	6932	6939	25 %	0 %	25 %	50 %	72384254
23	NC_007337	CGGT	2	8	7451	7458	0 %	25 %	50 %	25 %	72384254
24	NC_007337	CGGC	2	8	7661	7668	0 %	0 %	50 %	50 %	72384255
25	NC_007337	CCGT	2	8	7717	7724	0 %	25 %	25 %	50 %	72384255
26	NC_007337	TGGC	2	8	7851	7858	0 %	25 %	50 %	25 %	72384256
27	NC_007337	GAAG	2	8	8600	8607	50 %	0 %	50 %	0 %	72384257
28	NC_007337	CCGG	2	8	10297	10304	0 %	0 %	50 %	50 %	72384259
29	NC_007337	TGCC	2	8	10476	10483	0 %	25 %	25 %	50 %	72384260
30	NC_007337	CAGC	2	8	10652	10659	25 %	0 %	25 %	50 %	72384260
31	NC_007337	CCAG	2	8	11186	11193	25 %	0 %	25 %	50 %	72384260
32	NC_007337	GACT	2	8	11592	11599	25 %	25 %	25 %	25 %	72384260
33	NC_007337	GGCC	2	8	11682	11689	0 %	0 %	50 %	50 %	72384260
34	NC_007337	GCCG	2	8	11763	11770	0 %	0 %	50 %	50 %	72384260
35	NC_007337	GTCG	2	8	12108	12115	0 %	25 %	50 %	25 %	72384260
36	NC_007337	GCCT	2	8	12360	12367	0 %	25 %	25 %	50 %	72384261
37	NC_007337	GTGG	2	8	12655	12662	0 %	25 %	75 %	0 %	72384261
38	NC_007337	TGCA	2	8	13917	13924	25 %	25 %	25 %	25 %	72384261
39	NC_007337	TGGC	2	8	13928	13935	0 %	25 %	50 %	25 %	72384261
40	NC_007337	CGAC	2	8	14420	14427	25 %	0 %	25 %	50 %	72384261
41	NC_007337	ATCG	2	8	14771	14778	25 %	25 %	25 %	25 %	72384261
42	NC_007337	GTAC	2	8	14874	14881	25 %	25 %	25 %	25 %	72384261
43	NC_007337	TTCG	2	8	15024	15031	0 %	50 %	25 %	25 %	72384261
44	NC_007337	GATG	2	8	15528	15535	25 %	25 %	50 %	0 %	72384262
45	NC_007337	CGGC	2	8	17783	17790	0 %	0 %	50 %	50 %	72384264
46	NC_007337	TGGA	2	8	18499	18506	25 %	25 %	50 %	0 %	72384264
47	NC_007337	GCCA	2	8	18736	18743	25 %	0 %	25 %	50 %	72384264
48	NC_007337	CCGA	2	8	19206	19213	25 %	0 %	25 %	50 %	72384264
49	NC_007337	GTTG	2	8	19328	19335	0 %	50 %	50 %	0 %	72384264
50	NC_007337	CGGA	2	8	20735	20742	25 %	0 %	50 %	25 %	72384265
51	NC_007337	GCCC	2	8	20840	20847	0 %	0 %	25 %	75 %	72384265
52	NC_007337	AATG	2	8	20987	20994	50 %	25 %	25 %	0 %	72384266
53	NC_007337	GCTT	2	8	21915	21922	0 %	50 %	25 %	25 %	72384267
54	NC_007337	GACG	2	8	22164	22171	25 %	0 %	50 %	25 %	72384267
55	NC_007337	CGAT	2	8	22421	22428	25 %	25 %	25 %	25 %	72384267
56	NC_007337	CGAC	2	8	24331	24338	25 %	0 %	25 %	50 %	72384269
57	NC_007337	GGGC	2	8	24800	24807	0 %	0 %	75 %	25 %	72384270
58	NC_007337	TCGC	2	8	24833	24840	0 %	25 %	25 %	50 %	72384270
59	NC_007337	GCCG	2	8	25354	25361	0 %	0 %	50 %	50 %	72384271
60	NC_007337	GATC	2	8	25472	25479	25 %	25 %	25 %	25 %	72384271
61	NC_007337	GAAC	2	8	25966	25973	50 %	0 %	25 %	25 %	72384271
62	NC_007337	CAGC	2	8	26359	26366	25 %	0 %	25 %	50 %	72384271
