MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Ralstonia eutropha JMP134 megaplasmid

Total Repeats: 521

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007336	CCCAT	2	10	84	93	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_007336	GCCTT	2	10	3376	3385	0 %	40 %	20 %	40 %	72383735
3	NC_007336	GCGCC	2	10	4921	4930	0 %	0 %	40 %	60 %	72383736
4	NC_007336	AGGGG	2	10	8289	8298	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007336	CGCTG	2	10	8850	8859	0 %	20 %	40 %	40 %	72383738
6	NC_007336	CGCGG	2	10	9713	9722	0 %	0 %	60 %	40 %	72383739
7	NC_007336	GCGGG	2	10	10419	10428	0 %	0 %	80 %	20 %	72383739
8	NC_007336	GTCGA	2	10	12495	12504	20 %	20 %	40 %	20 %	72383740
9	NC_007336	GCGTG	2	10	12657	12666	0 %	20 %	60 %	20 %	72383741
10	NC_007336	CCGGC	2	10	12836	12845	0 %	0 %	40 %	60 %	72383741
11	NC_007336	CGTAC	2	10	14644	14653	20 %	20 %	20 %	40 %	72383742
12	NC_007336	ATGGA	2	10	17681	17690	40 %	20 %	40 %	0 %	72383745
13	NC_007336	TGCCA	2	10	19704	19713	20 %	20 %	20 %	40 %	72383747
14	NC_007336	GTTCG	2	10	20863	20872	0 %	40 %	40 %	20 %	72383748
15	NC_007336	AGCAG	2	10	21903	21912	40 %	0 %	40 %	20 %	72383749
16	NC_007336	GCGCG	2	10	23394	23403	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17	NC_007336	AACAC	2	10	23564	23573	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_007336	GCATG	2	10	24417	24426	20 %	20 %	40 %	20 %	72383751
19	NC_007336	CACAA	2	10	26567	26576	60 %	0 %	0 %	40 %	72383752
20	NC_007336	GGTCG	2	10	27784	27793	0 %	20 %	60 %	20 %	72383753
21	NC_007336	CTGCA	2	10	27986	27995	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_007336	GCGAG	2	10	28774	28783	20 %	0 %	60 %	20 %	72383754
23	NC_007336	TGGAT	2	10	28941	28950	20 %	40 %	40 %	0 %	72383754
24	NC_007336	CGTTG	2	10	30405	30414	0 %	40 %	40 %	20 %	72383755
25	NC_007336	ACGCC	2	10	31765	31774	20 %	0 %	20 %	60 %	72383757
26	NC_007336	TCGAC	2	10	32287	32296	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_007336	ATCGA	2	10	33472	33481	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_007336	TGGAC	2	10	35053	35062	20 %	20 %	40 %	20 %	72383760
29	NC_007336	CGAGC	2	10	35197	35206	20 %	0 %	40 %	40 %	72383760
30	NC_007336	TTGCG	2	10	38056	38065	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_007336	TTCGG	2	10	41050	41059	0 %	40 %	40 %	20 %	72383767
32	NC_007336	GGTCG	2	10	42170	42179	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_007336	CCGCG	2	10	42743	42752	0 %	0 %	40 %	60 %	72383771
34	NC_007336	GACCG	2	10	43153	43162	20 %	0 %	40 %	40 %	72383771
35	NC_007336	TGCGG	2	10	43283	43292	0 %	20 %	60 %	20 %	72383771
36	NC_007336	GTTGA	2	10	44293	44302	20 %	40 %	40 %	0 %	72383772
37	NC_007336	TCGGG	2	10	46242	46251	0 %	20 %	60 %	20 %	72383775
38	NC_007336	GGGCG	2	10	46278	46287	0 %	0 %	80 %	20 %	72383775
39	NC_007336	CTTGC	2	10	46887	46896	0 %	40 %	20 %	40 %	72383776
40	NC_007336	CGGGA	2	10	48242	48251	20 %	0 %	60 %	20 %	72383777
41	NC_007336	AATCC	2	10	49371	49380	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_007336	GGCCG	2	10	50389	50398	0 %	0 %	60 %	40 %	72383779
43	NC_007336	TTTGC	2	10	51126	51135	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_007336	TCCAG	2	10	52260	52269	20 %	20 %	20 %	40 %	72383780
45	NC_007336	CGATG	2	10	52885	52894	20 %	20 %	40 %	20 %	72383780
46	NC_007336	ACGAA	2	10	53877	53886	60 %	0 %	20 %	20 %	72383781
47	NC_007336	ACCTG	2	10	54906	54915	20 %	20 %	20 %	40 %	72383782
48	NC_007336	CAGAC	2	10	54948	54957	40 %	0 %	20 %	40 %	72383782
49	NC_007336	CTGCG	2	10	56735	56744	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_007336	CCGTG	2	10	60111	60120	0 %	20 %	40 %	40 %	72383787
51	NC_007336	GACGG	2	10	60599	60608	20 %	0 %	60 %	20 %	72383787
