Hexa-nucleotide Repeats of Ralstonia eutropha JMP134 megaplasmid

Total Repeats: 244

Go To Repeat Summary Page

Download The Result in

S.No.Genome IDMotifIterationsLengthStartEndA%T%G%C% Protein ID
1NC_007336GCGAGC2123775378616.67 %0 %50 %33.33 %72383735
2NC_007336GCCCAC2124400441116.67 %0 %16.67 %66.67 %72383736
3NC_007336GCGTGC212690069110 %16.67 %50 %33.33 %72383736
4NC_007336GCGGCC212697169820 %0 %50 %50 %72383736
5NC_007336CGGAGA2127673768433.33 %0 %50 %16.67 %72383737
6NC_007336GCCGTC21212001120120 %16.67 %33.33 %50 %72383740
7NC_007336CAAGCT212132861329733.33 %16.67 %16.67 %33.33 %72383741
8NC_007336GATGTC212156121562316.67 %33.33 %33.33 %16.67 %72383743
9NC_007336CCATGG212162941630516.67 %16.67 %33.33 %33.33 %72383744
10NC_007336GCCTGC21216676166870 %16.67 %33.33 %50 %72383744
11NC_007336GCCAAT212191501916133.33 %16.67 %16.67 %33.33 %72383746
12NC_007336CGATGA212231162312733.33 %16.67 %33.33 %16.67 %Non-Coding
13NC_007336CGTGCG21223903239140 %16.67 %50 %33.33 %72383751
14NC_007336TCGGGA212239912400216.67 %16.67 %50 %16.67 %72383751
15NC_007336TCGGGC21225575255860 %16.67 %50 %33.33 %72383751
16NC_007336GAAGGC212259262593733.33 %0 %50 %16.67 %72383751
17NC_007336TCGTGT21227552275630 %50 %33.33 %16.67 %72383752
18NC_007336GGAACG212299792999033.33 %0 %50 %16.67 %72383755
19NC_007336TCGCCG21232555325660 %16.67 %33.33 %50 %72383758
20NC_007336CCTCGG21232814328250 %16.67 %33.33 %50 %72383758
21NC_007336GATCAC212338593387033.33 %16.67 %16.67 %33.33 %72383760
22NC_007336GCCACC212377073771816.67 %0 %16.67 %66.67 %72383761
23NC_007336TGGGAG212391913920216.67 %16.67 %66.67 %0 %Non-Coding
24NC_007336ATGGTC212506655067616.67 %33.33 %33.33 %16.67 %72383779
25NC_007336TCCGGT21255124551350 %33.33 %33.33 %33.33 %72383783
26NC_007336CTATGC212587965880716.67 %33.33 %16.67 %33.33 %72383785
27NC_007336ACTTCG212626036261416.67 %33.33 %16.67 %33.33 %72383789
28NC_007336TGGCGG21263546635570 %16.67 %66.67 %16.67 %72383790
29NC_007336GCCATC212674586746916.67 %16.67 %16.67 %50 %72383793
30NC_007336ACGCCA212699146992533.33 %0 %16.67 %50 %72383795
31NC_007336CAGAAG212728247283550 %0 %33.33 %16.67 %72383798
32NC_007336TGCCTG21274890749010 %33.33 %33.33 %33.33 %72383800
33NC_007336CCAGCG212757177572816.67 %0 %33.33 %50 %72383801
34NC_007336CAAAAC212845728458366.67 %0 %0 %33.33 %Non-Coding
35NC_007336TGCGGG21288949889600 %16.67 %66.67 %16.67 %Non-Coding
36NC_007336CGGTCG21289960899710 %16.67 %50 %33.33 %72383811
37NC_007336CGGCGC21291276912870 %0 %50 %50 %72383812
38NC_007336GGTGTC21291652916630 %33.33 %50 %16.67 %72383812
39NC_007336GGTGTC21292309923200 %33.33 %50 %16.67 %72383812
40NC_007336GAAGGT212928079281833.33 %16.67 %50 %0 %72383812