63	NC_007337	TCGC	2	8	26808	26815	0 %	25 %	25 %	50 %	72384272
64	NC_007337	TCGC	2	8	26833	26840	0 %	25 %	25 %	50 %	72384272
65	NC_007337	GGCC	2	8	27475	27482	0 %	0 %	50 %	50 %	72384272
66	NC_007337	CGGC	2	8	28294	28301	0 %	0 %	50 %	50 %	72384272
67	NC_007337	TGGT	2	8	28362	28369	0 %	50 %	50 %	0 %	72384272
68	NC_007337	GCGA	2	8	28632	28639	25 %	0 %	50 %	25 %	72384273
69	NC_007337	ATGC	2	8	28769	28776	25 %	25 %	25 %	25 %	72384273
70	NC_007337	ATTC	2	8	29651	29658	25 %	50 %	0 %	25 %	72384273
71	NC_007337	CGAA	2	8	29893	29900	50 %	0 %	25 %	25 %	72384274
72	NC_007337	GGCG	2	8	30946	30953	0 %	0 %	75 %	25 %	72384275
73	NC_007337	CGAT	2	8	31222	31229	25 %	25 %	25 %	25 %	72384276
74	NC_007337	TCGA	2	8	31402	31409	25 %	25 %	25 %	25 %	72384276
75	NC_007337	CTCG	2	8	31581	31588	0 %	25 %	25 %	50 %	72384276
76	NC_007337	GCCG	2	8	31704	31711	0 %	0 %	50 %	50 %	72384276
77	NC_007337	TGCC	2	8	31877	31884	0 %	25 %	25 %	50 %	72384276
78	NC_007337	GGCG	2	8	32282	32289	0 %	0 %	75 %	25 %	72384276
79	NC_007337	CGCC	2	8	32695	32702	0 %	0 %	25 %	75 %	72384277
80	NC_007337	CCAT	2	8	32941	32948	25 %	25 %	0 %	50 %	72384277
81	NC_007337	CGGC	2	8	33223	33230	0 %	0 %	50 %	50 %	72384277
82	NC_007337	GCGA	2	8	33306	33313	25 %	0 %	50 %	25 %	72384277
83	NC_007337	GGCT	2	8	33414	33421	0 %	25 %	50 %	25 %	72384278
84	NC_007337	CCAT	2	8	33469	33476	25 %	25 %	0 %	50 %	72384278
85	NC_007337	CCGC	2	8	34047	34054	0 %	0 %	25 %	75 %	72384278
86	NC_007337	GACC	2	8	34086	34093	25 %	0 %	25 %	50 %	72384278
87	NC_007337	ATCT	2	8	35709	35716	25 %	50 %	0 %	25 %	72384279
88	NC_007337	GATG	2	8	35755	35762	25 %	25 %	50 %	0 %	72384279
89	NC_007337	AGCC	2	8	35811	35818	25 %	0 %	25 %	50 %	72384279
90	NC_007337	GATG	2	8	36283	36290	25 %	25 %	50 %	0 %	72384280
91	NC_007337	TCAA	2	8	37129	37136	50 %	25 %	0 %	25 %	72384281
92	NC_007337	TGCG	2	8	37351	37358	0 %	25 %	50 %	25 %	72384281
93	NC_007337	GGCT	2	8	38232	38239	0 %	25 %	50 %	25 %	72384282
94	NC_007337	CATG	2	8	38561	38568	25 %	25 %	25 %	25 %	72384282
95	NC_007337	CGCA	2	8	39472	39479	25 %	0 %	25 %	50 %	72384283
96	NC_007337	CGCC	2	8	39492	39499	0 %	0 %	25 %	75 %	72384283
97	NC_007337	CTGG	2	8	39595	39602	0 %	25 %	50 %	25 %	72384283
98	NC_007337	CGCC	2	8	39779	39786	0 %	0 %	25 %	75 %	72384283
99	NC_007337	GGCC	2	8	40171	40178	0 %	0 %	50 %	50 %	72384283
100	NC_007337	CGGG	2	8	40335	40342	0 %	0 %	75 %	25 %	72384283
101	NC_007337	GCTG	2	8	40829	40836	0 %	25 %	50 %	25 %	72384284
102	NC_007337	CGAA	2	8	42588	42595	50 %	0 %	25 %	25 %	72384286