52	NC_007336	TCGCA	2	10	62581	62590	20 %	20 %	20 %	40 %	72383789
53	NC_007336	GGAAG	2	10	62659	62668	40 %	0 %	60 %	0 %	72383789
54	NC_007336	TGGCG	2	10	63190	63199	0 %	20 %	60 %	20 %	72383790
55	NC_007336	TTGGC	2	10	63362	63371	0 %	40 %	40 %	20 %	72383790
56	NC_007336	CGCGA	2	10	64399	64408	20 %	0 %	40 %	40 %	72383790
57	NC_007336	GCGCA	2	10	64664	64673	20 %	0 %	40 %	40 %	72383790
58	NC_007336	TGATC	2	10	64755	64764	20 %	40 %	20 %	20 %	72383790
59	NC_007336	GATCT	2	10	65914	65923	20 %	40 %	20 %	20 %	72383791
60	NC_007336	GCCTG	2	10	66348	66357	0 %	20 %	40 %	40 %	72383792
61	NC_007336	CGGCT	2	10	66407	66416	0 %	20 %	40 %	40 %	72383792
62	NC_007336	CGGCA	2	10	67415	67424	20 %	0 %	40 %	40 %	72383793
63	NC_007336	GTCCA	2	10	69350	69359	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_007336	AGGAC	2	10	71069	71078	40 %	0 %	40 %	20 %	72383796
65	NC_007336	CGAGC	2	10	71442	71451	20 %	0 %	40 %	40 %	72383796
66	NC_007336	GCCGA	2	10	71512	71521	20 %	0 %	40 %	40 %	72383796
67	NC_007336	CTTGT	2	10	73126	73135	0 %	60 %	20 %	20 %	72383798
68	NC_007336	GGAGG	2	10	73387	73396	20 %	0 %	80 %	0 %	72383799
69	NC_007336	GTCAC	2	10	73895	73904	20 %	20 %	20 %	40 %	72383799
70	NC_007336	TGCTC	2	10	74352	74361	0 %	40 %	20 %	40 %	72383800
71	NC_007336	GCCAA	2	10	74864	74873	40 %	0 %	20 %	40 %	72383800
72	NC_007336	GCGAT	2	10	75176	75185	20 %	20 %	40 %	20 %	72383800
73	NC_007336	AATTC	2	10	78731	78740	40 %	40 %	0 %	20 %	72383803
74	NC_007336	GACCG	2	10	78994	79003	20 %	0 %	40 %	40 %	72383803
75	NC_007336	GTTCT	2	10	79564	79573	0 %	60 %	20 %	20 %	72383804
76	NC_007336	GAGGG	2	10	80819	80828	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007336	TGCAT	2	10	81653	81662	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_007336	GCTGA	2	10	82181	82190	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_007336	GTTCC	2	10	84754	84763	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_007336	AAAGA	2	10	87460	87469	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007336	AATTT	2	10	87487	87496	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007336	GAGGT	2	10	89771	89780	20 %	20 %	60 %	0 %	72383811
83	NC_007336	ACGCT	2	10	89930	89939	20 %	20 %	20 %	40 %	72383811
84	NC_007336	CGGCG	2	10	90276	90285	0 %	0 %	60 %	40 %	72383811
85	NC_007336	ACGGC	2	10	92845	92854	20 %	0 %	40 %	40 %	72383812
86	NC_007336	GGCGT	2	10	92922	92931	0 %	20 %	60 %	20 %	72383812
87	NC_007336	GGCGT	2	10	93264	93273	0 %	20 %	60 %	20 %	72383812
88	NC_007336	GGCGT	2	10	93606	93615	0 %	20 %	60 %	20 %	72383812
89	NC_007336	ACGGC	2	10	94213	94222	20 %	0 %	40 %	40 %	72383812
90	NC_007336	GGCGT	2	10	94290	94299	0 %	20 %	60 %	20 %	72383812
91	NC_007336	GGCGT	2	10	94632	94641	0 %	20 %	60 %	20 %	72383812
92	NC_007336	GGCGT	2	10	94974	94983	0 %	20 %	60 %	20 %	72383812
93	NC_007336	ACGGC	2	10	95239	95248	20 %	0 %	40 %	40 %	72383812
94	NC_007336	GCGTT	2	10	97965	97974	0 %	40 %	40 %	20 %	72383813
95	NC_007336	CGTAC	2	10	98488	98497	20 %	20 %	20 %	40 %	72383814
96	NC_007336	CCCGA	2	10	98647	98656	20 %	0 %	20 %	60 %	72383814
97	NC_007336	GCGGG	2	10	99796	99805	0 %	0 %	80 %	20 %	72383814
98	NC_007336	CTCCC	2	10	99861	99870	0 %	20 %	0 %	80 %	72383814
99	NC_007336	CGACT	2	10	101048	101057	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_007336	ATCGC	2	10	101255	101264	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_007336	CCAGC	2	10	102648	102657	20 %	0 %	20 %	60 %	72383816
102	NC_007336	CGGGC	2	10	104998	105007	0 %	0 %	60 %	40 %	72383818
103	NC_007336	TCGGT	2	10	105954	105963	0 %	40 %	40 %	20 %	72383819
104	NC_007336	GAGGC	2	10	107138	107147	20 %	0 %	60 %	20 %	72383820
105	NC_007336	GTACG	2	10	108376	108385	20 %	20 %	40 %	20 %	72383821