41NC_007336GAAGGT212931499316033.33 %16.67 %50 %0 %72383812
42NC_007336GAAGGT212934919350233.33 %16.67 %50 %0 %72383812
43NC_007336AAGGTG212938349384533.33 %16.67 %50 %0 %72383812
44NC_007336GAAGGT212941759418633.33 %16.67 %50 %0 %72383812
45NC_007336GAAGGT212945179452833.33 %16.67 %50 %0 %72383812
46NC_007336GAAGGT212948599487033.33 %16.67 %50 %0 %72383812
47NC_007336AAGGTG212952029521333.33 %16.67 %50 %0 %72383812
48NC_007336CGTTGC21296082960930 %33.33 %33.33 %33.33 %72383812
49NC_007336TTGCCA212964059641616.67 %33.33 %16.67 %33.33 %72383812
50NC_007336CATTGC212965119652216.67 %33.33 %16.67 %33.33 %72383812
51NC_007336GCGCAC212968369684716.67 %0 %33.33 %50 %72383813
52NC_007336GCCCGC21297998980090 %0 %33.33 %66.67 %Non-Coding
53NC_007336GCCGGC2121060181060290 %0 %50 %50 %72383819
54NC_007336GCTGCG2121085011085120 %16.67 %50 %33.33 %72383821
55NC_007336CCACGC21211104811105916.67 %0 %16.67 %66.67 %72383823
56NC_007336TGCGGC2121147161147270 %16.67 %50 %33.33 %72383827
57NC_007336ATGCCG21211506711507816.67 %16.67 %33.33 %33.33 %72383827
58NC_007336ACCTTG21211902111903216.67 %33.33 %16.67 %33.33 %72383831
59NC_007336GGTTCG2121200971201080 %33.33 %50 %16.67 %72383832
60NC_007336TCGTGG2121209881209990 %33.33 %50 %16.67 %Non-Coding
61NC_007336ATGCCG21212520012521116.67 %16.67 %33.33 %33.33 %Non-Coding
62NC_007336GGCGCC2121259981260090 %0 %50 %50 %Non-Coding
63NC_007336GCAAGC21213581513582633.33 %0 %33.33 %33.33 %Non-Coding
64NC_007336CCATGG21214024514025616.67 %16.67 %33.33 %33.33 %72383848
65NC_007336GGAAGC21214050714051833.33 %0 %50 %16.67 %72383848
66NC_007336GATTAA21214490114491250 %33.33 %16.67 %0 %Non-Coding
67NC_007336GCTCCG2121481901482010 %16.67 %33.33 %50 %Non-Coding
68NC_007336CGATAG21215123715124833.33 %16.67 %33.33 %16.67 %72383855
69NC_007336GGTGTT2121541341541450 %50 %50 %0 %72383857
70NC_007336CGCTAC21216578716579816.67 %16.67 %16.67 %50 %72383863
71NC_007336TGTTCG2121689921690030 %50 %33.33 %16.67 %Non-Coding
72NC_007336ACGGCG21217268817269916.67 %0 %50 %33.33 %72383866
73NC_007336CGCCAG21217272317273416.67 %0 %33.33 %50 %72383866
74NC_007336TCCCCA21217275017276116.67 %16.67 %0 %66.67 %72383866
75NC_007336GCCGAG21217360517361616.67 %0 %50 %33.33 %72383866
76NC_007336GACCGG21217450617451716.67 %0 %50 %33.33 %72383867
77NC_007336TACCGC21217564017565116.67 %16.67 %16.67 %50 %72383868
78NC_007336GTCGGC2121808921809030 %16.67 %50 %33.33 %72383875
79NC_007336CGCTGC2121812301812410 %16.67 %33.33 %50 %72383875
80NC_007336AGATCG21218396218397333.33 %16.67 %33.33 %16.67 %72383877
81NC_007336AGGTGC21218424218425316.67 %16.67 %50 %16.67 %Non-Coding
82NC_007336GGCATC21218709418710516.67 %16.67 %33.33 %33.33 %72383879