103	NC_007337	GCCG	2	8	43718	43725	0 %	0 %	50 %	50 %	72384287
104	NC_007337	TGCC	2	8	43905	43912	0 %	25 %	25 %	50 %	72384288
105	NC_007337	GCCT	2	8	44082	44089	0 %	25 %	25 %	50 %	72384288
106	NC_007337	CCGG	2	8	44319	44326	0 %	0 %	50 %	50 %	72384288
107	NC_007337	TCGA	2	8	44340	44347	25 %	25 %	25 %	25 %	72384288
108	NC_007337	TCGC	2	8	44668	44675	0 %	25 %	25 %	50 %	72384289
109	NC_007337	CTGG	2	8	45245	45252	0 %	25 %	50 %	25 %	72384289
110	NC_007337	CTCG	2	8	45662	45669	0 %	25 %	25 %	50 %	72384289
111	NC_007337	CTGG	2	8	46519	46526	0 %	25 %	50 %	25 %	72384290
112	NC_007337	GTCG	2	8	46681	46688	0 %	25 %	50 %	25 %	72384290
113	NC_007337	GGCT	2	8	47142	47149	0 %	25 %	50 %	25 %	72384291
114	NC_007337	CGGG	2	8	47488	47495	0 %	0 %	75 %	25 %	72384291
115	NC_007337	TCGA	2	8	47792	47799	25 %	25 %	25 %	25 %	72384292
116	NC_007337	CCGA	2	8	47971	47978	25 %	0 %	25 %	50 %	72384292
117	NC_007337	CGGC	2	8	47983	47990	0 %	0 %	50 %	50 %	72384292
118	NC_007337	GCCG	2	8	48265	48272	0 %	0 %	50 %	50 %	72384292
119	NC_007337	ACCG	2	8	48289	48296	25 %	0 %	25 %	50 %	72384292
120	NC_007337	CAAT	2	8	48723	48730	50 %	25 %	0 %	25 %	72384293
121	NC_007337	GAGC	2	8	48967	48974	25 %	0 %	50 %	25 %	72384293
122	NC_007337	GATT	2	8	49722	49729	25 %	50 %	25 %	0 %	72384293
123	NC_007337	GGCA	2	8	50061	50068	25 %	0 %	50 %	25 %	72384293
124	NC_007337	GGCG	2	8	50749	50756	0 %	0 %	75 %	25 %	72384293
125	NC_007337	CCAG	2	8	50796	50803	25 %	0 %	25 %	50 %	72384293
126	NC_007337	CCGG	2	8	51237	51244	0 %	0 %	50 %	50 %	72384293
127	NC_007337	CAGC	2	8	51740	51747	25 %	0 %	25 %	50 %	72384294
128	NC_007337	ACCC	2	8	51757	51764	25 %	0 %	0 %	75 %	72384294
129	NC_007337	CCAT	2	8	52074	52081	25 %	25 %	0 %	50 %	72384294
130	NC_007337	CCGG	2	8	52082	52089	0 %	0 %	50 %	50 %	72384294
131	NC_007337	TCGG	2	8	52361	52368	0 %	25 %	50 %	25 %	72384296
132	NC_007337	AGCC	2	8	52666	52673	25 %	0 %	25 %	50 %	72384296
133	NC_007337	CGGC	2	8	53081	53088	0 %	0 %	50 %	50 %	72384297
134	NC_007337	GCCG	2	8	53145	53152	0 %	0 %	50 %	50 %	72384297
135	NC_007337	GCCG	2	8	53193	53200	0 %	0 %	50 %	50 %	72384297
136	NC_007337	CGTG	2	8	53351	53358	0 %	25 %	50 %	25 %	72384297
137	NC_007337	CTGG	2	8	53394	53401	0 %	25 %	50 %	25 %	72384297
138	NC_007337	TCGC	2	8	53599	53606	0 %	25 %	25 %	50 %	72384297
139	NC_007337	ACGG	2	8	53733	53740	25 %	0 %	50 %	25 %	72384297
140	NC_007337	CCAT	2	8	54140	54147	25 %	25 %	0 %	50 %	72384297
141	NC_007337	CTGC	2	8	54889	54896	0 %	25 %	25 %	50 %	72384299
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.