106	NC_007336	CGGCG	2	10	110701	110710	0 %	0 %	60 %	40 %	72383823
107	NC_007336	CGGTA	2	10	111826	111835	20 %	20 %	40 %	20 %	72383824
108	NC_007336	GCGAG	2	10	112093	112102	20 %	0 %	60 %	20 %	72383824
109	NC_007336	GGCGC	2	10	112120	112129	0 %	0 %	60 %	40 %	72383824
110	NC_007336	GGGTG	2	10	114441	114450	0 %	20 %	80 %	0 %	72383826
111	NC_007336	GTTCG	2	10	114966	114975	0 %	40 %	40 %	20 %	72383827
112	NC_007336	CTTTT	2	10	118952	118961	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_007336	GCGCC	2	10	119823	119832	0 %	0 %	40 %	60 %	72383832
114	NC_007336	CACGC	2	10	121315	121324	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
115	NC_007336	GCGCG	2	10	125261	125270	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
116	NC_007336	TGCGC	2	10	125711	125720	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
117	NC_007336	GAGGC	2	10	125769	125778	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
118	NC_007336	GCGCG	2	10	126967	126976	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
119	NC_007336	CAGCG	2	10	127613	127622	20 %	0 %	40 %	40 %	72383838
120	NC_007336	GGTGC	2	10	127682	127691	0 %	20 %	60 %	20 %	72383838
121	NC_007336	TTTCC	2	10	130062	130071	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_007336	GCCTT	2	10	130550	130559	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_007336	CTCCC	2	10	138244	138253	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
124	NC_007336	TCCGG	2	10	140561	140570	0 %	20 %	40 %	40 %	72383848
125	NC_007336	GGCGC	2	10	141258	141267	0 %	0 %	60 %	40 %	72383848
126	NC_007336	GACGG	2	10	141698	141707	20 %	0 %	60 %	20 %	72383848
127	NC_007336	CATTG	2	10	143848	143857	20 %	40 %	20 %	20 %	72383850
128	NC_007336	GACCG	2	10	144513	144522	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
129	NC_007336	GCGCG	2	10	145748	145757	0 %	0 %	60 %	40 %	72383851
130	NC_007336	CAGGC	2	10	145799	145808	20 %	0 %	40 %	40 %	72383851
131	NC_007336	CGTGC	2	10	146277	146286	0 %	20 %	40 %	40 %	72383851
132	NC_007336	GCTTC	2	10	146316	146325	0 %	40 %	20 %	40 %	72383851
133	NC_007336	CCTCC	2	10	146625	146634	0 %	20 %	0 %	80 %	72383851
134	NC_007336	CGCAA	2	10	148002	148011	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_007336	TCGCG	2	10	148692	148701	0 %	20 %	40 %	40 %	72383852
136	NC_007336	GTACC	2	10	153734	153743	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_007336	ATCGA	2	10	153823	153832	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_007336	ATTCG	2	10	153960	153969	20 %	40 %	20 %	20 %	72383857
139	NC_007336	GTGAA	2	10	154255	154264	40 %	20 %	40 %	0 %	72383858
140	NC_007336	CGGCG	2	10	154805	154814	0 %	0 %	60 %	40 %	72383858
141	NC_007336	TAATT	2	10	155523	155532	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007336	CTTGC	2	10	155853	155862	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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144	NC_007336	GACTG	2	10	156744	156753	20 %	20 %	40 %	20 %	72383859
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150	NC_007336	CGCGC	2	10	165389	165398	0 %	0 %	40 %	60 %	72383862
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153	NC_007336	GTCGT	2	10	170323	170332	0 %	40 %	40 %	20 %	72383864
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155	NC_007336	TCCAT	2	10	173870	173879	20 %	40 %	0 %	40 %	72383866
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251	NC_007336	GTGGC	2	10	272578	272587	0 %	20 %	60 %	20 %	72383952
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262	NC_007336	GCCGA	2	10	285301	285310	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
263	NC_007336	GGACC	2	10	287050	287059	20 %	0 %	40 %	40 %	72383966
264	NC_007336	ACGGA	2	10	287831	287840	40 %	0 %	40 %	20 %	72383966