83NC_007336CTCGCG2121887121887230 %16.67 %33.33 %50 %72383880
84NC_007336CGCCCT2121911771911880 %16.67 %16.67 %66.67 %72383883
85NC_007336CAGATC21219138819139933.33 %16.67 %16.67 %33.33 %72383883
86NC_007336CACGCT21219193519194616.67 %16.67 %16.67 %50 %72383884
87NC_007336CAGCAC21219546019547133.33 %0 %16.67 %50 %72383887
88NC_007336CCTCGG2121955341955450 %16.67 %33.33 %50 %72383887
89NC_007336GCTTGA21219652419653516.67 %33.33 %33.33 %16.67 %72383887
90NC_007336CCGAGG21219979819980916.67 %0 %50 %33.33 %72383891
91NC_007336GCCATC21220028020029116.67 %16.67 %16.67 %50 %72383891
92NC_007336GGCGCG2122152672152780 %0 %66.67 %33.33 %72383904
93NC_007336TTGAAA21221850321851450 %33.33 %16.67 %0 %72383907
94NC_007336TGGGTG2122195462195570 %33.33 %66.67 %0 %72383908
95NC_007336CGGCCT2122229902230010 %16.67 %33.33 %50 %72383911
96NC_007336CAGCAC21222483022484133.33 %0 %16.67 %50 %72383912
97NC_007336CTTCGG2122249042249150 %33.33 %33.33 %33.33 %72383912
98NC_007336GCCAGC21222586222587316.67 %0 %33.33 %50 %72383912
99NC_007336TTCGTC2122273142273250 %50 %16.67 %33.33 %72383914
100NC_007336TCGACA21222872422873533.33 %16.67 %16.67 %33.33 %Non-Coding
101NC_007336CGGCTG2122294512294620 %16.67 %50 %33.33 %72383916
102NC_007336TGTTGC2122338452338560 %50 %33.33 %16.67 %72383920
103NC_007336GAATCG21224976824977933.33 %16.67 %33.33 %16.67 %72383935
104NC_007336CATCCT21225107625108716.67 %33.33 %0 %50 %72383936
105NC_007336ACACGC21225599425600533.33 %0 %16.67 %50 %Non-Coding
106NC_007336CCCTGG2122595962596070 %16.67 %33.33 %50 %72383943
107NC_007336CGGCAA21226528326529433.33 %0 %33.33 %33.33 %Non-Coding
108NC_007336CTGGCA21227270627271716.67 %16.67 %33.33 %33.33 %72383952
109NC_007336CGATGG21227619327620416.67 %16.67 %50 %16.67 %72383956
110NC_007336ACCGAA21227995727996850 %0 %16.67 %33.33 %72383960
111NC_007336CGCTGG2122846442846550 %16.67 %50 %33.33 %72383964
112NC_007336CGGCAC21228850628851716.67 %0 %33.33 %50 %Non-Coding
113NC_007336CGCCAC21228861728862816.67 %0 %16.67 %66.67 %Non-Coding
114NC_007336CAGACT21229868729869833.33 %16.67 %16.67 %33.33 %72383975
115NC_007336CAATGC21230024830025933.33 %16.67 %16.67 %33.33 %72383976
116NC_007336GACCAC21230742230743333.33 %0 %16.67 %50 %72383980
117NC_007336CGTCGC2123077873077980 %16.67 %33.33 %50 %72383980
118NC_007336TCGCGC2123087423087530 %16.67 %33.33 %50 %72383981
119NC_007336CAACAC21231252531253650 %0 %0 %50 %72383982
120NC_007336GGCGTC2123135153135260 %16.67 %50 %33.33 %Non-Coding
121NC_007336CCGCGC3183138563138730 %0 %33.33 %66.67 %72383983
122NC_007336CCGACG21231447131448216.67 %0 %33.33 %50 %72383984
123NC_007336CTGGCC2123151363151470 %16.67 %33.33 %50 %72383984
124NC_007336GCCGAA21231573331574433.33 %0 %33.33 %33.33 %72383984
125NC_007336GCGCTG2123169303169410 %16.67 %50 %33.33 %72383984
126NC_007336GCGCTG2123172903173010 %16.67 %50 %33.33 %72383984
127NC_007336CGCCAC21231765631766716.67 %0 %16.67 %66.67 %Non-Coding
128NC_007336TCACGA21231780731781833.33 %16.67 %16.67 %33.33 %Non-Coding
129NC_007336GAGCAT21231936531937633.33 %16.67 %33.33 %16.67 %72383987
130NC_007336GCCCCA21231965231966316.67 %0 %16.67 %66.67 %72383987
131NC_007336ATGCCT21232664132665216.67 %33.33 %16.67 %33.33 %72383991
132NC_007336GACGCG21233123233124316.67 %0 %50 %33.33 %Non-Coding
133NC_007336CCGCAG21233222333223416.67 %0 %33.33 %50 %Non-Coding
134NC_007336CCATCA21233286433287533.33 %16.67 %0 %50 %72383997
135NC_007336CGGTCG2123491893492000 %16.67 %50 %33.33 %72384009
136NC_007336TCTCCT2123500853500960 %50 %0 %50 %72384010
137NC_007336TGCCCG2123507213507320 %16.67 %33.33 %50 %72384010
138NC_007336GTCGTG2123522243522350 %33.33 %50 %16.67 %Non-Coding
139NC_007336GCCGAC21235383335384416.67 %0 %33.33 %50 %72384011
140NC_007336GAGATG21235863735864833.33 %16.67 %50 %0 %72384015
141NC_007336GGCGCG2123625373625480 %0 %66.67 %33.33 %72384018
142NC_007336CGAGGC21236278336279416.67 %0 %50 %33.33 %72384018
143NC_007336CTGGCG2123635433635540 %16.67 %50 %33.33 %72384018
144NC_007336GCTGCC2123644073644180 %16.67 %33.33 %50 %72384019
145NC_007336CCGCAG21236705836706916.67 %0 %33.33 %50 %Non-Coding
146NC_007336CTTCGC2123737573737680 %33.33 %16.67 %50 %72384025
147NC_007336ATGTCG21237680737681816.67 %33.33 %33.33 %16.67 %72384028
148NC_007336CTTGAT21237859137860216.67 %50 %16.67 %16.67 %72384030
149NC_007336CGACGC21237955437956516.67 %0 %33.33 %50 %72384030
150NC_007336GCACCG21238368138369216.67 %0 %33.33 %50 %72384033
151NC_007336GCCGAT21238373738374816.67 %16.67 %33.33 %33.33 %72384033
152NC_007336TGGCGG2123933473933580 %16.67 %66.67 %16.67 %72384040
153NC_007336CAGAAC21239424439425550 %0 %16.67 %33.33 %72384041
154NC_007336GCCTGT2123999944000050 %33.33 %33.33 %33.33 %72384046
155NC_007336TTTTGC2124016804016910 %66.67 %16.67 %16.67 %72384047
156NC_007336GCGCCC2124024284024390 %0 %33.33 %66.67 %72384048
157NC_007336TCAGCG21240337340338416.67 %16.67 %33.33 %33.33 %72384049
158NC_007336CGATTT21240978540979616.67 %50 %16.67 %16.67 %72384053
159NC_007336GCCTGC2124101234101340 %16.67 %33.33 %50 %72384053
160NC_007336GCGCGA21241644741645816.67 %0 %50 %33.33 %72384058
161NC_007336GCCCAG21241938241939316.67 %0 %33.33 %50 %72384061
162NC_007336GTCAGC21242194942196016.67 %16.67 %33.33 %33.33 %72384063
163NC_007336CATAGC21242225142226233.33 %16.67 %16.67 %33.33 %Non-Coding