265	NC_007336	CCGAC	2	10	288034	288043	20 %	0 %	20 %	60 %	72383966
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267	NC_007336	TTCCT	2	10	289730	289739	0 %	60 %	0 %	40 %	72383969
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269	NC_007336	CATCG	2	10	294714	294723	20 %	20 %	20 %	40 %	72383973
270	NC_007336	CCATC	2	10	295264	295273	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
271	NC_007336	CGTCT	2	10	297091	297100	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
272	NC_007336	CTCAC	2	10	297953	297962	20 %	20 %	0 %	60 %	72383975
273	NC_007336	GCGCG	2	10	298720	298729	0 %	0 %	60 %	40 %	72383975
274	NC_007336	GGGCC	2	10	299478	299487	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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276	NC_007336	CGCGC	2	10	302742	302751	0 %	0 %	40 %	60 %	72383978
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278	NC_007336	CGGTC	2	10	303120	303129	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
279	NC_007336	CAAAG	2	10	303723	303732	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
280	NC_007336	CACTG	2	10	304141	304150	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
281	NC_007336	CAACA	2	10	305891	305900	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
282	NC_007336	CACCT	2	10	306185	306194	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
283	NC_007336	AGGTG	2	10	306623	306632	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
284	NC_007336	CTGGC	2	10	306670	306679	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
285	NC_007336	AGGTG	2	10	306688	306697	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
286	NC_007336	CAAGG	2	10	308970	308979	40 %	0 %	40 %	20 %	72383981
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288	NC_007336	CGCAT	2	10	313309	313318	20 %	20 %	20 %	40 %	72383982
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303	NC_007336	CCGAA	2	10	330537	330546	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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305	NC_007336	GCCCG	2	10	333042	333051	0 %	0 %	40 %	60 %	72383997
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376	NC_007336	CGAAG	2	10	422407	422416	40 %	0 %	40 %	20 %	72384064
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383	NC_007336	ATGTC	2	10	436381	436390	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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389	NC_007336	CAGCA	2	10	449369	449378	40 %	0 %	20 %	40 %	72384085
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391	NC_007336	GACCT	2	10	452129	452138	20 %	20 %	20 %	40 %	72384087
392	NC_007336	TCAAA	2	10	454046	454055	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
393	NC_007336	CAAAA	2	10	455645	455654	80 %	0 %	0 %	20 %	72384091
394	NC_007336	CTGCG	4	20	456206	456225	0 %	20 %	40 %	40 %	72384092
395	NC_007336	ATGGC	2	10	457442	457451	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
396	NC_007336	CAACC	2	10	458075	458084	40 %	0 %	0 %	60 %	72384093
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400	NC_007336	CGAAG	2	10	464508	464517	40 %	0 %	40 %	20 %	72384097
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402	NC_007336	ACCCC	2	10	466643	466652	20 %	0 %	0 %	80 %	72384100
403	NC_007336	TCTCG	2	10	468144	468153	0 %	40 %	20 %	40 %	72384101
404	NC_007336	AGCGA	2	10	470350	470359	40 %	0 %	40 %	20 %	72384103
405	NC_007336	AGGCC	2	10	470445	470454	20 %	0 %	40 %	40 %	72384103
406	NC_007336	CTTTC	2	10	470694	470703	0 %	60 %	0 %	40 %	72384104
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498	NC_007336	GACAA	2	10	597681	597690	60 %	0 %	20 %	20 %	72384213
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