164NC_007336GGGGGC2124246544246650 %0 %83.33 %16.67 %72384066
165NC_007336GGCGAA21242548642549733.33 %0 %50 %16.67 %72384067
166NC_007336TGCCAA21243262443263533.33 %16.67 %16.67 %33.33 %72384071
167NC_007336AGCATG21243340443341533.33 %16.67 %33.33 %16.67 %72384071
168NC_007336ATGGCG21243402343403416.67 %16.67 %50 %16.67 %72384072
169NC_007336TCAAGG21243417343418433.33 %16.67 %33.33 %16.67 %72384072
170NC_007336TATCGA21243420443421533.33 %33.33 %16.67 %16.67 %72384072
171NC_007336CCAAGC21243556843557933.33 %0 %16.67 %50 %72384073
172NC_007336GGTGCT2124395294395400 %33.33 %50 %16.67 %72384077
173NC_007336TCGGAT21245723645724716.67 %33.33 %33.33 %16.67 %Non-Coding
174NC_007336GCGCCG2124600214600320 %0 %50 %50 %72384095
175NC_007336GTCAGC21246154846155916.67 %16.67 %33.33 %33.33 %72384095
176NC_007336TTGGCA21246748646749716.67 %33.33 %33.33 %16.67 %72384101
177NC_007336TGGCGT2124771314771420 %33.33 %50 %16.67 %72384109
178NC_007336ACGCGC21248423848424916.67 %0 %33.33 %50 %Non-Coding
179NC_007336CACAGC21248894648895733.33 %0 %16.67 %50 %72384121
180NC_007336GTCGAC21248951548952616.67 %16.67 %33.33 %33.33 %72384121
181NC_007336TCCCCG2124955664955770 %16.67 %16.67 %66.67 %72384126
182NC_007336TTTCGC2124959464959570 %50 %16.67 %33.33 %72384126
183NC_007336CTTCGA21249698549699616.67 %33.33 %16.67 %33.33 %72384127
184NC_007336ACGCAT21249912249913333.33 %16.67 %16.67 %33.33 %72384129
185NC_007336CTTCGC2125001995002100 %33.33 %16.67 %50 %72384130
186NC_007336TTCCTC2125014195014300 %50 %0 %50 %Non-Coding
187NC_007336AATGAA21250298450299566.67 %16.67 %16.67 %0 %72384134
188NC_007336GCCGGC2125165295165400 %0 %50 %50 %72384146
189NC_007336TCATGA21251909151910233.33 %33.33 %16.67 %16.67 %72384149
190NC_007336ACGCGA21252155652156733.33 %0 %33.33 %33.33 %72384152
191NC_007336GAACTG21252490952492033.33 %16.67 %33.33 %16.67 %72384155
192NC_007336GGTCGA21252680352681416.67 %16.67 %50 %16.67 %72384158
193NC_007336ACGAGC21252853052854133.33 %0 %33.33 %33.33 %72384160
194NC_007336CCTGGC2125306875306980 %16.67 %33.33 %50 %72384161
195NC_007336GCCATG21253088153089216.67 %16.67 %33.33 %33.33 %72384161
196NC_007336CTTGCG2125312435312540 %33.33 %33.33 %33.33 %72384161
197NC_007336GCATCG21253650953652016.67 %16.67 %33.33 %33.33 %72384165
198NC_007336CCGTAC21253771953773016.67 %16.67 %16.67 %50 %72384166
199NC_007336TGGCGG2125404165404270 %16.67 %66.67 %16.67 %72384170
200NC_007336CTCAAG21254045154046233.33 %16.67 %16.67 %33.33 %72384170
201NC_007336GGCCGA21254144054145116.67 %0 %50 %33.33 %72384170
202NC_007336GGCGAA21254194254195333.33 %0 %50 %16.67 %72384171
203NC_007336CGACAC21254221154222233.33 %0 %16.67 %50 %72384171
204NC_007336CGGTGC2125438095438200 %16.67 %50 %33.33 %72384173
205NC_007336GCGCAG21254481954483016.67 %0 %50 %33.33 %72384173
206NC_007336CCGGTG2125472395472500 %16.67 %50 %33.33 %72384175
207NC_007336AGGTCA21254772254773333.33 %16.67 %33.33 %16.67 %Non-Coding
208NC_007336AACGTG21254994954996033.33 %16.67 %33.33 %16.67 %72384177
209NC_007336CCAGCG21255090655091716.67 %0 %33.33 %50 %72384178
210NC_007336CCAGGC21255120655121716.67 %0 %33.33 %50 %72384178
211NC_007336TCGTTG2125538195538300 %50 %33.33 %16.67 %72384180
212NC_007336CGTTAC21255992455993516.67 %33.33 %16.67 %33.33 %72384184
213NC_007336GAGGCC21256013856014916.67 %0 %50 %33.33 %72384184
214NC_007336GAAGCG21256357756358833.33 %0 %50 %16.67 %72384186
215NC_007336GCAGTG21257068257069316.67 %16.67 %50 %16.67 %72384191
216NC_007336GCGTAC21257231457232516.67 %16.67 %33.33 %33.33 %72384193
217NC_007336GTACTG21257487757488816.67 %33.33 %33.33 %16.67 %72384194
218NC_007336CCGTCT2125754225754330 %33.33 %16.67 %50 %72384194
219NC_007336TGTACG21257600457601516.67 %33.33 %33.33 %16.67 %72384194
220NC_007336CGTTGG2125773445773550 %33.33 %50 %16.67 %72384195
221NC_007336AGGCGA21258252058253133.33 %0 %50 %16.67 %72384200
222NC_007336AGCGCG21258291558292616.67 %0 %50 %33.33 %72384200
223NC_007336GGCCGA21259743459744516.67 %0 %50 %33.33 %72384213
224NC_007336GCCATG21259840759841816.67 %16.67 %33.33 %33.33 %72384214
225NC_007336TGCCTG2126032266032370 %33.33 %33.33 %33.33 %72384218
226NC_007336CACGGC21260426160427216.67 %0 %33.33 %50 %Non-Coding
227NC_007336ACCGTC21260669160670216.67 %16.67 %16.67 %50 %72384220
228NC_007336TCATCG21261359161360216.67 %33.33 %16.67 %33.33 %Non-Coding
229NC_007336TCACGA21261522961524033.33 %16.67 %16.67 %33.33 %Non-Coding
230NC_007336AGAGCA21261572361573450 %0 %33.33 %16.67 %Non-Coding
231NC_007336CGGCAC21261647661648716.67 %0 %33.33 %50 %72384228
232NC_007336TGATCC21261665261666316.67 %33.33 %16.67 %33.33 %72384228
233NC_007336CAGTGC21261721461722516.67 %16.67 %33.33 %33.33 %72384228
234NC_007336GCCCAG21261804061805116.67 %0 %33.33 %50 %72384229
235NC_007336CCGACC21261810461811516.67 %0 %16.67 %66.67 %72384229
236NC_007336GCCGAA21262061862062933.33 %0 %33.33 %33.33 %72384231
237NC_007336GGCGAG21262281462282516.67 %0 %66.67 %16.67 %72384233
238NC_007336CATCGC21262335162336216.67 %16.67 %16.67 %50 %72384234
239NC_007336GCCGTC2126260876260980 %16.67 %33.33 %50 %72384236
240NC_007336GCCTGA21262642462643516.67 %16.67 %33.33 %33.33 %72384236
241NC_007336CAGGAA21262779662780750 %0 %33.33 %16.67 %72384237
242NC_007336CCCAGC21262828862829916.67 %0 %16.67 %66.67 %72384238
243NC_007336CATCAC21262846162847233.33 %16.67 %0 %50 %72384238
244NC_007336GCGCCG2126288236288340 %0 %50 %50 %72384238